KEGG   Lactobacillus crispatus: LCRIS_01172
Entry
LCRIS_01172       CDS       T01222                                 
Name
(GenBank) ATP-dependent helicase/nuclease subunit A
  KO
K16898  ATP-dependent helicase/nuclease subunit A [EC:5.6.2.4 3.1.-.-]
Organism
lcr  Lactobacillus crispatus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:lcr00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:lcr03400]
    LCRIS_01172
Enzymes [BR:lcr01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     LCRIS_01172
DNA repair and recombination proteins [BR:lcr03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    AddAB pathway proteins
     LCRIS_01172
SSDB
Motif
Pfam: UvrD-helicase UvrD_C AAA_19 UvrD_C_2 Viral_helicase1 DEAD AAA_12 AAA_16 ResIII AAA_30 PYC_OADA
Other DBs
NCBI-ProteinID: CBL50619
UniProt: D5GXW0
LinkDB
Position
complement(1173491..1177099)
AA seq 1202 aa
MSQFTKEQQQAIDDRGHDILVSASAGSGKTTVLVERVLREILSGTQVDELLVITFTKAAA
EEMKTRIKQALSAELAKPGSNRRYLREQLNQVDTANISTIDAFCLEVIHRFYYSVNLDPS
FSILTDDTQAALLKERALREIEGEFLEEKDVNFRHFYDNFAGDRDADSPRDLLLDLYDFA
MAKPEYRSWLKKLVDVYVVNGSIVESDLWQKQIKPYLLTSIGDLQGKINDYLENPVIETK
ELAKAKEAFTLFAQNLDHFVFALENDADYDKQRELLRSCVFTANYRKSSKWDEDVLNFYE
DLQKLKDEAKNLVFDTFTSFFAVDEQEQIKVMKRGQKIVAAIAKSELALIDRFNKLKRSE
NLLDYSDMEQLAYQILSQDTSNSQMAREFYQNKFKEILIDEYQDINALQENIIQQIKNKD
KNTLFMVGDVKQSIYGFRQAEPSLFLKKYHDFANDDNKQTKRILLSDNFRSTEPVTKIVN
QVFKSVLSSDFGGIDYQKEGQLIFGAKYYPENTPKASEVIVHEKKNSSNEDENEIDFSEI
QMVLARIKQLKEERVQIFDSKTGMRELRYSDIAILTRSRSDNLEIMQEFAKQDIPLFVTD
AKNYFQTFELTVMMNYLKIIDNPDQDIPLVSVLRSPLFNFGEKDLAKIRIKSKNSTFYSA
LTSYVGVGDELSTRIKDFLNQLADLRKFATAHRISELIWSIYARTNLLEIMTALPNGEQR
RVNLEALYERAASYESAGFKGLYQFINFINRMRQSQKDLAQPLLTKEAGNAVRLMTIHGS
KGLEFPIVFYVGMQHKYQMRDLKGNYVISSDSIGITLREEHYRIDSLVKAMGNVTKKRQL
LEEEARILYVALTRAKQKLILVGDVPNLDKRVKEWSTELNQIGQLSLADKLSSTSPLSFM
GPALALDRHLAVKMSDITNSLDKSQSFLYINYENANGELPDYQKAETSNDKTQSNLLNQT
TKRLYQFNYPFKDASETTAYQAVSEIKKAFNDPIETELENAHLLTSTNRYLQPIDTKPNF
LYQTKFTGAEIGTATHMILQYYDYHGNGAEDQLEVEIQELIKQKKLNPEIVSSLKKDQIE
WFVHSNFAEEFWQKPENLKREIDFSSLISAKTLFKNFSDPNAKILVHGTIDGYFVKNDGI
ILFDYKTDHVDQSHLSESIELIKEKYTGQLRLYEQAINEFSQKKVIGKYLILLDAKQAVE
VK
NT seq 3609 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgtctcaatttactaaagagcaacaacaagcaattgatgatcgtggtcatgatattctg
gtttctgcttctgcaggtagtggtaagacaactgttcttgttgagcgcgttttaagggag
attctttcgggaacccaagttgatgaattattagtaattacatttaccaaagcagcagct
gaagaaatgaaaactagaattaaacaggcattatcagctgaattagcaaagccgggatct
aatcgcagatatttacgtgagcagctaaatcaagtggatactgctaatatttctacaatt
gatgcattttgtctagaagtaatccatcgcttttattactctgtaaacttagatccaagt
tttagtattctaactgatgatactcaagctgcattgttaaaagaacgtgcattacgtgaa
attgaaggggagtttctagaagagaaagacgtaaattttaggcatttttatgataacttt
gcaggggatcgagatgcggatagcccgcgcgacttgttgctagatttgtatgattttgcc
atggccaaacctgagtatcgctcatggttaaaaaaattggttgatgtttacgtggttaat
ggcagtatcgtggaatctgatttgtggcaaaaacagattaagccatacttgcttactagt
attggcgacttacaagggaaaattaatgattatttagaaaatccagtaatagaaacaaaa
gagctagctaaggctaaggaagcttttaccttgtttgcacaaaatttagatcattttgtt
tttgctttagaaaatgatgcagactacgataaacaacgagaactattacgttcgtgtgtt
tttacagcgaattatcgtaagtcaagtaaatgggatgaagatgttctaaatttttatgaa
gacctacaaaagttaaaagatgaagcaaaaaatttggtttttgatacttttacttcattt
tttgctgttgatgaacaagaacaaattaaagtcatgaagcgcggccaaaagattgttgct
gcaattgctaaatccgagctagccttgattgatcggtttaataagctgaagcgcagtgaa
aatttgcttgactatagtgatatggaacaattggcttatcagattttgagtcaagataca
tcgaattctcaaatggctcgtgaattttatcaaaataaattcaaagagattttgattgat
gaatatcaggatattaatgctttgcaagaaaatatcatccagcaaatcaaaaataaagat
aaaaatacgcttttcatggttggtgatgtaaagcagtcgatctatggctttagacaagca
gagccaagcttatttttaaaaaaataccatgattttgccaatgatgataataaacaaacc
aaaagaattctgttgtcagataatttccgctctactgagccggttaccaaaattgtaaat
caagtatttaaaagtgtgctaagttcagattttggcgggattgactatcaaaaagaagga
caattgatttttggtgctaagtattatcctgaaaacactcctaaagctagtgaagtaatt
gttcatgaaaagaaaaatagcagtaatgaagatgaaaatgagatagatttttctgaaatt
caaatggttttagcacgtattaagcaactaaaagaagagcgtgtacaaatctttgatagt
aaaacaggaatgagagagttacgttacagtgatattgctatcttgactagaagtcgtagt
gataatttggaaataatgcaggaatttgctaagcaggatataccattatttgtaactgat
gcgaagaattattttcaaacttttgaattgactgttatgatgaactacttaaagatcatt
gataatcccgatcaggatattccattagtttcagttttacgttcgcctttgtttaatttt
ggtgaaaaggatttagctaaaattcgtatcaagagtaagaactctactttctatagtgca
ttgacttcttatgtaggtgtaggagatgaattaagtactcgaatcaaagattttttaaat
caactagctgatttgcgcaagtttgccacggcacatcgtatttctgaattgatttggagc
atttatgctaggacaaatttattagagataatgaccgcactacctaatggtgaacagcga
cgagttaatctagaagctttatatgaacgtgctgcttcatatgagagtgcagggttcaag
ggattataccaatttatcaattttattaatcggatgcggcaaagtcagaaggacttggca
cagcctttattaactaaagaagctggtaatgcggtcagattaatgactattcatggttct
aagggactagaatttccgatcgtgttttatgtggggatgcagcataaatatcaaatgcgt
gatttaaaaggtaactatgtgattagctcagatagtataggaattacgctccgtgaagaa
cattatcggattgactctttagttaaagcgatgggaaatgtaactaaaaaaaggcaatta
ttagaagaagaagcgcgaattctttatgtagcattaacgcgggctaagcagaaattaatt
ttggttggcgatgttcctaatctggataaacgagttaaagaatggtcgactgaactaaat
cagattggtcaattatcattagcagataagttatcttccactagtccattgagttttatg
ggacctgcgttggctttagatcgacacctagctgtgaaaatgtctgatattactaattcg
ttggataagagtcagtcgtttttgtatattaattatgaaaatgctaacggtgaactacct
gattatcagaaagcggagacaagtaatgataaaacgcaaagtaaccttttaaatcaaacc
acgaaacggctttatcaatttaattatccgtttaaagatgctagtgaaactacagcttat
caggcggtatctgaaataaaaaaagcattcaacgatccgatcgagaccgaattagagaat
gctcacttattgacatcgactaatcgttatttacaaccgattgatactaaacctaatttc
ttgtatcaaactaagtttactggtgcagaaattggaactgctacacacatgattttgcag
tattatgattatcatggcaatggtgctgaagatcaactagaagtagaaattcaagaattg
attaagcaaaagaaactgaatccagaaattgtttctagtttaaagaaagaccaaattgag
tggtttgttcatagcaattttgccgaggaattttggcaaaagccagagaatttaaagcga
gaaatagatttttctagtttaatctccgctaaaactttgtttaaaaacttttcagatcct
aatgccaaaattttggttcatggtacaattgatggctattttgtcaaaaatgatggtatt
attttgtttgactacaaaactgaccacgttgatcaatcgcatttatctgaatcaattgaa
ttgattaaagaaaaatatacaggtcagcttagactatatgaacaagctatcaatgaattt
agtcaaaaaaaagttattggaaaatatttaattctgcttgatgctaaacaagcggttgaa
gtgaaatag

DBGET integrated database retrieval system