Staphylococcus aureus Bmb9393 (MRSA): SABB_06020
Help
Entry
SABB_06020 CDS
T02717
Name
(GenBank) transcriptional antiterminator
Organism
saur
Staphylococcus aureus Bmb9393 (MRSA)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PTS_EIIA_2
PRD
Mga
HTH_Mga
HTH_11
PuR_N
HTH_DeoR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWH56614
LinkDB
All DBs
Position
283031..285127
Genome browser
AA seq
698 aa
AA seq
DB search
MNGDNQQILREIVLNPTIHGKELESIFGLSRRQLGYRIQKINLWLEQEGYPKLERTSQGN
FIVSSEIMTLFKRDVSEQQMLNGNNVIFNIETRRYYLMLMLFSKENAMSLNHFSIDLQVS
KNTVIHDINHVKEQLEDHGLSLKYSRKHGYEIVGDEFEVRRFFIKLIDQRLNHDITKSEV
LKALNLTFEDIAYQKDKIKQVEQFLKSRFIDKSLSSLPYVLCVIRRRIQSGHVINPLNIN
YQYLRDTKEYQATEIMTQHEPDLPEAEKLYLTLHLLSTSVQWTDLQESDNISNLTMAIDQ
MIHHFEQITFINIEDKEKLSQQLLLHLTPAFYRIKYNLTDRDELINPLQGNYQSLFHMVK
QSCQSLTEYFGKSLPDNEIAYLTMLFGGSLRRQDENFDGKIKAIIVCTQGTSVSQMMLYE
LRNLFPEIIFLDAISLRTFENYTLDYDIVFSPMFVLTHKKLFITKVALSENEQRKLRKEV
MKYINKESADIDKEINKLMALIERTTTVNDITELRDGLEDFIANYNSISTINGSIVTQNK
TLDLADLIPARYVKRIHHVENIDEAIAKASDVLVANHFIDIKYIHEMQQAFDDSYMVIMQ
NIAIPHAYSEKHVHKTAMSMLILQEPIYMSDGTAIHIIVPIAAVDKVTHLRALLQLRDVA
QNNDAIKRIIQSRKNSDVNEILKNYSNKEARENGWDSN
NT seq
2097 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacggggataatcagcaaatactcagagaaattgtattgaatcctactattcatggt
aaagaacttgaatcgatatttggtttgtctcgtagacaactaggatatcgcattcaaaaa
atcaatttgtggcttgaacaagagggttatccaaaacttgaaagaacaagccaaggaaat
tttattgtaagttctgaaatcatgacgttattcaaacgagatgtatcggagcagcaaatg
ttaaacggcaacaatgtcatttttaacatagaaacacgtcgttattatttaatgctcatg
ctttttagtaaggaaaacgcaatgtctctaaaccatttttcaattgatttacaagtcagt
aaaaatactgtcattcacgatataaatcatgtgaaagagcaattggaagatcatggtttg
tcacttaagtattctcgaaaacatggttatgaaattgttggtgatgaatttgaagttcgc
cgtttcttcattaagttgattgatcaaaggttaaatcatgatattactaaaagtgaagtt
ttaaaggcgctcaacttaacattcgaagatatcgcatatcaaaaagacaagatcaaacag
gtagaacaatttttgaagagtcgctttatagacaaatcactgagttcattgccttacgtc
ctttgtgtgattcgtagacgaattcaaagtggtcatgtgattaatccattaaatattaat
tatcagtatttgagggatacgaaagaatatcaagcaacggagattatgacgcaacatgag
ccggatttgccagaagcggaaaagttatatttgacgctacacttactttcaacaagtgtg
caatggactgatttgcaggaatcagataacatatcgaatttaacgatggccattgatcaa
atgattcaccattttgaacaaattacttttattaacattgaagataaggagaaattatca
cagcaactcttgttacatttaacgcctgctttttataggattaaatataacttaacggat
cgtgatgaattaataaatcctttacaaggaaattatcaatccttatttcatatggtgaaa
caatcatgtcaatcgttaactgaatatttcggaaaatcattgcctgataatgaaatagca
tatttaaccatgttgtttggaggtagtttgagacgtcaagatgaaaacttcgatggcaag
ataaaagctattatcgtgtgtacacaaggtacgtcagtatcacaaatgatgttatacgag
ttgcgaaacttatttccagaaattattttcttagatgcgatttcacttagaacatttgaa
aattacacattagattatgacatcgtcttttcaccaatgtttgtcttaacacataaaaaa
ttatttatcacaaaagtagctttatctgaaaatgagcaacgaaagttacgtaaagaagtg
atgaagtacattaataaggaatcggctgacattgataaggaaataaacaagttaatggca
ttaattgaacgcactacgacagttaatgacattacagaactacgtgatggtttagaagat
tttattgcgaattataattcaatttcaaccattaatggatcgattgtcacacaaaataag
acattagatttagctgacttgataccagcaaggtacgtgaaaagaatacatcatgttgaa
aatattgatgaagctattgctaaagcaagtgatgtgttagttgctaatcattttattgat
attaaatatattcatgagatgcaacaggcatttgatgattcgtatatggttatcatgcaa
aatattgctattccacatgcatactctgaaaagcatgtacataaaacagcgatgagtatg
ttgatattacaagaaccaatatacatgtcagatggcacagcaatccatattattgtacct
attgctgctgttgataaagtgacacacttaagagcgttactacaattgagagatgtggcg
caaaacaatgacgcaattaagcgcatcatacaaagtcgcaaaaattctgatgtaaatgag
attttaaaaaattattcaaataaagaagcgagggaaaatggatgggacagcaattag
DBGET
integrated database retrieval system