Populus trichocarpa (black cottonwood): 7468091
Help
Entry
7468091 CDS
T01077
Name
(RefSeq) vacuolar-sorting receptor 1 isoform X1
Organism
pop
Populus trichocarpa (black cottonwood)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PA
cEGF
EGF_CA
FXa_inhibition
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7468091
NCBI-ProteinID:
XP_002309184
UniProt:
B9HDJ2
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(8450014..8455928)
Genome browser
AA seq
625 aa
AA seq
DB search
MREKLGFLVGVWLLLCGFCFGRFVVEKNNLKLTSPDSLKGVYECAIGNFGVPQYGGTLVG
TVIYPKANQKACKGFDGVDISFKSRPGGLPTFVLVDRGDCYFTLKAWNAQNGGAAAILVA
DDKDEPLITMDTPEEENADADYLQNITIPSALISKSLGDSIKKAISNGEMVNMNLDWTEA
LPHPDERVEYEFWTNSNDECGPKCDSQIEFIKNFKGAAQILEQKGYTQFTPHYITWYCPE
AFVLSKQCKSQCINHGRYCAPDPEQDFSKGYDGKDVVVQNLRQACFYKVANESKKPWLWW
DYVTDFSIRCPMKEKKYTKECADQVIQSIGVDLKKIDICIGDHEADVENEVLKAEQHVQI
GKGSRGDVTILPTLVINNRQYRGKLDKGAVLKAICAGFEETTEPAICLSEDVETNECLEN
NGGCWQDRAANLTACKDTFRGRVCECPMVQGVKFVGDGYTHCNASGSLRCEINNGGCWKK
TQDGTTFSACVEDRSQGCKCPPGFKGDGVNSCEDVDECKDKVACQCPECKCKNTWGSYEC
SCSGGLLYMREHDTCISNAARAEYSWSFVWIIILGLATAGVAGYAIYKYRIRRYMDSEIR
AIMAQYMPLDSQADIPVHHAPRGDI
NT seq
1878 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagggaaaagttaggatttttagttggtgtatggcttttgctttgtgggttttgtttt
ggtaggtttgtagtcgagaaaaacaacttgaaactaacatcacctgattcattgaaaggt
gtttatgaatgtgcgattggtaattttggagttcctcaatatggagggaccttagtcggt
actgtgatctatccaaaagctaatcaaaaggcatgcaaagggtttgatggggttgatatc
tctttcaaatctagacctggagggttacctacttttgtccttgttgatcgtggagattgt
tacttcaccctgaaggcatggaatgcacagaatggtggagcagcagctattcttgtagca
gatgacaaggatgaaccattgattaccatggacacccctgaagaagagaatgcagatgct
gattatctgcagaatatcactatcccctcagcacttattagcaagtccttgggggatagt
atcaagaaagctatatctaatggagagatggttaacatgaatcttgattggacagaggct
cttccacatcctgatgagcgggttgagtatgagttttggacaaatagcaatgatgaatgt
gggccaaagtgtgacagtcagattgagtttatcaagaacttcaaaggtgcagcacagata
cttgagcagaagggttatactcagttcacccctcactatataacatggtattgcccagag
gcatttgttctgagcaaacaatgcaaatcccagtgcatcaaccatgggagatactgtgct
ccagatcctgagcaggatttcagcaaagggtatgatggaaaagatgttgtagttcaaaat
ctacgccaagcttgcttttataaagttgccaatgaaagtaaaaagccatggctttggtgg
gactatgtgactgatttttcaatccgttgcccaatgaaagagaagaaatacaccaaagag
tgtgcagatcaagttattcaatctattggtgttgatctcaagaagatagatatatgtata
ggagaccatgaggcagatgtggaaaacgaagttcttaaagctgaacaacatgtgcagatt
ggaaaaggttctcgaggagatgtgactatacttccaactctcgtgataaacaacaggcag
tatagaggtaagttggacaaaggagcagttctcaaggcgatttgtgcaggttttgaagag
actacagagccagccatttgtttaagtgaagatgtagaaaccaacgagtgtctagaaaat
aatggtgggtgctggcaggacagggctgctaaccttactgcatgcaaggatacttttcgg
ggtcgggtatgtgaatgtccaatggtacaaggtgtgaagtttgttggtgatggttatact
cattgtaatgcttcaggttctttacgctgtgaaattaacaacggaggatgctggaagaaa
actcaagatggcactacgttttctgcttgtgttgaagatcgttcacaaggttgcaagtgt
cctccaggattcaagggtgatggagtaaattcctgtgaagacgtggatgaatgcaaagac
aaggtagcttgccagtgtccagaatgcaaatgcaagaatacctggggcagttatgagtgc
agctgcagtggtggtttattatacatgcgagaacatgacacttgcataagtaatgctgct
agggcagagtacagctggagctttgtttggattattattcttggcttggctactgctgga
gttgctggatatgcaatttacaagtacagaattcggagatacatggattcagagattcgg
gctatcatggcgcagtatatgccattggatagtcaagcagacatccctgttcatcatgct
ccccgtggggacatctga
DBGET
integrated database retrieval system
