Metamycoplasma cloacale: DK849_00055
Help
Entry
DK849_00055 CDS
T06147
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
mclo
Metamycoplasma cloacale
Pathway
mclo03030
DNA replication
mclo03430
Mismatch repair
mclo03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mclo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
DK849_00055
03430 Mismatch repair
DK849_00055
03440 Homologous recombination
DK849_00055
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mclo03032
]
DK849_00055
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mclo03400
]
DK849_00055
Enzymes [BR:
mclo01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
DK849_00055
DNA replication proteins [BR:
mclo03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
DK849_00055
DNA repair and recombination proteins [BR:
mclo03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
DK849_00055
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
HHH_6
PHP
DUF2358
Ribosomal_S13
tRNA_anti-codon
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWX42482
UniProt:
A0A2Z4LL76
LinkDB
All DBs
Position
complement(8163..11144)
Genome browser
AA seq
993 aa
AA seq
DB search
MKLINGHLNTIFSFLESTITIDNLFQQLKEKNIEYFSITEHNNLFSFAPILSKSRKENLK
PIFGLDCDIDIDGQLFRYILYPKNLDGWNAIKLISYKLLSKENVKLIDILKDNNIYIVEH
PILGYWRQTNCIIEQNNYYYGIDINEVENNSLTKTHTHKCLIINHFSILNADENSTIDVL
SKMKDSSKIANFYIPLFFEIEDDVEYKDLIIQTNEFLKQCYIHFETEKFELPKYPNDLNI
SSYEYLERLIKQNLPKLFKKENWNSIYSERLKYELSVIKQLKFEDYFLIIQDWINYAKNN
DISVGPGRGSAAGSLVSYILGITEIDPIKYNLIFERFLNPERVTMPDIDVDVQDDKRHLV
LQYLIDKYGVNNVANIVTYSTLGKKSSIRDVMSAFGKNISEINSVSKAISDAEINLLQEY
ETNKKFALELNKLNEVDFSMSKQILYEANKLEGLYRQSGTHAAGIVLSSKPIIDKIPTYL
LDGIQQTQTSMEYLEEFGLLKMDILGLRTLTTIKEILSFIKSSKNIEIDLSKIDYNDQLT
FKLLTSGNTAGIFQLESYGMMNALKKVGVSSFDDITAIISLYRPGPMEHINTYVKRKFGK
EAIPKINATYDEIVKNTYGIIIYQEQIMQIVQAVAGFSFGHADLIRRIISKKQVDLMLKE
KEIFIKAAIQNGYSLKDAQNIFDNIEKFADYGFNKSHAVSYATLSYQMAYLKAHFPLEFY
ASAISSAQGSHATIAKFANEARNLDIEIISPNINYSSNKAIIMDNKIVLPLTMIKGIGNE
SVKLIINERQLNGVYKNFFDFLLRMDNVKSIGLSTIQILIKANALKCFGYNQMTLLSELL
NNNNNSDTMLMLKYLRNNDNQTEVNNAIKNWKPYVVYEQNIDEENENEIALLGQIYNLSL
TEDFEVNGSRLIDMHIGNEYLTTLFCNSIMQKTSKNGSQYYLINLQDSTKKISIFYFGTI
ENYKKFNKQLVSVNIYVKSENQYILKGWKLKHE
NT seq
2982 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattaattaacggacatttaaatactattttttcttttcttgaaagtactataaca
attgataatttatttcaacagttaaaagagaaaaacattgaatattttagcattacagaa
cataataatttattcagtttcgccccaatattaagtaaatcaagaaaagaaaacttaaaa
ccaatattcggattagattgtgatattgacattgatggtcaattatttagatatattcta
tatccaaaaaatttagatggttgaaacgcaataaaattaatttcttataaattattaagt
aaagagaatgttaaattaattgatatattaaaagataataacatctacattgttgaacat
ccaattttaggttattgaagacaaactaattgcataattgaacaaaataattattattat
ggaattgatattaatgaagtagaaaataattcacttactaaaacgcatacacacaaatgt
ttaattatcaatcatttttcaatattaaatgctgatgaaaattcaacaatagatgttttg
tctaaaatgaaagacagttcaaagattgctaatttttatattccattatttttcgaaatt
gaagatgatgttgaatataaagatttaataattcaaacaaacgaatttttgaaacaatgt
tatatacattttgaaacagagaaatttgaattacctaaatatcctaatgatttaaatatt
tcttcatatgaatatctagaacgtttaattaaacaaaatctacctaaattatttaaaaaa
gaaaattgaaattcaatctattctgaacgtctaaagtatgaattatccgttattaaacaa
ttgaaattcgaagattattttttaatcattcaagattgaattaattatgctaaaaacaat
gatatatcagtaggcccagggcgtggttcggcagctggttcattagtgtcatatatttta
ggaattactgagattgatccgattaaatacaatttaatttttgaacgtttcttaaatcca
gaacgggtaacaatgccagatattgacgttgatgttcaggatgataaaagacatttagtt
cttcaatatttaattgataaatatggggttaataatgttgcaaacattgtaacttattca
acattgggcaaaaagtcatcaattcgtgatgtaatgagcgcatttggtaaaaacatttca
gaaatcaatagtgtgtcaaaagcgatatcagatgctgaaattaatttattgcaagaatat
gaaacaaataaaaagtttgctcttgaattaaataaattaaatgaagttgatttttctatg
tctaaacaaatattgtatgaagctaataaattagaaggtttatatcgtcaaagcggtaca
catgcagctggtattgttttatcttcaaaaccaattattgataaaattcctacctattta
ttagacggtatccaacagacacaaacctcaatggaatacctagaagagtttggtttgtta
aaaatggatatattaggtttaagaacactaactactattaaagaaattctttcatttatt
aaatcaagtaaaaatattgagattgatttatcaaaaattgattacaatgatcaactgact
tttaaattattaacttcaggaaatacggcaggtattttccaacttgaaagttatggaatg
atgaatgcattgaaaaaagtaggtgtaagtagttttgatgatattactgcaattatttca
ttgtatcgtccaggtccaatggaacatattaatacatatgttaaacgtaaatttggtaaa
gaagcaattcctaaaatcaatgcaacatatgatgaaattgtaaaaaatacatatggaatt
attatctatcaagaacaaataatgcaaattgttcaagcagttgcaggttttagttttgga
catgccgacttgattagaagaattatttctaaaaagcaagttgatttaatgttaaaagaa
aaagaaatttttataaaagccgctattcaaaatggttatagcttaaaagatgcgcaaaat
atatttgataatatagagaaatttgctgattatgggtttaataaatcgcatgccgtttca
tatgcaacactttcatatcaaatggcttatttaaaagcacatttcccattagagttttat
gcttctgctatttcatcggcacaaggaagtcatgcgacaattgctaaattcgctaatgaa
gcaagaaatttagatattgaaattatttcgccaaacattaactattcaagcaataaagca
attattatggataataaaattgttttacctttaacaatgattaagggaattggtaatgaa
agtgttaaattaattattaatgaacgtcaattaaatggtgtatataaaaacttctttgat
ttcttattaagaatggataatgttaaatcaattggattgtcaactattcagatcttaatt
aaagcaaacgctctaaaatgcttcggctataatcaaatgacattgctatcagaactattg
aacaacaataataatagtgatacaatgctgatgttaaagtatttaagaaacaatgacaat
caaactgaagttaataatgcaattaaaaattgaaaaccatatgttgtatatgaacaaaat
attgatgaagagaatgaaaatgaaattgcattattgggtcaaatatacaatttatcttta
acagaagattttgaagtaaatggttcacgtttaattgatatgcatatagggaatgaatat
ctaacaaccttattctgtaactcaattatgcagaaaacgtcaaaaaatgggtctcaatat
tatttaattaatctacaggattcaactaaaaaaatctcaattttctattttggaacaata
gaaaattacaagaaattcaataaacaattagtttcggtgaatatttatgttaaaagcgaa
aaccaatatatcttaaaaggatggaaattaaaacatgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
