KEGG   Metamycoplasma orale: NCTC10112_00473
Entry
NCTC10112_00473   CDS       T08183                                 
Symbol
hsdR
Name
(GenBank) Type I restriction enzyme EcoR124II R protein
  KO
K01153  type I restriction enzyme, R subunit [EC:3.1.21.3]
Organism
mob  Metamycoplasma orale
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mob00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:mob02048]
    NCTC10112_00473 (hsdR)
Enzymes [BR:mob01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.21  Endodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.21.3  type I site-specific deoxyribonuclease
     NCTC10112_00473 (hsdR)
Prokaryotic defense system [BR:mob02048]
 Restriction and modification system (R-M system)
  Type I R-M system
   NCTC10112_00473 (hsdR)
SSDB
Motif
Pfam: SWI2_SNF2 EcoR124_C HSDR_N ResIII DEAD
Other DBs
NCBI-ProteinID: VEU55886
UniProt: A0A448ZX98
LinkDB
Position
1:514054..517209
AA seq 1051 aa
MIKNVNKSQRILVDDGTSTVLAEFISKKLKKTTFQTEADLEKEFIEQLQSQGYEYRTDLK
TEEDLIKNLKEQIEKLNNYKFTNNEWNEFLNKYLLNKNEHIQEKTNKIQKDFIYALTCEK
DGSTKNIRLLDKSNVHNNVLQVINQYESINEEKDGRKTRYDVTILVNGLPLAHIELKRRD
IPIKEAFNQIKRYGRESFGNGQGLFEYIQIFVISNGRESKYYSNSTHYLTIKNNENNSTS
EKTTSNSFEFTSYWSDAKNNRIFDLIDFTETFFARHTIINILTKYCVWTEDKILKVLRPY
QIIAAERIFNIVKNNKDLFNSTHKGGYVWHSTGSGKTLTSFKAATLIKELPEVDKVLFVV
DRKDLDYQTIKEYENFEKGCAATNATSNQLKELLESYEFSSKLIITTIQKLGKFIDKNSN
HSIFNKNVVIIFDECHRSQFGEYNEKISKKSFKKFILFGFTGTPIFSDNSNYKKYIKEEN
IRKTMTTKELFGNPIHEYTLVEAIINNNVLPFKIDYVGKTEYNEDISDELIRDIDREEAF
INTKRISKIVEYILNNYSSKTKRNDKYFYHSIITNVNEIVSSKNETAKKQKSSLNGFNSL
LACQSIKAAKIYYDEFKRQQASKPENEKLKVALIYSFCPNEAEDELGDENNESAEGLDQS
SRDFLDGAIKDYNAMFETTYSTNVDSFNNYYKDLSLRIKNRDVDIAIVVNMFLTGFDATT
LNTLWLDKKLKQHSLIQAMSRTNRILNSVKQSGNIVCFQKLEDEINNAIELFTNKNNNAI
NIVKIRSFKEYYYGYVDEKNERHIGFVELIENIKALYDSICNQLPTDKEEKEFVKNFNQF
CKLENMLKLFDEYQEHEPDKVINDREKQDFTGLYLTLYDKYHTKQIMEKVSISHDLEWEI
DLIKSDDINVDYILKLLNDKMTTIDVPKFEDISAFIDASPSLRPKRELIKKFVESININV
NAQTDIFTEFRKFEKTSWLDDINAAIKKFNLNKDKTINFMNKALEKGYINYEGTDLVNIM
PKISMLDPNRYKIKQEIYKALEEILIKHQDN
NT seq 3156 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattaaaaacgttaataaaagccaaagaatacttgttgatgatggaacatctactgtt
ttggctgaatttatttctaaaaagttaaagaaaactacttttcaaactgaagctgattta
gaaaaagagtttattgaacagcttcaatctcaaggttatgaatatagaacggacttaaaa
actgaagaagatttaattaaaaatttaaaagaacaaatcgaaaaattaaataattataag
tttactaataatgaatgaaatgaattcttaaataaatatttgcttaacaaaaatgaacac
attcaagaaaaaaccaataaaattcaaaaagattttatttatgctttaacttgtgaaaaa
gatggaagtactaaaaatattagattacttgacaaaagcaatgttcataataatgtgctt
caagtaatcaatcaatatgaatctattaatgaagaaaaagatggaagaaaaacaagatat
gatgtaactattttagttaatggtcttcctttagctcatattgaattaaagcgaagagat
attcctataaaggaagcctttaatcaaattaaaagatatggtcgtgaatcattcggaaat
ggacaaggtctatttgaatatatacaaatatttgttatttctaatggtcgtgaatctaaa
tattattcaaatagtactcactatttaactattaaaaataatgaaaataattctacatca
gaaaaaacaacaagtaattcatttgaatttacatcatattggtcagatgctaaaaacaat
agaatatttgatttaatagactttacagaaacattttttgcaagacacaccattataaat
attttaactaagtattgtgtttgaactgaagataaaattttaaaagttcttagaccttat
caaattattgctgctgaaagaatatttaatattgttaaaaataataaagatttatttaat
agtactcacaagggtggctatgtttgacatagcacaggatctggaaaaactctaacatct
tttaaagctgctactttaataaaagaacttcctgaagttgataaagtactttttgtagtt
gatagaaaagacttagactatcaaaccataaaagaatatgaaaattttgaaaaagggtgt
gctgctactaatgctacttctaatcaattaaaagaattgttagaaagttatgagtttagt
tctaaattaataattacaactattcaaaagcttggtaaatttattgataaaaattctaat
cattcgatctttaataaaaatgtggttattatttttgatgagtgtcaccgttcacaattt
ggtgaatataatgaaaaaatttctaaaaaatcatttaagaaatttatattatttggtttt
acaggtacgccaatttttagtgataattcaaattataagaaatatataaaagaagagaat
attagaaaaacaatgacaaccaaggaattgtttgggaatccaatccatgaatatactctt
gttgaagctattataaataataatgttttaccttttaaaattgattatgttggtaaaaca
gaatataatgaagatattagtgatgaattaattagagatatagatcgagaagaagctttt
ataaatactaaacgtatttctaaaattgttgaatatatattgaacaattatagttctaag
acaaaaagaaatgataaatatttttatcactcaattattactaatgttaatgaaattgta
tcttcaaaaaatgaaacagcaaaaaaacaaaaatcatctcttaatggatttaattctctt
ttggcatgtcaatcaattaaagcagccaaaatttattacgatgagtttaaaaggcaacaa
gcttcaaaacctgaaaacgaaaaattaaaagtagctttaatttatagtttttgtcctaat
gaagctgaagatgaattgggtgatgaaaataatgaaagtgctgaaggtcttgatcaatcc
tcaagagattttttggatggcgcaataaaagattacaatgcaatgtttgaaacaacatat
tctacaaatgttgatagttttaataattattataaagatttaagtttaagaattaaaaat
agagatgttgacattgctattgtggttaatatgtttttgactggatttgatgccactact
ttaaatactttatgattagataaaaaattaaaacaacatagtttaatacaagcaatgtct
agaaccaatagaattttaaactcagtaaaacaatcaggaaacattgtttgttttcaaaaa
ttagaagatgaaattaataatgcaattgaattgtttaccaataaaaataataatgcaata
aacattgttaagataagatcatttaaagaatattattacggatatgttgatgaaaaaaat
gaaagacatataggttttgttgaattaattgaaaatattaaagctttatatgattcgatt
tgcaatcaattgcctactgataaagaagaaaaggaatttgttaaaaactttaatcaattt
tgtaaattagaaaatatgcttaaactttttgatgaatatcaagagcatgagcccgataaa
gttattaacgatagagaaaagcaagactttactggtttatatcttacattatatgataaa
tatcatacaaaacaaataatggaaaaagtaagcatttctcatgaccttgaatgagaaata
gatttaattaaatctgatgatattaatgttgattatattttaaaattattaaatgataaa
atgacaactattgatgtgcctaaattcgaggatattagtgcatttattgatgctagccca
agtttaagaccaaagagagaattaattaaaaaatttgttgaaagtataaatattaatgta
aacgctcaaactgatatttttacagaatttagaaaatttgaaaaaactagctgattagat
gatattaatgcagctattaaaaaatttaatctaaataaagataaaacaattaattttatg
aataaggctttagaaaaaggatatattaattatgaaggaactgatttagttaatataatg
cctaaaattagtatgttagatcctaatagatacaaaataaaacaagaaatctataaggct
ttagaagaaatactaattaaacaccaagataattaa

DBGET integrated database retrieval system