Candidatus Pelagibacter ubique: SAR11_0371
Help
Entry
SAR11_0371 CDS
T00257
Name
(GenBank) possible transmembrane receptor
Organism
pub
Candidatus Pelagibacter ubique
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peripla_BP_6
Peripla_BP_5
LppC
ANF_receptor
DUF465
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAZ21193
UniProt:
Q4FNP6
LinkDB
All DBs
Position
complement(362158..363309)
Genome browser
AA seq
383 aa
AA seq
DB search
MNKIIKIILFLAFGFSITPVALLANEKIRIGLLVPLTGKNSEIGQSIIKSTRLAINTINN
ASIEIIPKDTQSNPEVTLKAAKELANSGIKIVIGPVFNESLIYLSELSELTFLALTNKND
NFSKNIINAGINATSQLNAIKKFIELNEIKKTIFLTPDVGFKNEIEKAISNSKIKILENY
IYNTDPTKLTKQIEKITRYEIRKQNLEDEINRLEKSEQSNKELLIERLKKRDTLGSVKFD
SVVISDFDESLKSVTTSLLYTDITPKEKYFITLNQWFDESLLKETSSQPLYFPSANKDNY
DEFSNEYFEKYNQYPNQLSFLSYDLVGLVYYLILQNESVIDKKMFTKKTLFKGKVGVFEI
KNNKINHILNFYKAEDGEFKKVF
NT seq
1152 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaaattattaaaattatactttttttagcttttggtttctcaattactccagta
gcactcttggcaaatgagaaaattaggattggtcttcttgtccctttaactggaaagaac
tctgaaataggacaatctataattaaatctacacgtcttgcaattaatacaattaacaat
gcatcaattgagattataccaaaagatacacagtcaaaccctgaggtcactttaaaggca
gctaaagagttggctaattcaggaataaaaattgtaattggtccagtttttaacgaaagt
ctaatttacctaagtgagttaagtgaattaacattcttggctctaacgaataagaatgat
aatttttccaaaaacattatcaacgctggaattaatgcaacttcacaactaaatgcaatt
aagaagtttatagaattaaacgaaataaaaaaaactatctttcttactccagatgtaggt
tttaaaaatgaaattgaaaaagctatttctaattctaaaataaaaatattagaaaattat
atttataatactgacccaactaaacttaccaaacaaattgaaaaaattacacgttatgaa
attagaaaacaaaaccttgaagatgaaataaatagattagagaaatcggaacaaagcaat
aaagagctcttaattgaaaggttaaaaaagagagatactcttggtagtgtaaaatttgat
tcagtggtaatttctgattttgatgaaagtttaaaaagtgtaacaacttccctgctttat
acggatataactcctaaagaaaaatattttattactcttaatcaatggtttgatgagtct
cttttaaaagagacaagctcacaacccttgtattttccttctgcaaataaagataattat
gatgaattttctaatgaatattttgaaaaatataatcagtaccctaatcaattgtcattt
ttaagttatgacttggttgggcttgtgtattatttaattcttcaaaacgaatctgttatt
gataaaaaaatgtttactaaaaaaaccttgtttaaaggaaaggttggagtttttgaaatt
aaaaacaataaaattaatcatattttaaatttttataaagctgaagatggagaatttaaa
aaagttttttaa
DBGET
integrated database retrieval system