Ipomoea nil (Japanese morning glory): 109172491
Help
Entry
109172491 CDS
T04663
Name
(RefSeq) ATP-dependent DNA helicase pif1-like
Organism
ini
Ipomoea nil (Japanese morning glory)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PIF1
Pif1_2B_dom
Herpes_Helicase
AAA_30
AAA_16
AAA_22
AAA_5
ArsA_ATPase
UvrD_C_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109172491
NCBI-ProteinID:
XP_019177192
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
658 aa
AA seq
DB search
MIPSSFVLGNEGDPIRQIVDSTFPEYHSGKMDARQLESRAILAPTLDVVDEVNEYMNGMN
QASAITYLSCDSVCNCMGKPEIVWYAVWQHLSDDAQFNVRRQLQNRDFVLTDSHKTNFAL
VEIEKLLSTHGKSLKDYPEMPTANFGALNVIANRFIQEESAYDCGEQEKENQELVRQLIE
EQNVIYNEVLTDIDCQDGGLFFVYGYGGTGKTFLWRALSSALRFKSEIVLNVASSGMSSL
LLPGGRTAHSRFAIPISVNEDSTCNISHGSQLAELLVQTKLIIWDEAPMMHKFCFEALDR
TMRDLLRFINPRSYDMTFGGKTVVFGGDFRQILPVIPKGTRQDIVRASISSSYLWKFCKV
FRLTKNLRLRSVQSENEGKEIEEFAKWIANIGDGTIGSQRDGESEITVPEHLLLKCEDDP
IATIVDSTFPNFRLGIGNLSYLNDSAILAPTLDVVDAVNQYMNDHNPVEGKTYLSCDSVC
KSDSNVDMLANLHTPEFLNALRCSGVPNHALTLKVGSPVMLLRNIDHTLGLCNGTRLIVT
RLADHVLEGQIMCGTNAGTGVLIPRMSLTPSDPRLPFKFQQKQFPLMLSYVMTINKSQGQ
TLAKVELLKKPVFNHGQLYVAVSRVSNPRGLKILICGENVPCLSTTKNVVYNEAFNNV
NT seq
1977 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataccatcttcctttgtattgggaaatgagggcgatcccattagacaaattgttgac
agcacatttcctgaataccattctggaaagatggatgcaagacaacttgagagtagagcg
attctggctccaacgttagatgttgtcgacgaggtgaatgaatacatgaacggtatgaat
caagcctcagcaataacatatttgagttgtgattctgtttgcaattgcatgggtaaaccg
gaaatagtttggtatgctgtgtggcaacatttatcagatgatgcacaattcaacgtccgt
agacaactgcagaatagagattttgtgttgaccgattcgcacaagacgaactttgcctta
gtagagattgagaagctattatctactcatggtaagagtttgaaagactatcctgaaatg
cctacggcaaattttggggccttaaacgttattgcaaataggtttattcaagaagaatca
gcatacgactgtggcgaacaggagaaagagaatcaggaattggtaaggcaattaatagaa
gaacaaaatgtcatatacaatgaagttttaactgatattgattgccaagatggggggtta
ttcttcgtttatggttatggagggaccggtaagacttttttgtggcgagcactgtcttcc
gcattaaggtttaagagtgaaatagtgttaaatgttgcctctagcggcatgtcttcgctt
ttattacctggtgggaggactgcacattctcgatttgctataccgatatctgttaatgaa
gattccacatgcaacataagtcacggcagtcaactggcagagctccttgtgcaaaccaag
ttgataatatgggatgaagctccaatgatgcacaaattctgttttgaagccctagaccga
actatgcgggatctgttgcgcttcataaatccaaggagttatgatatgacatttggtggt
aaaacagttgtttttggtggcgatttcaggcaaattttaccagtaattccaaagggtacc
agacaggatatagttcgagcaagcattagctcatcatatctctggaaattctgtaaagtt
tttaggctgactaagaatctacgattgagaagtgttcaatcagaaaacgagggtaaggag
attgaggaatttgcaaaatggatagctaatataggtgacggaacaattggtagtcaacgt
gatggtgagtccgagattactgttccagaacatttgttgttgaagtgcgaggatgaccct
attgctacaattgttgatagcacattccctaattttagactgggaattggcaatttgtca
tatcttaatgatagtgcaattttagctccaacattggatgtggtagatgccgttaaccaa
tacatgaatgatcataatccggttgagggtaagacatacttgagttgtgattctgtgtgt
aagtcagattcaaatgttgacatgttagcgaatttgcacactccggaattcttgaatgcc
ttgagatgttctggagtaccaaatcatgctttgactttgaaagttggatcacctgttatg
ctattgcgaaatattgatcacacactaggattatgcaacggtacaaggttgattgttaca
aggttagctgaccacgtgctggaaggccagatcatgtgcggtacaaatgcaggaaccgga
gtattgattcctagaatgtcacttacaccgtcagatccaagattgcctttcaaatttcaa
caaaagcaattccctttgatgttatcctatgtcatgacaatcaacaaaagtcaaggacaa
acgcttgctaaagtggagttgttgaaaaaacctgtctttaaccatgggcaattgtacgta
gctgtttcaagagttagtaaccccaggggtttgaaaattttgatttgcggggaaaatgta
ccatgtcttagtacgactaaaaatgttgtgtacaacgaagccttcaataatgtataa
DBGET
integrated database retrieval system