Ruminococcus bovis: E5Z56_05755
Help
Entry
E5Z56_05755 CDS
T05998
Name
(GenBank) sugar ABC transporter permease
KO
K15771
arabinogalactan oligomer / maltooligosaccharide transport system permease protein
Organism
ruj
Ruminococcus bovis
Pathway
ruj02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ruj00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
E5Z56_05755
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ruj02000
]
E5Z56_05755
Transporters [BR:
ruj02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Saccharide, polyol, and lipid transporters
Arabinogalactan oligomer/maltooligosaccharide transport system
E5Z56_05755
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BPD_transp_1
TM_PBP2_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCT06896
UniProt:
A0A4P8XUZ4
LinkDB
All DBs
Position
1219443..1220945
Genome browser
AA seq
500 aa
AA seq
DB search
MKYIDYVQLNAFQKFGYKCKNFFVNLPHNLLKFFAAIGNFFKKLFLGIGHGFANFGKRFA
KGDWATKLSYLIMGMGNFSKGQYIKGLLFLIIEAAYAMFLIFFGIDQISQFGTLGTQEGG
LGIDPTTGAYGYVEGDNSMLILLYGVTTIVVSVVFLVFYIMNTKSAMKAQELKAEGKHVP
TFKEDLKQFGDEKFHVTLLSLPCLLIGVFTVLPLIFMVLIAFTNYDHSHQVPGHLFTWVG
FQTFKDVFSNVGGANMGETFLTLTEWTIIWAIFATFLNYFFGMIVALMINKKGIKLKSLW
RTLFVITVAVPQFVTLLVMNQMLQYDGGAINVLLQNLGLARINFLNGSALTAKITVIVVN
LWVGIPYTILITSGILMNIPADLYESATIDGAGPVKSFFKITLPYMLFVTTPYLITTFIN
NINNFNVIYLLSSGGPTTDKLYGGAGQTDLLVTWLFKLTMSAQDYNYAAAIGILVFIVCA
SLSLITFNMTKSAKDEEAFS
NT seq
1503 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatacatagattatgtccagctaaatgcattccagaagtttggatataagtgtaaa
aatttctttgtgaatttacctcataatcttcttaagttctttgctgcaattggtaacttc
ttcaagaaattattcttaggtatcggtcacggctttgcaaactttggtaaaagatttgct
aaaggtgactgggcaacaaagctatcttaccttattatgggtatgggtaactttagtaag
ggacagtacattaagggtttactattcttaattattgaagcagcatatgcaatgttccta
attttctttggtattgaccaaatttcacagttcggcacacttggtactcaagaaggcgga
cttggtattgacccaacaacaggtgcttacggctatgttgaaggtgataactcaatgctt
atccttctatatggtgttacaacaattgttgtttcagttgtattcctagtattctatatt
atgaatactaagtcagctatgaaagctcaagagctaaaggctgaaggtaagcacgttcct
acatttaaggaagatttaaagcagttcggtgatgagaagttccacgttacacttctttct
ctaccatgcctactaattggtgtatttactgtactaccacttatattcatggtgctaatt
gcatttacaaactatgaccacagccatcaggttcctggtcacttgtttacatgggtaggt
ttccagacatttaaggatgtattcagtaatgttggtggcgctaacatgggtgaaacattc
ctaacactaactgaatggacaattatttgggctatttttgctacattcctaaactatttc
tttggtatgatcgttgctctaatgattaacaagaagggcattaagctaaagtcactttgg
agaacattattcgttatcacagttgctgttcctcagttcgttactctactggttatgaac
cagatgctacagtatgacggtggtgctattaacgttctattacagaacctaggtttagca
agaattaacttcctaaacggttcagctctaacagcaaagattacagttattgttgttaac
ctatgggttggtattccttatactatcctaattacttccggtattcttatgaatatcccg
gctgacctatatgaatcagctacaattgacggtgcaggtcctgtaaagagtttcttcaag
attactcttccatatatgctattcgttacaacaccatatctaatcacaacatttatcaac
aatatcaataacttcaatgttatttacttgttatcaagtggtggtcctacaacagataag
ttgtacggtggtgccggtcagaccgacttgcttgttacatggctatttaagttaacaatg
agtgcacaggattacaactatgctgctgctatcggtatcttagtatttattgtttgtgca
tccttgtcactaattacattcaatatgacaaaatctgctaaggatgaggaggcattctca
tga
DBGET
integrated database retrieval system