Psychrobacter sp. PAMC27889: E5677_05315
Help
Entry
E5677_05315 CDS
T06076
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
psyp
Psychrobacter sp. PAMC27889
Pathway
psyp02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psyp00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
E5677_05315
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_6
Big_13
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCB30458
UniProt:
A0A7Z1YDG4
LinkDB
All DBs
Position
1242367..1248696
Genome browser
AA seq
2109 aa
AA seq
DB search
MLQATDKINYEFLDESTGYAPNNIITKRVGQDLQISFESDSVDPDLIIEGFYDATESALI
GVAEDGSYYYYVPDTGEVADYVTELEAGEIQGQSLGGDAQVSPWWVGATESGAFNALPWL
AGLAGIGLATAAFSNDDNDDSDADADADADADADADADADADADADADADADADADADAD
ADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADAD
ADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADTDADADADADADAD
ADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADAD
ADADADADADAPTIDTPIAGDDIVNAAEVAAGFTVTGTGTEGDTITLTNGAGALIGTALV
DADGNWSVLVDQADVDAMGEGAETLTATATNTAGNTSTATTNIIVDITAPDAPVVTINDD
GDSVTVTGEEGAAVVITTPTGVIEGTIVDGVFTAVLDPALTNGEEVSATLTDDAGNVSDP
GTENALDTTAPGIPAVVIGNDDDTINGFDLNEDGDVIVNVSLPINALVGDTLTVNGLEIP
VTQDMLDNGYDTAVTPPAEGEVLTVTASVTDQAGNTSPIATISATVGDITAPGIPAVVIG
NDDDTINGFDLNEDGDVIVNVSLPINALVGDTLTVNGLEIPVTQDMLDNGYDTAVTPPAE
GEVLTVTASVTDQAGNTSPIATISATVGDITAPGIPAVVIGNDDDTINGFDLNEDGDVIV
NVSLPINALVGDTLTVNGLEIPVTQDMLDNGYDTAVTPPAEGEVLTVTASVTDQAGNTSP
IATISATVGDITAPGIPAVVIGNDDDTINGFDLNEDGDVIVNVSLPINALVGDTLTVNGL
EIPVTQDMLDNGYDTAVTPPAEGEVLTVTASVTDQAGNTSPIATISATVGDITAPGIPAV
VIGNDDDTINGFDLNEDGDVIVNVSLPINALVGDTLTVNGLEIPVTQDMLDNGYDTAVTP
PAEGEVLTVTASVTDQAGNTSPIATISATVGDITAPGIPAVVIGNDDDTINGFDLNEDGD
VIVNVSLPINALVGDTLTVNGLEIPVTQDMLDNGYDTAVTPPAEGEVLTVTASVTDQAGN
TSPIATISATVGDITAPGIPAVVIGNDDDTINGFDLNEDGDVIVNVSLPINALVGDTLTV
NGLEIPVTQDMLDNGYDTAVTPPAEGEVLTVTASVTDQAGNTSPIATISATVGDITAPGI
PAVVIGNDDDTINGFDLNEDGDVIVNVSLPINALVGDTLTVNGLEIPVTQDMLDNGYDTA
VTPPAEGEVLTVTASVTDQAGNTSPIATISATVGDITAPGIPAVVIGNDDDTINGFDLNE
DGDVIVNVSLPINALVGDTLTVNGLEIPVTQDMLDNGYDTAVTPPAEGEVLTVTASVTDQ
AGNTSPIATISATVGDITAPVSIDAVDDFDTAEIIVTPVTTTENLQNTAASLINVLGIGN
ARPTVSFDIAEGSTGTAVITLSGGGLAEIVDRSSLVLQVKDASGNYVNVANSSNIGLINV
LGLFGEGAGFRIEDLPAGEYRINGNVGGLIGVLETGTIRAIITETDPSVVGTITTEAATG
NVIDDNDVATQSTIVTEVNGQPVNSTGNTTIIGDHGTLIINSDGAYTYTPNSTVSEIGQM
DEFVYIIVDPITSSTDSATLTVGINSDYPAVNFPIDAVDDIAGTKLIVEPLTTVENLQDS
DTALTGFTNTSVSFDIAAGNVGSADIAITAGGISILDSATVILQKQRANGTWETIDSSSG
GSLIEVIGILGDATRFSIDGLEAGNYRINGRAGGLLGVVPNHTIKAIVTEIDPDVPGTYG
SQAAVGNVISDNDDVTLSTVVSSVDGVAVTGATLIDGDFGTLTIKPDGSYFYTPDGNVNV
INQVDQFEYTIVDDFNNTDTATLTINITSDWPAPAPVTADSMPFDDSFIFADDSSDDTIE
LPDTSLTFSSEGLDVLSFEGADQVISLADLMQPETLDIIDISGLGANTLNVAAEDISSTL
YIKGDSDDTVDLGGAGDDLSDTDGASNPSSWFDTGVDVTDTGGHAYNVWQLDSDISTQMY
IDTNITNVI
NT seq
6330 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgctccaagctaccgataaaattaactatgagtttcttgatgagtcaacgggttacgcc
cccaacaacattattactaaacgtgtcggtcaagaccttcagatttcttttgaaagtgat
agtgtcgatcctgatctgattattgagggattctacgatgctactgagagtgcgcttatc
ggtgtcgcggaagatggtagttattactactatgttcctgatactggtgaagttgctgac
tatgtcactgagttagaagcaggtgagatacaaggacaatcattgggcggagatgcgcag
gtttcgccttggtgggtaggagctacggagtctggcgcttttaatgcgctgccttggttg
gcgggtcttgcaggaataggccttgctaccgctgctttctctaatgacgataacgatgac
agtgacgccgatgctgatgctgatgccgatgcagacgctgatgcagacgccgatgcagac
gccgatgccgatgccgatgcagacgctgatgcagacgccgatgcagacgccgatgccgat
gctgatgccgatgctgatgcagacgcagacgctgatgctgatgctgatgctgatgcagac
gccgatgctgacgccgatgctgacgccgatgcagatgccgatgcagatgccgatgcagat
gccgatgccgatgccgatgccgatgccgatgccgacgctgatgctgatgctgatgctgat
gctgatgccgatgcagacgccgatgcagacgccgatgcagacgccgatgcagacgccgat
gcagacgccgatgccgatgctgatgcagacgccgatgccgatgccgatgccgatgccgat
gctgatgctgatgctgatactgatgcagacgccgatgccgatgctgatgcagacgctgat
gccgacgccgacgctgacgccgacgctgacgccgacgctgacgccgacgctgacgccgac
gctgacgctgacgccgacgctgacgccgacgctgatgctgacgccgacgctgatgctgac
gctgacgccgacgctgatgctgatgcagatgcagatgcagatgcagacgctgatgctgat
gctgatgctgatgctgatgcagacgctgatgccccaacgattgatacgccaattgcaggc
gatgacattgtcaatgccgctgaagtcgctgcaggctttaccgtcacaggaacaggcaca
gaaggggataccatcaccttgaccaatggagcaggggcgctcattggtaccgcccttgtc
gatgccgatggcaactggagtgttcttgtcgatcaagccgacgtggacgccatgggtgaa
ggtgcggaaacgttgacagcgacggctacaaatactgcagggaacacttccactgcgact
accaatattatagtggacatcaccgcgcctgatgcccctgtggtaactatcaatgatgat
ggcgactcagtgaccgtcacgggtgaagaaggggctgcggttgtcatcaccacaccaact
ggtgtgattgaaggcacgattgtagacggtgtctttacggccgtgcttgatcctgcctta
accaatggtgaagaggtcagcgccacgttaactgatgatgcgggtaacgtatccgatcca
ggcacagaaaatgccctagacaccacagcgccaggcatcccagctgtggtgattggcaat
gatgatgacaccatcaatggctttgacttgaatgaagatggcgatgtgatcgtgaatgtg
agcttaccgatcaatgctttggtgggtgacaccctcactgtaaacgggttagaaatccca
gtaacccaagacatgcttgataacggctatgacaccgccgtgacgccgcctgcagaaggt
gaggtattgacggtcaccgcaagcgtgaccgatcaggcaggtaacaccagtccgatagcc
acaatcagtgccactgtgggtgatatcacagcgccaggcatcccagctgtggtgattggc
aatgatgatgacaccatcaatggctttgacttgaatgaagatggcgatgtgatcgtgaat
gtgagcttaccgatcaatgctttggtgggtgacaccctcactgtaaacgggttagaaatc
ccagtaacccaagacatgcttgataacggctatgacaccgccgtgacgccgcctgcagaa
ggcgaggtattgacggtcaccgcaagcgtgaccgatcaggcaggtaacaccagtccgata
gccacaatcagtgccactgtgggtgatatcacagcgccaggcatcccagctgtggtgatt
ggcaatgatgatgacaccatcaatggctttgacttgaatgaagatggcgatgtgatcgtg
aatgtgagcttaccgatcaatgctttggtgggtgacaccctcactgtaaacgggttagaa
atcccagtaacccaagacatgcttgataacggctatgacaccgccgtgacgccgcctgca
gaaggtgaggtattgacggtcaccgcaagcgtgaccgatcaggcgggtaacaccagtccg
atagccacaatcagtgccactgtgggtgatatcacagcgccaggcatcccagctgtggtg
attggcaatgatgatgacaccatcaatggctttgacttgaatgaagatggcgatgtgatc
gtgaatgtgagcttaccgatcaatgctttggtgggtgacaccctcactgtaaacgggtta
gaaatcccagtaacccaagacatgcttgataacggctatgacaccgccgtgacgccgcct
gcagaaggtgaggtattgacggtcaccgcaagcgtgaccgatcaggcaggtaacaccagt
ccgatagccacaatcagtgccactgtgggtgatatcacagcgccaggcatcccagctgtg
gtgattggcaatgatgatgacaccatcaatggctttgacttgaatgaagatggcgatgtg
atcgtgaatgtgagcttaccgatcaatgctttggtgggtgacaccctcactgtaaacggg
ttagaaatcccagtaacccaagacatgcttgataacggctatgacaccgccgtgacgccg
cctgcagaaggtgaggtattgacggtcaccgcaagcgtgaccgatcaggcaggtaacacc
agtccgatagccacaatcagtgccactgtgggtgatatcacagcgccaggcatcccagct
gtggtgattggcaatgatgatgacaccatcaatggctttgacttgaatgaagatggcgat
gtgatcgtgaatgtgagcttaccgatcaatgctttggtgggtgacaccctcactgtaaac
gggttagaaatcccagtaacccaagacatgcttgataacggctatgacaccgccgtgacg
ccgcctgcagaaggtgaggtattgacggtcaccgcaagcgtgaccgatcaggcaggtaac
accagtccgatagccacaatcagtgccactgtgggtgatatcacagcgccaggcatccca
gctgtggtgattggcaatgatgatgacaccatcaatggctttgacttgaatgaagatggc
gatgtgatcgtgaatgtgagcttaccgatcaatgctttggtgggtgacaccctcactgta
aacgggttagaaatcccagtaacccaagacatgcttgataacggctatgacaccgccgtg
acgccgcctgcagaaggtgaggtattgacggtcaccgcaagcgtgaccgatcaggcaggt
aacaccagtccgatagccacaatcagtgccactgtgggtgatatcacagcgccaggcatc
ccagctgtggtgattggcaatgatgatgacaccatcaatggctttgacttgaatgaagat
ggcgatgtgatcgtgaatgtgagcttaccgatcaatgctttggtgggtgacaccctcact
gtaaacgggttagaaatcccagtaacccaagacatgcttgataacggctatgacaccgcc
gtgacgccgcctgcagaaggtgaggtattgacggtcaccgcaagcgtgaccgatcaggcg
ggtaacaccagtccgatagccacaatcagtgccactgtgggtgatatcacagcgccaggc
atcccagctgtggtgattggcaatgatgatgacaccatcaatggctttgacttgaatgaa
gatggcgatgtgatcgtgaatgtgagcttaccgatcaatgctttggtgggtgacaccctc
actgtaaacgggttagaaatcccagtaacccaagacatgcttgataacggctatgacacc
gccgtgacgccgcctgcagaaggtgaggtattgacggtcaccgcaagcgtgaccgatcag
gcgggtaacaccagtccgatagccacaatcagtgccactgtgggtgatatcacagcgcct
gtcagtatagatgcagtggacgattttgatacagcagaaattatcgttacgccagtgacg
actactgagaatctacaaaacacagctgcctcactcataaacgtgttaggcataggtaat
gctagacctacagttagctttgatatcgctgaaggcagtacaggtacggcagtaattacc
ttgtctggaggtggtttagctgaaattgtcgatagaagtagcttggttctgcaagtgaaa
gatgctagtggtaactacgttaacgtcgccaattctagtaatattggcttgatcaacgta
cttggtctctttggtgagggagcaggctttaggatagaagatctcccagcgggtgaatac
cgtatcaacggtaatgttggtggactaattggtgtgctagaaactggtactattagggca
atcatcactgagactgatccatcagtggttggcacgatcactacggaagctgccactggt
aatgtcattgatgataatgacgttgcaacgcaatcgaccatagtcacagaggttaatggt
cagccagttaattctactggtaacactactatcataggtgaccatggtactttaatcatc
aactctgatggtgcgtatacttatacgccaaactcgactgttagtgaaattggacagatg
gacgagttcgtatatatcattgttgatccgatcactagtagcaccgacagcgcaacactt
accgtgggcatcaatagtgattatccagcggtcaatttcccaattgatgcagtggatgat
atagcaggtaccaaattgattgttgagcctttgacaactgtcgagaatcttcaagattct
gacacagcattgactggtttcacgaatacgagcgtttcgtttgacattgctgcaggcaat
gtaggttctgctgatattgctataacagcaggcggaataagtattcttgacagtgctacc
gttattctacagaagcagagggctaatggtacttgggaaactatagatagctcttcaggt
ggcagcttaattgaagtcattggtatccttggtgatgctacacgcttctctatagatggt
ctagaagcaggtaactatcgtattaatggtagagctggtggacttcttggtgtggtacca
aatcatacgataaaagccatcgtgactgagattgatccagatgtaccaggcacttatggt
tcgcaagctgcggttggcaatgttatcagtgacaatgatgatgtaactttatcgactgtt
gtttcatcagttgatggtgtagctgttactggtgctaccctcatagacggcgacttcggt
acgcttacgatcaaaccagatggttcgtatttctatacccctgatggtaatgttaatgtt
atcaatcaagtggatcagtttgagtatacgatagttgatgattttaataataccgataca
gccacactgaccattaatattacgagtgattggcctgctccagcgccagttactgcagat
agtatgccattcgatgatagttttatatttgctgatgatagcagtgatgacactatcgag
ctacctgatacatcattgactttctcaagtgaaggacttgatgttctaagttttgagggc
gcagatcaagtgattagcttagcggatcttatgcaacctgaaacgcttgatatcatcgat
atcagtggtttgggtgcgaataccttgaacgtggcagctgaagatataagctctactctt
tatatcaaaggtgatagtgatgataccgttgatttaggcggcgctggcgatgaccttagt
gatacagatggcgctagtaacccttcaagttggttcgatacaggagtggatgtcacagat
actggtggacatgcatataatgtatggcaattagacagtgatatatctactcagatgtac
attgatacgaatattacaaacgttatctaa
DBGET
integrated database retrieval system
