Rhopalosiphum maidis (corn leaf aphid): 113555191
Help
Entry
113555191 CDS
T06065
Name
(RefSeq) transcriptional regulator ATRX homolog isoform X1
KO
K10779
transcriptional regulator ATRX
Organism
rmd
Rhopalosiphum maidis (corn leaf aphid)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rmd00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
rmd03000
]
113555191
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
rmd03036
]
113555191
Transcription factors [BR:
rmd03000
]
Eukaryotic type
Zinc finger
Cys4 GATA-factors
113555191
Chromosome and associated proteins [BR:
rmd03036
]
Eukaryotic type
Heterochromatin formation proteins
Other heterochromatin formation proteins
113555191
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
DEAD
AAA_34
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113555191
NCBI-ProteinID:
XP_026815368
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(77594072..77621566)
Genome browser
AA seq
1517 aa
AA seq
DB search
MDTVYPNDDEIKFRKHHYKGVEEILNCEVKCTICNDDLLHEIISKKMIMVHQSHLFLCCY
NCFYKLCEGNKYSCILCKSNKDLSNCIKCNLNVCNRCVENHEIDIISIGVLNKCFNCVPK
MLWKERAQAANVLKVFSSQLCLPNGLLVNETDHEQAVRKYLVKEAKIGQNSKIDNIKNNL
CIDFIFNSYKLSITNELSTFSPKDYDSINDNLNEFINICEHVLEKTCSTLTNYKRIFNIN
SHLSPGVSSIMKSLLKPVDEDDNILVNNSILNGNLNKNTKSNTADRLIKTPNRSTKRNLR
SEKKQKIDTNNLSTNISSSSVQPISSPNKLSAFKNINKQLTVVIERLDDSIISSMMSNKL
SNKVHLELEKNETTHPLNLFDDDNSDSDDNREYTRKLRNRTLIKTNKVKNQAINSTKSQN
ILNEKSDDEKENDRLTNLRTIEKCSKKKKSVTDDEDNSDDTNIIPTNNTSLKVYQNKSNN
EIDKLESIQQFLSTLDATDSDTDNDFQNEDNLESVKCIFTEIKNAVGIPQINTEDNSGDE
SEDSSINDVINSCLTACKRPSIEHYHNKTQETESSIYDMETIHESELENDIEMSESSDIH
NNTTIVTRSSKVTPFKMPSTSDDDSDFEFKIKNKTKGVKRKLLTSNSTKDSDSSSKYFKK
TPKRKLKNNIRTSSCGLTSNSSSNNSNSSSSSNEDSSPVNVRKRRRIKKLSNDESDEVND
SDSNNTSNNRCLPKIGRKNIRKMKKKEDLSELTQSALKEEGLRKKRIEKRQQEYNKFCNL
PRPMESCKKLVLDFDENTMEELVTVHPDLVKFLKPHQVKGVTFLWNSVFESLARIKEHKG
NGSILAHCMGLGKTLQIITLIHTLFRYPDTGIKTVLIITPSATIENWCKEFHKWLHNIDE
NHFLVLNFTDSKTYEGRKNIIDEWKRDHGVLITSYQLFRSVVNFKNIDKFPTISEGLVDP
GPDLIICDEGHVLKNHSTAISKAVNRIKSLRRIVLTGTPLQNNLREYHCMVDFIRPNLLG
SIKDFTNRFINPITNGQYSDSTAIDVRLMKRRSHVLHRMLEGFVQRFDYSVLTPFLPPKH
EYVIYLKMADIQIELYQKFLDDHRQPELFSNYHMLQMVWTHPKLLALYLKRAESKREKQK
LKDEESRLLNDESSDTDCNSNSVDEVEIPGYDLPNTKNPDMPYLNWWKPLIPKTKFESVY
PYSKFIMMFSILQECENIGDKVLLFSQSLFTLDLIQDFLENAEDIDDEGGPYGKSWDHGL
DFYRIDGSTSLKAREDCCEKFNDVNNHKMRLLLLSTKAFNLGINLVGANRVIIFDVTWNP
SLNVQSIFRVFRFGQNKPCYIYRLISEGTMEQKIYERQISKLSTAFRVVDEHQIDRHFNL
KCQEELYEFEPNTTKPKSTLNLPKDRLMAELILKHKDLVMDILEHDSLLQNNEAEELDEN
DRNAAWEDYEKERDGIQTNNLNSTLIHNLNLGFPHVHKSNDDDLQLFNTLRELFPQASML
QLHDMLIKVKNAQNVEQ
NT seq
4554 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacacagtttatccaaatgacgatgagatcaaatttcgaaaacaccattataaaggt
gttgaagaaattttgaactgtgaagttaaatgtacaatttgtaatgatgatctattacat
gaaattatttcaaaaaaaatgattatggttcatcaaagtcatctatttctatgttgctat
aactgtttctacaaactatgtgaaggcaataagtatagttgtattttatgcaaatccaac
aaagatttatctaattgtataaagtgcaatctcaatgtttgtaataggtgtgttgaaaat
catgaaattgatataatatctattggtgttttaaataaatgcttcaattgtgtaccaaaa
atgttgtggaaagaaagagctcaagctgctaatgtattgaaagtattttcttctcaatta
tgtctgcctaatggtttattagtaaatgaaaccgatcatgaacaagctgttcgaaaatac
ttagtaaaagaagctaaaattggacaaaattctaaaatagataatattaaaaacaattta
tgcattgatttcatttttaattcatataagttgtctataacaaatgaactgtcaacattt
tctcctaaagattatgattcaattaatgataatttaaatgaattcatcaatatttgtgaa
catgttttagaaaaaacatgttctactttaaccaattacaagagaatatttaatatcaat
tcacatttgagtcctggagtttcttctataatgaaatctttattgaaaccagttgatgaa
gatgataacatattggtaaataattctatattaaatggaaatctaaataaaaacaccaaa
agcaatacagccgatcgtttaataaaaacaccaaacagaagtactaaaagaaatttaaga
tcagaaaaaaaacagaaaattgatacaaataatttaagtactaacatttcttcttcaagt
gtgcagccaatatcatccccaaataagttatcagcatttaagaacatcaataaacaatta
actgttgttatagagcggttagacgattctattatatcaagtatgatgagtaataagttg
tctaataaagttcatcttgaattggaaaaaaatgaaacaactcatcctttaaatttattt
gatgatgataatagtgatagtgatgataacagagagtacaccagaaaattgagaaatcgt
acactaataaaaaccaataaggtaaaaaaccaggctataaactcaactaaaagtcaaaat
atacttaatgaaaaatccgacgatgaaaaagaaaatgataggcttactaatttaagaact
attgaaaaatgttctaaaaaaaaaaaaagtgtaactgatgatgaagataattctgatgac
actaatattataccaactaacaatacaagtttaaaagtatatcaaaataaatcaaataat
gaaatagataagttggaaagtattcagcaattcctttcaacacttgatgcaaccgactct
gatactgataatgattttcaaaatgaagacaatttagaatcggtgaaatgtatttttact
gaaattaaaaatgctgtaggaattcctcagattaacactgaagacaacagtggcgatgaa
agtgaagacagctcaattaatgatgtaataaattcatgtttaactgcttgcaaaagacct
agtattgaacattatcataataaaactcaagaaactgaatcaagcatttatgatatggaa
actattcatgaatctgaattagaaaatgacattgaaatgtcagaatcgtcagatatacat
aataatacaactattgttactcgttcaagtaaagtaactccatttaaaatgccatcaaca
agtgatgatgatagtgatttcgaatttaaaatcaaaaataaaacaaaaggagtaaaaaga
aagctgttaacatccaactcaacgaaagattcagattcttcatcaaaatactttaaaaaa
acaccaaaaagaaaactcaaaaataatattagaactagctcatgtggcttaactagtaat
agcagtagcaataatagtaacagcagcagcagttctaatgaggattcatctcctgtaaat
gttaggaaacgaagaagaattaaaaaattgtctaatgatgaatctgatgaagttaatgat
tctgatagcaataatacttcgaacaatcgttgtttgccaaaaatagggcgaaagaatatt
cgtaaaatgaaaaaaaaagaagatctcagcgaattaacgcaaagtgctttaaaagaagaa
ggattacgtaagaagcgtattgaaaaacgtcaacaagaatataataaattttgtaattta
ccaagaccaatggaatcgtgtaagaaattagtattggattttgatgaaaatacaatggaa
gaacttgttacagtccatccagaccttgtcaaatttcttaaacctcatcaagtgaaagga
gtaacatttttatggaattctgtgtttgaatcattggctagaataaaagaacataaagga
aatggatctatcttagctcattgtatgggtctaggtaaaactctacaaattataacttta
attcatacattatttagatatccagatactggcattaaaactgttttaataattactcct
agtgcaaccattgagaattggtgtaaagagtttcataaatggttacacaatattgacgaa
aatcatttcttagtacttaactttactgattcaaaaacatacgaaggtcgtaaaaacatt
atagatgaatggaaaagagatcatggagtattaattacaagctatcagttatttagatcc
gttgttaattttaagaatattgataagttccctactatatctgaaggtcttgttgatcca
gggccagatttaattatatgtgatgagggacatgtattaaaaaaccatagcactgcaata
tcaaaagcagttaatcgtattaaatcactaagaagaattgttttaactggaactccatta
caaaataatttaagagaatatcattgtatggttgatttcatccgaccaaatttgttagga
tcaataaaagattttactaaccgttttataaatccaattactaatggacaatactctgat
tcaactgcaatagatgtaagattaatgaagagaagatcacatgttttacatagaatgctc
gaaggatttgtacagagatttgactatagcgttcttacaccattcttaccacctaagcac
gaatatgtaatttatttgaagatggctgatatacaaatagaattataccagaaatttttg
gatgatcatagacaaccagaattatttagtaattaccatatgcttcaaatggtttggacc
catcctaaattattagcattatatttaaaacgagcagaatcaaaacgagaaaaacaaaaa
ttaaaggacgaagaatcacgtttgttaaatgatgaaagtagtgatactgattgtaattca
aattctgtcgatgaagttgaaattccaggttatgatttgccaaacactaagaatccagat
atgccttaccttaactggtggaaaccattaataccaaaaactaaatttgaatctgtatac
ccatattcaaagttcataatgatgttttcaatacttcaagaatgtgaaaacataggtgac
aaagtgttattattcagtcagtcattatttactcttgatctcattcaagattttttagaa
aatgccgaagatatagatgatgaagggggtccttatggaaaatcttgggatcatggatta
gatttttatagaattgatggttcaactagtttaaaagcgagagaagattgttgtgaaaaa
tttaatgatgtcaataatcataaaatgcgtcttttattgttgtcaacaaaagcttttaat
ttaggtattaatctagttggagctaatcgagttattatttttgacgtgacctggaatcca
tctcttaacgttcaaagtatatttcgtgtgtttagatttggacagaataaaccatgttat
atttatagattaatttctgagggtacaatggagcaaaaaatatatgaacgtcaaatatca
aagttatctactgcttttcgtgtagttgacgaacatcaaattgatcgtcattttaatttg
aaatgccaagaagaactttatgaatttgagccaaatactaccaaaccgaaatcaacatta
aacttacctaaggatcgtttgatggccgagttaatattgaaacacaaagaccttgtaatg
gacatacttgaacatgactcattgttacaaaataatgaggcagaagaattagatgaaaat
gacagaaatgcagcttgggaagattatgaaaaagaaagagatggaatccagacaaacaat
ctaaattcaactttaattcacaacttaaatttaggttttccacatgtccataaatcaaat
gatgatgatctacaactgttcaatactttaagagaattatttcctcaagcttcaatgtta
caacttcatgatatgttaataaaagttaagaatgcccaaaatgttgaacaatga
DBGET
integrated database retrieval system