Lacinutrix sp. 5H-3-7-4: Lacal_2527
Help
Entry
Lacal_2527 CDS
T01533
Name
(GenBank) type III restriction protein res subunit
Organism
lan
Lacinutrix sp. 5H-3-7-4
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ResIII
Helicase_C
DEAD
SWI2_SNF2
AAA_22
ATPase_2
AAA_30
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEH02368
UniProt:
F6GIX9
LinkDB
All DBs
Position
complement(2807712..2809265)
Genome browser
AA seq
517 aa
AA seq
DB search
MKVTALELEERQEGKSLYSYQQGAINKIFKCFEEAPEDYHLLYQLPTGGGKTVIFSEIVR
QYLKHHKKQVLVMTHRIELCKQTSNMLSEFGVSNKIVDSKADLSDQGDFNCFVAMVETLN
NRLNDNKLDISDIGLVIIDEAHYNSFTKLFKFFEKSFVLGVTATPLSSNINLPMKDNYDE
LIVGETIQSLIDNEFLARAEVFSYNVGLTSLIVGANGDYTVKSSEDLYTNTDMLTKLIQA
YEERCKGKKTLIFNNGINTSLHVYDTFRRAGYPIAHLDNNNTKKERKAILKWFKETPDAV
LTSVSILTTGFDEPTVDCIILNRATKSLTLYYQMIGRGSRILKNKNKFTVIDLGNNLHRF
GPWGSDLDWHKIFRSPNFYLDGILSDEDLEENFRYEMPEELRAEFAKSEDVYFDVKAMYI
RSVREGDSSKVILERSIKHHAKMCIENSEDLWDALGLAKMLKDDIDYRIQRYTKCISKST
FNFVEWLKDDYKKKLNAYLRANFDEMFEEIHGYPPED
NT seq
1554 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagtcacagctttagaattagaagaaagacaagaaggcaaaagtttatatagctac
caacaaggagcaattaataaaattttcaagtgttttgaagaagcacctgaggattaccat
ttattgtatcaattaccaactggtggtggaaaaacagttattttctctgaaattgttcgc
caatatttaaaacaccataaaaagcaagttttagtaatgacgcataggattgagctttgt
aagcaaacatctaatatgctgtctgaatttggtgtaagtaataaaattgtagattctaag
gcagatttaagtgatcaaggtgattttaattgctttgttgccatggttgaaaccttaaat
aataggttaaatgataacaaacttgacattagtgatattggtttagttattattgatgag
gcgcactacaactcatttactaaactatttaagttttttgagaaatcttttgtattagga
gtaacagcaacaccattaagtagtaatattaaccttccaatgaaggataattatgatgag
cttattgttggagaaactattcaatctttaatagataatgagtttttggcacgtgccgaa
gtgttttcttataacgtaggtttaacctctttaatagttggtgcaaatggtgattatact
gtaaaatcatctgaagatttatatacaaatacagacatgcttactaagcttattcaagct
tacgaagaacgctgtaaaggaaagaaaaccttaatatttaacaacggtattaatacatcg
ttacacgtttatgatacttttaggcgagcaggttacccaattgctcacctagataataat
aatacaaaaaaagagcgtaaagctattttaaaatggtttaaagaaacacctgatgcagta
ttaacttcggtaagtattttaacaactggatttgatgaacctactgtagattgtattatt
ttaaatagggcaacaaaatctttaacgctttactaccaaatgattggtcgtggatcgcgt
attttaaagaataaaaacaaatttactgttatagatttaggtaacaaccttcaccgtttt
ggaccttggggaagcgacttagattggcacaaaatatttagatctccaaacttttactta
gatggtattttaagtgatgaagatttagaagaaaactttaggtatgaaatgcctgaagaa
cttagagcagaatttgctaagtctgaagatgtgtattttgatgttaaagccatgtacatt
agatctgtaagagaaggtgattcgtctaaagtaattttagagcgctcgataaagcatcat
gctaaaatgtgtatagaaaacagtgaagatttatgggatgctttaggcttagcaaaaatg
ctaaaagacgatatagattaccgtatacaacgttacacaaaatgtataagtaaaagtact
tttaactttgtagaatggttaaaagatgattacaaaaagaaattaaacgcttatttacgt
gctaatttcgatgagatgtttgaagaaattcacgggtatccaccagaagattaa
DBGET
integrated database retrieval system
