Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100197308
Help
Entry
100197308 CDS
T01080
Name
(RefSeq) nucleoporin NUP42-like
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
zf-CCCH_4
zf-CCCH
zf_CCCH_4
Nucleoporin_FG
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100197308
NCBI-ProteinID:
XP_047145285
LinkDB
All DBs
Position
12:complement(3775052..3807522)
Genome browser
AA seq
463 aa
AA seq
DB search
MVICNFFLKGNCKFGNRCRNEHSQQGGAFGARPLFSSPQNDRYHYNKTTNVSVNEVKLPI
GNGEVSVQMIRKELQDWAINKVWPFSCFAVQRERNCLSGFVEISPEELRFEAYECKGTGL
QTYLEGVQNLTNQVLKRRNQLIKYDDKQLFTEINNQQSVQSAASTTDHFGNKSLFNNPYE
SSSQTSGKLFGNSSSSSANFFNLNNSSKEVFSMQAPNNSANIFGIQASNNNTNIFGMQAS
NNNTNSFFSKLTQSSSSGGLFNTKESEQNSTVVKNNLFSVSSSSENPFKSDTSLNFFSKN
LQPSEKGIIPNNTTSNFFNNNSTMAGSLNIFSALNSQSKPSSTDESGGVSSLNSTSMGLF
SNSGNRPDQNTDFSQVSTQPLNPFFSSQTSTQPTNPFLSSQVSTQVRPIQSLPIYEQLRV
YKPIQIENIFLIPLMTSDDIESFKACRFEIGKIPKCPPPIEFC
NT seq
1392 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttatatgcaactttttcctaaaaggaaattgcaagtttggcaatagatgtcgtaat
gagcactcacagcaaggtggagcatttggtgcacgcccactgtttagctctccccaaaat
gatcgatatcattacaacaagactacaaatgtgtcagtaaatgaagttaagttaccaatc
ggtaatggagaagtttctgtacaaatgataagaaaagagcttcaagattgggctataaat
aaagtttggccattttcatgttttgctgttcaaagagaaaggaattgtctgtcaggtttt
gtggagatttcaccagaagaactcaggtttgaagcatatgaatgcaaaggcacaggactt
caaacttatcttgaaggtgttcaaaatcttaccaatcaagttttaaagcgacgaaatcag
cttattaagtatgacgacaagcaattatttaccgaaatcaacaatcagcagtctgtccaa
tcagcagcatcaacaacagatcattttggtaataaaagtctttttaataatccttatgaa
agttcatcacagacatctgggaaattgtttggaaattcttcttcaagttctgcaaatttt
tttaatttgaataattcttcaaaagaagtttttagtatgcaagctcctaataatagtgca
aatatatttggcatacaagcctctaataataacacaaatatatttggtatgcaagcttct
aataataacacaaatagtttttttagcaaattaacacaatctagtagttctggtggatta
ttcaacactaaagaatctgaacaaaattctacagttgttaaaaataatttgttttcagtt
tcttcatcttcagaaaatccatttaaatcagatacaagtttaaactttttttctaaaaac
ttacaaccttctgaaaagggtatcattccaaacaatacaacttctaacttttttaataat
aattcaacaatggctggcagtttaaatatattttcagccttaaactcacaaagtaaacca
tcttcaacagatgagtcaggtggtgtttcttctttgaatagcacttcaatgggtttgttt
tcaaatagtggcaacagaccagaccaaaacacagatttttctcaggtttctacccaacct
ttaaatccatttttttcatcacaaacttctacgcaacctacaaatccatttttatcttca
caagtttccacacaagttcggccaatacaatcattgccaatttacgaacaacttagagta
tataaaccaattcaaatcgaaaatatcttcctaattccactgatgacttctgatgatatt
gaaagttttaaggcgtgtcgttttgaaattggaaaaattccaaaatgccctccacctatt
gagttttgttaa
DBGET
integrated database retrieval system