Shewanella sp. FDAARGOS_354: CEQ32_14875
Help
Entry
CEQ32_14875 CDS
T04944
Name
(GenBank) GlyGly-CTERM sorting domain-containing protein
Organism
shf
Shewanella sp. FDAARGOS_354
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S8
PA
Inhibitor_I9
Big_9
CshA_repeat
Big_10
fn3_5
Cadherin_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASF16151
LinkDB
All DBs
Position
complement(3327198..3332093)
Genome browser
AA seq
1631 aa
AA seq
DB search
MKLKKISIMTFAALYATGIGTLVANPLDRNQAEQKLIGIKLAPEQILANKNKPTHPALNR
ANRPGQIGMNVHRAVNGSSNKAPFAWEKDIDGTHTYIIQLMDAPVSLYQGDRPEFAATSP
RSNQPAIRSNERFGTIDLKSKTVKNYQAFLTRSQDETASQIKRVAPDAEIKRRFNVALNG
MTMVLTQEQAAEVAKLPNVKAVTRAKEYQLFTDVGPKHIGADMIWQGTSTPDGVAMRGEG
IIAGIIDTGINSDHPSFAAVSADGYKHVNPLGEGNYLGDCQEYPLMCNSKLIGVRSYDMI
TDTYKDPIFQPDLPPWEVDYKRPPNGEDYNGHGSHTASTVAGNVLYNVPFKLSGTDEKSD
GFDTSLVFPEISGVAPRANIIAYQVCYPGGGSYGENYGGCPGDALVAAIEDAIIDGVDVI
NFSIGGLESLPWYDAVEMAFLAARESGISVAASAGNWGRYGPGYIDHVSPWLTSVAASTH
GRQIEPVEGSLTFAGENAPNKMAGYAVTGDITGRLVDAATYSDPLCLAPFPAGTFNSDDI
VLCKRGENARVQKGVNVAAGGAGGIILYNAVSWDDGTGANSLNLNPFPIPGMHIDAASGN
QLVEWIANTTEPKVTITAGKIITTEREADVLADFSSRGPSSTNPNVMVPNVSAPGVDVFA
AYSDEMPFSLYPSPSDYEAISGTSMAGPHVAGALALLTQAHPQWTPAMIQSALMTTAVLG
KAPTYDNPPKLVDAAFYDMGSGVINVARAVKAGLVMDENGDNYRAANPMEGGDVTALNVP
YLVNAECKSSCTWMRTFTATTDGEWNVSATEITTEGAPFLELSVYPQTIKLKAGEQQSIM
VTAKILDVTSVNANSSSNEVFGKIDLKPTDASLPDQYLPVMARFTGSSLPEIVAGKIHRD
TGTMLTPELMTKEISALNVKVSGLTAGTVTEHKLNAAYVDFTKPETMENNPGVSVHFFDV
PEGTRRIVWEEVSADNAASTSLDIGMDLNSNGKVEWYDEAICYSYTDVTDYCAINDPTPG
RYWVMLGNFKRPWGDEIDTKDSIKASLAIISDTDTKQLNVTGPASTNGIDPYQLQMNWSV
TGSKAGDRLYGLVEVGNGAQNVGNIGKMAVHLVHEGNDVSITTSQQQAKEGDVVEVKMLM
APNLLGLERDVNIALTLPEGLQLLPDTLKANSNNQDLKAGLTVAAQQITLKAMQQASNAQ
KRQYTFTTSETDESCRIPIGSNPYYLDLFTEAGIASEAAIAGRVNDTVTVPLSAFGIDRI
PLYNNPEEYSHKDTLSISPGGFIQLDQLPLFWAAHYPMEEQYFPDTVIAPLWRGDGVTIP
EYNLDTESMDGVSLAVTNDRRYLIVEWDNMRQDFAFGINHDPDYDARYSFELLASTQLNF
APGEHEFIFAYDKLTGNKAHLGSIGLHGYYGPRGTFGPAYGYIGDGFAFNDLDKKIAEGL
VVCANYTGPEATAIELSFSARVGAKAVGQDLQIIAKSDYTGSSSVTSSGSLKVPSNLAIG
ALGNMSVAENTSISFEVLVQDKENTANGIQVTGAHITSVVNGNQVTITPEKDWHGTTTVT
VKAFDKVYQNDMVQTSFNLVVNSDGVEPTPPTPPTPPVEETKESDGGSLGWLAVLMLGLM
AASRQKWNVNK
NT seq
4896 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattgaagaagatcagcataatgacctttgcggcgctatatgcgaccggaataggg
acgttagttgccaatcctttagataggaaccaagccgagcaaaaacttattggtatcaag
ctggcacccgaacaaatattagccaataaaaataaaccaacccatccggctttgaatcgc
gctaatagaccgggtcaaattggtatgaacgtccatcgcgctgtaaatgggagtagcaat
aaggcgccatttgcatgggaaaaggacattgatggaacgcatacctatattattcaatta
atggatgctcctgtttcactttatcagggtgatagacctgagtttgccgccacgtcgcct
cgtagcaatcagcccgcaatacgttctaatgagcgttttgggacaatcgatttaaagagc
aaaaccgttaaaaactaccaagcttttttaacgcgctctcaggatgaaaccgctagccaa
atcaagcgtgttgcaccagatgctgaaataaagcgtcgctttaatgtggcactaaacggt
atgaccatggtgttaactcaggagcaagccgctgaagtggctaagttgcccaatgttaaa
gcggtgactcgggcgaaggaatatcaattattcaccgatgtcggccctaagcatattggc
gctgatatgatttggcagggcacgagcactcccgacggcgttgcgatgcgtggtgagggc
attattgccggtattatcgacactgggattaactcagatcacccctcttttgccgcagtt
tcggcagacggttataagcacgtcaacccattaggcgaaggcaattatctgggcgactgc
caagaatatcctttgatgtgtaacagtaagcttatcggtgtacgttcttacgatatgatt
accgatacctataaagatccgattttccaacccgatctgccaccgtgggaagtggattat
aaacgcccacccaatggtgaagattacaacggccatggttcacatactgccagtactgtt
gcgggtaacgtgctctacaatgtgccctttaaactgagtggaactgatgaaaaatcagat
ggttttgatacctctttagtcttccccgaaatttcaggcgttgccccaagagccaacatt
attgcctaccaagtgtgttatcccggtggtggttcgtatggcgaaaactacggtggttgt
cctggcgatgcattagtcgctgctattgaagatgccattatcgacggcgtcgatgtaatt
aacttctctatcggtggacttgaaagtctgccttggtacgatgccgttgaaatggcgttt
ttagctgcgcgtgaatcggggatctctgttgctgcttcggcgggtaactggggacgctat
ggcccaggctatatcgaccatgtctcgccttggttaacatccgttgctgccagtacccat
ggtcgccaaattgaacctgttgaaggctcgctcacttttgcaggtgaaaacgcacctaat
aaaatggcaggttatgccgtaacgggagatatcactggccgtttagttgatgccgcaacc
tatagtgatccactgtgcttggctcctttcccagctggcacattcaatagcgatgatatc
gtgttatgtaagcgcggtgaaaatgctcgcgtacagaaaggtgttaacgttgctgcgggc
ggtgcaggtgggattattttatataacgccgtatcttgggacgatggtactggcgcgaat
agcctaaatttaaaccctttccctatccctggaatgcacatcgacgcggcatcaggcaat
cagcttgttgaatggattgccaacaccacagagcctaaagtcaccatcactgcgggtaag
attatcaccactgagcgcgaagccgatgtgttagctgacttctcctcccgtggtccaagt
agcactaaccccaatgtaatggtgccaaacgtgtcagcccccggggtggacgtgtttgct
gcttattctgacgaaatgccttttagcttgtatccctcaccgagtgattatgaagccatt
agtggtacttctatggcaggtccacatgtggcgggcgctttagcgttattaacccaagcg
cacccacaatggacgcctgcgatgatccagtcggcactgatgaccaccgccgtgttaggt
aaagctccaacctacgataatccgccaaaattagtggatgcagctttctacgatatgggt
agcggagtgattaacgtagccagagcggtaaaagcgggtctggtgatggatgaaaacggt
gacaattatcgcgcagccaaccccatggaaggtggcgatgtgaccgcgttaaacgtgcct
tatttagtcaatgcggaatgtaaaagtagctgcacttggatgcgtacctttactgccacg
acagacggtgagtggaacgtgagtgcgaccgaaattaccacagaaggcgcgcctttcctt
gagctaagtgtttatccgcaaacgattaagttaaaagcgggtgagcagcaaagtattatg
gtaacggcgaaaatcctcgatgtaacctctgtcaacgctaactcttcctcaaacgaagtg
tttggtaaaattgacctgaaaccgacggatgccagtttgccagatcaatacttgcccgta
atggcacgttttactggctctagcttgcctgaaattgtcgcaggaaaaatccaccgcgat
actggcactatgttgacaccagagttaatgaccaaagaaatcagcgcgctgaatgtcaaa
gtgagtggcttaaccgcaggtacagtcacagagcacaaacttaatgccgcctatgttgac
tttacaaagcctgaaacaatggaaaataatccgggtgtttcggtgcatttctttgacgta
ccagaaggcactcgccgcatcgtatgggaagaagtctctgcagataatgccgcatcaacg
tctttagatattggtatggacttgaatagcaacggcaaagtggaatggtatgacgaggcg
atttgttactcctataccgatgttaccgactattgcgcgatcaatgatccaacgccaggc
cgttactgggtgatgttaggtaactttaagcgcccatggggagacgagattgataccaaa
gacagcattaaagcgagtctggcgattatctccgacactgatactaagcaactgaatgta
acagggccagcaagtaccaatggtatcgatccttaccaattgcaaatgaactggtctgtc
acaggcagtaaagcgggtgatcgcttatacggcttggttgaagtcggtaatggtgcgcaa
aacgttggcaacattggcaaaatggccgtgcatttagtacatgagggcaatgatgtcagt
atcacgaccagccaacaacaagccaaagaaggcgatgttgttgaggttaagatgctgatg
gcaccaaacctactcggattagagcgcgatgtgaatattgccttaacactgcctgaaggt
ttgcaattattgcctgacacgctaaaagcgaacagcaataaccaagatcttaaagctggt
ctcactgttgctgcgcagcaaattactctgaaagcgatgcaacaagcgagtaatgcgcaa
aaacgtcaatacacctttaccaccagcgagaccgacgagagctgtcgaattcccatcggt
tcaaatccttattatttggatttatttaccgaggctggaatcgcgtctgaagcggcaatt
gctggtcgggtgaatgatacggtaactgtgccattaagcgcatttggtattgatcgtatc
ccgctgtataacaatccagaggagtattcacacaaagataccttaagtatttctcctggt
ggatttattcagctcgatcaactgccactgttttgggctgctcactatccaatggaagag
caatatttccccgatactgtgattgctccgttatggcgtggagatggtgttaccatccct
gaatataatttggataccgaaagcatggacggcgtatcgcttgctgttaccaatgaccga
cgttatctgattgttgaatgggataatatgcgtcaggattttgcctttggtattaaccat
gatcctgattacgatgcccgttacagttttgagctattagcctcaactcagcttaatttt
gcccctggtgaacatgagtttatttttgcctatgacaaattaaccggtaacaaagcgcat
ttaggctcaattggtttacatggttactatggaccacgtggcacctttggccctgcgtat
ggttatatcggtgatggctttgcctttaacgatctggataagaaaattgcagaaggctta
gtggtctgtgctaactacactgggcctgaagcgacagcaatcgaactatcattctcagcc
cgtgttggtgctaaagcggtaggtcaagatctgcagattattgctaaaagtgattacact
ggcagcagtagtgtgacctctagcggaagcctcaaagtaccttcaaaccttgcgataggt
gcactcggcaatatgtctgttgctgaaaacaccagcatcagttttgaggtgctagtgcaa
gacaaagaaaataccgctaatggtatccaagtcacaggcgcgcatatcacctcagttgtt
aatggtaaccaagtcaccatcactcccgaaaaagattggcacggtacaaccactgtcaca
gtgaaagcctttgataaggtttatcaaaatgacatggtgcaaacgagcttcaacttagtc
gtgaactctgatggtgtggagccaacgccaccaacacctccaacaccacctgttgaagag
actaaagagagcgatggcggtagcttgggctggcttgctgtcctgatgcttggcttgatg
gccgcatcacgtcaaaaatggaatgttaataagtaa
DBGET
integrated database retrieval system