Drosophila persimilis: 6591516
Help
Entry
6591516 CDS
T01063
Name
(RefSeq) E3 ubiquitin-protein ligase hyd isoform X2
KO
K10593
E3 ubiquitin-protein ligase EDD1 [EC:
2.3.2.26
]
Organism
dpe
Drosophila persimilis
Pathway
dpe04120
Ubiquitin mediated proteolysis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dpe00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
04120 Ubiquitin mediated proteolysis
6591516
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
dpe04121
]
6591516
Enzymes [BR:
dpe01000
]
2. Transferases
2.3 Acyltransferases
2.3.2 Aminoacyltransferases
2.3.2.26 HECT-type E3 ubiquitin transferase
6591516
Ubiquitin system [BR:
dpe04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
HECT type E3
6591516
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HECT
E3_UbLigase_EDD
PABP
zf-UBR
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
6591516
NCBI-ProteinID:
XP_002016781
UniProt:
B4GE46
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2872 aa
AA seq
DB search
MVSMQFVLQPLPGNDDQFIERVREVSEKVNRFGYGTHRIFEQLKIPVREVVIGPTHIGVL
LEDGKAFRVSFSINSEKLDLTKSDTKCSTTGAGGTTNASKAPSSSRPMARSRARLLRATG
RSSSSGQGSGSRSTGVIIGGSTSNRPLVTVPATYVPEELISQAEVVLQGKSRNLIIRELQ
RTNLDVNLAVNNLLSRDDEEAEDTEEGADNYVPEDLISLLDNGFSADNNSVIIDPSDGLF
SEEIFSNYSSIRNLLFDRIRSERSNSNTNAAESNQSNRSTTSGGSISGNSGLSAQISVNA
DREAFSRWRDRQYYGPRRWINKDDYTWEKDADSKKKEPSSMLSPIWISEELQPWPDKTSV
RFKTIGALFSEFIALSDNGDLYQWRWSDSEPYKSDVDNMYHPKTLALNINERVVHISANF
IRCSVVTESNRVATWMDEQLGYLGAKLDHTCCTFNEFISDPITNIYVCSLYTVVRTDSNN
IYWWGVLPFDQRRYLWDKFRTKTKKPFKVIATDINVGAQVIMKKCPIYQSGSIGFTCSNG
VPKVGQLLNSVWNFTDVCRMKIINISTHLGPDKCPATGVNQNIQGASTDKDLLKATVMQS
TSNSKNGQMSSSSKESTDRIDMPPPPSPASSTCSDTGSVTSHKRTKRMTAKEDSHTNQES
RKDEELWQLKDVVFVEDKVGPIGKVLKVDGDFVAVRFPALNNASNAASTSKDECKEDDWQ
QCRLLRREDVQVFRTVMSTRGPDWLQKQPKKVNVGADTAGVQLLTIAVDMRGIHVIKKVL
GKIHYSLYNLYNSKQEQNCQFPTDCASFIGVSPTNILMACNNDCSGNNSTIVLRDGNGAL
YPLAKDCLGSIKDPQWFDLPPVKSITMATIPLPAMVSGLNLKSKVCMTALLFDTQKLMPH
ILRCDIKNSFAAIARLEKEDHTDTASVVEERCDGARNIFHACVIMCAPTSNKDSHADSPS
SSSDKKTLSAGLSITRSIPNAPAYVSGNSFGANASTTSDSASFATMTAGISASGVRDNRI
NLRDMMQRLINTDQPEQSGHPTTSGNEDHAYIPWPAEASSANNLSGVSSQNIADGIEDIS
KAIPSSTQSSILSSIKLGSPNYTFDLSQRREHALLILQQMCASPALRPYLYQMLSTKDAQ
GQTAFMLSVTCRAYEAGIIILNTILMLADQDSQFKESMIFPNGSPADQSPLHVICYNDTC
SFTWTGADHINQNIFECKTCGLTGSLCCCTECARVCHKGHDCKLKRTAPTAYCDCWEKCK
CKALIAGNLTKRFALLCKLVSCTDLVTKFNSKGESILLFLIQTVGRQIVEQRQYRFNVRV
RNVGNTTGSTNGNNTAISNRKSSSLDVESEMPDHDLEPPKFARKALERLLIDWNAVRCMI
MSGAEKNDINYHISPSNIAESPSPDSFNTFIQTQQGSTLLDKFTHSLIVKCTGDHLDTLL
LTLVRELQNVGITNRCKEAEEVARRFVRSVARVFVIFNLEKQPNPEKRKLHTACNKYVQS
CVKVFQTLHRISIEELCEVSEALIAPVRLGVVRPTAPFTMSSSNLDNSDDLFSVDPLAPS
NVEPLSENVLGHDAANDQSTSFNIQQNYDVVAMETIRDASESEEAINREANSHTQDDDLI
ENQRNEDGLQDDESDNDFTFNDAETESDSDDNQSNQEVQRNVPTGATAGSETDIGVLFLE
DESGDSSAQEEDGSEDGESDDHSDEFNFNDQQLERRNTSSNARSDLAPQTMQWAIRSRDT
ARSSLRVPTGSNLVFIDPMALRRSTVPATTAVTTPSAESHTMATTASNLARAFGITIRQI
SELISILSYNIVNDIDTSLKIQGEEAVAVQAFVEKRLKSTWDWMFTVMDGTEAQLKFGAY
LTNYTDPNHPLHPLNLSGPSTNNQTPAPTTSTSIGVNVLGSNSRRDFFTYCLSLMRAHTS
EHRDALPVLDITALRHIAYVLDAFIYYMRNDTGFYDKQENISGRINNVSPMPENYDTDDE
STNLEEFSDVQPSTSTLSSSNLGTRRHAFFTRSESTLSLGCSAPDGFELPLDMAMPLADK
PHLLQPNSKRQELFANLPLLVVASANASIDDPPTRLGFSNSLKTDGPVFETVPSQQPVEV
IQNPVNSILDDDNIAYEADETAETNIYLQLKKKQCFEDLKSRKDVDGSQSCQFDRVVSMD
TDELEKLGSGTSTSKTTDALMATRPEVIIAPNKASLTSSTADHCSVIVLAGGSCLKTVDS
ELNSSSSNSILLTSEKTKCDTLQPKTPPQMLVFPIRGSLFYKNTFSELPSWNFLLSRWKL
TLDIFGRVFMDDVGMEHGSVLPELRGFPVKEMRFRRHMEKLRNGQQRDLVFCKLERNRET
LIVQTFKELNTQFGNQNRRSQPPIAFNRVKVTFKDEPGEGSGVARSFYTSIAEALLANAK
MPSLESIQVGSSHSKYGVPFSSILRSRTVAGSSRDQPTLQRRGTSSKILWRTARDRKVLN
VDARPYTPSNSTDNSMAESANEHLSVHLQQLGERLYPKINSINSAHAPKITGMLLEIPTP
QLLSVLSSDETLRQKVNEAIEIITFKQKSESCSQNSQQKKSASVVLVEPADDDNEPLFYS
PGKRGFYTPRQGFATFERINAFRNIGRLIGLCLLQNELLPLFLQRHVLKYILGRKIKFHD
LAFFDPALYESFRQIIQNAQTKDGEETINRMELCFVIDLMKEEGCGNTELIPGGREVPVT
SSNIFDYIRRYTEYRLIKSQEKALEALKDGVFDVLPENSMNSLTAEDLRLLLNGVGDINV
LTLISYTTFNDESSEGPDKLLKFKRWFWSIVEKMNILERQDLVYFWTGSPALPASEEGFQ
PLPSVTIRPADDSHLPTANTCISRLYIPLYSSKSILRTKMLMAIKSKNFGFV
NT seq
8619 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtttctatgcaatttgtgttgcaacctcttccaggcaatgatgatcaatttattgaa
agagtacgggaagtttcggaaaaagtgaatcgatttgggtatggcactcatcgtatattt
gagcaattgaaaattccagtaagagaagtcgttattgggcctacccatattggtgtactt
cttgaggatggtaaagcatttcgagtatcattttctatcaactctgaaaagcttgatttg
actaaatctgatactaaatgttccacaactggtgccggtggaacaaccaatgcttcaaag
gctccttcatcatcgcgtcccatggcccgttctagggcacgtcttttgcgtgcaacaggc
cggtcaagctcaagtggtcaaggatccggatcacgaagtaccggtgtaattataggaggc
agcacatctaatcgtcctttggtaactgtaccagctacgtatgtcccagaggaacttatt
tcacaagcagaagtagttctacagggcaagagcagaaatctcataataagagaattgcag
cgcaccaatttagatgtaaatttagctgtaaacaatttgctttcgcgcgatgatgaagaa
gctgaagatacggaggaaggtgcagacaattatgtgcctgaagaccttatatcactgttg
gacaatgggtttagtgcagataataacagcgttatcatcgatccttcagatggactattt
tcagaagaaatattcagtaactattcaagcattcgaaatttactgttcgaccgtatacgt
agtgagcgcagtaattccaacacaaacgcagcagaaagtaatcaatcaaaccgttcaacg
acatcaggtggttctatatctggaaacagtggactctcagctcaaatatctgttaatgct
gatcgcgaagcgttcagtcgttggcgggatcgtcagtactacgggccgcgccgctggata
aataaagacgattatacatgggagaaggatgcagattcgaaaaaaaaagaaccttcatca
atgttgtctccaatatggatatcggaggaactgcaaccatggcctgataaaacttcggtc
cggtttaagacaatcggagctttattttctgaattcattgcactgtctgataatggagac
ttataccaatggcgttggtccgactcagagccttataagtcagatgtggacaatatgtat
catccaaaaaccttggcactcaacattaacgaaagggtcgtgcatatttcagctaatttt
atacggtgttccgtggtgactgagtcaaatcgagttgccacctggatggacgaacaactg
ggatatcttggagccaagctggaccatacttgttgtactttcaatgaatttatttcagat
ccaataacaaacatttatgtttgttcattgtatacagtggttagaacggacagcaacaac
atttattggtggggcgttcttccatttgatcagcgccgatatctgtgggacaaatttcga
acaaaaacaaagaaaccgtttaaggttattgcaacggatattaatgtaggggcgcaggtc
ataatgaaaaaatgtcctatatatcaatctggatcaattggttttacatgttccaacggt
gtacccaaagttgggcaactcttaaactcggtttggaatttcactgatgtgtgtcgtatg
aaaattataaatattagcacacatttgggcccagataaatgtccagcaactggggtaaac
caaaatatccaaggagcatctacagataaggaccttttgaaggcaacagtcatgcaaagc
acaagcaatagtaaaaatggacaaatgagttcatcgagcaaggaatcaaccgataggatc
gacatgcctccaccaccatctccggcttctagcacctgcagtgatactggtagtgttaca
tcacacaaacgcactaagagaatgactgcaaaagaggactcccacaccaatcaagagagc
agaaaggacgaagagctatggcagttaaaagacgttgtttttgttgaagataaggtcggc
ccgattggaaaagtgcttaaagtcgatggtgactttgtagccgttcggtttccagcattg
aacaacgcctctaatgcagcttcaacatccaaagacgaatgtaaagaagacgactggcaa
caatgccgtctgcttcggcgcgaagatgtacaagtttttcggactgtaatgtcaacgcgt
ggtccagattggttgcaaaagcagccaaaaaaagttaatgtcggtgctgatacagctggc
gttcagttgctcacaatagctgttgatatgcgaggtattcacgtaatcaaaaaggtactc
ggtaaaatacattacagcttgtacaacttgtacaacagtaagcaggagcaaaactgccaa
tttcctacagactgcgcttcatttattggcgtttctcctacaaatatattaatggcttgc
aataatgattgtagtggaaataacagtactattgtgctcagagatggcaatggtgccctg
tacccattagcgaaggattgtcttggctcaataaaggatccccagtggtttgatttaccc
ccagtaaaatcaattaccatggcaacgataccgctaccggcaatggtttctggattaaac
ctcaaatcaaaggtgtgcatgacggctttgctttttgacacacaaaaactcatgccgcat
atactacgttgtgatataaagaatagcttcgctgctatagcccggcttgaaaaagaagat
cacactgatactgcttcagttgtcgaagagcgctgcgatggggctcgtaacatattccat
gcatgtgttattatgtgtgccccaacctctaacaaggattcgcatgcagattctcctagt
agtagctctgataaaaagacactatcggctgggctttcgatcacacgttctattccaaac
gcaccagcatatgttagcggtaactcttttggagcgaatgcgtccactaccagtgacagc
gctagtttcgccacaatgacggctggaataagcgcgtctggtgtaagagacaatcgcatt
aatttgcgtgatatgatgcaacgccttattaatactgatcaacctgagcaatccggtcat
ccaacgacgagcggaaacgaagaccatgcttatattccatggccagcagaggcgtcttcg
gctaacaatctaagcggggtctcatcgcaaaacatcgcagatggtattgaagatatttcc
aaagcaattccgtcctctacccagagttccattttatcaagcattaaattaggttctcca
aactacacattcgatctatcacaacgccgtgagcatgcactcttgattctgcaacaaatg
tgcgccagtcctgcactacggccttacctctaccagatgctaagtaccaaagatgcgcag
ggtcaaactgcttttatgctatccgttacatgtcgtgcctatgaagcagggattataatt
ttgaacactatactaatgcttgctgatcaagattctcagtttaaggaatctatgatattt
cccaatggttctccagcggatcaatcaccattacatgtgatatgttacaatgatacgtgc
tcatttacttggacaggggctgatcatataaaccaaaacatttttgaatgtaaaacatgt
ggtctgactggatcattatgctgctgcacagagtgcgctcgagtatgccacaaaggacat
gattgtaaattaaagcgcacagcaccgacagcctattgtgattgctgggaaaaatgcaag
tgcaaagcacttatcgctggcaatctcacaaagagatttgctttgctctgcaaactagtt
tcttgtaccgatttggtcacgaaattcaactctaaaggggaatctatactactatttctg
atacagactgtgggtagacaaatagtggagcaaagacaataccgtttcaatgttagggtt
cgtaatgtcggaaatactacggggagcacgaatgggaacaacacagctatatcgaatcga
aagtcttcctcgctggacgtagaaagtgaaatgccagaccatgatctcgaaccaccgaaa
ttcgccagaaaagcacttgaacgactcctaattgattggaatgcagtacgctgcatgata
atgagtggagctgaaaaaaacgatataaattatcatatttctccgagcaacattgcagaa
agccctagtccggatagtttcaacacgtttatacagacccagcaaggttctacacttctg
gacaagtttactcacagtttaattgtaaaatgcacaggcgaccatcttgacactttgctg
cttacattagtacgcgagctacaaaacgttggtattactaatagatgtaaggaggctgag
gaagttgcaaggcgcttcgttcgctccgttgctcgtgttttcgttatttttaatttagaa
aaacaaccaaatccagaaaaaagaaaactacacactgcatgcaataaatatgttcaaagc
tgtgtgaaagtttttcagacgttacacagaatatctattgaagaactatgtgaggtttct
gaagcactaattgctccagtacgacttggtgttgtgaggcctaccgctccttttacaatg
tcatcatcaaacctagataactcggatgatctatttagtgtagacccgttagcaccctcg
aatgtagagccactttccgagaacgtattgggacacgatgctgcaaacgatcaaagtact
agctttaatatccagcaaaactacgacgttgtcgcaatggaaacgattcgcgatgcttca
gaatcggaagaagctattaatcgagaagcaaattctcatactcaggacgatgatttgata
gaaaatcaacgaaatgaggatggtctccaggatgatgaaagtgataatgattttactttt
aatgatgctgagaccgaatcagactctgatgacaaccagagtaaccaggaggtgcagaga
aacgttccaaccggtgcaaccgctggatccgaaacagatattggtgttctatttttggag
gacgaatcgggagactcatcagcacaagaggaagatggttcagaagatggtgaatctgat
gatcattccgatgaatttaattttaacgatcaacaacttgaacgtcgtaacactagttca
aatgcacgtagtgatctagctccccagacaatgcaatgggcaatcagaagccgtgacact
gctcggtcatcgctacgcgtgccaacgggttccaatttagttttcattgacccgatggct
ttaagacgctccacagtaccagctactaccgcggttactacgccatccgcagagtctcat
acaatggctacaactgctagcaatttagcacgggcatttggaattacaattagacagatt
tctgaacttataagtattctatcttacaatatagtaaatgatatagatacatcattgaaa
attcaaggagaggaagcagttgctgtccaggcatttgttgaaaagcgattaaagtcaaca
tgggactggatgtttacagtgatggacggaacggaagcacagctaaagtttggtgcctat
ttgaccaactatactgaccccaatcatcctctgcacccccttaaccttagcggaccatcg
accaataatcaaacacctgctcctaccacttctacatccattggtgttaatgtgctggga
tctaactcacgtcgagacttctttacatactgcctgtctctgatgcgtgcgcacacctct
gaacatagagatgcccttccagtattggatataactgctcttcgacatattgcatacgtg
ctcgacgcgtttatttactatatgcgcaatgatacaggattttatgataagcaggaaaat
atctctggacgtataaacaatgtgtcaccaatgcctgaaaattatgatacggacgatgaa
tcaacgaacttagaagagtttagtgacgtacagccgtctacaagtaccctgtcttcaagc
aatctcggcacacgcagacatgcctttttcactagatctgagtcgaccctcagcttaggc
tgctcggcgccggacggctttgaattaccgcttgatatggcaatgccccttgccgataaa
cctcatttgctgcagcctaattccaaacgacaggagctttttgccaatctaccactcctt
gtagttgcaagtgctaatgctagtatcgatgaccctcctacaaggctcggattttccaat
tccttaaaaacggatgggcctgtttttgaaactgtcccatcccaacagcctgtggaagta
atacaaaatccggtgaatagcatcttagatgatgataatatcgcatatgaggctgatgag
actgcagaaaccaatatttacctgcaattaaagaaaaaacagtgtttcgaagatttaaaa
tcccgtaaggacgttgatggaagtcaaagctgccaattcgatagagtggtatcaatggat
acagatgagttggaaaaattaggcagtggtacaagtacatcaaaaacgacggatgcgtta
atggctacaagaccagaagttataattgcgccaaacaaagcatcattaacgtcgtcgaca
gccgatcattgcagcgttattgtactggcaggaggttcttgtttaaaaacggttgactcg
gagctcaacagttcttcttccaattccattttattaacttcggaaaaaacaaaatgtgat
acacttcaaccaaagacaccaccgcagatgttggtgtttcctattcgaggttctttgttt
tacaaaaatactttttcggaactgccgtcttggaactttttgttaagccgttggaaacta
acacttgatatcttcggacgtgtattcatggatgatgttggaatggaacatgggtctgta
ttgccagaactgagaggttttcctgttaaggaaatgcgttttcgacgacacatggaaaaa
ctgcgaaatggtcaacagcgtgatttagtgttctgcaaactcgaacgaaaccgagaaacg
ttaattgttcaaacttttaaagagcttaatacccaatttggcaatcaaaataggcgatct
cagcctcctattgcattcaacagagtaaaagtaacatttaaagatgaacccggtgaggga
tctggtgtagcccgcagcttttatacatccatcgcagaagctttgctggctaacgcaaaa
atgcctagtcttgaatctatacaagtggggagctcgcatagcaaatatggagtgccgttt
tcgagtatactgagaagcagaaccgtcgccggatctagtcgcgaccagcccacattacaa
agacgtggcaccagtagcaaaattctatggcgaacagctcgtgaccgaaaggttttaaat
gtagatgccagaccgtataccccatccaacagcacagataattcaatggcggagagcgca
aacgaacatttatctgttcatttgcaacaacttggagaacgtttataccctaagatcaac
tcgataaactcagcacatgcaccgaagataacaggaatgctcttggagataccaaccccc
caacttctatctgttctttcctcagatgaaacactgcgtcaaaaagttaatgaagccata
gaaattataacttttaagcaaaagtcggaatcatgttctcaaaatagtcaacaaaaaaaa
tctgcatcagtagtgctagtcgaacccgcagatgacgataatgaaccattattttactct
ccgggtaagcggggattttatacaccacgccagggctttgcgacctttgagcgcattaac
gcatttagaaatattggaagactaattggactttgtctgttgcaaaatgaattgctgcca
ctgttcctacaaaggcacgtgttaaagtacatacttggacgtaaaattaagttccacgat
ttggcgtttttcgatccagcattatatgaatctttcaggcaaattattcaaaatgcccaa
acaaaagatggtgaagaaactatcaatcgaatggaattatgttttgtaattgatttaatg
aaagaggaaggttgtggcaacacagagttaattccgggaggtcgtgaagtaccggtaaca
tcaagcaacatattcgattatataagacgttatacggaatacagactgattaaatcgcag
gaaaaggcacttgaggcattaaaagacggggtttttgacgttctgcctgaaaacagtatg
aacagcttaaccgcagaagatttacgtttgctcttgaatggcgtcggagatataaacgta
ttaacattgatttcatacactacctttaatgacgagtctagtgaaggtcctgataaactt
ctaaagtttaaacgatggttttggagcattgttgaaaaaatgaatatattggaacgtcaa
gatttggtttatttttggacaggttcgccagccttacctgcttcggaagagggatttcaa
cccttgccctctgttactataagacctgcggatgactctcatcttcccactgcaaatact
tgtatatctcgactgtatatccctttgtactccagcaaatccattttacgcactaaaatg
ctgatggccatcaaatccaaaaattttggattcgtataa
DBGET
integrated database retrieval system
