Clostridioides difficile 630: CDIF630_03254
Help
Entry
CDIF630_03254 CDS
T03885
Name
(GenBank) putative AMP-binding protein
Organism
pdc
Clostridioides difficile 630
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AMP-binding
AMP-binding_C
DUF5866
PA28_alpha
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJP12734
UniProt:
Q184G0
LinkDB
All DBs
Position
complement(3434856..3436247)
Genome browser
AA seq
463 aa
AA seq
DB search
MNYYELLRIKKERHKNKNFLIIDGEKYTYENILSYSEELGKQISLGENIPILIYSKNIMF
QLISFFAINYSKNIPIICHYNLSKKVLDDILLKNNISIIISDESMDVIDLYDDNNNEVAK
KVNFSIFNPKFNIYMYQYKNLINYLDKSICMGALSSGSTSVPKVLYRTYKSWAGFFPIQN
DIFNISGESILFVNGTLSFTGNLNSIMSVLYEGGSIVISSGLNCKSWIRTIKQYNVTNIY
LIPTKLQLLVRHLKEPVLKVVSIFTGSQLLFEDTARNLKKYMPKSEIILYYGASELNYIT
YLCYDELIEKPLSVGRPFPGIDIYIREGKIFVNTEYAVYNVTKPYSVNDIGYYDNDGYLI
FEGRSDDIINIGGFKVSSTKIENEVKKIPQIEDAIVLPYSDTIRGNQIVLFVITIDKITK
KDLLIKMKDNLMKNEIPKKIIFLNSFPYTSSEKIDRLALLKML
NT seq
1392 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaactattatgaacttttaagaataaaaaaagagaggcataaaaataaaaatttttta
attatagatggagaaaaatatacttatgaaaatatattgagttatagtgaggaactagga
aagcaaatttctttaggtgaaaatatcccgattttaatatattctaaaaatataatgttt
cagttgattagtttttttgctattaattattcaaaaaatattcctattatttgtcattat
aatctttctaaaaaagtattagatgatattttattaaaaaataatatttcaatcattata
tctgatgaatctatggacgttattgatttatatgatgataacaataatgaagtagcaaaa
aaagttaatttttctatttttaatcctaaatttaatatatatatgtatcaatataagaac
cttataaattatttagataaaagtatttgtatgggagctttatcttcaggttctacaagt
gttccaaaggtattatatagaacatataagagttgggctggattttttcctatacaaaat
gatatttttaatatctctggggaatcaatcttgtttgttaatggaacacttagttttaca
gggaatctaaattctataatgtcagtattatatgaaggaggtagtattgtaataagttca
ggtcttaattgtaaatcatggataaggacaataaaacaatataatgtaactaacatatac
cttatacctacaaaacttcaacttttggttagacacttaaaagaaccagtactcaaagtt
gtaagtatttttacagggtctcaattattatttgaagatactgcaagaaatctaaaaaaa
tatatgccaaagtctgaaattattttatactatggggcaagtgaattaaattatattaca
tatttatgctatgatgaactaattgaaaaacctctaagtgtaggcagaccatttccagga
atagatatatatattagagaaggaaaaatttttgtgaatacagaatatgcagtatataat
gtaaccaaaccttattctgtcaatgatattggatattatgataatgatggatacttaata
tttgaaggaagaagtgatgacattataaatattggaggatttaaagttagttctactaag
attgaaaatgaagttaaaaaaattcctcaaattgaagatgcaattgtattgccgtactca
gacactataagaggaaatcaaattgtattatttgtaataactatagacaaaattacgaag
aaagatttgttgattaaaatgaaagataatctaatgaaaaatgaaatcccaaagaaaatt
atctttttaaattcatttccatatacctcttctgaaaagatagatagattagcattatta
aaaatgttataa
DBGET
integrated database retrieval system