Glaesserella sp. 15-184: CJD39_05855
Help
Entry
CJD39_05855 CDS
T05643
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
gle
Glaesserella sp. 15-184
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gle00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
gle02000
]
CJD39_05855
Transporters [BR:
gle02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CJD39_05855
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
YadA_head
ESPR
YadA_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUI66129
LinkDB
All DBs
Position
complement(1254535..1262874)
Genome browser
AA seq
2779 aa
AA seq
DB search
MNKIFRVVWNHSTQTWVAVSELAKGKAKSSNSIDIAEVVNRSDKKWWTAGAISLLSILAT
NPIWAASSTGNGIVADVPSGTNTALNLAIGTATATGGIIDNGAAIAIGQRATATGYGVVA
VGDRVTATGSQSAVFGSNATANGLQSVAIGNDVKASGYGSIAIGGDDIGDKSSYTVAGKT
FSITNSAGQTVTYVSPVASGKGAVVIGALGQATGDFSSAIGANALAKAEGSTAIGSFSSA
TGVGSLAGGVNATASANSSTALGINSAASADFTTALGIDANASSANATALGANAKASQVG
ATAIGTNATASHQRTVAIGVDAKATFMNATAIGGLAQATKEDAIAIGALANTTGNSAIAI
GKSSNSTSQNSIAMGNDADAVSDNTLAFGAYSVANNTNAIAIGRTTHATAENAIAIGREA
KSALAGAVALGNASETGTSVPTTTLSYSFLNAAGDAVTATAACQTASSVVSVGKGNYARK
ITNVAAGTVSATSTEAINGSQLYNVVTNVGFNTQENGANKSRVNNNNIVNFVNGTYTAAN
VTGTGNTAVKFNVVTQGITSTNGVASVSGTTAGLATSADVVNAVNNTGFTLQANGASGSF
IKSGSTVSINKGSNIDVTKSGNNITVATSMTPTFTTITTTGDATVGGTLNMTNGKITNLD
NGTAAGDAVNLSQLKANTSKVVAGKNTSVTNTTSADGTTYTVNANDTSASVSTDSALLSV
NANGTKTVGDATVTDYKVSLAKGTFGTTTTGALTTATAGVATVADVATAVNAGYWKVGNN
ARTATAQIKFGDQVNFVNGSGTTSNVSGSSITFDVAVDGKTIELNSDGKLTVNASSLPKG
VSVEAGNHTTVTPSTTNGATVYKVDAEKTTVSAGSDAVTVTAGTKNANGVTDYVVDLNAS
TKAQLAKEESASAGNNNIVVTANGTKNGTNGTDYVVTLNNTLDLGTAGSVTMGNTKIDNS
GLTITGGPSVTNTGINAANKAISNVLAATSDDQAVNLAQLKANTTKVVAGNHTSVTNSSD
ANGITYTVNAEKTTASAGSDAVTVTAGAKNANGVTDYVVDLNATTKDQLAKADSALQNFT
TSVNGQTVETITKDNRDVNFVNGTGTTARNDSSNITFDVNKANLTTAKDGTVTSDAKGDN
FATAEDVADAINSASKAAKTEVVQGDNIVVTSETGANGQTIYTVKTADNLNVTSVTATKV
NATTVTAGDSVITTDGITINNGTQGKSVSLTKDGLDNGGNKITNVANGTAPNDAVNFSQL
QASSNAAKTEVVKGTNIASVTSETGTNGQTIYTVNANGTTASAGSTAVTVTGTAGANNVT
DFAIDLAQTTKESLSKADSAMQSFTTSINGTQVETINQSNTDVNFVNGTGTTARNDSSNI
TFDVNKANLTTAKDGTVTSDAKGDNFATAEDVADAINSASKAAKTEVVQGDNIVVTSETG
ANGQTIYTVKTADNLNVTSVTATKVNATTVTAGDSVITTDGITINNGTQGKSVSLTKDGL
DNGGNKITNVANGTAPNDAVNFSQLQASSNAAKTEVVKGTNIASVTSETGTNGQTIYTVN
ANGTTASAGSTAVTVTGTAGANNVTDFAIDLAQTTKESLSKADSAMQSFTTSINGTQVET
INQSNTDVNFVNGTGTTARNDSGNITFDVNKANLTTAKDGTVTSDAKGDNFATAEDVADA
INSASKAAKTEVVQGDNIVVTSETGANGQTIYTVKTADNLNVTSVTATKVNATTVTAGDS
VITTDGITINNGTQGKSVSLTKDGLDNGGNKITNVANGTAPNDAVNFSQLQASSNAAKTE
VVKGTNIASVTSETGTNGQTIYTVNANGTTASAGSTAVTVTGTAGANNVTDFAIDLAQTT
KESLSKADSAMQSFTTSINGTQVETINQSNTDVNFVNGTGTTARNDSSNITFDVNKANLT
TAKDGTVTSDAKGDNFATAEDVADAINSASKAAKTEVVQGDNIVVTSETGANGQTIYTVK
TADNLNVTSVTATKVNATTVTAGDSVITTDGITINNGTQGKSVSLTKDGLDNGGNKITNV
ANGTAPNDAVNFSQLQASSNAAKTEVVKGTNIASVTSETGTNGQTIYTVNANGTTASAGS
TAVTVTGTAGANNVTDFAIDLAQTTKESLSKADSAMQSFTTSINGTQVETINQSNTDVNF
VNGTGTTARNDSSNITFDVNKANLTTAKDGTVTSDAKGDNFATAEDVADAINSASKAAKT
EVVQGDNIVVSSETGTDGQTIYTVATAKDLNVNSVNLGNVVLNTNGLVFGNNGPSITFSG
INAGNKVITNVANGSISSTSTDAVNGSQLYAVTQTAVAAKTEVVQGDNIVVNSTTGANGQ
TIYTVSTAKDLVVDSVKSGDTTLNNDGLSINGGPQITKDGITGVADGDISPDSTDAVNGS
QLYDVQQAAKAAKTEVLAGNNIVVNSNVGSNGQTIYTVETAKDLTVDSITAGNTVLNNNG
LAINGGPSVTKTGIDAGNVKITGVATGTADTDAVNVKQLTDSITAAKTTVSSNDNSITVV
SSGNNHDLSVNTDGTSIRNGKNGLEVVKGEISTNDNGQAVVTSGDKSSLATTGDVVNAVN
NVSWTVAVGEVEGSNGNASSYSAKDNKVKAGDSVSVNAGNNIVISGSGKNINVAVSDKPT
FNSIQSNSVNIVDGPSINSDGINMNNKRITNVAPGRDAGDAVNVEQLNNAMANVNNKVHS
VDKNLRSGVAGAVAIGSLVQAYNPSDSLLAVGGGTYRGASALALGYSKVSDNGKIILKVT
GSVNNSGHYMGGASVGYKF
NT seq
8340 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaatttttagagttgtatggaatcactctactcaaacttgggttgcggtatct
gaattagcaaaagggaaagcaaaatcttcaaattcaattgatatagctgaggttgtaaac
cgttcagataaaaaatggtggacggcaggggctatttcgttattaagtatcttagcgact
aatcctatatgggcagcttcatcaacaggtaatggtattgttgctgatgtgccatcaggt
acgaatacagctttaaatttagctataggtacagcaacagcaactggtggaatcattgat
aatggtgctgctattgcaatagggcaacgtgctactgcaactggatatggtgtcgttgct
gtgggggatcgtgtaacagctacaggtagccaaagtgctgtttttggttctaatgcaaca
gcaaatggtctacaaagtgttgcgattggtaatgatgtaaaagcatcgggatatggctct
attgctattggtggtgacgatatcggtgataaatcatcttatactgttgcgggtaaaaca
ttctctattacaaacagtgctggtcagactgttacttatgtttctcctgttgcaagcgga
aaaggtgcggtagttattggtgcattggggcaggcgacaggagacttctcaagtgctatt
ggggcaaatgcgcttgcaaaagcagaaggttcgactgctattggttctttttcatctgca
acaggtgtgggtagcttggcgggtggtgtgaatgcaacagcaagtgccaatagttcaact
gcattaggtattaatagcgctgcaagtgctgattttacaacggctttgggtattgatgct
aatgcaagctctgcaaatgcaactgctcttggggcaaatgctaaggcaagccaagttggt
gcaacagcgatcggtactaatgcaactgcaagccatcaacgtactgtagctattggtgta
gatgccaaagctacatttatgaatgcaactgcaattggtgggctagctcaagcaactaaa
gaagatgccattgctattggtgcattggcaaatacgacaggtaactctgctattgctatt
ggtaaatcatctaattcaacgtctcaaaactctattgcaatgggtaatgatgcagatgca
gtatcagataatacattggcttttggtgcttatagcgtagctaataatactaatgctatt
gcaattggtagaactacacacgctacagcagaaaatgcaattgcaataggtagagaagcc
aaatcagctttagcgggtgctgttgctctaggtaatgcttcagaaacaggcacttctgtt
cctacaacgacattaagttatagctttcttaatgcagcaggagatgcagttacagcgaca
gcagcatgccaaacagcaagttcggttgtttctgtcgggaaggggaactatgctcgtaaa
attacgaatgtagctgcaggtactgtatcggctacatctaccgaagcgattaacggtagc
caactttataacgttgttactaacgtgggttttaatacgcaagaaaatggcgcaaataaa
tcacgtgtaaataataataatatcgtaaattttgttaatggcacttataccgcagcaaac
gtaacgggtacaggaaatactgcagtaaaatttaatgttgtaactcaaggtattacatcg
acaaacggcgtagcatccgtatcaggcacaactgcaggtttagctacttctgcagatgtg
gtcaatgccgtgaataacactggcttcactttacaagcaaatggtgcaagcggttcattt
atcaaatcaggcagcacagttagtataaataaaggatctaatattgatgtaaccaaatca
ggtaataatattactgttgccacatcaatgaccccaacctttaccacaattaccactaca
ggcgatgcaaccgttggcggtacattaaatatgaccaatggcaaaattactaaccttgat
aatggtacagcggcaggcgatgcggtcaatttatctcaattaaaagcaaatacatctaaa
gttgtcgcgggtaaaaatacaagcgttactaatacaacaagtgcagatggcacaacttat
accgttaatgctaatgatacgagtgcgagtgtttcaacagacagtgcattgcttagtgtg
aatgcaaacggcactaaaactgttggcgatgcaacggttacagattataaagttagtcta
gctaaaggtacatttggcacaacgactacaggagcattgacaacagctacagcgggcgtt
gcaactgttgcagatgtagcgacagcggttaatgctggctactggaaagtaggcaataat
gcaagaacagcaactgctcaaattaaatttggtgatcaagtaaactttgtcaatggtagt
ggtacaacatcaaatgtttcaggttcaagtatcacctttgatgttgcagtggatggtaag
actattgaacttaatagtgacggtaaacttactgttaatgctagctcattaccaaaaggt
gtgtctgttgaagcgggtaatcatactacagttacaccaagcacaactaatggtgcaaca
gtgtataaagttgatgcagaaaagacgacagttagtgcaggttcagatgcagtcactgta
acagcgggcacgaaaaatgctaatggtgtaacagactatgtggtggatttaaatgcaagc
actaaagcgcaattagcgaaagaagaatcggcatcggcagggaataacaatattgttgtt
acagcaaatggaacgaagaatggtaccaatggtacagattatgttgtgaccttaaataat
accttagatttagggacagcaggctcggtaacgatgggtaataccaagattgataacagc
ggtttaaccattacaggtggtccgagtgttacaaatacagggattaatgcagccaataaa
gcgataagtaatgtacttgcagcgacatcagacgatcaagcggtgaatttagcacaatta
aaagcaaatacaacgaaagtcgttgcaggcaaccatacaagcgtgacgaatagcagtgat
gcaaacggcattacttataccgtgaatgcagagaaaacaacggcgagtgcaggttcagat
gcagtcactgtaacagcgggcgcgaaaaatgctaatggtgtaacagactatgtggtggat
ttaaatgctacaactaaagatcaattagcaaaagcagattctgcgctacaaaacttcaca
acgagtgtgaatggtcagacagtggaaactatcactaaggataatcgagatgttaacttt
gtgaacggcacgggtacgacggcacgtaatgacagtagcaacattacctttgatgtaaac
aaagcgaatctcacgacagcaaaagatggcacggtgacatcggatgcgaagggagataac
tttgcgacagcggaagatgttgcagatgcgataaacagtgcgagtaaggcggcgaagacg
gaagttgttcaaggtgacaacattgtagtaacaagcgagacaggagcaaacggtcaaacg
atttacacggtaaaaacggcagataatttgaacgtaactagcgtgaccgcgacgaaagtg
aatgcaacgactgtgacggcgggagatagcgtcatcacaacagatggcatcactatcaat
aacggcacacaaggcaagtcagttagcttaacgaaagacggcttagacaacggtggaaac
aaaatcacgaatgttgcaaacggcacagcgccaaatgatgcggtaaactttagtcaatta
caggcatcatcaaatgcagcgaagacagaagttgtcaagggaacgaacattgcgtcagtc
acgagtgagacagggacgaacggtcaaacgatttacacggtaaatgcgaatggcacgacg
gcatcggcgggctcgacagcggttacagtcacgggtacagcgggagcgaacaatgtcact
gattttgcgatagacttagcacagacgacgaaagagtcgttatcgaaagcggacagtgca
atgcaaagctttacgacgagcatcaacggtactcaagtagaaaccattaaccaaagcaac
acagatgtgaactttgtgaacggtacgggtacgacggcacgtaatgacagtagtaacatt
acctttgatgtaaacaaagcgaatctcacgacagcgaaagatggcacggtgacatcggat
gcgaagggagataactttgcgacggcggaagatgttgcagatgcgataaacagtgcgagt
aaggcagcgaagacggaagttgttcaaggtgacaacattgtagtaacaagcgagacagga
gcaaacggtcaaacgatttacacggtaaaaacggcagataatttgaacgtaactagcgtg
accgcgacgaaagtgaatgcaacgactgtgacggcgggagatagcgtcatcacaacagat
ggcatcactatcaataacggcacacaaggcaagtcagttagcttaacgaaagacggttta
gacaacggtggaaacaaaatcacgaatgttgcaaacggcacagcgccaaatgatgcggta
aactttagtcaattacaggcatcatcaaatgcagcgaagacagaagttgtcaagggaacg
aacattgcgtcagtcacgagtgagacagggacgaacggtcaaacgatttacacggtaaat
gcgaatggcacgacggcatcggcgggctcgacagcggttacagtcacgggtacagcggga
gcgaacaatgtcactgattttgcgatagacttagcacagacgacgaaagaatcgttatcg
aaagcggacagtgcaatgcaaagctttacgacgagcatcaacggtactcaagtagaaacc
attaaccaaagcaacacagatgtgaactttgtgaacggtacgggcacaacggcacgtaat
gacagtggcaacattacctttgatgtaaacaaagcgaatctcacgacagcgaaagatggc
acggtgacatcggatgcgaagggagataactttgcgacagcggaagatgttgcagatgcg
ataaacagtgcgagtaaggcagcgaagacggaagttgttcaaggtgacaacattgtagtg
acaagcgagacaggagcaaacggtcaaacgatttacacggtaaaaacggcagataatttg
aacgtaactagcgtgaccgcaacgaaagtgaatgcaacgactgtgacggcgggagatagc
gtcatcacaacagatggcatcactatcaataacggcacacaaggcaagtcagttagctta
acgaaagacggcttagacaacggtggaaacaaaatcacgaatgttgcaaacggcacagcg
ccaaatgatgcggtaaactttagtcaattacaggcatcatcaaatgcagcgaagacagaa
gttgtcaagggaacgaacattgcgtcagtcacgagtgagacagggacgaacggtcaaacg
atttacacggtaaatgcgaatggcacgacggcatcggcgggctcgacagcggttacagtc
acgggtacagcgggagcgaacaatgtcactgattttgcgatagacttagcacagacgacg
aaagagtcgttatcgaaagcggacagtgcaatgcaaagctttacgacgagtatcaacggt
actcaagtagaaaccattaaccaaagcaacacagatgtgaactttgtgaacggcacgggt
acgacggcacgtaatgacagtagtaacattacctttgatgtaaacaaagcgaatctcacg
acagcaaaagatggcacggtgacatcggatgcgaagggagataactttgcgacagcggaa
gatgttgcagatgcgataaacagtgcgagtaaggcagcgaagacggaagttgttcaaggt
gacaacattgtagtgacaagcgagacaggagcaaacggtcaaacgatttacacggtaaaa
acggcagataatttgaacgtaactagcgtgaccgcaacgaaagtgaatgcaacgactgtg
acggcgggagatagcgtcatcacaacagatggcatcactatcaataacggcacacaaggc
aagtcagttagcttaacgaaagacggcttagacaacggtggaaacaaaatcacgaatgtt
gcaaacggcacagcgccaaatgatgcggtaaactttagtcaattacaggcatcatcaaat
gcagcgaagacagaagttgtcaagggaacgaacattgcgtcagtcacgagtgagacaggg
acgaacggtcaaacgatttacacggtaaatgcgaatggcacgacggcatcggcgggctcg
acagcggttacagtcacgggtacagcgggagcgaacaatgtcactgattttgcgatagac
ttagcacagacgacgaaagagtcgttatcgaaagcggacagtgcaatgcaaagctttacg
acgagcatcaacggtactcaagtagaaaccattaaccaaagcaacacagatgtgaacttt
gtgaacggtacgggtacgacggcacgtaatgacagtagtaacattacctttgatgtaaac
aaagcgaatctcacgacagcgaaagatggcacggtgacatcggatgcgaagggagataac
tttgcgacggcggaagatgttgcagatgcgataaacagtgcgagtaaggcagcgaagacg
gaagttgttcaaggtgacaacattgttgtgagtagcgagaccggtactgatgggcagact
atctacactgttgcaacagctaaagatctcaatgtaaatagcgtgaatttaggtaatgtt
gtattaaatacaaatggtttagtctttggcaataatggtccaagcatcacgttctctggc
attaatgcagggaataaagtgattactaatgttgcgaatggctctatttcatcgactagt
acagatgcagttaatggaagccagttatatgctgtaactcaaacagcagtagcggcaaaa
actgaagttgtacagggagataacatcgttgtaaacagcacaactggagcaaatgggcaa
actatttatacggtatcaacagctaaagatcttgttgtagatagtgtgaaatcaggagat
acgacattaaataatgatggtttaagtatcaatggtggaccgcagatcacaaaagatggg
attactggtgttgccgatggtgatatttctccagatagcacagatgcagtaaacggtagc
caattgtatgatgttcagcaagcggcgaaagcggcaaaaactgaagtgttagcaggaaat
aacattgtagtaaatagtaatgtgggaagtaacggacagactatttatacagttgaaact
gcaaaagatttaactgtggatagcataactgcaggtaataccgtattgaataataatggt
ctagctattaacggtggtccaagtgttactaaaacaggtattgatgcaggtaatgtgaaa
attacaggcgttgcaactggtacagcagatacagacgcagtaaatgtgaagcaattaaca
gactcgattaccgcagcgaaaacaacggtttcatctaatgataattctattactgtagta
tcaagtggtaataatcacgatctatctgtaaatacagatggtacttctattcgtaatggc
aaaaatggcttagaagttgtgaaaggtgaaatcagtacaaacgataatggtcaagcagtt
gtaacttcaggcgataaatcttctcttgcaacaacaggggatgtagtaaatgctgtgaat
aatgtttcttggactgtggctgtaggcgaagtagaaggctctaatggtaatgcaagtagc
tattcagctaaagataacaaagttaaagctggagattcagtttctgtaaatgcaggtaat
aatattgttattagcggttcaggtaagaacattaatgttgcggtttcagataagccaaca
tttaatagtattcagtctaattcagttaatatcgtagatggtccatcaattaactctgat
ggtattaatatgaataataagagaattacaaatgttgcgcctggtcgtgatgcaggagat
gccgtaaatgtagagcaattgaataatgcaatggctaatgtcaataataaagttcattca
gtcgataagaacttacgtagtggtgttgctggtgcagtggcaattggctctttagttcaa
gcctataatccaagcgattcattattagcagttggtggtggtacctatcgtggtgcgtca
gcacttgccttaggttattctaaagtttctgataatggaaaaatcatcttgaaggtaact
ggtagtgtgaataactctggtcactatatgggtggtgcaagtgtaggatataaattctaa
DBGET
integrated database retrieval system