Helicobacter pylori Shi169: HPSH169_04295
Help
Entry
HPSH169_04295 CDS
T02038
Name
(GenBank) putative Outer membrane protein
Organism
hhq
Helicobacter pylori Shi169
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Toluene_X
ABC2_membrane_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFH99547
UniProt:
A0A0E0WB67
LinkDB
All DBs
Position
875344..877107
Genome browser
AA seq
587 aa
AA seq
DB search
MKNFSPLYFLKKFKKRHLIAWSLPLLSYANGFKIQEQSLNGTALGSAYVAGARGADASFY
NPANMGFTNDWGENRSEFEMTTTVINIPAFSFKVPTTNQGLYSVTSLEIDKSQQNILGII
NTIGLGNILKALGNTAATNGLQQAFNRIQGLMNLTNQKVVTLASSPDTQIVNGWTGTTNF
VLPKFFYKTRTHNGFTFGGSFSAPSGLGMKWNGKGGEFLHDVFIMMVELAPSMSYTVNKR
FSVGVGLRGLYATGSFNNTVYVPLEGASVLSAEQILNLPNNVFADQVPSNMMTLLGNIGY
QPALNCQKAGGDMSDQSCQEFYNGLKKIMGYSGLVKASANLYGTTQVVQKSNGQGISGGY
RVGSSLRIFDHGMFSVVYNSSVTFSMKGTLVAITELGPSLGSVLTKGSLNINVSLPQTLS
LAYAHQFFKDHLRIEGVFERTFWSQGNKFLVTPDFANATYKGLSGTVASLDSETLKKMVG
LANFKSVMNMGAGWRDTNTFRLGVTYMGKSLRLMGAIDYDQAPSPQDAIGIPDSNGYTVA
FGTKYNFRGFDLGVAGSFTFKSNRSSLYQSPTIGQLRIFSASLGYRW
NT seq
1764 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaacttttccccactctattttttaaaaaagtttaaaaaacgccatttaatcgct
tggagcttgcccttgctttcttatgccaatggctttaaaatccaagagcaaagtttgaac
ggcacggctttaggctcggcgtatgtcgctggggctaggggcgctgacgcttccttttat
aacccggcgaatatgggctttactaacgattggggtgaaaacagaagcgaatttgaaatg
accaccaccgtgattaacattccggcctttagctttaaagtccctacgactaatcaaggc
ttgtattcagttacgagcttagaaattgataaaagccaacaaaatattttaggcatcatc
aacactatagggcttggcaatatccttaaagcgcttggcaacacggccgctaccaatggc
ttgcagcaagctttcaatcgtattcaagggcttatgaatctaaccaatcaaaaagtcgta
accctcgcttcatcgcctgacactcaaatcgtgaatggctggacgggcacgactaatttt
gttttacccaaattcttttataaaacgcgcacgcataacggcttcacttttggggggagt
tttagtgctcctagcgggttgggcatgaaatggaatggtaaagggggggaatttttgcat
gatgttttcatcatgatggtagagcttgcccctagcatgagttatactgttaataagcgc
ttttccgtgggcgtgggcttaagggggctttatgcgaccgggagctttaataacaccgtt
tatgtgcctttagagggcgcttcggttttgagcgcggagcaaattttaaatttacccaac
aatgtttttgccgatcaagtgccaagcaacatgatgactttattaggcaatattggctac
caacccgcgcttaattgccaaaaagccggtggggatatgagcgatcaaagctgtcaagag
ttttataacggcttgaaaaaaatcatgggctatagcggtttagtgaaagcgagtgcgaat
ctttatggcacgactcaagtcgtgcaaaaatctaacgggcaaggcatatcggggggctat
agagtgggttcgagtttgcgtatctttgatcatggcatgttttctgtggtgtataattct
tcagttacattcagcatgaaaggcactctagtggctatcacagagcttggtccttctttg
gggagcgttttgactaaaggcagcttgaatatcaatgtttcactcccccaaaccctaagc
ctagcctacgcccaccaattttttaaagaccatttaagaatagagggggtgtttgagcgc
accttttggagtcaagggaataaatttttagtaacccctgattttgcgaacgccacttac
aagggcttgagcggaacggtggcttcactagactctgaaacgcttaaaaaaatggtaggc
ttggcgaattttaaaagcgtgatgaacatgggggctggctggagggacaccaacaccttt
agattaggggtaacttacatgggcaaaagcttgcgtttaatgggcgctattgattatgac
caagctccaagcccccaagatgcgataggcattccggattctaatggctataccgtggct
tttgggactaaatacaattttaggggctttgatttaggcgtagcggggagtttcactttt
aaaagcaaccgctccagtttgtatcaatccccaaccattgggcaattgagaatctttagc
gcctctttaggctatcgctggtaa
DBGET
integrated database retrieval system