Helicobacter pylori Rif1: C695_04310
Help
Entry
C695_04310 CDS
T02317
Name
(GenBank) outer membrane protein P1 (ompP1)
Organism
her
Helicobacter pylori Rif1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Toluene_X
ABC2_membrane_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFV43644
LinkDB
All DBs
Position
889728..891491
Genome browser
AA seq
587 aa
AA seq
DB search
MKNFSPLCCFKKLKKRHLIALSLPLLSYANGFKIQEQSLNGTALGSAYVAGARGADASFY
NPANMGFTNDWDENRSEFEMTTTVINIPAFKFQVPTTNQGLYSVTSLQIDKSQQNILGII
NTIGLSNILKALGNTAATNGLSQAINRVQGLMNLTNQKVVTLASKPDTQIVNGWTGTTNF
VLPKFFYKTRTHNGFTFGGSFTAPSGLGMKWNGKGGEFLHDVFIMMVELAPSMSYTVNKH
FSVGVGLRGLYATGSFNNTVYVPLEGASVLSAEQILNLPNNVFADQVPSNMMTLLGNIGY
QPALNCQKAGGDMSDQSCQEFYNGLKKIMGYSGLIKASANLYGTTQVVQKSNGQGVSGGY
RVGSSLRVFDHGMFSVVYNSSVTFNMKGALVAITELGPSLGSVLTKGSLNINVSLPQTLS
LAYAHQFFKDHLRIEGVFERTFWSQGNKFLVTPDFANATYKGLSGTVASLDSETLKKMVG
LANFKSVMNMGAGWRDTNTFRLGVTYMGKSLRLMGAIDYDQAPSPQDAIGIPDSNGYTVA
FGTKYNFRGFDLGVAGSFTFKSNRSSLYQSPNIGQLRIFSASLGYRW
NT seq
1764 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaacttttccccactttgttgttttaaaaagctcaaaaaacgccatttaatcgct
ttgagcctgcccttgctttcttatgctaatggctttaaaatccaagagcaaagcctgaat
ggcacggctttaggctcggcgtatgtcgctggggctaggggggctgatgcttccttttat
aacccggcgaatatgggctttactaacgattgggatgaaaacagaagcgaatttgaaatg
accaccaccgtgattaatatcccggcctttaagtttcaagtccctacgactaatcaaggc
ttgtattcggttacgagcttacaaattgataaaagccaacaaaatattttaggcatcatc
aacactatagggcttagcaatatccttaaagcgcttggcaatacggccgctaccaatggc
ttatcacaagcaatcaatcgggttcaagggcttatgaatctaaccaatcaaaaagtcgta
accctcgcttcaaaacctgacacccaaatcgtgaatggctggacgggaacgactaatttt
gttttacccaaattcttttataaaacgcgcacgcataacggcttcacttttggggggagt
tttaccgctcctagcgggttgggcatgaaatggaatggtaaagggggggaatttttgcat
gacgtgtttatcatgatggtagagcttgcccctagcatgagctatactgttaataagcac
ttttccgtgggcgtgggcttaagggggctttatgcgaccgggagctttaataacaccgtt
tatgtgcctttagagggcgcttcggttttgagcgcggagcaaattttaaatttacccaac
aatgtttttgccgatcaagtgccaagtaacatgatgactttattaggcaatattggctac
caaccagcgcttaattgccaaaaagccggtggggatatgagcgatcagagctgtcaagag
ttttataacggcttgaaaaaaatcatgggctatagcggcttaatcaaagcgagcgcgaat
ctttatggcacgactcaagtcgtgcaaaaatctaacgggcaaggcgtatcggggggctat
agagtgggttcgagtttgcgtgtgtttgatcatggcatgttttcggtggtgtataattct
tcagttacattcaatatgaaaggcgctctagtggctatcaccgagcttggcccttcttta
gggagcgttttgactaaaggcagcttgaatatcaatgtttcactcccccaaaccctaagc
ctagcctacgcccaccaattttttaaagaccatttaagaatagagggggtgtttgagcgt
accttttggagtcaagggaataaatttttagtaacccctgattttgcgaacgctacttac
aagggcttgagcggaacggtggcttcactagactctgagacgcttaaaaaaatggtaggc
ttagcgaattttaaaagcgtgatgaacatgggggctggctggagagacaccaacaccttt
agattaggggtaacttacatgggtaaaagcttgcgtttgatgggtgctattgattatgac
caagccccaagcccccaagacgcgataggtatcccagattccaatggctataccgtggct
tttgggactaaatacaattttaggggctttgatttaggcgtagcggggagtttcactttt
aaaagcaaccgctccagtttgtatcaatccccaaacattgggcaattgagaatctttagc
gcctctttaggctatcgctggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
