Desulfotalea psychrophila: DP2127
Help
Entry
DP2127 CDS
T00192
Name
(GenBank) unknown protein
Organism
dps
Desulfotalea psychrophila
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAG36856
UniProt:
Q6ALB9
LinkDB
All DBs
Position
complement(2445072..2449574)
Genome browser
AA seq
1500 aa
AA seq
DB search
MLHQKSYKKKYNAVTALAVGAFLLTMNSSNVFADPVITVDGQSTTCTTGGSGGYQYNDVH
NTKEVLRITPSADVKDVHISFAGSAEEVKEGIEVFGVEEGKANVLGIGVEILADGRDSAK
RNLEVVSDANITLDLHNESGEGIAAGIFVPVGESVADDSHILVENKGRILAKESLSSSPN
HNVGMVVERQDSTGENLAVVMRNSGTIDVSTDQEALGMWSEGVGHAGDILTLNNAADGKI
IVSDSDSIAMGSGAPYVSPLGDQHDRDSIDSEEPVIGITMLNKGTISVVHGGVITGTHAG
KKLDGHHTRGMRGTGGNFIVNSGSILGGEDTIVTAIDGNGEGSTTINSGVIDLKGNYSVG
MMSDPYTHTENRGTITVSQSVDDVDHSPSSAMKSVYYPAAGEEMSDPALDMALNTGTGTI
KLGGGAIGFELVSRDAFEDQEDAPVHMTDALGINLGEISSFSPLVGEDPAPAKSFRVTGG
GAVGVNAADLADKVQLREGGNFLLIGNPEGAEKTIARIQVRDPGDATYEGHSANSWIHVG
MDAEDKKALAGSKFNEIRGYLNSPANFAIKRIQLQGNAVESEHDNQHAHLSVADGATVSV
GKFDLTNAHIVTQDSSQAKISNLNLYGQNKISVRDTSHLTVETVTAPYHTNSAIEVEKGA
VLTTSYDLLATGSSIADTSEFSFAGQGTIDLVSSDVYDQERITSFETSFKSQYSDFKGSF
LYSGFDMGDGPIDLGLAEIIDSPEKEIKLTVPEDSVDKTQISFAKGTPMGAQSYELPDTV
AEVKVSKGTVLSLRGSSSGEESLLKGGAEEKSVNVGGGSVLNLGAKGEVATEKRTQGTLD
AKVELVAADDSSAPKTELNVRNGDFSITALTAQSGTTVNIGDSQGQGQGSLALETASLGG
KVNIKKGTLSVKELTATEETVINIGNSQGQGSLALETASLNGAMLFADPNWLDSTELAKA
KDASHVSIVNFGTGADSNVINGHLVAGQNSIIALGTTDAGDVDNIVKKITEDNNTTWGRT
GVTAAVYLDGPYKVGAAGSLTVDGSRVTAPTGADVPVGGTATFADNSLLVVDVTNLAGQP
AITADTVTISNKAFVGVKGALVGEKYTMTSTGDNWLLANIYLYNQLQEVASLVDGSFTTK
SAGTAATLYGARGNTASFLTNYNERGYEVLGVTSTNYMKGILRGASPTSGGQATEASANI
AGVGGIAHVNTIASALVLDLAQKHTDITGDYSTGIYFQPLYQKSDISGMNIGNYSTDMDI
DLYGAALGADSVLGDFLYGGAFTYGAGKVSGEGFTSSADTDSDFYGLTMYGAYNLSNAMQ
ISVDALYTAMSSDTRYSTLKADGIDSYVLGTGVKASYLFELGDTVVSPYAGMRYQYYKQD
AYTNDVFAVNASSMDTWIIPMGVKYMYKFAAADSGLQFNIAADAGVNFAFGDTDFTSRST
LIGTPETLPLITDVYDDVTGKLSVDLIAERGQLFGSFGVNTAISSHISSLGANLKFGFRF
NT seq
4503 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgcatcaaaagtcgtataaaaaaaaatataacgcggtaactgccttggccgttggt
gcctttctgctaaccatgaacagcagtaatgtctttgccgatcctgtgattactgtcgat
ggacagtccaccacctgcactacaggtggtagtggaggctatcaatataatgatgtacat
aatacaaaagaagttctgcgtattacgccctctgcagatgtgaaagatgtacatatctct
tttgccgggagtgctgaagaggttaaagaggggatagaggtatttggggttgaagagggt
aaagccaatgtcttggggattggggtagaaattcttgctgacggaagagattctgccaag
cgtaatctggaagttgtttcagatgccaatatcacccttgatctgcacaatgaatccggt
gaaggtattgcggcaggtatttttgtgcccgtaggtgagagtgttgccgatgattctcat
attcttgtcgagaataagggacgtattcttgcaaaagagtctctaagcagtagcccaaat
cacaatgttggtatggtggttgagcgacaagatagtactggggaaaatttagctgtagta
atgagaaattctggcaccattgatgtatccactgaccaggaggcactgggcatgtggtct
gaaggcgttggacatgctggggatattctcacccttaacaatgccgcagatggcaagatt
attgtcagtgactctgatagcatagccatggggtccggcgcgccctatgtcagcccccta
ggtgatcaacatgaccgggatagtatcgacagtgaggagccggtgatcgggattacaatg
ctcaataaagggacaattagcgttgttcatggtggcgtaattacgggtacccatgcaggg
aaaaagctggatggccatcacacccgggggatgagaggtaccggcgggaattttattgta
aacagtggcagcatactgggtggagaagacaccattgtcacagccattgatggtaatggt
gagggttcaaccactatcaactctggagtaattgatctgaagggcaactactccgtaggt
atgatgagtgatccctatactcataccgagaacaggggaaccatcactgtctctcaatcg
gtggatgatgtggatcattcgccttccagtgccatgaagtctgtctattatcctgccgct
ggtgaagagatgtctgatccagccttagatatggctcttaataccggtaccggcacaatt
aaactgggtgggggggcaatcggttttgagctggtaagtagagatgcctttgaggaccag
gaggatgcacctgtccatatgactgatgccttggggattaacctcggcgaaatcagctca
ttttccccccttgtcggagaagatcctgccccggccaagtcttttagggttactggtggc
ggtgctgtcggggttaatgctgcagatcttgctgataaggtacagctcagagagggtggt
aattttctcctcattggtaatcccgaaggggcggagaagactatcgccagaatacaggta
agggacccaggtgatgccacctatgaaggtcattcggctaattcctggattcatgtgggc
atggatgcagaggataaaaaagctcttgcaggctcaaaatttaatgagattagggggtac
ttgaacagtcccgcaaactttgccattaaaagaattcagttacagggtaatgctgttgag
tccgagcatgacaatcagcatgctcatctcagcgtagctgacggcgcaactgtttcagtt
ggaaaatttgatttgaccaatgctcatatcgtcacccaggacagttctcaggctaagatt
agtaatctgaacctttatggccagaataaaatcagtgtaagagatacctctcatctgact
gtcgagacagtaactgcgccttatcatacaaattccgctattgaagtggagaaaggtgca
gttttaaccacctcctacgatttattggcaacggggagttctatagcagataccagtgaa
ttctcttttgctggtcagggaactattgatcttgttagttctgatgtttatgaccaagag
agaatcacttcttttgaaactagcttcaaaagccaatattctgattttaaaggaagtttc
ttatatagtggctttgatatgggtgatgggcctatcgaccttgggctggctgaaatcata
gacagtcctgaaaaggaaataaagctgactgttcctgaggactctgttgacaagactcaa
atctcttttgctaagggcacaccgatgggggcgcaaagctatgaacttcccgataccgtt
gcggaagttaaggtgagtaaggggacagtgctttcccttagggggagttctagtggagaa
gaatccctgctaaaaggtggggcagaggaaaaatctgtgaatgttggtggaggaagtgtt
cttaatcttggcgccaaaggtgaggttgcaaccgagaaaaggactcagggaacgcttgac
gctaaggttgagctggttgcagctgacgactcttcggctccaaaaaccgagcttaatgtt
agaaatggagatttttccatcacggctttaacagcccaaagtggaacgactgttaatatt
ggtgatagccaggggcaggggcaaggctcgttggcccttgaaacagcatcacttggtggc
aaagtaaacattaaaaagggaactctttccgtcaaggaattaacagccacagaagagacg
gttattaatattggtaatagtcagggccaaggctcgctggctcttgaaacagcgtctctt
aatggagctatgctctttgccgatcccaattggttagatagtacggaacttgctaaagct
aaagatgcctcccatgtaagcattgttaattttggaactggtgctgatagtaatgttatt
aacggccatttagtggctggacaaaattctattattgccctgggtacaaccgatgctggt
gatgttgataatattgttaaaaaaatcacagaggacaataacacaacctggggccgcact
ggggtaacagctgccgtctatcttgatggcccttataaagttggtgctgccggctccctt
accgtagatggttctcgcgtcacggcgccaactggggcagatgtaccagttggcggaaca
gctacatttgctgacaattctctgttggtggttgatgtaaccaatctggctggacaacct
gctattactgcggatacggtaactatttccaacaaggcatttgtaggtgttaagggtgca
cttgtcggggaaaaatataccatgacaagtactggcgataactggctactggctaatatc
tatctttataaccaactccaggaagttgcttctttagttgacggtagttttacgactaaa
agtgccggtaccgccgccaccctctatggtgctcggggaaatactgcaagcttcctgact
aattacaacgaacgtggttatgaagtgcttggagttacatccaccaattatatgaagggt
attttgcgtggcgctagcccaacaagcggcggacaggcaacggaggcatctgccaatatt
gccggagttggtggtattgcccatgtaaataccattgcctctgctctggtacttgatctc
gcccagaaacacacggatataaccggtgattacagcacaggtatctattttcaacctctt
tatcaaaaaagcgatattagcggtatgaatataggtaactatagcaccgatatggatatt
gatctttacggtgcagccttaggtgctgatagcgtgcttggtgattttctctacggtgga
gccttcacctatggtgctggtaaggtatctggtgaaggatttacatcttctgccgataca
gacagtgatttctacggcctaaccatgtatggagcttacaacctctctaatgctatgcag
attagtgtggatgctctttatacagcaatgtcttctgacacaagatattcaactctcaag
gccgatggcattgactcctatgtacttggtacgggggtaaaggctagttatctgtttgag
ctgggagataccgttgtcagcccatatgctggtatgcgttatcaatattataagcaagat
gcttatacaaacgatgtttttgccgtaaatgcaagcagcatggacacctggataatccct
atgggtgttaagtatatgtataagtttgccgcagctgacagtggattgcaatttaacatt
gctgctgatgccggggtgaattttgcctttggtgataccgattttaccagcagaagtacc
ctgattggcacaccggagactttacctttaataacagatgtttatgatgatgttaccggc
aaactgtctgtcgacctgattgccgaaagaggacagcttttcggtagcttcggcgtaaac
actgcgatctcttcgcatattagcagtttgggtgcaaacctgaaattcggcttccgtttc
taa
DBGET
integrated database retrieval system