Gardnerella vaginalis 409-05: HMPREF0424_0590
Help
Entry
HMPREF0424_0590 CDS
T01146
Name
(GenBank) putative ATP synthase F0, A subunit
Organism
gva
Gardnerella vaginalis 409-05
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_trans_2_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADB14598
LinkDB
All DBs
Position
644347..647748
Genome browser
AA seq
1133 aa
AA seq
DB search
MDSITAHNLTFEDEVLQVLSSAKDAHPHDVDSSIMAMMCVERDTRFYADTLHAVLSQSIL
PGTLVIVDCASRVKQTMQTNLQIKINSSKLAGAINTRKSLLQNANNIDSNNAIDSDSKYR
PNTNRVNNTRVNNSENKSVHIIIIPISYAHSFGDAIEKSLRKILPCAGVSALWLLHDDSR
PADFHCLEYLRETWRNTPTASVLGAKQVDWQGNILHNVGMYAWRHGVHTLTVDGEPDQEQ
YDGRGDVYAVSLAGALVTLTAWQTLRGTQPWMTTFGESRDFCRRVCLSGGRVVVVPSARI
AHRRARLEGIRTRNGDARNHNNSGSKYGVAASLVAKQRYKYTDISIFLWPLIWILSLPAC
FVGALHSLFAKHPYIAWIRLLLPWLAIMQLPRAVFARRRVARNTRVPLKRLVPLIADRHQ
VARWRDRSSAFQAQQHFVLLSPLAKRHLHIRVLRRWSAVILASLLLFAVILNLYGSPWRE
ILSGASWNAQQWLPTGADFNQLWNSAIGAWVPDDGFGPAIPPAPWLSIWAIASIVVGANP
LLAVTLMFFLAAPAMCLSFWALAGVFTRSDTVRVCAGICWTMIAIAFGLFARGDLPMLMT
MAFLPAAFAFAFHAVGMYVTEDPVRPVKSTQCAACAALCFMVPVAAEPQLVLPLIVIFIA
SFIMVRSHRIMFALMPIPSIIVLLPTIGSAIRYGESGMWRQLFSSMALPLRSVQGAPRVS
DYADVLLHAFNMASPNVEINMPLMSLRTIIMVIFAILAVVMAVTSLTLPFALRVSRMMWV
VIISGMLLSLIAARVVVASDISGPVAASVLPGVALSTVGILSCMCMVAGQAVRRFEPLRT
SKESESQIFDNYKTRASRRAAMRRSAAQLLQRIIRIARAVLASSMLTMAVLLGLFAVLSG
PATSICANNNELPMVVSDYLRKDDTRRILALRAQSSHDLSISIMRTSKGDAIDESPALRV
RQVMFGDSSSNKAIYRASAQLLSHADNGAISTLKQLGIGGIYIVNSSENKQVSHKTSMSI
QQLLHPSVQTVSNVNKEATEQLIAHVNASDGTQLVVSSPQGTYCRFDGVPDSKSLSSTSP
YYRSRPLAWRVPWIIVSSMVLLLYCIVAVPRFGGHAMIERSDDRHEEELDELA
NT seq
3402 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcgataaccgctcataatcttacatttgaagacgaagttttacaggtgctgtca
tctgcgaaagatgcgcatcctcatgatgtggattcgtccattatggcaatgatgtgtgtg
gagcgagatactcgtttttatgctgatacgttacatgcagtactaagtcaatcaattctt
cctggaactttagtaatagtcgattgtgctagtcgagtaaagcagactatgcaaacgaat
ttacaaataaaaattaattcatctaagcttgcgggagcaattaatactaggaaatcatta
ttgcagaatgctaataatatcgattccaataatgcaattgatagcgattcaaaatataga
ccaaatactaatcgcgtaaataatactcgcgtaaacaatagtgaaaataaatctgtacac
ataattattattcccatttcttatgctcattcttttggagatgcaatagaaaaatctttg
cgcaagattttgccttgtgcaggagtttctgcattatggcttttgcatgatgattctcgt
cctgcagacttccattgcttagaatatttgcgtgaaacttggcgcaatactccgactgca
tcagtattgggagctaaacaagttgattggcaaggaaatatcttgcacaacgttggaatg
tatgcttggcgtcacggtgttcatactcttactgttgacggcgagccagatcaagaacag
tatgatgggcgtggagatgtgtatgcagtatcgctagcaggtgctttagtcacattaact
gcatggcagactttacgcggtacgcaaccatggatgacaacttttggcgaatcaagagat
ttttgtcgtagagtatgtctatctggaggtcgtgttgttgtagttccttcagctcgtatc
gcacacaggcgtgcaaggttagaaggtatccgtactcgtaacggtgatgctagaaatcat
aataattcaggatctaagtatggtgtagcagcttctctcgtagctaagcagcgttacaaa
tacactgatattagtatttttttgtggcctcttatatggattcttagtttgcctgcttgt
ttcgttggtgctttgcattcgctgtttgccaaacatccttatatagcgtggattcgtctg
cttttgccatggcttgctattatgcaattacctagagcagtttttgctcgcagaagggtt
gcaaggaatactcgtgttcccttaaaacgacttgttcctcttatcgcagatcgtcatcaa
gttgcacgttggcgtgatcgtagttctgctttccaagctcaacagcatttcgtgctgtta
agtcctctagcgaagcggcatttgcatattcgagtgttgcgtaggtggagtgctgttatt
cttgcatctcttcttctttttgcagtcatattgaatttatatggctctccatggcgtgaa
attttaagtggcgcttcttggaatgcacagcaatggttaccaacgggtgcagatttcaat
caactatggaattctgctattggtgcatgggttcctgatgatggttttggacctgcaatt
cctccagcaccatggctaagtatttgggcaatcgcatcaattgtggttggtgctaacccg
ttattggctgtcacattaatgttcttcttagctgctccagctatgtgtttaagtttttgg
gctcttgctggcgtatttacgcgctcggatactgtgcgtgtatgcgctggtatttgctgg
actatgattgctattgcttttggtttgtttgcacgcggtgatttgccaatgttaatgact
atggcatttttgcctgcagcatttgcttttgcgttccatgctgttggaatgtacgtaaca
gaagatcctgtgcgtcctgttaaatccactcaatgtgcagcatgcgcagcattatgcttt
atggttccagtagctgcagaaccgcagcttgttttgcctcttattgttatttttattgcg
tcgtttattatggtgcgctctcatcgtattatgttcgcgcttatgcctataccatcgata
attgttttgcttcctacaataggaagtgctattagatatggcgaatctggaatgtggcgt
caattgttctctagtatggctttgccattgagaagtgtgcaaggtgctccacgcgtaagc
gattacgctgatgttttgttgcacgcttttaatatggcttctcctaatgttgaaattaat
atgccattgatgagcttaagaacaataataatggtaatttttgcaattctagctgttgtt
atggctgttacgtcattaactttgccttttgctttgcgagtttctcgaatgatgtgggtt
gtgattatttccggaatgctgttatctcttattgccgctcgtgttgtagttgcatccgat
atttcaggacctgttgctgcaagcgttttgcctggagtcgcattatctactgtcggcatt
ttatcttgtatgtgcatggttgccggtcaagctgttcgacgctttgagccactacgtact
tcgaaggaatctgagtctcaaatttttgataactataaaactcgtgcaagtagacgtgct
gcaatgcgtcgttctgcggcacaattgttgcagcgcataattcgcatagcacgcgctgtt
cttgcaagtagcatgttgactatggcggttcttttgggtctttttgctgtattgagcgga
cctgctacatctatttgcgcaaataacaatgagctccctatggttgtttctgattatttg
cgaaaagacgatactcggcgaatacttgctttaagagctcaaagtagccatgatttgtca
atctctattatgcgaacatctaagggagatgcaatagacgaatctccagcacttcgtgtt
agacaagtaatgtttggtgattcatcaagcaataaagcaatatatcgtgcctcagcacaa
ttgttatctcatgcagataatggcgcaatttcaacgttaaagcaacttggaattggcggt
atttatattgttaatagttcagaaaataagcaggtttcccataaaacttctatgtcaata
caacaattgttacatccttctgtgcaaacagtgagtaatgttaacaaagaagctactgaa
caattaattgcacacgttaacgcttctgacggtacacaattggttgtttcatcaccgcaa
ggaacttattgcagatttgatggtgtgcctgattctaagtcgttgtcttctacatctccg
tattatcgatctaggcctcttgcgtggagagttccttggattattgtttcttctatggta
ttactgctgtactgtattgttgccgtgcctcgatttggcggacatgcaatgatagaacgt
tcagatgacaggcatgaggaggaattagatgaactggcataa
DBGET
integrated database retrieval system