Allocoleopsis franciscana: Mic7113_1774
Help
Entry
Mic7113_1774 CDS
T02374
Name
(GenBank) PAS domain S-box
Organism
mic
Allocoleopsis franciscana
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GAF
GAF_2
PAS_4
GAF_3
HATPase_c
PAS
PAS_9
PAS_8
PAS_3
HisKA
PdtaS_GAF
Mce4_CUP1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ17632
UniProt:
K9WDQ0
LinkDB
All DBs
Position
complement(2059205..2063272)
Genome browser
AA seq
1355 aa
AA seq
DB search
MQSCNSDLNHSLAHMTESMSDNTDNEWTLKKKQELISTNLNQANSWSKQPAQQDQWTQLL
AKITLKIRQSLQLEDILQTTVTEVRELLEADRVLIYRLWPDGTGSGVTEAIVPGWSTVLG
QVFEAEVFPQEYHQLYASGRILAIKNVEDAEISPCMVEFLQQFEVKSKLVVPILLKEKLW
GLLVAHQCAHPRQWLRGEIELLQQLADQVSIALSQAQYQEHLEELVAQRTAKLTKTLEQL
QQEINERQRTEKALRESEERWRSLVKNAPDLIFTCDRTGKILYINRTVPGFTLEQAIGSS
VYDYIPDESKPLLKQSFERVFQTGEAVYYETQGSGAYGTTSWYASRVGPIQQEGEVIAAM
VISTDITERKQAEELLHLREQEFRALVEHSPDLIVRFDPQLRHLYVNPAVERSTGIPRQT
FIGKTNQELGMPQELVAGWNKVLLEVLATGQEGMIEFDFPTASGLKSYQTRIIPEFAQDG
TIRFLLGVTHDITPAKQAEKALQQRLLREQALHQLVQSIRNSLDLETIFFTAVAEIGKLL
PVDRALVVQYLPDRKLWLNVADYRASSDLPVALGLEIPDEDNCIAARLKQSQLVLMDHTN
QCEDEINRHFSPTFPGAGLWVPLYLGSQLWGSLSLFVENHAYAWQDSEVQLTLAVAEQLA
IAIQQAELLNQSQIATVKAQEQAEALKHEIKERKRTEETLRAIYKVSTARKLSFEQRLQG
LLALGRRRFGLEIGALGRVKNNVYEVIAAQVAPKSSFPITKGTIWNLEQTYCSVTLGTKE
PIAFASAGTSSWRHLPAYTSRPVEAYLGMSVVVAGQIYGSLSFFSLHAHQHPFTAGDKAL
LKLMAQWVGALLEHQLSEEELRQSEARFRAIAQREALLNQLASQIRRSLDLNTILETAVH
EIQNLLKIDRCFFLWYRAHETQPVWEVVTEARSPAFPSVIGHCVPLSTFGPLTRRVFNKE
ITRVDNARSLTDPAERKFFFSLGYTAMLALPIHTTSGEIGVVSCGHSTGSRPWRQEEVEL
LEAVADQMAIAIDQAELLHQSRTTAAAAQEQATQLKQALNELQQTQAQLVQSEKMSSLGQ
LVAGIAHEINNPVNFIYGNLTYVSEYAEDLLHLIQLYQEYCPRPAPVIETAAANLDLDFM
KEDFPKIVSSMKGGADRIRQIVLSLRNFSRVDEAEMKWVDIHEGIDNSLLILAHRLKAQR
PEESDIQIIKDYNNLPKVQCYAGQLNQVFMNILANAIDAIASRNACEALGQVNPPCSPEL
FKSHPGLIWICTEVIAERNEVMILISDNGPGMTQEVQRRIFDPFFTTKPVGSGTGLGLSI
SYQIVVEKHGGRLECISAPGQGTVFLISLPIRQSS
NT seq
4068 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagagctgcaactcagacctcaatcacagcttagctcacatgacggaatcaatgtcg
gacaacacagataatgaatggacattgaaaaaaaaacaagagcttatttcgactaattta
aatcaagccaattcctggagcaaacagccagctcaacaagaccagtggacacagttactg
gctaaaatcactcttaaaattcgccagtctttacagttagaggacattctgcaaaccaca
gttacagaagtgcgagagttgctggaggcggatcgagttttaatctatcggctttggccc
gatggaaccggaagcggagtcacagaagcgattgtgcccggttggtcaacggttctggga
caagtatttgaagccgaagtttttccccaagagtaccatcagctctatgcctctggacgt
attctggcgattaaaaatgtagaagacgctgagatatctccttgcatggtggaatttctc
caacaatttgaggtgaagtccaaattagtggtaccgattcttctcaaggaaaaactttgg
ggtttgttggtagcccatcagtgcgctcatcccaggcagtggttaaggggtgaaattgaa
cttttgcagcaactggctgaccaagttagcattgctctatcccaggctcaatatcaggaa
cacctggaagaattagttgcacagcgtactgctaaactcacaaaaaccttagaacaactt
cagcaagaaattaatgagcgccaacgcaccgaaaaagccctgcgtgaatccgaagaacgg
tggcgctccctggtaaaaaatgctcccgacctgattttcacctgcgatcgcaccggtaaa
atcctgtatataaatcgcactgtacccggttttacattagaacaggccattggtagcagt
gtgtatgattacatacccgacgaaagtaaaccgttattaaaacaatcctttgagcgagtt
ttccaaaccggggaagcggtttactacgaaacacagggatcgggagcctatggtacaacg
tcctggtatgccagccgtgttggcccaattcaacaggagggagaagttatcgcagcaatg
gtgatttccacagacatcaccgaacgaaagcaagctgaagaactgttacatctgcgtgaa
caagaatttagagccttggtggaacattcaccagacttgattgtgcggtttgacccccaa
ttacgccatctgtacgtcaatccagccgtggaacgcagcacgggaataccgagacagaca
tttattggcaaaactaatcaggaattgggtatgccacaggaactcgtggcgggttggaac
aaggtcttgttggaggtattggcaaccgggcaggaagggatgattgaattcgattttccc
accgccagtggtcttaaatcttatcaaacccgtattatcccagagttcgcccaagatggg
acaatccggtttttgctcggtgtaactcacgacattacaccagccaagcaggcagaaaaa
gcgctgcaacaacgccttctcagagagcaggcgctacatcagcttgtccaatctatccgc
aactctctcgatttagagacgatttttttcaccgctgttgctgaaattggcaaactcttg
cccgtagatcgggcgcttgtggttcaatatttgccagaccgcaagctgtggttgaatgtc
gctgattatcgcgcctcctctgatttacccgtcgcattaggtttagaaattccggatgag
gataattgtattgctgctcgattgaagcaatcacaactggttttgatggatcacacgaat
cagtgtgaggatgaaattaaccgccacttttctccaacttttcccggtgctgggttatgg
gtgccgttgtatttgggttcccaactctggggaagtctcagcttgtttgtcgaaaatcat
gcttacgcttggcaagactcagaggtgcaactcaccttagctgttgccgagcaattggcg
atcgccattcaacaagcggaactcttaaatcaaagtcaaattgccactgttaaagcccaa
gagcaagccgaagcgctgaaacacgaaattaaggaacgcaaacgcacggaagaaaccctg
cgagcgatctataaagtcagcacagctcgaaaactcagctttgagcaacgcctgcaaggc
ttgttagctctgggacgccgccgatttggactggaaataggggctttaggtcgggtgaaa
aacaatgtctatgaagtcattgccgctcaagttgcgcccaaatctagctttcccattacc
aaaggaacgatctggaatctagagcagacgtattgcagcgtaacgttgggcacgaaagaa
ccaattgcgtttgcatcggctggaacttcttcctggcgtcatctccctgcctatacctct
cgcccagtggaagcctatcttggtatgtccgtggtggtagcgggtcaaatatacggcagc
ttaagcttttttagtctccacgcacaccaacacccttttacagccggagataaggcactg
ttgaagctgatggcgcagtgggtgggagcattgttggaacatcagctttcagaagaggag
ttgcggcaatcggaagctagatttcgagccatagctcagagggaggctttgctgaaccaa
ttggcaagtcagattcgtcgttctctcgacctcaacaccattctagaaacagcggtgcat
gaaattcaaaacttattaaagattgaccgttgtttctttttgtggtacagagcgcatgaa
actcaacccgtttgggaggtcgtgaccgaagcgaggagtccggcctttcccagcgttatt
ggtcactgtgttccgcttagcacctttggccccttgacccgtcgggtgtttaacaaggaa
attactcgtgtggacaatgccaggagtttaacagatcccgccgagcgcaagtttttcttc
agtttgggctacacggcgatgttggcattgccgattcacaccacatccggcgaaattgga
gtggttagctgtggtcactcaacgggttcaagaccttggcgtcaggaggaagtagaattg
ctagaggcagtggcggatcaaatggcgatcgctattgaccaggccgaacttttgcatcaa
agtcgcacaaccgcagcagcagctcaagagcaagcaacccagcttaaacaggcattgaat
gaactccagcaaacccaggctcaattggtgcaaagcgaaaaaatgtcttctttagggcaa
ttagtcgcgggtatcgcgcacgaaattaataatcctgttaattttatctatggcaatctc
acctacgtgagtgaatatgccgaagatttgctccatctgattcaactttatcaggaatat
tgcccccgtcctgcacccgtgattgaaacggcagcggcgaaccttgatttggatttcatg
aaagaggatttccccaaaatcgtgtcatccatgaagggcggtgccgatcgcatccgtcag
attgtcttatctttgaggaacttctcacgggtggatgaagctgagatgaaatgggtggat
attcacgaggggattgataatagcctgttgattctcgctcatcgcctgaaagcccaacga
ccggaagaatcagatatccaaattattaaagactacaacaatctgcccaaagtgcagtgc
tatgcggggcaactcaatcaggtgtttatgaatatcctggcgaatgccatagacgcgatc
gcatctcgtaacgcttgcgaggcgcttggacaggttaacccaccgtgttcgcctgagctg
ttcaaaagtcatcctgggttgatttggatttgcacagaggttatagccgagcgcaatgag
gtaatgattctgattagtgacaacgggcctgggatgacccaagaggtacagcgaaggatt
ttcgatccgttctttacaaccaaacccgtcggttcgggtacaggtttagggttgtcgatt
agttaccagattgtggtggaaaaacacggggggcgattggagtgtatttcagcaccaggt
cagggtacggtgttcttaatttcccttccgattcggcaatcttcgtag
DBGET
integrated database retrieval system
