Sedimentisphaera salicampi: STSP1_01078
Help
Entry
STSP1_01078 CDS
T05439
Symbol
cbhB
Name
(GenBank) Exoglucanase B precursor
Organism
pbp
Sedimentisphaera salicampi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sde182_NH-like
Sde0182_C
fn3
RGI_lyase
Pectate_lyase_3
PKD_4
fn3_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARN56689
UniProt:
A0A1W6LLP0
LinkDB
All DBs
Position
complement(1449101..1453351)
Genome browser
AA seq
1416 aa
AA seq
DB search
MKFKTFKLSVAMLFSVLFTVCTSNCFGDVVSVNFGFSSTDVAGAAGAYPYAANNWNNATS
GAAGSMTDLIDSSGVSTGISISWSANEVWHRSSSASDDDEKLMKSFLNDTPPGGDRSQSS
TDPSTVTVSNLPGGGYDLVIYSDGDETNIEKSTIFNVNDGSGVITKTANDLVQYPDDGYV
LDSGLNYRSTNNDSDYGNYLVFENLQGTSVQIEFHGENDISWRGHLNGIQIVSNLGIVPP
QNLSAFDISSNKAHLSWESAGAGSAVDGYKVYRDGVNIADVTAAEYVDYCLSPDTQYSYQ
VSAYNSEDESDLSPSLAVETMSFGDLAGDGAVDTNDLRVLLFNWLESGMCIQGDLNNDSI
VNLVDYSELLSHWTYPDITAPSVPQNLSVSDVTSASVSLTWQSSADDTAVAGYYVYRDGA
QVSSSGDNVQTDAPLDAQTSYSYQIAAYDEAGNVSDLSDPVDVTTTNETYSVAGVPHKEL
DFSKEVKTWWSELSYNPDSVNYDPTIPSPEFVLNAGDFDGSIQDAIDALPEEGGTVFVPN
GVYTENFGIIARDNVHIVGESKEGVIIRAPAWDPNQSNEYHSDDHHMIKVAGHESAILYP
VFDYHSSLNKGDFREEEWNALVNKKRNIAFRNLTFDGHGTVNGAIDFAAVMDILVENCEF
KNFTHSVGYHEPAITGHAHIDNIIVRNCTFREAIDTPLQFYMDGVHGCYMINNVFEGKLL
FLCNDDFTEDLNENGVTDEYEERESKYVVIYDNEFVKDTWDPMSFTGSNLLFKKNHLPIN
IVTIATCTTRYSHQAPDLVYEFFNLNFLENDIKSVGTTLVRLNNNSNPAPEEYSDPLMGY
INIEDNYVGSNPTDDAYLIVEPPVMESTITVNGNMYGQPWPPVEPDTQAPTAPSGLSVTN
VSSSSAALSWSASTDNIAVEGYKVYRDGVYIDSTSSTSYIDSSLNPETAYSYSVSAFDAA
DNDSNLSNSVNAQTESADTQKPRVVVMTDFGRLTSEGDAWIGDPDDYQSMTRLLLYSNMI
DLQGLICVTSTSVKYDLYPDELKTHIDAYGQVKDNLLLHESGFPTAGYLKSIVKSGNVDS
SVYGMDAVGSGKSSEGSDWIISLVDSDDPRPLYILAWGGTNTLAQALWDVQANRSQAELN
EFLSKIRVYPIAKQDGSYNWLVSNFVQAGDPDKQLFWIDGAAGAWKGISAGPSTIFDVQG
GDESLVSHQWIDDNIRNKGALGVPQRYPYHTYIMEGDTPSFMYMLPVGIGDPERPELGGW
GGRYSSDGPLHTAEIDTVNGISEIYASVWRWRQAYQNDFSARMDWCVESYNLANHPPEVE
VEAALERTVNQGDLVAFDAQNSYDPDSDNLNYQWYRYSEADTYSGSINISNPDTATASFT
APGVSSTETINIILAVTDNGSPNLTRYKQFVITVNP
NT seq
4251 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatttaagacttttaagctctcagttgcgatgttattctcagtgttgtttaccgtt
tgcacttcgaattgcttcggtgatgttgtcagtgttaattttggattcagcagtaccgac
gtcgctggtgcagccggagcttacccgtatgctgcaaacaactggaacaatgccacttcg
ggcgcagccggttcaatgaccgatttgattgattcctctggcgtctctactggaatcagc
attagctggtctgccaatgaagtctggcacagaagctcttccgcttctgatgacgatgag
aagcttatgaagtctttcctcaatgatactcctccaggcggggatcgcagtcaaagttca
acagatccttcaacagttacagtttctaacctgccgggcgggggttatgatctagtgata
tattccgacggcgacgaaactaatattgaaaaatcaacgattttcaatgtcaatgacggc
tctggcgttatcaccaagaccgccaatgatttagtccagtatccagatgacggctatgtg
cttgattcaggtttgaattatcgttctacaaacaatgattccgattacggcaattatctt
gtctttgaaaaccttcaaggcacttctgttcagatagaatttcacggtgagaatgatata
tcatggcgaggtcatttaaatggtattcagatagtttctaatctcggtatcgtcccgcct
cagaatttatcagcatttgacatttcaagcaataaggcccatttgagctgggaatcagcg
ggagccggctcagcagttgatggctataaagtatatcgcgacggggtaaatatagcggat
gtaacagcagccgaatatgttgattattgtttgagccctgatacccagtacagctatcag
gtaagtgcctataattcagaggatgaatctgatttaagcccttcattggcagttgagaca
atgagttttggtgatttagccggcgacggcgcagtagatacgaacgaccttagggttctt
ctctttaactggctggaaagcgggatgtgcattcagggtgatctgaataacgacagcata
gttaatttggttgattattccgagctgctttctcattggacttaccctgatattacagcc
ccgagtgtaccccaaaatctatcagtatcggatgtaacaagcgccagcgtctcattgacc
tggcagagctcagcggacgatacagcagtagctggttattatgtatatcgtgatggggca
caggtaagttcaagtggggataacgtccaaacagatgctccgctcgatgcccaaacctca
tacagctatcagatagcagcttatgatgaagccggtaatgtctcagatctcagtgatcct
gttgatgttaccactacaaacgaaacatacagtgtagctggtgtaccacataaggagctt
gatttttccaaagaagtcaaaacttggtggtctgaattaagctacaaccctgattcagta
aattatgacccgacaatcccttcacctgagtttgttcttaatgcaggtgattttgatgga
agtatccaagatgcaattgacgccctgcctgaagagggcggcacagtatttgttccaaac
ggcgtgtacactgagaatttcggtattatagcgcgggataatgtgcatattgttggtgag
agcaaagaaggtgttataattcgtgcccctgcatgggacccaaatcagtcgaatgaatac
cacagtgatgatcaccatatgattaaagtggcaggtcatgaatctgcaatactctaccct
gtatttgactatcactcatcgcttaacaagggtgatttcagagaggaggaatggaatgca
cttgtaaacaaaaaacgcaacattgcttttcggaatctgacttttgacgggcatggaact
gtcaatggtgcgattgattttgcagcagtgatggatatcttagttgaaaattgtgaattc
aaaaacttcactcattctgttggttaccatgaaccggctatcacaggtcatgcccatatt
gataatattatcgtacgtaactgtactttccgtgaggctatagatactccgctccaattc
tacatggacggcgttcacggctgctatatgattaataacgtatttgaagggaaattgctg
ttcctctgcaacgatgattttaccgaggacctcaacgagaatggcgttacggatgagtat
gaagagcgtgaatcaaaatatgttgtcatctacgataatgagttcgttaaggatacatgg
gatccgatgtcgtttactggttctaaccttctcttcaagaagaatcatctgcctatcaat
atagtaacaattgctacatgcactacccgttactcacatcaggcccctgatcttgtttat
gaatttttcaacttaaatttcctcgagaatgatataaagagcgtcggcaccactctggtc
aggctgaataataactcaaacccggccccggaagagtattcagatccgctcatgggctat
ataaacattgaagacaactacgtaggcagcaatccaactgatgatgcatatcttatagtt
gaacctccggttatggaaagcactattacagttaatggtaacatgtatggtcagccttgg
cctccggttgagcctgatacacaggctccaactgcaccatctggtctgagtgtaacgaat
gtttctagttcaagtgctgcactttcatggagtgcttcgacagataacatcgctgtagaa
ggttacaaggtttaccgggacggtgtttatattgattctacaagctctacaagctatata
gacagctctctaaaccctgaaaccgcttacagttattcagtttcagcatttgatgcagca
gataatgattccaatctgagtaattcagtaaatgctcaaaccgaatctgcggatacccaa
aagccgcgggtagtcgtgatgacagattttggaaggcttacgagtgaaggtgatgcttgg
ataggcgatcctgatgattaccagtctatgacgcgccttttgctgtacagtaatatgata
gatttgcaggggcttatttgtgtaacaagcacaagtgtgaaatatgatttatatcctgat
gagctcaaaacgcatattgatgcatatggtcaggtgaaagacaatttactgcttcatgag
agcggtttcccaactgcgggatatctaaagagtatagtaaaaagcggtaatgttgattcg
agtgtttacggtatggatgccgtaggttcgggaaaaagctcagaaggctcagactggata
atttctcttgtagattcggatgacccgaggccgttgtacattttggcatggggcggcact
aacacacttgcgcaggccctttgggatgtgcaggcaaaccgcagtcaagctgagctgaat
gaattcctcagcaaaattcgtgtttatcctattgcaaagcaggacggttcttataactgg
ttagtaagtaactttgttcaagccggcgatcctgacaagcagcttttctggattgatggc
gctgcgggtgcatggaaaggtatttcagccggtccgagtactatttttgatgtccaggga
ggcgatgagagcctggtttctcatcaatggattgacgataatataagaaataaaggcgct
ttgggtgttccgcaaagatacccttatcatacctatataatggaaggtgatacgccctcg
tttatgtatatgctgcctgtagggattggtgatcctgagcgtcctgagcttggaggatgg
ggcggaagatacagctccgacgggcctttgcataccgccgagatcgataccgtaaatgga
atatctgaaatctacgccagcgtctggcgatggaggcaggcttaccagaatgatttctca
gccaggatggactggtgtgttgaatcatataatcttgctaatcatccgccggaggtagag
gttgaggctgctctggagaggacagtgaaccaaggggatctggtagctttcgatgcccaa
aacagctacgatccggacagcgacaacttaaattaccaatggtacaggtactctgaagca
gatacctattccggttcaatcaatataagcaatcctgatactgcgactgcaagttttact
gcccccggagtcagcagtactgagacaattaatatcattttggccgtaactgataatggt
tcgccaaacctgacgagatataaacaattcgtaataactgttaatccttaa
DBGET
integrated database retrieval system