Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868: RA0C_1200
Help
Entry
RA0C_1200 CDS
T02107
Name
(GenBank) fibronectin type iii domain protein
Organism
rai
Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S8
Por_Secre_tail
fn3
PPC
CRLF2-like_D2
Tissue_fac
TcfC
CRLF2_D1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFD56102
UniProt:
E4TC54
LinkDB
All DBs
Position
complement(1181264..1183897)
Genome browser
AA seq
877 aa
AA seq
DB search
MKKRVLFTGAFTLGASVFFFAQTEQQRLKITKEYNQQKLDKIVDESKLKEQKQKAELAEF
LKKNNLPLKIQHKEGGTSELIRVENGVPIYFTNNNIAAARSTRANHLNTGGSLGLQLDGQ
GMTAYVWDAGSVRPSHREFGNRVTVGDGASHNGDNHATHVGGTIAATGVTAAAKGMASKA
LIRSYDWSSDYSEASTAARAGMLLSNHSYGYNSLSLPDWYFGAYIGESADWDRLMYSAPY
YLMCVAAGNDGSNYGYNQDTGKYELLNASPLGGTTNDYDKLTGHSTSKNALVVANANDAN
VDAQGNLLSVTIASSSSQGPTDDLRVKPDIAGNGVQVYSPVAYTSTSTGKTYGNAYYDSY
TGTSMASPNVTGSLLLVQQHYNNKEGQFMLGAQLKGLALHTADDAGMEGPDANFGWGLLN
VKKMVEAIDARGTSSLIENLNLANGAFYTKKIVSDGVAPIRVSISWYDPAGPLQTSSQLN
SSIKRLVNDLDLRVTSSNGTIYFPWALTSRSTNAKKDNNSDNFERVDLGVVPAGEYTVRV
SHKGTLTNSSQNYTLIVTGANGGGATTPTPTPTVCGDPSNMTVSDITSSAATVSWTASSS
ANVNYTLQYKLASSSSWVDLTTTTSTTVSLTSLSADTAYDLRVRTNCSSTSMSNYTSASF
RTLSAMVTTCNGAYEPNNTFSSATRITALNRDYNAAIETTTDRDYYVLTTSTAGYVTVKL
SGLTHDIDLRLYNSAGTQIRSSLNSGTKSELIQAYLAAGTYYVLVSPYSGSSPNSCYTLR
LEPGYTSFAEGASGMVSSNNDFKVYPNPVTDVAYVDVPEKLSKNATIKVYDMTGRMVLET
KAEAGVNKLNVSNLAAGAYVVNVENDLETISSKFIKK
NT seq
2634 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagagagtattatttacaggagccttcacgttgggggcgtctgtatttttcttt
gctcaaacagaacagcagagattgaaaattaccaaagagtataatcagcaaaaactagac
aaaattgttgatgagagtaagcttaaagagcaaaaacaaaaagctgagttagctgagttt
ttgaaaaagaataatctgccattgaagattcagcacaaggaaggtggtacatcggagctt
attagagtagagaatggggttcctatttattttaccaataataatattgcagcagcaaga
tctaccagagctaatcacctaaatacgggaggtagtttaggattgcaattagatgggcag
ggtatgacggcttatgtatgggatgcaggtagtgtaagaccttctcatagagagtttggt
aatagagttacagtaggagatggtgctagtcataatggggataaccacgcaacccatgtg
ggaggaactattgccgcaacaggtgtgactgcggctgctaaaggtatggcaagtaaagcc
ttaattcgttcttacgattggtcatcagactactccgaagcaagtacagcggcgagagcg
ggtatgttgctgagtaatcattcatacggatataattcgttatctcttccagattggtat
tttggagcttatataggagagtctgcagactgggatagattgatgtatagtgcaccatat
tatttaatgtgtgtagctgctggtaatgacggctctaattatggttataatcaagataca
gggaagtatgaattgctaaacgctagtccattgggaggtactactaatgattatgataaa
ttaacgggacattctacatctaaaaacgcattagttgtagccaatgctaatgatgctaat
gtggatgctcagggtaatttattatctgtgactatcgcttcctctagcagtcaaggtcct
accgatgatttaagggtgaagccagatatagcaggtaatggggttcaagtatattctcca
gtagcatatacatctactagcactggtaaaacttatggaaatgcttactatgatagttat
acagggacatctatggcgagccctaatgttacggggtctttacttttggttcagcaacat
tataataataaggaggggcagtttatgttaggagctcaattgaaaggtttggcattgcat
acagctgatgatgcagggatggaaggtcctgatgctaattttggttggggacttcttaat
gtaaagaaaatggtagaggcaattgatgctagaggaacttcttctttgatagaaaactta
aatttagctaatggagcattttatactaaaaagatagtttctgatggagttgcgcctatt
agagtgtcaatttcttggtatgatccagctggacctcttcaaacatcgtctcagttaaat
agctctattaaaagattggttaatgatttagacttaagagtaacctcttctaatggtaca
atttatttcccttgggctcttacttctagaagtactaatgcaaaaaaagataacaatagc
gataactttgagagagttgatttaggggttgttccagcgggggaatatacggtaagagtt
tctcataaaggaacattgactaactctagtcaaaactatactctaatagttactggagct
aatggagggggggcaacaactccgacgccaacacctacagtttgtggtgacccttctaat
atgacggtaagtgatattacttcgtctgcggctacagtttcttggacggcaagttcttcg
gctaatgtaaattatacactgcaatataaattagcatctagttcttcttgggtagattta
acaacaacaacatcaactactgtttctcttacaagtctttcagcagatacagcttacgat
ttaagagtgagaactaattgttcttcaacttctatgagtaattatacttctgcttcgttt
agaacattaagtgctatggtaactacttgtaatggagcttatgagcctaataatacattc
tcttctgctactagaattacggcgttgaatagagattataatgctgcgatagagacaact
acggatagggattattatgtgttgactacaagtactgcgggttatgttacagtaaagtta
agtggattaactcatgatatagatttaagattgtacaatagtgcaggaactcaaattagg
tcatctcttaactctggaacaaaatctgaattgatacaagcttacttggcagcaggtact
tattatgtgttagtgagtccatattcaggttctagccctaactcttgctatacattaaga
ttggagccgggttatactagttttgctgagggtgcttctggtatggtgtctagcaataat
gactttaaagtttatcctaacccagtaacagatgtggcttatgtagatgttcctgaaaaa
ttgtctaaaaatgctactataaaagtgtatgatatgacagggcgtatggtgctagaaact
aaagctgaagcaggagtaaataaacttaatgtttcaaatcttgctgcaggtgcttatgtg
gtgaatgtagagaatgatttagaaactatttcttctaaatttattaagaaataa
DBGET
integrated database retrieval system