Saccharomyces cerevisiae (budding yeast): Q0055
Help
Entry
Q0055 CDS
T00005
Symbol
AI2
Name
(RefSeq) intron-encoded reverse transcriptase aI2
Organism
sce
Saccharomyces cerevisiae (budding yeast)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Intron_maturas2
RVT_1
COX1
AI2M-like_HNH
HNH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
854594
NCBI-ProteinID:
NP_009309
SGD:
S000007262
UniProt:
P03876
LinkDB
All DBs
Position
MT:join(13818..13986,16435..18830)
Genome browser
AA seq
854 aa
AA seq
DB search
MVQRWLYSTNAKDIAVLYFMLAIFSGMAGTAMSLIIRLELAAPGSQYLHGNSQLFNVLVV
GHAVLMIFCAPFRLIYHCIEVLIDKHISVYSINENFTVSFWFWLLVVTYMVFRYVNHMAY
PVGANSTGTMACHKSAGVKQPAQGKNCPMARLTNSCKECLGFSLTPSHLGIVIHAYVLEE
EVHELTKNESLALSKSWHLEGCTSSNGKLRNTGLSERGNPGDNGVFMVPKFNLNKVRYFS
TLSKLNARKEDSLAYLTKINTTDFSELNKLMENNHNKTETINTRILKLMSDIRMLLIAYN
KIKSKKGNMSKGSNNITLDGINISYLNKLSKDINTNMFKFSPVRRVEIPKTSGGFRPLSV
GNPREKIVQESMRMMLEIIYNNSFSYYSHGFRPNLSCLTAIIQCKNYMQYCNWFIKVDLN
KCFDTIPHNMLINVLNERIKDKGFMDLLYKLLRAGYVDKNNNYHNTTLGIPQGSVVSPIL
CNIFLDKLDKYLENKFENEFNTGNMSNRGRNPIYNSLSSKIYRCKLLSEKLKLIRLRDHY
QRNMGSDKSFKRAYFVRYADDIIIGVMGSHNDCKNILNDINNFLKENLGMSINMDKSVIK
HSKEGVSFLGYDVKVTPWEKRPYRMIKKGDNFIRVRHHTSLVVNAPIRSIVMKLNKHGYC
SHGILGKPRGVGRLIHEEMKTILMHYLAVGRGIMNYYRLATNFTTLRGRITYILFYSCCL
TLARKFKLNTVKKVILKFGKVLVDPHSKVSFSIDDFKIRHKMNMTDSNYTPDEILDRYKY
MLPRSLSLFSGICQICGSKHDLEVHHVRTLNNAANKIKDDYLLGRMIKMNRKQITICKTC
HFKVHQGKYNGPGL
NT seq
2565 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtacaaagatgattatattcaacaaatgcaaaagatattgcagtattatattttatg
ttagctatttttagtggtatggcaggaacagcaatgtctttaatcattagattagaatta
gctgcacctggttcacaatatttacatggtaattcacaattatttaatgttttagtagtt
ggtcatgctgtattaatgattttctgtgcgccgtttcgcttaatttatcactgtattgaa
gtgttaattgataaacatatctctgtttattcaattaatgaaaactttaccgtatcattt
tggttctgattattagtagtaacatacatagtatttagatacgtaaaccatatggcttac
ccagttggggccaactcaacggggacaatagcatgccataaaagcgctggagtaaaacag
ccagcgcaaggtaagaactgtccgatggctaggttaacgaattcctgtaaagaatgttta
gggttctcattaactccttcccacttggggattgtgattcatgcttatgtattggaagaa
gaggtacacgagttaaccaaaaatgaatcattagctttaagtaaaagttgacatttggag
ggctgtacgagttcaaatggaaaattaagaaatacgggattgtccgaaaggggaaaccct
ggggataacggagtcttcatagtacccaaatttaatttaaataaagtgagatactttagt
actttatctaaattaaatgcaaggaaggaagacagtttagcgtatttaacaaagattaat
actacggatttttccgagttaaataaattaatagaaaataatcataataaacttgaaacc
attaatactagaattttaaaattaatgtcagatattagaatgttattaattgcttataat
aaaattaaaagtaagaaaggtaatatatctaaaggttctaataatattaccttagatggg
attaatatttcatatttaaataaattatctaaagatattaacactaatatgtttaaattt
tctccggttagaagagttgaaattcctaaaacatctggaggatttagacctttaagtgtt
ggaaatcctagagaaaaaattgtacaagaaagtatgagaataatattagaaattatctat
aataatagtttctcttattattctcatggatttagacctaacttatcttgtttaacagct
attattcaatgtaaaaattatatgcaatactgtaattgatttattaaagtagatttaaat
aaatgctttgatacaattccacataatatgttaattaatgtattaaatgagagaatcaaa
gataaaggtttcatagacttattatataaattattaagagctggatatgttgataaaaat
aataattatcataatacaactttaggaattcctcaaggtagtgttgtcagtcctatttta
tgtaatatttttttagataaattagataaatatttagaaaataaatttgagaatgaattc
aatactggaaatatgtctaatagaggtagaaatccaatttataatagtttatcatctaaa
atttatagatgtaaattattatctgaaaaattaaaattgattagattaagagaccattac
caaagaaatatgggatctgataaaagttttaaaagagcttattttgttagatatgctgat
gatattatcattggtgtaatgggttctcataatgattgtaaaaatattttaaacgatatt
aataacttcttaaaagaaaatttaggtatgtcaattaatatagataaatccgttattaaa
cattctaaagaaggagttagttttttagggtatgatgtaaaagttacaccttgagaaaaa
agaccttatagaatgattaaaaaaggtgataattttattagggttagacatcatactagt
ttagttgttaatgcccctattagaagtattgtaataaaattaaataaacatggctattgt
tctcatggtattttaggaaaacccagaggggttggaagattaattcatgaagaaatgaaa
accattttaatgcattacttagctgttggtagaggtattataaactattatagattagct
accaattttaccacattaagaggtagaattacatacattttattttattcatgttgttta
acattagcaagaaaatttaaattaaatactgttaagaaagttattttaaaattcggtaaa
gtattagttgatcctcattcaaaagttagttttagtattgatgattttaaaattagacat
aaaataaatataactgattctaattatacacctgatgaaattttagatagatataaatat
atgttacctagatctttatcattatttagtggtatttgtcaaatttgtggttctaaacat
gatttagaagtacatcacgtaagaacattaaataatgctgccaataaaattaaagatgat
tatttattaggtagaatgattaagataaatagaaaacaaattactatctgtaaaacatgt
cattttaaagttcatcaaggtaaatataatggtccaggtttataa
DBGET
integrated database retrieval system
