Oenococcus sp. UCMA 16435: DSM07_01985
Help
Entry
DSM07_01985 CDS
T05781
Name
(GenBank) helix-turn-helix transcriptional regulator
Organism
oen
Oenococcus sp. UCMA 16435
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_2
TPR_1
TPR_MalT
HTH_3
SHNi-TPR
SMC_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZZ60173
LinkDB
All DBs
Position
complement(389627..390475)
Genome browser
AA seq
282 aa
AA seq
DB search
MKLTIDGNLFRNRRKEFKITQVELASNITSQTVVCSLEHGVIPKLEVLTEIMQRLSLSLD
DVFPNSPFCLSRLDELKIKLDNENYRQVWSGLEKIKKTALVSSAEKQKFYYLSASSAFHD
GRIEDADFACYELLGFSERERLWFFDALANTIKAQIWQLKEDFSKAENCFKRVIKILNDF
PYEKEAVPSMISYIRIYQALAEHFLLVENFKRAASYIDKALKILSEEKSTWHLGELLLLK
SKIAGEYGLNDQKEKLILTAQQLYEFGKSPQLGRMLNKSKSN
NT seq
849 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaaattaaccattgatggcaatttatttagaaatagaagaaaagaatttaaaataact
caagttgaacttgcatcgaatataacttctcaaacagttgtttgttctttagaacacggg
gttatacctaaattagaggtcctaactgagataatgcagcgcctgtccttatctcttgat
gatgtttttcctaatagcccattttgtttaagcagactcgatgagttaaaaattaaattg
gataatgaaaattatcgacaggtttggtcaggattagaaaagattaaaaaaactgcgttg
gtgtcttcggcagaaaaacaaaaattttattatttatcggcttcctcggcttttcatgac
ggaagaattgaagatgctgattttgcttgttatgaattacttggtttttctgaaagggaa
agattgtggttttttgatgcattagccaatacaattaaggcacaaatttggcagcttaag
gaagacttttcaaaagcagaaaattgttttaaaagagtaatcaaaatattaaacgatttt
ccttatgaaaaagaagcggttccttcgatgattagctatatcaggatttatcaagccctt
gcagaacatttcttgctggtcgaaaattttaaacgtgctgcttcttatattgataaagct
ttaaaaatattatcagaagaaaagtctacttggcatcttggtgaattactgttgcttaaa
tcaaaaattgctggtgaatacggtctaaacgaccaaaaagaaaagctaattttaacagcc
cagcaattgtatgagtttggtaaaagtcctcagttagggcgaatgcttaataaaagcaaa
tccaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
