Pseudoalteromonas sp. Bsw20308: D172_006185
Help
Entry
D172_006185 CDS
T04175
Name
(GenBank) ligand-gated channel
KO
K16087
hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor protein
Organism
pbw
Pseudoalteromonas sp. Bsw20308
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pbw00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pbw02000
]
D172_006185
Transporters [BR:
pbw02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
D172_006185
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALQ09713
LinkDB
All DBs
Position
1437259..1439277
Genome browser
AA seq
672 aa
AA seq
DB search
MSAICTSFSSPISAQELAKSKASVEKISVVGSATNLSITAEEIEQYQASDLADIFRHSPS
VSVGGSVGVAQKIYIRGVEDSLLNITVDGAQQTSTLFHHIGRVTIDPDLLQQIDVQAGAG
EATSGPGAIGGSIRFKTKDAQDLLNQGEQFGGRVKASYFSNDGTRFSTSVYGKLSDTWGL
LGYFSTVDRDNMEDGDGDTIYGTAADQDMMFIKASGELADNHHLSLSIEKRDEEGDFSAR
PNWAVQEGDALYPSEADRETYVANYIFSHNNLLYLEATAYKTESSFNGGRFAWLADIDTY
GLDIRNTSIIDEHKFIYGVDYRNDEVSSGSAAGTKENAEQGSVLGIYAQGYSDITPQLLL
SYGVRFDSYKFKQDILLDEYYGTAITESASSLDDSEVSFNIGLAYDINDAWTVGLGYAEA
ARGKQIGDGFTIDGYLYDGSDIPVADESLVPETVANIEASITYINENLSAKASIYNSSLD
DVIFEGYAGNSVYNNIGTLETKGFEFDLAYRLNSFDFFIGFSATDTELDPRDGLYSVSYD
AIDINGYEFVGLGNSRGNTWVAGVDYDINTDAKVGFSVTKVDSLDIDTLHQAVDLGWTDS
LYTLNKPSYTTVDLYGQWNMTNALLFNVSVTNLFNELYIDHSSVGDYSKVFDTVVGPYES
GRDIRLSISYQF
NT seq
2019 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgagtgccatttgtacatcattcagttcacctatatccgcgcaagaacttgctaaaagt
aaagcatctgttgaaaaaatatctgtagttggctctgcaactaatttgagtattacagct
gaagaaatagaacaatatcaagcaagtgatctggctgatatttttcgacattcaccttct
gttagcgtgggtggctcggtaggcgttgcgcaaaagatctatattcgtggtgttgaagat
tctttattaaatataacggttgatggtgcacaacaaacatcaacgttatttcatcatatt
ggccgtgtaacaatagatccagacctactgcaacaaatagatgtacaagcgggggccggt
gaagcaacaagtggtcctggtgcgattggtggctctatacgctttaaaactaaagacgca
caagacctacttaaccaaggtgaacaatttggtgggcgtgttaaagcaagttatttttca
aatgacggcacgcgtttcagtaccagtgtatacggtaaattaagtgatacatgggggtta
ttaggatatttcagtactgtggatcgcgacaacatggaagatggtgatggcgatactatt
tatggtacagctgctgatcaagatatgatgtttattaaagccagtggtgagttagcagat
aatcatcatttatcgttaagtattgaaaaacgtgacgaagaaggggatttttcagcacgc
cctaactgggcggtacaagaaggtgatgctctgtacccaagtgaagcagatcgagagact
tacgttgctaattatatattttctcacaataacttattgtacttagaggcaacagcatac
aaaaccgaatcatcttttaatggtggtcgttttgcttggcttgctgacattgatacatat
ggcttagatattcgcaatacaagtattattgatgagcataaatttatttatggtgttgat
tatagaaacgatgaagtgtcgagcggatctgcagcaggtacgaaagaaaatgcagaacaa
ggcagtgtacttgggatttatgcgcaaggttatagtgatattaccccacaacttttactg
agctatggggtgcgttttgatagttataagtttaaacaagacatcttattagatgaatat
tatggcactgcaattacagaaagcgcatcgagtttagacgatagtgaagtaagttttaat
ataggtttagcatatgatattaatgatgcttggacagtagggcttgggtatgctgaagcc
gcgcgtggtaaacaaataggggatggctttaccattgatggatatttatatgatggctca
gatattcctgtggcggatgaaagtttagtacctgagaccgtagctaatattgaagcatct
ataacgtacattaatgaaaatttatccgctaaagccagtatttataattcgtctttagat
gatgtgatatttgaagggtatgcaggtaactcggtttataacaatataggcacgttagag
actaaagggtttgagtttgacctagcatatcgcttaaattcatttgatttcttcattgga
ttttcagctactgatacagagcttgacccacgtgatgggttgtacagtgtaagttatgat
gcaattgatattaatggctatgagtttgtcggtttaggtaatagcaggggcaatacatgg
gttgctggcgttgattacgacattaacactgatgcaaaggttggttttagtgtaactaaa
gtcgattcactcgatattgatactcttcatcaagctgttgaccttggttggactgattct
ttatataccctaaataaaccaagctataccactgttgatttatatgggcagtggaatatg
acgaatgcattattatttaatgtttctgttactaacttatttaatgagttatatatcgat
cattcaagtgtgggtgattacagtaaagtatttgacactgttgttggtccatacgaatct
gggcgcgatattcgcttatcgatttcttatcagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
