Ruminiclostridium herbifermentans: EHE19_013890
Help
Entry
EHE19_013890 CDS
T07161
Name
(GenBank) spore germination protein
KO
K06295
spore germination protein KA
Organism
rher
Ruminiclostridium herbifermentans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rher00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99978 Cell growth
EHE19_013890
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GerA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNU65971
UniProt:
A0A4U7JLB6
LinkDB
All DBs
Position
3455760..3457304
Genome browser
AA seq
514 aa
AA seq
DB search
MFKKIINKITAKNNSKNENNTDNLFILSKSLEENISNIKEQFADDDTLIIRSFENAQNKD
IKFSIVFTDGMVSSTQLNDNIIKPLLTYTGFNTKLNLMDAIIYHVLSSNSVKKLTDENEI
IDSIVRGNPVLFAQGESEVVSIDSKGWQTRAISEPEVEKSLRGSREGFTESLLMNLTMIR
RRLATNKLKFKMQVLGKQTKTKICICYLDGIANKKILDELNKRLDKIDIDGITGSGIIVE
FIKDYPYSPFKTIGGTERPDVIATKLLEGRIAIFVDGTPFVLTLPYVFIEYFQTSEDYYL
NFYYASINRLLRILSFFITISAPALYIAITTFHQEMIPTVFVRSIIAARQGVPFPTVLEM
VMLLIVFELLRETGVRMPSFSGTAVSVVGGLVLGSAAVDARIVSAPVVIVVALTAVTGLT
TPKIKGPAILLRFILIALSATIGLYGYLFGISALLIHLLQLRSFGIPYMLSITNFRLNDM
KDTVIRAPWNFLKYRSEFIAPDNLVRNNSGGKKK
NT seq
1545 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaaaaagataataaataaaattacagcaaaaaataattctaaaaatgaaaataat
actgataatttatttattttaagcaaatctttagaagaaaatatttcaaatattaaagag
cagtttgcagatgatgatactttgattattcgttcctttgaaaatgctcaaaataaagat
ataaagtttagcattgtgtttactgacggaatggtaagcagtactcagctcaatgataat
atcattaagcctttattaacatataccggatttaatactaaattaaacttaatggatgca
ataatatatcatgtattatcctctaatagcgtaaaaaaattaacagatgaaaatgaaata
attgattcaatagtaaggggaaatcctgtcctttttgcacaaggtgaatctgaagttgta
agcattgactcaaagggttggcaaactagagccatctcagagcctgaggtagaaaagtca
ttgcgtggttcaagggaaggatttacagaatctttgcttatgaaccttacaatgataaga
agaagacttgcaacaaataaattaaaatttaaaatgcaagttttaggtaagcaaacgaaa
accaagatttgcatatgctacttggacggtatcgctaataagaaaattttagatgaactt
aataaaaggctggataaaatagatattgatggaattaccggttcaggaattattgtagaa
ttcattaaggactatccatattctccttttaaaacaattggggggactgagagacctgat
gttatagccacaaaattactagaagggcgcattgcaatatttgtagatggcacccccttt
gtattgactttgccctatgtattcattgaatattttcaaacaagtgaggattattacctt
aatttttattatgcttcaataaatagactcttaagaatactcagcttttttataacaata
agtgcacctgcattatatattgccataacaacctttcatcaggaaatgataccaacagta
tttgttagaagtattatagcagcaaggcaaggggtaccattcccaacagttttggaaatg
gtaatgcttttaattgtatttgaattgctaagagagacaggtgtacgtatgccatcattt
tccggaacagcagtaagcgtggttggcggtttggttttaggctcagcagctgttgatgcc
agaatagtaagtgcacctgtagtaattgttgtagcactaactgctgttacagggttgact
actccaaagattaaaggccccgctattctattaagatttatactaatagcactttcagca
acaattggattgtatggatacttattcggaatatcagcgctgttaatacacttattgcaa
ttgcgttcttttggtattccttatatgctcagtataacaaatttcagattaaacgatatg
aaggatacagtaatcagagcaccttggaattttttgaaataccgttctgaatttatagct
ccggacaatcttgtcaggaataattctgggggtaaaaagaaatga
DBGET
integrated database retrieval system