Pediculus humanus corporis (human body louse): Phum_PHUM293360
Help
Entry
Phum_PHUM293360 CDS
T01223
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase I largest subunit, putative
Organism
phu
Pediculus humanus corporis (human body louse)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8229707
NCBI-ProteinID:
XP_002427074
VectorBase:
PHUM293360
UniProt:
E0VLT0
LinkDB
All DBs
AA seq
1659 aa
AA seq
DB search
MAVEKVEINKIIFGIFNASDIYNLSVVEIKTSICFNALDHPLKDGLYDLVMGPSGMLKES
CLTCRQTIRNCCGHFGHINLPLPVINPLFHKEVLTLLKLSCSYCYKLAIPPNLRNLFIYQ
MKLLDHGKMAEAEDLETKALNLKEMDSNDAQNYVVKENYSEYLKELELDSNPVNIPSSRS
IESLRLKFLNEFIKQIILPKSCTHCKNPFKRIIKFQNKIISSITKVEIAKKFKDVPQNAF
NKGSKQETTFITPKESRETLRKIWEESKDLVEELMPILKNSNLSYPTDLFFMDVILVTPP
KARPVEFANVKAVDTGDYNSFPPEYKVYIDGIRGATVLEKLHECWLQLQNDIDTLLDSSA
ARISLKKGISGLKQVLEKKEGVLRMHMMGKRVNFAARTVITPDPNLNIQEIGVPEYFAKK
LTYPVGVNFFNVEELRKMVQNGPDVYPGATLIENENGSLIKLTGGEENRKKRIGISKLLL
KSIEGDPTSFKTKKVHRHLLNGDIVLLNRQPTLHRPSIMAHIVKILKNEKTFRLHYSNCK
AYNADFDGDEMNLHLPQTELSRSEGYNIVNVANHYLVPKDGTPLGGLIQDHIVSTVRLTM
KNQMFEKEDYHQLVYQGLSHKNGNIILLPPCIVKPKKLWSGKQIISTILINIIPKDKDLI
SFNGNAKISVKLWETGSPRKWMCGEEFKSDNEMSESSIILRKGILVTGVLDKQHFGATPF
GLTHCLYELYGGECSSKFLNSIGRLSTAFLQMTGFTLGVEDILVKAKADKSRKKIIEKLR
KCGDEIAAKALGLEEIPNDLYERLEREYFKNRTMFKGKLDQEYKVKLNSFTNEINKVCLP
KGLISRFPENNLQLMVTSGAKGSTVNTMQISCLLGQIELEGKRPPFMISGKSLPSYKAFD
TQPCAGGYIDNRFMTGISPQEFFFHCMAGREGLIDTAVKTSRSGYLQRCLIKHLEGVSIG
YDGTVRDHDGTVIQFIYGGDGLEVQKSTFFKPTHMEFLHNNLNAVVKKSVIESLKADVPY
KKIEAYREEVMAGINLSKKVLAPFTSFSQSIKNDIRNKYFTKLDKRTGRTKAYSKMLKKW
NALADEDKQLYKQEVRLDPVTSKYNRNHDFGVITEKLETLIKDYLDAKCSNQSKKEKKKV
KNMVEAKYMLSLCQPGEPVGLLAAQSIGEPSTQMTLNTFHFAGRGEMNVTLGIPRLREIL
MTASKSIKTPYVDVPLKKKSEKKMLKNGNKLKKIFQRVTLADVLETITVHEKVIFKPSPL
FTYTIRFKFLPHSFYKDDYLIKPKDVLEYVEKPFLILLCKEIRKLSKKFGDIIFESKEEK
MISKEDEEKDDADNVDSAGVNFNKYRGFGENHESSDEEEELDDDDATKEKVRNRHCENQE
YDEPEESEEEKSDEENDTLYQDEPSEYEEETERRVELGEEESESRDIPEINLTSEELKNV
ENRKNFVLNTFPMIKKYDFDVVKEEWCEMVVGIPLTLNKIDFSTILKVICGKSVLYQIPN
VRRAFVYKNPSGELHLKTEGVNFNEMFKFYKMIDINRLYSNDVNKVVETLGIEAGVRIIV
KELNDVFGVYGITVDHRHLLLVADYMTNQGNYSPFNRIGLADSSSPLQQMSFERSTGFLK
KSLVRNQEDFMNSPSARIMAGRFCKSGTGCFDVMTLPSI
NT seq
4980 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgttgaaaaagtggaaatcaacaaaataatatttggaatatttaatgcatctgat
atatacaatctcagtgtagtggagatcaagacttcaatatgttttaatgctcttgatcac
ccattaaaagatggattatacgatttagttatgggtccttctgggatgttaaaagagtct
tgtttaacatgtagacaaacaattcgcaattgttgtggacattttggtcatattaattta
ccactgccagttataaatccattgtttcacaaagaagttttaacattattaaaattatct
tgtagctattgttataagttggcaatacctccgaatttaagaaacttatttatttaccaa
atgaaacttctagatcatggtaaaatggcagaagcagaagatttagaaacgaaggctttg
aacttaaaagaaatggattcaaatgatgctcaaaattatgttgtaaaagagaattattca
gaatacttaaaagaattagaattggattcgaatccagttaatattccttcatcgaggagt
attgaatctttgcgtttaaaatttctcaatgaatttataaaacaaataattcttcccaag
tcatgcactcattgcaaaaatccttttaaaagaattatcaagtttcaaaataaaataata
agctccattacgaaagttgaaatagcaaaaaaatttaaagatgttccacaaaatgctttt
aataaaggttcaaagcaagaaacaacgttcataactccaaaagaatcaagagagacactt
cgaaaaatttgggaagaaagtaaagatttagtagaagaattgatgccaattttaaaaaat
tcaaatttaagctatcctacggatttattttttatggatgtaatattggtcactccacca
aaagccagaccagtagaatttgctaatgtgaaagccgtcgacactggtgattataacagt
ttccctccagaatataaagtttacatcgatgggattcgtggagccacagttttggaaaaa
cttcatgaatgctggttacaattacaaaatgatattgatacattattagattcaagtgca
gctcgaatttctttaaaaaaaggcatatctggattgaaacaagttttagaaaaaaaagaa
ggtgttttaagaatgcacatgatgggtaaaagagttaattttgcagcaagaacagtaata
actcctgatccaaatttaaatattcaggaaatcggtgtgccggaatatttcgccaagaaa
ttgacgtacccagtcggcgtaaatttttttaacgtcgaagaattaagaaaaatggttcaa
aatggtcctgatgtttatccaggagcgaccctaattgaaaatgagaacggctcactaata
aaacttacaggtggggaagaaaatagaaaaaaaagaataggaatttccaagttgttattg
aaatcaattgaaggagatccaacttcatttaaaactaaaaaagttcatagacatttgcta
aacggagatattgttcttttaaatcgacaacccactcttcatcggccgagtattatggct
cacattgtaaaaattttaaaaaacgaaaagacgtttagactgcattattctaattgtaaa
gcctacaatgctgattttgatggagatgaaatgaaccttcatttacctcaaaccgaatta
tcaagaagtgaaggctataatatagtaaatgttgcgaatcattatttggtacctaaagac
ggaacacctttaggtggtctcattcaagatcatattgtatctacagtccgattaacaatg
aagaaccaaatgtttgaaaaagaagattatcatcaactagtgtaccaaggtttatctcac
aaaaatggaaatataattttattacctccgtgtattgtcaaaccgaaaaaattatggtcc
ggaaagcaaataatttctaccattttaattaacattattcctaaagacaaggatttaatt
tcatttaatggaaatgctaaaattagcgtcaaattatgggaaacaggatcacctagaaaa
tggatgtgtggagaagaatttaaaagtgataacgaaatgtcagagtcctcaattatttta
agaaaaggaatcctggtgactggcgtgttagataaacagcactttggagccactcctttt
ggattaacgcactgtttgtatgaattgtatggcggagagtgttcttcgaaattcttaaac
tccattggccgactaagcactgcttttttacaaatgacgggttttactcttggcgtggaa
gatatattagtgaaagccaaggcagataaaagtagaaaaaaaataattgaaaagttaagg
aaatgtggggatgagatagctgcaaaagcacttggcttggaagaaattccgaatgattta
tacgaaaggttagaaagagaatattttaagaatagaaccatgtttaaaggaaaattagat
caagaatataaggtgaaattaaattcattcacaaatgaaataaacaaagtttgcttgcct
aagggtttaatttccagatttccagaaaataatttacaattaatggttacgtcaggagct
aaaggaagtacagttaacacaatgcagatctcttgccttttgggacaaatcgaattggaa
ggcaaaagaccaccctttatgatttctggaaagagccttccttcttataaggctttcgac
actcagccgtgcgctggtggttacatagataatagatttatgacgggtatatctcctcag
gagttttttttccactgcatggctggtagagaaggtttaatcgatactgccgtcaagact
tccagaagtggttacttgcaaagatgtttaataaaacatttagaaggagtaagcataggt
tacgacggaaccgtgagagatcatgatggtaccgtgatacagtttatttacggaggtgac
ggtttagaagttcaaaaatcaactttttttaaacctactcatatggaatttcttcacaat
aatttaaatgcagttgtcaaaaaatctgtgattgaaagcctcaaagccgacgtaccgtat
aaaaaaattgaagcgtacagagaagaagtaatggcaggaataaacctaagtaaaaaggtt
ctcgctcctttcacttctttttctcagtctataaaaaatgatatacgcaataaatatttt
acaaaattagataaaagaacgggaagaacgaaagcgtattctaaaatgcttaaaaagtgg
aatgccttagccgatgaagataaacaactttacaagcaagaagttcgattagatccagtt
acgtccaagtataacagaaatcacgactttggtgtgataacagaaaaattggaaacttta
ataaaggattatttagatgcgaaatgttcaaaccaatcgaaaaaagaaaagaagaaagtt
aaaaatatggtagaagccaaatacatgttatcattatgtcaacctggagaaccagtgggt
cttttggctgctcaatcaattggtgaaccatccactcaaatgactttaaatacttttcat
tttgccggaagaggagaaatgaacgtaactcttggtatacccaggctcagagaaatttta
atgacggcatcgaaatcaataaaaactccttacgttgacgtgcctttgaagaaaaagtct
gaaaaaaaaatgttgaaaaacggtaataaattgaaaaaaatatttcagagagtgacgcta
gccgatgttttagaaacgattacggttcatgaaaaagttatttttaaaccaagtccttta
tttacatacacgattagatttaaatttcttccacatagtttctacaaggatgattattta
ataaaacctaaagatgtgctggaatacgtggaaaaaccttttctcatattgctgtgtaag
gaaattagaaaattaagtaaaaaatttggtgacattatattcgagtcgaaggaagagaaa
atgataagcaaagaagacgaagaaaaagacgacgcggataatgtggattccgcaggagtc
aattttaataaataccgaggtttcggagaaaatcacgagagttccgatgaagaagaagaa
ttggatgatgacgatgcgaccaaggaaaaggtaaggaatagacattgcgaaaatcaagaa
tacgacgaacctgaagaatcggaagaggaaaaaagcgacgaagaaaatgacactctgtat
caggacgaaccgtcggaatacgaagaagaaacggaaagaagagttgaattaggggaagaa
gaaagcgaatcccgggacattccagaaatcaatttgacaagcgaagaattgaaaaatgtc
gaaaatagaaaaaatttcgttttgaatacatttccgatgataaaaaaatacgatttcgac
gttgtcaaagaagaatggtgcgaaatggtcgtgggtatacccctcaccctaaataaaatt
gatttttcaacgatattgaaagtgatttgcggaaaatccgttctgtatcaaatccctaac
gtcagacgagctttcgtttataagaatccgtccggagagctgcatttgaaaacggaaggg
gttaatttcaacgaaatgttcaaattttataaaatgatcgacataaacagactttattcg
aacgacgtgaacaaagtggtcgaaactttaggaatcgaagccggtgtgagaataatcgtc
aaagaattaaatgacgtcttcggagtgtatggaatcaccgtcgatcacagacatttacta
ctggttgccgattacatgacgaatcaaggtaattattcaccatttaacagaataggtttg
gcagacagttccagtccgctccagcaaatgtcctttgaaagatcaacgggatttttgaaa
aaatcactcgtgagaaatcaagaggatttcatgaattcgccaagcgcgagaataatggct
ggaagattttgtaaaagcggaaccggatgttttgacgtcatgactttaccgagtatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
