Streptococcus parasanguinis ATCC 15912: HMPREF0833_11289
Help
Entry
HMPREF0833_11289 CDS
T01545
Name
(GenBank) putative serine-rich adhesin for platelets
Organism
scp
Streptococcus parasanguinis ATCC 15912
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
aRib
Rib
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEH56320
UniProt:
F8DKF7
LinkDB
All DBs
Position
complement(1344634..1351731)
Genome browser
AA seq
2365 aa
AA seq
DB search
MNRNLEATIWIYATVNNNSSEATLNAQVATSSRPFDGSTTSGNYTQVMNGSVPTGTGQRA
TDKAPTISITPSYVEVYNDEVLGGANGIPFVMRDDKGVLTMLADPNNTIITGLTMSRTPI
GNQGFKPYYSNRQNPKEHTSVVGGTIGRDNGWKPMTPGVYNLDFKVFDTAQQSTLGRLTL
NIKGFNERNNPVSGDTVTVNNPSSLSETEKAQILANFKNQNATILSSADYVKGSEGGKEI
TVSNTGEITITYRDNTVDIVQASVRAETEVPVPAVTVTRDGQTIPATPSPVASRGNEHIV
YAGDDFTIKFTATDNSGKLKEFKIVPKADGSQPGLRDNFFEDPKYGTGSVGLLTGDITAT
PANPATITVNAHMKDDLEWKSGNTWQRNAVATDQVGNVNGTVGTGNVRITQGQLKDRLSV
TNPEFTPVADKNNLTETEKTAVKNAIYAKNNQTTHRIKDIEVQANGTATIVYKDETRSTP
IPQSVTVNERPKLVIPYDRPDVKEIDIYRGEPTNLTFSATDDSGEISSLKFETQGTADNA
NGTNYAGYTGINRSNPITSLTNQSNATITITGTLDKSIPAGKSFERYLIATDDRGVTDSV
HTKNGVADNGYVKFVIKNQTDKYNAVAKTPTVYTYVGETASDLSNAANFVQLEGGKQLPQ
GATVAWKTPIDTTNSGDNKTAVATVTYADGSTDDVTVTYSTMSTITSKDPINDIQGTTPH
NGNGSNWLDYVYKSGDAWFPSGSRQTWTNEDGARLSEAPITTTEAGQQRFKLTFTYPKGR
LGETDSSKLLSKTVDVIHNVYKFETNRSYIFTQGQINDDTYKQVVANPKDSITKVTGAPD
YNVNKTNFRWADGAPDLSQVGRFTKDVEVELPVDGTGVRVKQRVPITYTVNPQTPEISID
STNETGGLPNRSIVVTNVTPGSTVTLTLAGHTFTKDVKATDNSVTFDPQDLKKAYDGNNG
LLPTGNVTAKSTVDGLNSEVASGTITPERVKPTITYTVKVNGQEPKKDSNGRYLFYAGDN
IQITYTGKDNSGKLVTLKVSGNRKDLTDFFENRPEWGTGPITNIISTLTNDDQTTFTINV
NTNEDLAWRSGNTWGRWLTATDPSGNSVDVGEIRIQQDQLQNLFNKPVIDVTEVKDKNHL
TETDKEKVREEIKKAHDKIVPNGRNRISSIDVSEDGIATVYYKDNAKVASGSQPYSPIVY
SQDETVSEKKYRSESASTSASESESASTSASESASTSASESALTSASQSASTSASESAST
SASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASE
SASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSAST
SASESASTSASQSASTSASESASTSASMSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQ
SASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESAST
SASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASE
SASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSAST
SASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQ
SASTSASESASTSASMSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASMSASTSASESAST
SASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASESAST
SASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASE
SASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSAST
SASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQ
SASTSASESASTSTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASMSASTSASESA
STSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSSSESASTSASQSASTSA
SESASTSTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASASASTSASM
SASTSASESASTSASMSASTSASNSVITSKGDPAIHSLDSIDINSVIISDSISVSVSESI
SASQSVSRSASASASTSASLSASTSASESASTSASQSASTSASESASTSASQSASTSASE
SASTLASQSASTSASESASTSASLSTSISASASAQSSETHAKLPQTGDQSANTATLGLGL
LTGLLGLGVVAKRRKDEDEDGVIEQ
NT seq
7098 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaataggaatcttgaagcgactatttggatctatgctactgtaaataataattctagt
gaagctactttgaatgcccaagtggctacaagtagtagaccgtttgatggttctaccact
tcgggcaattacacccaagttatgaatggttcggttcctactggtacaggtcaaagagca
accgataaagcacctactatctcgatcaccccttcttatgttgaagtatataatgatgag
gttctaggtggagcaaacggaattccttttgttatgagagatgacaaaggggtgctaact
atgttagctgatccgaataatactatcatcactggtttgaccatgagtcgtaccccaatt
ggtaatcaaggatttaaaccttattattctaatagacagaatcctaaagaacatacttca
gttgtaggtgggacaattggccgtgataacggatggaagccaatgactccaggcgtttac
aatctcgacttcaaagtgtttgacactgctcaacaaagtactttgggtcgcttgacgctt
aacatcaaaggtttcaacgagcgtaacaatcctgttagtggcgacactgttacagttaac
aacccgtcatctttaagcgagactgagaaagctcaaatcctagcaaacttcaagaaccaa
aatgctacgatcctatcaagtgctgactacgtgaagggttctgaaggtggtaaagaaatt
acagtgtctaacactggtgaaatcaccattacctatcgtgataacactgtagacatcgtc
caagccagcgtaagagcggaaacggaagtgcctgttcccgctgttacagtgacgcgtgat
ggtcagactattccagcgactccaagtccagtcgctagtcgtggaaatgaacatatcgtt
tatgctggtgatgacttcacaattaagtttactgcaactgataatagtggtaagttaaaa
gagttcaagattgttcctaaagcagatggaagccaaccaggattgagagataacttcttt
gaagaccctaaatacggtacaggttctgtaggactcttgacaggtgatattacagctaca
ccagcaaatcctgctacaatcacagtcaacgctcatatgaaagatgatctggagtggaag
tcagggaatacttggcaacgaaatgctgtcgcaacagaccaagtaggaaatgtcaacggg
actgttggtaccggtaatgttcgtatcactcaaggacaacttaaagaccgtctttcagtg
acaaatcctgaatttacacctgttgcagataaaaataacttgacagaaactgaaaaaaca
gctgttaagaatgccatctatgctaagaataatcagacaactcaccgtatcaaagatatt
gaagttcaagcaaatggtacagcaacgattgtctataaagatgaaactcgtagcactccg
attccacagtcagtgacagttaatgaacgtccaaaattggtgattccatatgatagacca
gatgtcaaagaaatcgatatctatcgtggtgagcctactaacctaacctttagtgcgaca
gatgattctggggaaatttcctctttgaagtttgaaacacaaggtacagctgacaatgct
aatggtacaaactatgcaggatatactggaattaatcgttcaaatccaattactagctta
actaaccagtcaaatgcaactattaccattactggcacgcttgataaaagtatcccggcg
ggcaaatcatttgaacgctatttgatagcgacggatgatcgtggcgtcacagatagtgtt
catacgaagaatggtgttgctgacaatggttatgtcaagtttgtgatcaaaaatcagacg
gataaatataacgctgtggctaagactccaactgtctatacatatgtaggcgaaacagct
agtgatttgtcaaatgcggctaactttgttcagcttgaaggtgggaaacaattaccgcaa
ggtgctactgttgcttggaaaacaccaattgacacaactaactctggggataataaaaca
gctgtagcgacagtcacatacgcagatggatctacagatgatgttactgttacatacagt
accatgtctacaatcacgtctaaagatcctatcaatgatatccaaggaacaactcctcac
aatggtaatggttcaaactggcttgactatgtgtataagtcgggagatgcttggttccca
agtggttctcgacaaacatggacaaatgaagatggagctcgcttgtcagaagctcctatc
actacgacagaagctgggcaacaacgcttcaaattaacttttacatatcctaaaggtcgt
cttggtgagacagatagttcgaaattgctcagcaagacagtagatgttattcataatgtt
tataagtttgagactaatcgttcttacatctttactcagggtcaaataaatgatgataca
tataaacaagtagttgccaatccaaaagattctattacgaaagtgacaggtgcgcctgat
tataatgtaaataagacgaacttcagatgggctgatggtgctccagatctttcacaagtg
ggacgatttacaaaagatgtggaagttgaactacctgtagatggtacgggagtacgtgtc
aaacaacgagttccaatcacttacacagttaatccgcaaactccagagatttctattgat
tcaactaatgagacaggtggcttgccaaatcgctcgattgtggtaacaaatgtcacaccg
ggatcaactgtaaccctgacattagctggacatacttttactaaagatgtaaaagctact
gataatagcgtcacttttgatccccaagatctgaagaaagcttatgatggtaataatggt
cttcttccgacaggtaatgtgacagctaagtcaacagttgatggattgaactcagaagtc
gcctcaggaacaatcactccagagcgtgtaaaaccaacaatcacttacacagtcaaagta
aatggtcaagaacctaagaaagatagtaatggtcgatatctgttctatgctggggataat
atccagattacttatacaggtaaagataatagtggtaaattagtcacactgaaggtctct
ggtaatagaaaagacctaacagacttcttcgaaaatagacctgagtggggaactggtcct
atcacgaacataatcagtaccttaacaaatgatgaccaaactacctttactataaatgtt
aatactaatgaagatcttgcgtggagatcaggaaacacttggggacgatggctcactgct
acagatcctagtggaaacagtgttgatgtaggagaaattcgaattcaacaagatcagttg
caaaacttgtttaacaagcctgttattgatgtgacagaagttaaggataaaaatcactta
acagaaactgataaggaaaaagttcgcgaagagattaaaaaagctcacgacaagattgtt
ccaaacggtcgcaatcgtatttctagcattgatgtaagtgaggatggaattgcaactgtc
tactataaagataatgctaaagtagcatcgggtagccagccatattcaccgatagtctat
agtcaagatgaaactgtttcagagaagaaatatcgttctgagtcagcttcaacgtcagca
tcagaatcagaatcagcgtcaacgtcggcatcagagtcagcaagcacaagcgcctcagaa
tctgcattaacgtccgcttcacaaagtgcttcaacgagtgcaagtgaatccgcaagtacg
tccgcatcgcaaagtgcttcaaccagcgcgtctgaatcagcaagtacctcagcatcgcaa
agtgcatcaactagtgcatcagagtcagcaagcacctcagcatcacaaagtgcttcaact
agtgcaagtgaatccgcaagcacgtcagcgtcacaaagtgcttcaaccagtgcgagcgaa
tcagcaagtacatcagcatcgcaaagtgcttcaacaagtgcgagcgagtccgcaagtacg
tcagcgtcacaaagtgcttcaaccagtgcgagcgaatctgcaagtacatccgcatcgcaa
agtgcatcaacaagtgcgtcagaatcagcaagcacaagtgcttcacaaagtgcttcaact
agtgcaagtgaatccgcaagcacgtcagcttcacaaagtgcttcaactagcgcctcagag
tccgcaagtacctcagcgtcaatgagtgcttcaacgagcgcgtctgaatctgcaagtact
agcgcatcgcaaagtgcgtcaacaagtgcaagtgagtccgcaagtacatcagcttcacaa
agcgcttcaacaagtgcttctgaatccgcaagtactagcgcatcgcaaagtgcttcaacc
agtgccagtgaatccgcaagtacgtccgcatcacaaagcgcttcaacaagtgcgagcgaa
tccgcaagtacgtccgcatcacaaagcgcttcaaccagcgcaagtgagtccgcaagtacg
tccgcatcacaaagcgcttcaaccagcgcaagtgagtccgcaagtacgtctgcatcacaa
agtgcttcaaccagtgcgagcgagtccgcaagtacgtcagcgtcacaaagtgcttcaacc
agtgcgagcgaatctgcaagtacatccgcatcgcaaagtgcatcaacaagtgcgtcagaa
tcagcaagcacaagtgcttcacaaagcgcttcgacaagtgcgagcgagtccgcaagtacg
tcagcttcacaaagtgcttcaacaagtgcgagcgaatccgcaagtacctcagcatcgcaa
agtgcatcaacgagcgcgtctgaatctgcaagcacatcggcttcccaaagtgcatcaacc
agtgcgagcgagtccgcaagtacctcagcgtcacagagtgcgtcaacaagtgcatcagag
tcagcaagtacatctgcatcgcaaagtgcttcaaccagcgcgtcagaatcagcaagtacg
tctgcatcacaaagcgcttcgacaagtgcgtcagagtcagcaagcacctcagcatcgcaa
agcgcatcgacaagtgcttctgaatccgcaagcacaagtgcatcaatgagcgcatcgaca
agtgcttctgaatctgcaagtacatccgcatcgcaaagtgcatcaacaagtgcaagtgag
tcagcaagcacaagtgcatcaatgagtgcctcaacaagtgcttctgaatcagcaagtact
agcgcatcgcaaagtgcttcgacaagtgcttctgaatcagcaagcacatccgcatcccaa
agcgcttcaaccagtgcgagcgaatccgcaagtacgtcagcgtcacagagtgcctcaacg
agtgcgtcagagtccgcaagtacgtccgcatcgcaaagtgcgtctgaatcagcaagcaca
tccgcatcccaaagcgcttcgacaagtgcgagcgaatccgcaagtacgtccgcatcgcaa
agtgcttcaactagcgcctcagagtccgcaagtacgtccgcctcacaaagcgcttcaacc
agtgcgagcgaatcagcaagtacgtccgcatcgcaaagtgcatcaaccagtgcgagcgaa
tcagcaagtacctcagcctcacaaagcgcttcaacaagtgcgagcgaatcagcaagtaca
tccgcctcacaaagtgcatcgacaagtgcaagtgagtcagcaagcacctcagcatcgcaa
agtgcatcgacaagtgcgtcagagtcagcaagcacctcagcatcgcaaagtgcatcaaca
agtgcgtcagagtccgcaagtacatccgcctcacaaagcgcttcgacaagtgcaagcgaa
tccgcaagtacgtcagcgtcacaaagcgcttcaaccagtgcgagcgaatcagcaagtacg
tccgcatcgcaaagcgcttcgacaagtgcaagtgaatcagcaagtacgtccgcatcgcaa
agtgcatcaaccagtgcaagtgagtctgcaagcacaagtacgtcagcgtcacaaagcgct
tcaaccagtgcgagcgaatccgcaagtacgtccgcatcgcaaagcgcttcgacaagtgca
agtgaatcagcaagtaccagtgcatcaatgagtgcatcgacaagtgcaagtgaatcagca
agtacgtcagcctcacaaagcgcttcgacaagtgcaagcgaatccgcaagtacgtctgca
tcgcaaagcgcatcgacaagtgcgagcgaatccgcaagcacaagtgcatcgcaaagtgca
tcaacaagttcttctgaatcagcaagtacctcagcatcgcaaagtgcatcaacaagtgca
agtgagtctgcaagcacaagtacctcagcttcacaaagtgcctcaactagtgcctctgaa
tccgcaagtacatcagcatcacaaagcgcttcaacaagtgcgtcagaatcagcaagcaca
agtgcttcacaaagcgcttcaacgagcgcgtcagcgtcagcaagtacctcagcatcgatg
agtgcatcgaccagcgccagcgaatccgcaagtacgtctgcatcaatgagtgcttcaacc
agtgcatcaaactctgtcattacaagtaagggagatccggcgatccactctcttgatagc
attgatattaatagtgttattatctcggattctattagtgtgtctgtatctgagagcatc
tctgcatcgcaaagtgtctcaaggagcgcctcagcatcagcaagtacctcagcttcattg
agcgcgtcaacgagtgcatcagaatctgcaagcaccagtgcatcacaaagcgcttcgacc
agcgcgagcgaatccgcaagtacatcggcttcccaaagtgcatcaacgagtgcgagtgaa
tctgcaagtaccttagcttcacaaagtgcttcaaccagtgccagtgaatcagccagcaca
agcgcttctctaagtacaagtatttctgcttcggcctcagcacagtcgtcagagacacat
gcgaaattgccacaaacaggtgatcagtcagctaatacagctaccctaggacttggtcta
ctgacaggcttacttggtttaggagttgttgctaaaagaagaaaagatgaggatgaagat
ggagtaattgaacagtag
DBGET
integrated database retrieval system
