Listeria monocytogenes 08-5923 (serotype 1/2a): LM5923_1952
Help
Entry
LM5923_1952 CDS
T01164
Name
(GenBank) peptidoglycan binding protein
Organism
lmy
Listeria monocytogenes 08-5923 (serotype 1/2a)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CBM39
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADB71793
LinkDB
All DBs
Position
complement(1954726..1957428)
Genome browser
AA seq
900 aa
AA seq
DB search
MMKKQRVDYKRRLDQKRAQKAKLIAALITTTTMMVAPVTVNYDSFNHQFALSGIQADAAT
IDLLGNSNLNTQYSNGKLVITLSGNQLVSASAVSTYYPYFELPSELSSILSNPNIRANTK
IDYKIAYLGIGGIGLFNQGTVNGSSSSNFFIDSSRNAIGAKVNHLLGVGVGSVSTFTLTI
DLLALGVTALPSANDGKLDFAARTGDGLLDVDLLNSNAARGFITTDVGDADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADVDIDW
RDFLVEKPTVNPIYEGTKTISGSSIYKNMNINALLKSLQSDAPVGTTFYINLTLPDGTVI
GNVLIHADGTYTINIPNYNLKAGDVIHLQVTAKYGDEVKTSDDVSVTVLPLVDSDADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADGGPNPSTNGGTTGTSNGGTGVTV
TNMSSNGSGTMLSSGYSADGTTSISASDLPSTGDTNSSLPWVGLGLFSLAGAFLLRLFRK
NT seq
2703 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaaaaaacagcgtgtagattacaaacggagattagaccaaaagcgagcgcaaaaa
gcaaaattaattgcggcgcttattacgacaacaacgatgatggtagcgcctgtcactgtg
aattacgattcttttaatcaccaatttgccctaagtggtattcaagcggatgcggcaaca
attgatttgctagggaattctaatttgaatacacagtattctaatgggaaattagtgatt
actctttctgggaatcagttagttagtgctagtgcggtatccacatactatccatatttt
gaattgccaagtgaactttcttctattttgagtaatccaaatataagagcaaatacgaaa
attgactataaaattgcttatttaggaattggcggtattggattatttaatcaagggaca
gtaaatggaagtagctcaagcaatttctttattgattctagtagaaatgcaattggtgcg
aaagtaaatcacttactgggagtcggagttggtagtgtatctactttcactttgacaatt
gatttgctagcgcttggcgtaactgcgctacctagtgccaatgatgggaaattagacttt
gctgctagaactggtgatgggcttttagatgttgatttgttgaatagtaatgcggctcgt
gggtttattactacggatgttggggatgcggatgctgatgcggatgcggacgctgatgcg
gatgctgacgctgatgcggatgctgacgctgatgcggatgccgatgctgacgccgatgcg
gatgctgacgccgacgcggatgcggatgctgacgctgatgcggatgccgatgctgacgcc
gatgctgacgctgatgcggatgctgacgctgatgcggatgctgacgctgatgctgacgct
gatgctgacgctgatgctgacgctgatgctgacgctgatgcggatgctgacgctgatgcg
gatgctgacgctgatgctgacgctgatgctgacgctgatgctgacgctgatgcggatgct
gacgccgacgcggatgcggatgctgatgcggatgctgacgccgacgcggatgcggatgct
gacgcggatgctgatgctgacgccgatgctgacgctgatgcggacgcggatgcggatgcc
gatgcggatgccgatgctgacgctgatgccgatgcggatgcggatgccgatgccgacgct
gatgcggacgctgatgcggatgcggatgcggatgcggatgccgatgccgacgctgatgct
gacgctgatgcggatgccgatgcggatgccgatgccgacgctgatgcggatgccgatgcg
gatgctgacgctgatgccgatgcggatgcggacgccgacgctgatgctgacgccgatgct
gacgctgatgcggatgccgatgcggatgcggatgccgatgcggatgctgacgccgatgct
gacgctgatgccgacgctgacgcggatgctgacgctgatgccgatgcggatgccgacgct
gatgcggatgccgacgctgatgcggatgctgatgcggatgcggatgctgacgccgatgcg
gatgctgacgctgatgccgatgcggatgctgacgctgatgccgacgctgatgcggatgcg
gacgccgacgctgatgccgacgctgacgctgatgcggatgccgacgctgatgcggatgcc
gatgcggatgcggatgcggacgccgatgcggatgcggatgccgacgctgatgcggatgcc
gacgctgatgcggatgcggatgcggacgccgacgctgatgcggatgcggatgcggacgcc
gatgctgatgcggatgcggatgcggacgctgatgcggacgccgatgcggatgctgacgcc
gatgcggatgcggacgctgatgctgacgctgatgctgacgcggatgctgacgcggatgcc
gatgcggatgctgacgcggatgcggatgctgacgcggatgccgatgtagacattgactgg
agagatttcctagttgaaaaaccaactgtaaatccaatatatgaaggaactaaaacaatt
tcaggttcctcaatttataaaaacatgaacatcaatgcccttctgaaatcattgcaatca
gatgcacctgttggaacaactttctatattaatttgactcttccagatggtactgtaatt
ggaaatgtcttaattcatgcagatggaacctatacaatcaatattcctaattataatttg
aaagctggagatgttattcatcttcaagtaacagctaaatacggcgatgaagtaaaaaca
agtgatgatgtatccgtaacagttctgcctttagtagactcagacgctgatgcggatgcg
gatgcggatgccgatgctgacgctgatgccgatgctgatgcagatgctgacgccgatgct
gacgccgatgctgacgcggatgctgacgcggatgctgacgctgatgcggatggtggacca
aatccttctaccaatggaggaactactggaacttctaacggaggaactggcgtaaccgtt
acaaacatgagctcaaatggttcaggaacaatgctttcctcaggttatagcgcggatgga
actacttctatctcagctagtgatctcccatcaactggagatacaaacagtagtcttccg
tgggttgggcttggattattctcactagcaggcgcgtttttactacgtcttttccgtaaa
tag
DBGET
integrated database retrieval system
