KEGG   Spiroplasma chrysopicola: SCHRY_v1c01380
Entry
SCHRY_v1c01380    CDS       T02676                                 
Symbol
uvrA
Name
(GenBank) excinuclease ABC subunit A
  KO
K03701  excinuclease ABC subunit A
Organism
scr  Spiroplasma chrysopicola
Pathway
scr03420  Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:scr00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03420 Nucleotide excision repair
    SCHRY_v1c01380 (uvrA)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:scr03400]
    SCHRY_v1c01380 (uvrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:scr03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    GGR (global genome repair) factors
     SCHRY_v1c01380 (uvrA)
  DSBR (double strand breaks repair)
   NHEJ (non-homologous end-joining)
    SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)
     Supressor
      SCHRY_v1c01380 (uvrA)
SSDB
Motif
Pfam: UvrA_inter UvrA_DNA-bind ABC_tran SMC_N AAA_29 RsgA_GTPase nSTAND3 nSTAND1 AAA_33 AAA_14 AAA_16 APS_kinase AAA_18 ATPase DnaJ_CXXCXGXG NACHT AAA_24 NB-ARC AAA_21 CelTOS
Other DBs
NCBI-GeneID: 16151548
NCBI-ProteinID: AGM24723
UniProt: R4U2N5
LinkDB
Position
156298..159138
AA seq 946 aa
MAKDWIIVKGARENNLKNINVKIPKDKLVVFTGLSGSGKSSLAFNTIYAEGRRRYIESLS
SYARQFLGGNEKPDVDAIEGLSPAISIDQKTTSNNPRSTVGTVTEIYDYLRLLYARVGVP
YCINGHGVIKSVSIKEIINNLKQQLNEDEKFMILSPVIRDKKGSFKELFLKLRQESFIRV
NINGELRNLDEDIELDKNKRQNIDIVIDRIIFHNNEEIISRIHDALEIALKYGNGLVKIA
FQEQGKDALFSTNYACSICGFVIPELEPRLFSFNSPNGACPDCKGLGIKLEVDEELLIPN
QNLSVLQGGIVYLKNIINTTNIEWQKFTVLANHYHIPLDLPISDLTKTQLNYLLRGSDET
IDYNFKTASGNIMRGYDYIEGIGQLIERRYTETTSESAREYYKQFMSDRKCTTCHGQRLN
EIPLAVKVNDLSISDFTNLSVEEELSQVLNLRLTEYQQEIAKLIVNELVNRLDFLSRVGL
GYLTLSRSAATLSGGEAQRIRLATQIGSQLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDKLIETLKSLR
DLGNTLIVVEHDEDTIRASDYIIDIGPRAGINGGEVVAYGQLEDIMKNPNSITGKYLTGE
LEIAIPKTHRGGNGLTLEVKGARENNLKNINVTIPLNKLVCLTGVSGSGKSTLMHEIIWK
GIKKNLGLATERPGAYDKIVGIDNIDKVINISQDPIGKTPRSNPATYTSVFDDIRDLFAG
TNEAKARGYLKGRFSFNVPGGRCENCQGDGIIKISMHFLPTVFVNCEVCDGKRYNDETLM
VKFKEKNIYDVLEMTVDQAALFFEKQPKIYQKLLTMQEVGLGYIKLGQSATELSGGEAQR
VKLSTFLLKRTTGKTLFLLDEPTTGLHVDDVKRLLVVLNRIVDNGDSVLVIEHNLDVIKV
ADYIIDLGPEGGNGGGTVVATGTPEQIVKKSDISFTGQYLKLILNK
NT seq 2841 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcaaaagattgaattattgttaaaggtgcgcgggaaaataatttaaaaaatattaat
gttaaaattccaaaagataaattagtagtttttactggattatcaggaagtggtaaatca
tcattagcttttaatacaatttatgccgagggtcgtcgtcgttatattgaaagtctttcg
agttatgctcgtcaatttttagggggcaatgaaaaaccagatgttgatgcaattgaagga
ttatcccctgcaatttcaattgatcaaaaaacaacaagtaataatcctcgtagtacggta
gggacagtaacagaaatttacgattatttacggttattatatgcgcgagtaggagttcct
tattgcattaatggtcacggggttattaaatcagtttcaattaaagaaattattaataac
ttaaaacagcaattaaacgaagatgaaaaatttatgattttatcgccggtaattcgtgat
aaaaaaggtagttttaaagaactatttttgaagttacgccaagaaagttttattcgggta
aatattaatggtgaattacgtaatttagatgaggatattgaattagataaaaataaacgg
caaaatattgatattgtcattgaccgaattatttttcataacaatgaagaaattattagc
cggattcatgatgcccttgaaattgccttgaaatatggtaatggtttagttaaaattgcg
tttcaagaacagggaaaagatgccttgttttcaacaaattatgcttgtagtatttgtggt
tttgttattccagaattagaaccacgactattttcgtttaattccccaaatggagcatgt
cctgattgcaaggggttaggaattaaattggaagttgatgaagaacttttaatcccgaat
caaaacctgagtgttttacaaggagggatagtctatttaaaaaatattattaatacaact
aatattgaatgacagaaatttactgttttagctaatcattatcatattccgttggattta
ccaattagtgatttaacaaaaacgcagttaaattatttactacgcggaagtgatgaaaca
atagattataattttaaaactgctagtggtaatattatgcgtggttatgattatattgag
gggattggccagttaattgaacgccgttataccgaaacaacaagtgaatcagcacgggaa
tattataagcagtttatgtcagaccgaaaatgtacaacttgtcatggccaacggttaaat
gaaattcctttagcagttaaggttaatgatttaagtatttctgattttacgaatttatct
gtggaagaagaattatcacaagtattaaatttacgcttaacagaatatcaacaagaaatt
gctaagctaattgtcaatgaattagttaatcgtcttgattttttatcgcgggttggttta
ggatatttaactttgtcacgtagtgccgctactttatcagggggtgaagcgcaacggatt
cgtcttgctacgcaaattggtagtcagttaacaggagttttatatgttttagatgagcca
tcaattgggttacatcaacgtgataatgataaattaattgaaacattaaaaagtttacga
gatttaggtaatactttaattgttgttgaacatgatgaagatacaattcgggcaagtgat
tatattattgatattggtcctcgagcaggaattaatggtggagaagttgttgcttatggg
caattagaagatattatgaaaaatcctaattcaattactggaaaatatttaacgggagag
ttggagattgccataccaaaaacccaccgtggaggtaatggtttaacattagaagttaaa
ggtgcgcgggaaaataatttaaaaaatattaatgtaacaattccattaaataaattggtt
tgcttaactggtgtatcaggaagtggaaaatcaactttaatgcatgaaataatctgaaaa
ggaattaagaagaacttaggattagcaacagaacgaccaggagcatatgataaaatagtt
ggaattgataacatcgataaagttattaatatttcccaagatccaattggtaaaacaccg
cgtagtaatccggcgacatatacttcggtctttgacgatattcgtgatttatttgctgga
acaaatgaagcaaaggcacgtggttatttgaaaggtcgtttctcatttaatgttccaggg
ggaagatgtgaaaactgccaaggggatggaattattaaaatttcaatgcacttcttacca
acagtttttgttaattgtgaagtttgtgatgggaaacgttataatgatgaaacattaatg
gttaaatttaaagaaaaaaatatttatgatgttttggaaatgaccgttgatcaagcggcg
ttattttttgaaaaacaaccaaaaatttatcaaaaattattaacaatgcaagaagttggg
ctaggttatattaaattaggtcaatcagcaactgaattatcagggggtgaagcccaacgg
gtaaaattatcaacttttttattaaaacgaacaacaggaaaaacattattcttactagat
gagccaacaacaggattacacgttgatgatgtaaaacgcttattagtcgtgttaaatcgg
attgttgataatggggatagtgttttagttattgaacataatctagatgttattaaggta
gcagattatattattgatttaggaccagaaggtggtaacggcgggggaactgttgttgca
actggaacgccagagcaaattgttaaaaagagtgatattagttttactggtcagtattta
aaactaattttaaacaaataa

DBGET integrated database retrieval system