Pseudoalteromonas donghaensis: D0907_07275
Help
Entry
D0907_07275 CDS
T05890
Name
(GenBank) LacI family transcriptional regulator
Organism
pdj
Pseudoalteromonas donghaensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peripla_BP_3
Peripla_BP_1
LacI
Peripla_BP_4
HTH_Crp_2
HTH_5
HTH_IclR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXV65074
LinkDB
All DBs
Position
complement(1599132..1600151)
Genome browser
AA seq
339 aa
AA seq
DB search
MKGKATSFDIAHYAGVSQSTVSRALRNSPLVNEETRRRVHEVAKQLNYKVDKNASNLRTQ
QSSTLALLLFEDPTSDESQINPFFLAMLGSITRACAKEGYDLLVSFQSSSSDWQADYEDS
HRADGLILLGYGDYLDYQPKFRTLIEQNTKFVCWGASVDNRPDLTVSCDNYGGGKMAAQH
LLATGRTDCAFIGDASDHSPEFFARYHGFKDAFLAKGITLSERKMANAISTEESGYHATR
SLIANNIRFNSLFAASDLIAIGAIRALKEAKINVPDDVHVVGFDNIAVASFVNPPLTTVQ
QDTTLAGQMLVDNLLKLIRGEPVENTLLPPRLIIRGSSI
NT seq
1020 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaggtaaggctacatcatttgacattgcacactatgcaggtgtgtctcagtcaacc
gtgtctcgcgcactcagaaatagtccgctggtcaacgaagaaacacgtcgacgagttcac
gaggtcgcaaaacagcttaattataaagtagataaaaatgccagtaacttgcgcacgcaa
caaagcagtaccctcgcgctgttactctttgaagatcctacatcggatgagtcacaaata
aatcctttctttttggccatgcttggcagtattacgcgtgcttgcgcaaaagaaggctac
gatttattggtttcctttcagtcaagtagctctgattggcaagccgactatgaagatagt
caccgcgctgatggccttatattacttggctatggcgactacttagactatcaacccaag
tttagaaccttaattgagcaaaacaccaagtttgtttgttggggagccagtgtagataac
cgccctgacttaacggttagctgtgataattatggtggcggaaaaatggcggcgcagcat
ttactggcaaccggtcgcaccgattgtgcttttataggtgatgcatcagaccatagccct
gaattttttgctcgctaccacggttttaaagatgcctttttggcaaaagggattactctt
agcgaacgaaaaatggccaatgcaatttctacagaagagtcaggttaccatgccactcgt
tcactgattgctaataatattcgctttaactcgctgtttgctgcgagtgacttaattgct
attggtgctattcgggctttaaaagaagcaaaaatcaacgtgcccgacgatgttcatgtt
gtagggtttgataatattgctgttgcgagttttgttaatccaccgctaacaacagtacag
caagacaccacactcgcagggcaaatgttagttgataaccttttaaaactaattcgaggt
gaaccggttgagaacaccctactcccgccgcgtttaatcattcgaggttcaagtatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
