Listeria monocytogenes NE dc2014: CQ02_11310
Help
Entry
CQ02_11310 CDS
T03477
Name
(GenBank) cell surface protein
Organism
lmok
Listeria monocytogenes NE dc2014
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SpaA
SdrD_B
Collagen_bind
CarboxypepD_reg
MucBP
Cupredoxin_1
Gram_pos_anchor
SpaA_2
Big_8
UDP-g_GGTase
SSSPR-51
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHN33420
UniProt:
A0A0B8RGW8
LinkDB
All DBs
Position
complement(2254191..2259323)
Genome browser
AA seq
1710 aa
AA seq
DB search
MKNIRHWKKLVIAMVIGLLVFQNVSPVLATMTDDETAKTTLKITKEDKDTKEKINGSTFE
IKNKETGETNDLTISANGEATMDSLSPGDYLVKEKVAPKGYTLDEKEYSVTLAEKEEVIT
SVSAKVQEETTKEATTPTPVKKATQNANLKAAITDNIFNKVTLKDGNGDEINTSDRIQNG
SGVVLNMNFAFSGKNYKAGDTFTTVLPDAFNFGNKNLSGNFLPSTEAEWTLDVTTRELTI
TFLKDGIQEGDYDVNISTAFKVFTSTEETIQEVVFKTAGKDTVYQIEVVPVVNYPTTVGI
TANPGVVNPTKGQVDAKFNLTKEKDAKGELKLNDYASGGTTTIDKDTIKVYSSDVSAGGT
FIGTKKLLVEGTDYTLTYSATSLTVTLNGGLAGKGYQVTYDRTINKPSDSLSYMSTQAYT
VGDSGTLSSNSAYVYLTMTNYKHIEKKATYNGSTQSIDWKINFNFDQDEISPSTVLTDVL
ADNDVEYVADSLKIKRVTFNATNGSPIVGGDASSDWTTSAISANGNFNLTYKNTNTNAYE
ITYSTKITDFSDRKIKNEITDENGVSADATIAIQPDLLKKEAGTIDYFNNTMTWKITANS
DRIKMGNLNITDEFSTGVKALKSYTVRAYTDNINSVLLTEGKDYTIDKDVTPAGFYIQLI
GDYATTDKKIVVDFVTEIDLSDVTKTIDNKASISYYDGGIIKYVDDVKASMTPDPAMMTN
GGKYGSYNSTTGNIDWIVSVNAMAKNYDNLIFDDAIPTGLTYVEGSLQYRNVASTSEMMN
LYIPLNSVGTVAKTGDKNYPTKVDTTGNKLHLEFANLENSRVFIKYSTKPNENWYFYSYV
QNTAKVSDNGVGEKSYSYQAYASKLYNAMTKTATIDPSFDNKVNWVVTLNNISADRPINN
PTITDTMKTGTTGAQVVKSSFKVINETTGEDIDSKYYDITYTDNNFTIQFKDYKATAPIK
VTYSTISLMSGLVSNTATTASPDYGSLPMTYKSRTTSISPAFTIGSGSGTATIGSLEITK
VDKKDNTKKLAGAKFQLYTLEGDKAGQEATTDTDGKIVMDGLQSGKYKLVETEAPTGYTI
SDEYKDGKEIAVTADAVTNVTIENTEQTGSAVLLKEDSVTKDAIAGAEFELQNADGTKVA
ENLVSNADGKIEVTDLAPGDYQFVETKAPTGYVLDATPSEFTIEFNQEAAVIVTKENTAK
TGSVVLTKEDSVTKATIAGAEFDLQKADGTKVSENLVTDADGKIEANDLAPGDYQFVETK
AAAGYVLDATPSEFTIEFNQDKAAVVTKENTAKSGSVVLTKQDSATKAALSDAEFELQTA
TGTKVKDNLTTNASGEIEVADLAPGDYKFIETKAPTGYELDATPVTFTIEFNQSTAVKVT
KENVAKTGSVVLTKLDSKSRSNLAGAEFELQTKLGVSLKDKVVTEANGQLQIDNLAPGDY
QLVETKAPTGYELDATPVEFTIEFNQKDAVQVTKTNKMSTGSVVLTKTDGQTKAPLADAT
FKLVDADNNVTENLTTDASGKLEITNLSPGDYQLIETKAPKGYELDTVPVDVKISFNQNQ
VLQVTKTNIKTVVSGKVIAEFVDTKGNVLAEQEIHAGLVGEKYVTKAKSIAGYKLTKDPT
NKVGIYKEADQKVTFVYEKNKSPLVVDPTKPIKPSKPTKPSANPSKQATVKKAQSLPSTG
DNSLANLIITGLFASTLGLFLLRKSKKVND
NT seq
5133 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaaaatatcagacactggaagaagctagttattgcaatggttatcggattactagta
ttccaaaacgtttcacctgtactagctacaatgacagacgatgaaacggcaaaaacaaca
ttaaaaatcaccaaagaagataaagatacaaaagaaaaaatcaatggttctacctttgag
ataaagaataaagaaacgggcgaaacaaacgatttaacaatcagcgcgaatggtgaagcg
actatggattcactttcacctggtgactatcttgttaaagaaaaagttgcgccaaaaggt
tacacactagatgaaaaagaatatagtgtaactttagcagaaaaagaagaagtgattact
tcggtttcagcaaaagtgcaagaagaaacaacaaaagaagcaacaacaccaacaccggtt
aaaaaagcaacacaaaatgcaaatctaaaagctgctattacagacaatatttttaacaaa
gtaacgctaaaagatggtaatggcgatgaaatcaacacttcagaccgaattcaaaatggt
agcggtgttgtgcttaacatgaactttgcgttttctgggaaaaattataaagcgggagat
acgtttacaactgttttaccagatgctttcaactttgggaacaaaaatttaagtggtaac
ttcttaccatctacagaagcagaatggacgcttgacgttacaacgcgtgaacttacgatt
actttcttaaaagatggcattcaagaaggcgattatgatgtgaatatcagtacagccttc
aaagtgtttacctcaacagaagaaacgatacaggaagttgttttcaagacagctgggaaa
gatactgtttatcaaatcgaagttgtaccagtagttaactacccaacaactgtaggaatt
acggcgaatccaggggtagtaaatccgacaaaaggtcaagtagatgccaagttcaactta
acaaaagaaaaagatgctaagggtgagctgaaacttaatgattatgcttccggtggaaca
acaactattgataaagataccatcaaagtatattcgagtgatgttagtgctgggggaacc
ttcataggtacgaaaaaattacttgtagaaggcacagattatacgctaacttattccgca
acttctctaactgttacgttaaacggtgggcttgctgggaaaggctaccaagtaacatat
gaccgcacaatcaataaaccaagtgattcactttcttatatgtctacacaagcttataca
gtaggcgattcaggaacattatcaagcaactccgcttatgtttacctgacaatgacaaat
tataagcatatcgagaaaaaagctacttacaacggctcaacacaaagtattgattggaaa
attaactttaactttgatcaagacgaaatatctccttcaacagtgcttaccgatgtttta
gcggataatgatgtcgaatatgtagcagattcacttaaaattaaacgagtaacttttaac
gcaacgaatggatcgccaatcgttggaggtgacgcttcaagtgattggacaacttcagca
atctcggcaaatgggaattttaatttaacgtataaaaacacaaacacaaacgcatatgaa
atcacttattccacgaaaatcacggactttagtgatcgtaaaattaaaaatgaaattaca
gatgaaaatggtgtttccgctgacgcaacgatcgcgattcaaccagatttactgaaaaaa
gaagctggaacaattgactattttaataacacgatgacatggaaaatcactgccaactct
gacagaattaagatgggaaatcttaatatcacagatgaattttctactggtgtaaaagcc
cttaagagctacactgttcgtgcctatacagataatatcaatagcgtcttattaacagaa
ggcaaagattatacgattgataaagatgtgacaccagctggtttttatattcaacttatc
ggcgattatgctacaacagacaaaaaaattgtagttgatttcgtcacagaaattgacctt
tctgatgtaacaaaaacgattgataataaagcatccatttcttattacgatggcggaatt
atcaagtatgttgatgatgtaaaagcttccatgacaccagacccagctatgatgacaaat
ggtggtaaatacggatcatacaactccactacggggaatatcgattggatcgtatctgta
aatgctatggcgaaaaactatgacaacttgatttttgatgatgctattccaactggatta
acatacgtagaaggctcactacaatatcgtaatgtagcttccacaagtgagatgatgaat
ttatacatcccgcttaactctgttggaacagtagctaaaacaggtgataaaaactaccca
acaaaagtcgatactactgggaataaattacatttagaattcgctaacttggagaattca
cgcgtatttattaaatacagtaccaaaccaaacgaaaactggtatttctactcctacgta
caaaacactgcgaaggtgagtgataatggagtaggcgaaaaatcttacagttaccaagca
tacgcaagcaaactttataatgcgatgacaaaaacggctactattgatccatcttttgat
aataaagttaactgggttgttacactgaacaatatctctgcagatcgtcctattaacaat
ccaacaattacagatacaatgaaaacaggaacaacaggagcgcaagtagtaaaaagtagc
tttaaagtaatcaatgaaacgacgggtgaagatattgactcaaaatattatgacatcaca
tacacagacaataatttcactatccagttcaaagactataaagcaactgcaccaattaaa
gtaacctatagtacaatcagcttgatgtctgggcttgttagtaacacagcgacaactgct
tctcctgactacggtagtttaccaatgacatataaatcaagaacaacaagcatatcgcca
gccttcactattggtagtggtagcgggacggcaacaattggttcacttgaaattaccaaa
gtggataaaaaggataatacgaaaaaactagcaggagctaaattccaactttatacgctt
gaaggtgataaagcgggacaagaggctaccactgatacagatggtaaaatcgtgatggat
ggccttcaatctgggaaatataaactagttgagacagaagcgccaacaggttacacaatt
agtgatgaatataaagacggtaaagaaatcgcggttaccgccgatgcagttacaaacgtt
acaattgaaaacacagagcaaactggtagcgcggttcttttaaaagaagatagtgtaacg
aaagacgctatcgcaggagcagaattcgaattacaaaatgcagacggtacaaaagtcgct
gaaaacttagtatctaatgcagatggtaaaatcgaagtaactgacttagcgccaggcgat
taccaatttgtagaaacaaaagcgccaactggctatgtattagatgcaacgccaagcgaa
ttcacgattgaatttaaccaagaagccgctgtaattgttacaaaagaaaacacagcgaaa
actggtagtgtggttctaacgaaagaagatagtgtaacgaaagctacgatagccggagcg
gaattcgatttacaaaaagcagacggaacaaaagtatccgaaaacttagtaacagacgca
gacggtaaaatcgaagcaaacgatttagcaccaggagactaccaatttgtagaaacgaaa
gctgcggctggctatgtattagatgcaacgccaagcgaattcacgattgaatttaaccaa
gacaaagcagctgtcgtaacaaaagaaaacacagcaaaatctggcagcgtagttctaaca
aaacaagatagtgcaacaaaagctgcgttatctgatgcggaatttgaactacaaactgcc
actggaactaaagtaaaagataatttaacaacgaatgcaagtggtgagatagaagtagct
gatttagcaccaggcgattacaagttcattgaaaccaaagcaccaacaggctacgaatta
gatgccacaccggttacttttaccatcgaatttaaccaatcgactgcagtcaaagtaaca
aaagaaaatgttgcgaaaactggtagtgtggtcttaactaagctagatagtaaatcaaga
agtaatttagctggtgcagagttcgaattacaaacaaaacttggtgtcagtttgaaagat
aaagtagtgacagaagcaaatggtcaactgcaaattgataacttagcaccaggcgactac
caattagtagaaacgaaagctccaacaggttatgagcttgatgcaacaccagttgaattc
accattgaatttaaccaaaaagatgcagttcaagtgactaaaacaaataaaatgtctact
ggatctgttgtgttaactaagactgatgggcaaacaaaagcccctcttgcagatgcaacg
tttaaattagtagacgcagataataacgtcacagaaaatctaacaacagatgcttctggt
aaactggaaataactaatctatcccctggtgattatcaattaattgaaacgaaagcacca
aaaggttatgaattagataccgttccagtcgatgtgaaaatcagttttaatcaaaatcaa
gtacttcaagtaactaaaacaaatattaaaacagttgtaagcggcaaggtaatagctgaa
tttgttgatacaaaaggaaatgtattagcagaacaagagattcatgcaggtttagtcggg
gagaaatatgtaactaaagcgaaatctatcgcgggttataaactaacgaaagaccctacg
aataaagtcggcatatacaaagaagcagatcaaaaagtaacctttgtatatgagaaaaat
aaatcaccactcgttgtcgaccctactaaaccaattaaaccttctaaaccaacaaaacca
tcagcaaacccttcaaaacaagccacagtgaaaaaagcacaaagtcttccttcaacagga
gataattccctagctaatctaatcattaccggattattcgctagtacactaggacttttc
ttactaagaaaatccaaaaaagtaaatgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
