Rickettsia rickettsii Arizona: RPO_07035
Help
Entry
RPO_07035 CDS
T01721
Name
(GenBank) outer membrane protein A
Organism
rra
Rickettsia rickettsii Arizona
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFB25523
LinkDB
All DBs
Position
complement(1176811..1181355)
Genome browser
AA seq
1514 aa
AA seq
DB search
MANISPKLFKKAIQQGLKAALFTTSTAAIMLSSSGALGVATGVIATNNNAAFSNNVGNNN
WNEITAAGVANGTPAGGPQNNWAFTYGGDYTVTADAADRIIKAINVAGTTPVGLNITQNT
VVGSIITKGNLLPVTLNAGKSLTLNGNNAVAANHGFDAPADNYTGLGNIALGGANAALII
QSAAPSKITLAGNIDGGGIITVKTDAAINGTIGNTNALATVNVGAGTATLGGAVIKATTT
KLTNAASVLTLTNANAVLTGAIDNTTGGDNVGVLNLNGALSQVTGNIGNTNSLATISVGA
GTATLGGAVIKATTTKLTDAASAVKFTNPVVVTGAIDNTGNANNGIVTFTGNSTVTGNVG
NTNALATVNVGAGLLQVQGGVVKANTINLTDNASAVTFTNPVVVTGAIDNTGNANNGIVT
FTGNSTVTGDIGNTNALATVNVGAGITLQAGGSLAANNIDFGARSTLEFNGPLDGGGKAI
PYYFKGAIANGNNAILNVNTKLLTASHLTIGTVAEINIGAGNLFTIDASVGDVTILNAQN
INFRARDSVLVLSNLTGVGVNNILLAADLVAPGADEGTVVFNGGVNGLNIGSNVAGTARN
IGDGGGNKFNTLLIYNAVTITDDVNLEGIQNVLINNNADFTSSTAFNAGAIQINDATYTI
DANNGNLNIPAGNIQFAHADAQLVLQNSSGNDRTITLGANIDPDNDDEGIVILNSVTAGK
KLTIAGGKTFGGAHKLQTILFKGAGDCSTAGTTFNTTNIVLDITGQLELGATTANVVLFN
DAVQLTQTGNIGGFLDFNAKNGMVTLNNNVNVAGAVQNTGGTNNGTLIVLGASNLNRVNG
IAMLKVGAGNVTIAKGGKVKIGEIQGTGTNTLTLPAHFNLTGSINKTGGQALKLNFMNGG
SVSGVVGTAANSVGDITTAGATSFASSVNAKGTATLGGTTSFANTFTNTGAVTLAKGSIT
SFAKNVTATSFVANSATINFSNSLAFNSNITGGGTTLTLGANQVTYTGTGSFTDTLTLNT
TFDGAAKSGGNILIKSGSTLDLSGVSTLALVVTATNFDMNNISPDTKYTVISAETAGGLK
PTSKENVKITINNDNRFVDFTFDASTLTLFAEDIAADVIDGDFAPGGPLANIPNAANIKK
SLELMEDAPNGSDARQAFNNFGLMTPLQEADATTHLIQDVVKPSDTIAAVNNQVVASNIS
SNITALNARMDKVQSGNKGPVSSGDEDMDAKFGAWISPFVGNATQKMCNSISGYKSDTTG
GTIGFDGFVSDDLALGLAYTRADTDIKLKNNKTGDKNKVESNIYSLYGLYNVPYENLFVE
AIASYSDNKIRSKSRRVIATTLETVGYQTANGKYKSESYTGQLMAGYTYMMPENINLTPL
AGLRYSTIKDKGYKETGTTYQNLTVKGKNYNTFDGLLGAKVSSNINVNEIVLTPELYAMV
DYAFKNKVSAIDARLQGMTAPLPTNSFKQSKTSFDVGVGVTAKHKMMEYRINYDTNIGSK
YFAQQGSVKVRVNF
NT seq
4545 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgaatatttctccaaaattatttaaaaaagcaatacaacaaggtcttaaagccgct
ttattcaccacctcaaccgcagcgataatgctgagtagtagcggggcactcggtgttgct
acaggtgttattgctactaataataatgcagcatttagtaataatgttggcaataataat
tggaatgagataacggctgcaggggtagctaatggtactcctgctggcggtcctcaaaac
aattgggcatttacttacggtggtgattatactgtcactgcagatgcagccgatcgtatt
attaaggctataaatgttgcgggtactactcccgtaggtctaaatattactcaaaatact
gtcgttggttcgattataacgaaaggtaacttgttgcctgttactcttaatgccggcaaa
agcttaactttaaatggtaataatgctgttgctgcaaatcatggttttgatgcgcctgcc
gataattatacaggtttaggaaatatagctttagggggagcgaatgctgcactaattata
caatctgcagctccgtcaaagataacacttgcaggaaatatagatggaggaggtataata
actgtcaagacagatgctgccattaacggaacaataggtaatacaaatgcattagcaaca
gtgaatgtaggagcaggtacagccacgttagggggagcggttattaaagctactacgact
aaattaacgaatgctgcgtcggtattaacccttacaaatgcaaatgcagtattaacaggt
gcgattgataacaccacaggcggtgataatgtaggtgtcttaaatttaaatggtgcatta
agtcaagtaactgggaatataggtaatacaaattcattagccacgataagtgtaggagca
ggtacagccacgttagggggagcggttattaaagctactacgactaagttgacagatgct
gcgtcagcagtgaaatttacgaatcctgtagtggtgactggagcgatagataataccggt
aatgcaaataatggtatagtaacgtttaccggtaatagtacagtaactgggaatgtaggt
aatacaaatgcattagcaacagtgaatgtaggagcaggtttgctacaagtacaaggtgga
gtggtaaaagcaaatacaataaacttaacggataatgcgtcagcagtgacatttacgaat
cctgtagtggtgaccggagcgatagataataccggtaatgcaaataatggtatagtaacg
tttaccggtaatagtacagtaactggggatataggtaatacaaatgcattagcaacagtg
aatgtaggagcaggaataacattacaagctggaggaagcctagctgcgaataatatagat
tttggagccaggagtactttagagtttaacggacctcttgatggtggtggtaaagcaatc
ccttattattttaaaggagctatagcaaacggcaataatgctatattaaatgttaataca
aagttacttacggcatctcatttaactataggaacagttgcagaaatcaatattggagct
ggtaatctttttacaattgatgcaagtgttggtgatgttactatattaaatgctcaaaat
attaattttagagctcgagattctgttttagtactttctaacttaaccggagtcggagta
aataatatattattagcagctgatttagtagctcccggtgctgatgaaggtacggtagtc
tttaatggtggggttaatggcctgaatattgggagtaatgtagcaggtaccgctagaaat
atcggtgatggaggcggtaataaatttaacactttacttatttataatgctgttacaata
actgacgatgtaaatttagaaggtatacagaacgtgcttattaacaataatgcagatttt
actagtagtacagcatttaatgctggtgctatacaaataaacgatgctacttatacgatt
gatgcaaataatggtaatttaaatataccggcaggaaatattcaatttgcacatgcggat
gctcaattagtattacaaaatagttcaggaaacgaccgtacgataacactaggtgcgaat
atagaccctgataatgacgatgagggtatagtaatattaaattctgtaactgcaggaaaa
aaattaacgatagccggaggcaagacgtttggtggagctcataagttacaaactatattg
ttcaaaggagcgggagattgtagcacggcaggtaccacttttaatacaacaaatatagta
cttgatattacaggtcaattagaacttggagctactacggcaaatgtagttttatttaat
gatgctgttcaattaactcaaaccggtaatattggcggtttcttagattttaatgcaaaa
aacggtatggtaacattaaataacaatgtaaatgttgcgggagcagtccaaaataccggc
ggtactaataacggtacgttaatagttttaggtgcaagtaatcttaatagagtaaacggg
attgctatgttaaaagtaggtgcaggaaatgtaactattgccaaaggcggtaaagttaaa
atcggcgaaatccaaggtacaggcacaaatactttaacattacctgcacactttaactta
acaggcagcataaataaaaccggtggtcaggctctgaagctaaacttcatgaatggcggt
agtgttagcggtgttgtagggactgcggctaattcggttggtgatatcacaacggcaggt
gctacaagttttgcaagcagtgttaacgcaaaaggtacggcgacacttggcggtactaca
agttttgccaatacattcactaatacaggtgcggttactttagccaaaggttctatcact
agttttgctaaaaatgtaacggctaccagctttgtagctaacagtgctactattaatttc
agcaatagcctagcctttaatagtaatataacaggtggcggtactacacttactttaggt
gcaaatcaagtaacatatactggcaccggtagctttaccgatacgctaaccttaaatact
acttttgacggagcagctaagtcaggtggtaatatcttaattaaatcaggtagtactctt
gatttatcaggggtttcaactttagcacttgttgttactgctactaatttcgacatgaat
aatataagcccagatacaaaatatacggtaatatctgcagaaacagcaggtggtttaaag
cctacttctaaagagaatgttaaaataactattaataatgacaaccgttttgttgacttt
acttttgatgcatcgactttaacgttatttgcagaagatatagctgcagatgttatagat
ggagattttgcaccgggtggaccgcttgcaaatatcccaaatgctgcaaatataaagaaa
tcgcttgagttaatggaggatgctcccaatggttcagatgcacgtcaagctttcaataac
tttggtctaatgacaccgctacaggaagcagatgctacaactcatctcattcaagatgtt
gtaaaacctagcgacactatagctgccgttaataatcaagttgtagcgagtaatatatca
agtaatataactgctctaaatgctagaatggataaagtacaatcagggaataaaggtcct
gtttcttctggtgatgaagatatggatgctaagtttggtgcgtggataagcccgtttgtc
ggtaatgcaacgcagaagatgtgtaacagtataagtggttataagtctgatacaactggt
ggcactataggttttgacggcttcgttagcgatgatctagcactcggacttgcatataca
agagccgatactgacattaagctaaaaaataataaaacgggcgataagaataaggtagag
agcaacatctattctttatacggtttatataatgtaccttatgaaaatctcttcgttgaa
gctatagcatcttactcagataataagataagaagcaaatcaagacgtgttattgcaacg
acactagagactgtcggttatcaaactgcaaacggtaagtataaatccgaaagctataca
ggtcagttaatggctggttatacctatatgatgcctgagaacattaacttaacaccgcta
gctgggcttagatattcgactatcaaagataagggctataaggaaaccggtactacttac
caaaatcttaccgttaaaggcaagaactataatactttcgacggtttactcggtgctaaa
gtatcaagtaatatcaatgtcaatgaaatagtgctaacacctgagctttacgcaatggtc
gattatgcattcaagaataaagtttcggcgattgatgcaaggttacaaggtatgactgct
cctcttccaaccaacagctttaagcaaagcaaaacaagttttgatgtcggtgtcggtgtt
actgctaagcataaaatgatggaatacaggattaactacgataccaatatcggaagtaag
tatttcgctcagcaaggtagtgtaaaagttcgtgttaatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
