KEGG   ORTHOLOGY: K14280
Entry
K14280            RNA       KO                                     
Symbol
U6snRNA
Name
U6 spliceosomal RNA
Pathway
map03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K14280  U6snRNA; U6 spliceosomal RNA
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K14280  U6snRNA; U6 spliceosomal RNA
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K14280  U6snRNA; U6 spliceosomal RNA
Spliceosome [BR:ko03041]
 Splicing related RNAs
  K14280 U6snRNA; U6 spliceosomal RNA
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small non-coding RNA
  Small nuclear RNA
   K14280  U6snRNA; U6 spliceosomal RNA
Genes
HSA: 101954271(RNU6-9) 101954275(RNU6-7) 101954278(RNU6-8) 103625684(RNU6-2) 124900488 124900632 124900883 124900887 124901516 124902331 124902335 124903414 124904107 124904109 124904694 124904727 124904986 124905264 124905326 124907960 124907961 124908124 26827(RNU6-1)
PTR: 112204222 112204345 112204352 112204445 112204513 112204523 112204531 112204534 112204729 112204730 112204820 112204831 112204964 112205059 112205206 112205314 112205317 112205416 112205527 112205544 112205800 112205802 112205824 112205985 112206110 112206115 112206130 112206339 112206548 112206617 112206688 112206789 112206793 112206957 112206958 112206963 112206970 112206980 112206981 112206999 112207040 112207116 112207120 112207123 112207125 112207127 112207137 112207461 112208315 112208550 112208551 112208554 112208708 112208733 112208734 112209019 112209025 112209042 112209075 112209174 112209270 112209572 112209975 112209988
PPS: 112436719 112436720 112436864 112436865 112436951 112436953 112437030 112437139 112437140 112437157 112437379 112437382 112437496 112437497 112437848 112438053 112438118 112438172 112438258 112438271 112438283 112438289 112438337 112438363 112438499 112438500 112438503 112438504 112438510 112438518 112438665 112438768 112439037 112439047 112439232 112439234 112439363 112439630 112439652 112439670 112439671 112439685 112439873 112440168 112440179 112440643 112440707 112440816 112440878 112440945 112440966 112441129 112441136 112441217 112441344 112441345 112441347 117976720 117976724 117977373 117978507
GGO: 115930249 115930396 115930398 115930399 115930505 115930508 115930509 115930632 115930748 115930997 115931175 115931177 115931377 115931517 115931520 115931522 115931526 115931808 115931883 115932112 115932128 115932151 115932152 115932209 115932447 115932449 115932450 115932454 115932455 115932456 115932466 115932467 115932788 115932789 115933402 115933433 115933686 115933687 115933813 115933926 115933927 115933938 115934099 115934377 115934400 115934423 115934435 115934534 115934716 115934733 115934767 115934772 115934775 115934781 115935077 115935540 115935541 115935557 115935751 115935882 115935948 115935967 115936176 115936438
PON: 112128688 112128977 112128978 112129133 112129311 112129314 112129316 112129319 112129507 112129737 112129745 112129747 112129859 112129862 112130037 112130038 112130046 112130051 112130261 112130446 112130557 112130904 112130910 112130919 112130922 112130946 112131022 112131042 112131079 112131082 112131092 112131093 112131347 112131408 112131766 112131938 112132237 112132239 112132245 112132543 112132544 112132545 112132797 112132805 112132819 112133188 112133195 112133229 112133241 112133343 112133344 112133345 112133527 112133532 112133533 112133947 112133975 112134448 112134548 112134555 112134729 112134734 112134767 112135383 112135564 112135703 112135886 112136046
NLE: 115830611 115830767 115830770 115830772 115831098 115831100 115831118 115831407 115831588 115831679 115831750 115831756 115831772 115831787 115831982 115831999 115832077 115832079 115832234 115832237 115832238 115832555 115832737 115832742 115833079 115833188 115833373 115833375 115833382 115833385 115833522 115833583 115833615 115833625 115834001 115834487 115834490 115834496 115834854 115834858 115834878 115835235 115835239 115835246 115835248 115835262 115835814 115836023 115836027 115836222 115836227 115836235 115836237 115836473 115836564 115836567 115836788 115836796 115836862 115836867 115837192 115837200 115837464 115837694 115837696 115838518 115838519 115838522
HMH: 116456386 116458128 116458201 116458203 116459565 116460578 116461591 116462190 116462191 116462795 116463055 116464660 116465836 116465902 116466097 116466115 116466118 116466264 116467608 116467614 116467621 116469944 116469947 116469952 116469957 116469973 116469997 116471983 116471984 116473913 116475958 116475972 116475984 116476001 116477069 116477096 116477452 116477623 116477627 116477630 116479736 116479847 116481389 116481391 116482683 116484324 116484430 116809756 116809771 116809778 116809789 116809796 116809806 116812297 116812425 116812428 116812429 116814076
MCC: 114670179 114670267 114670268 114670272 114670273 114670637 114670721 114670722 114670730 114671252 114671254 114671261 114671587 114671675 114671679 114671683 114672074 114672077 114672458 114672596 114672597 114672956 114672976 114673247 114673254 114673369 114673653 114673654 114673929 114673930 114674233 114674787 114674842 114674905 114674939 114675150 114675164 114675302 114675305 114676473 114676478 114677147 114677162 114677318 114677322 114677791 114677797 114678486 114678489 114678514 114678527 114678531 114679068 114679224 114679738 114679739 114679779 114679809
MCF: 123567046 123567047 123567051 123567052 123567317 123567400 123567401 123567403 123567409 123567739 123567743 123567847 123567849 123568133 123568221 123568223 123568227 123568230 123568562 123568563 123569003 123569318 123569320 123569340 123569573 123569682 123569935 123570151 123570154 123570155 123570408 123570820 123570908 123570935 123571418 123571431 123571560 123571562 123571612 123571950 123571955 123572553 123572729 123573137 123573149 123573708 123573713 123573735 123573745 123573751 123574189 123574729 123574735 123574771 123574799 123575449
MTHB: 126929885 126929963 126929964 126929966 126929970 126931857 126931961 126933225 126933237 126933248 126933343 126933344 126933348 126934601 126934606 126936636 126936637 126938136 126939987 126939995 126940109 126940933 126941628 126941631 126943643 126944441 126944680 126944753 126945169 126945170 126946951 126946965 126947099 126947101 126949389 126949395 126951734 126951738 126953971 126953981 126955779 126955815 126955819 126957687 126960150 126960152 126960163 126960192 126963531 126963535 126963536
MMU: 115486786(Gm25790) 115486822(Gm23103) 115486843(Gm22444) 115486850(Gm23445) 115486996(Gm26331) 115487003(Gm24445) 115487005(Gm22509) 115487332(Gm22286) 115487337(Gm23730) 115487341(Gm23248) 115487342(Gm22069) 115487553(Gm22623) 115487554(Gm26239) 115487555(Gm24019) 115487561(Gm22911) 115487563(Gm25626) 115487572(Gm23041) 115487575(Gm26122) 115487579(Gm22950) 115487583(Gm22260) 115487587(Gm23422) 115487706(Gm24267) 115487710(Gm22114) 115487713(Gm25457) 115487843(Gm25930) 115487845(Gm23507) 115487933(Gm24149) 115487937(Gm23506) 115487940(Gm25929) 115488243(Gm24870) 115488249(Gm25020) 115488447(Gm25670) 115488453(Gm23622) 115488582(Gm26178) 115488731(Gm22977) 115488866(Gm23649) 115488867(Gm22474) 115488968(Gm23610) 115488969(Gm22886) 115489063(Gm25431) 115489068(Gm22113) 115489158(Gm24535) 115489166(Gm24268) 115489173(Gm26441) 115489184(Gm23794) 115489274(Gm22057) 115489275(Gm25793) 115489278(Gm23678) 115489281(Gm25207) 115489324(Gm24592) 115489660(Gm25258) 115489667(Gm23369) 115489669(Gm23503) 115489754(Gm22505) 115489762(Gm26166) 115489764(Gm23096) 115489765(Gm23941) 115489770(Gm22458) 115489772(Gm25039) 115489773(Gm25199) 115490098(Gm25137) 115490229(Gm24538) 115490326(Gm22450) 115490328(Gm25672) 115490330(Gm22308) 115490511(Gm23924) 115490515(Gm23648) 19862(Rnu6)
TGU: 115490921
LSR: 116184284
SCAN: 115484689
PMOA: 120496024
OTC: 121342742
OMA: 130260694
CCAE: 111937596
CCW: 120410994
ZAB: 113460572
MMEA: 130578184
HRT: 120761151
TALA: 116963578
ACAR: 114818416
AROW: 112965677
DNE: 112988110
PSS: 112545286
CAUA: 113039244
CGIB: 127964272
PPRM: 120472499
MAMB: 125268021
MASI: 127416549
EEE: 113567692
CHAR: 116223952
SLUC: 116053598
ECRA: 117941375
ESP: 116670717
PFLV: 114553411
GAT: 120819887
PPUG: 119199056
AFB: 129100438
CLUM: 117730200
CUD: 121527451
OAU: 116334150
OML: 112162717
XHE: 116720860
CTUL: 119789763
GMU: 124861021
KMR: 112450052
NWH: 119423272
AOCE: 111571429
MCEP: 125000465
XGL: 120795977
OGO: 124021700
OKI: 116359051
OKE: 118381200
SALP: 112073428
ELS: 114830100
AANG: 118207147
SPU: 115927792
LPIC: 129266068
AJC: 117105130
DME: Dmel_CR31379(snRNA:U6:96Aa) Dmel_CR31539(snRNA:U6:96Ac) Dmel_CR32867(snRNA:U6:96Ab)
DSE: 6607767
DYA: Dyak_GE27273(Dyak_snRNA:U6:1)
DAN: 6508076
DPO: 6898013
DPE: 6594259
DMN: 117187592
DGR: 6564012
DMO: Dmoj_GI25471(Dmoj_snRNA:U6:1) Dmoj_GI25472(Dmoj_snRNA:U6:2) Dmoj_GI25473(Dmoj_snRNA:U6:3)
DNV: 115562999
DHE: 111592401
DVI: 6629878
CCAT: 111591612
BOD: 118683794
TDA: 119686609
MDE: 131800681
LSQ: 119601896
ECOE: 129943616
HIS: 119650510
ACOZ: 120954300
AMER: 121591196
AFUN: 125766683
AALI: 118462192
BCOO: 119085563
AME: 113218703
ACER: 114577229
ALAB: 122716467
ADR: 116185504
AFLR: 116415250
BVK: 117232316
BAFF: 126919056
NMEA: 116424424
CGIG: 122396026
SOC: 113003465
HST: 112588284
CFO: 112638565
FEX: 115240466
OBO: 113562223
PFUC: 122518447
VPS: 122629734
VCRB: 124423993
NVI: 116415874
TPRE: 111694263
LHT: 122497724
LBD: 127276770
DAM: 114841268
VCAN: 122411751
CCIN: 112494226
DPA: 125503600
APLN: 112904536
PPYR: 116165201
OTU: 111420672
BANY: 112046097
MJU: 123869495
MCIX: 123653351
PBX: 123713879
ZCE: 119836556
CCRC: 123698290
LSIN: 126972261
HAW: 126055613
HZE: 124634186
OFU: 114357416
CCRN: 123294344
AGS: 114120274
RMD: 113555337
ACOO: 126832973
NLU: 120350736
HAME: 121861805
ESN: 126987054
HAZT: 125177596
DSV: 119432040
RSAN: 119372821
RMP: 119160239
TUT: 112538845
UDV: 129227073
CEL: CELE_C28A5.7(C28A5.7) CELE_F54C8.10(F54C8.10) CELE_K09B11.19(K09B11.19)
PCAN: 112554745
CRG: 117683333
PMAX: 117324693
MCAF: 127722480
MMER: 123537669
LAK: 112041419
NVE: 116603348
EPA: 114574955
AMIL: 114957425
PDAM: 113679634
DGT: 114516393
ATH: AT3G13855(U6-26) AT4G04615(U6.4) AT4G08755(U6.5) AT5G46315(U6-29)
BRP: 117126363
CCAJ: 114914994
PSAT: 127090054
ZJU: 112489163
MNT: 112092809
TWL: 119981562
VRI: 117911931
SMIL: 130987279
ATRI: 130804910
MING: 122063356
SVS: 117834887
SCE: YNCL0006W(SNR6)
KLA: KLLA0_F19950r(SNR6)
LTH: KLTH0G12804r(SNR6)
ZRO: ZYRO0D06292r(SNR6)
CGR: CAGL0M11652r(SNR6)
DHA: DEHA2D15774r(SNR6)
CAL: CAALFM_C305500WA(SNR6)
YLI: YALI0F07549r(SNR6)
 » show all
Reference
  Authors
Yu AT, Ge J, Yu YT
  Title
Pseudouridines in spliceosomal snRNAs.
  Journal
Protein Cell 2:712-25 (2011)
DOI:10.1007/s13238-011-1087-1
Reference
PMID:3360322
  Authors
Kunkel GR, Pederson T
  Title
Upstream elements required for efficient transcription of a human U6 RNA gene resemble those of U1 and U2 genes even though a different polymerase is used.
  Journal
Genes Dev 2:196-204 (1988)
DOI:10.1101/gad.2.2.196
  Sequence
[hsa:26827]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system