Shewanella inventionis: K8B83_14175
Help
Entry
K8B83_14175 CDS
T07895
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
sinv
Shewanella inventionis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sinv00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sinv02000
]
K8B83_14175
Transporters [BR:
sinv02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
K8B83_14175
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UAL42024
LinkDB
All DBs
Position
3225826..3228546
Genome browser
AA seq
906 aa
AA seq
DB search
MLLFKPSLLTLALAAAGASISAYAADDVNTTETAEENIEVIQVTGIRRSLQESQSLKMSS
SSIVEAISAEDIGKLPDVSIAESLARLPGVSAQRLDGRANVISIRGLGPDFTTATLNGRE
QASVNDNRGVEFDQYPSELLNRVVVYKTPDASVMAQSIGGTVDMQTISPLTHGEQTIAVA
LRGEMNDLGSLNSGSSDTGYRSSISYIDQFADDTIGIALGYARMMSPNQEERWQAWGYPT
NDAGDSVLGGAKPFVRSSELERDGVLAVFEYAPNEQFTSVVDVYYTKFTDDQRLRGIEIP
AAWGANGGVTALTTEDGLVTQGTINGAEVVVRNDVNKRDADSLSIGWNNKYTINDNWLVE
ADLAISKVERTDIGMESYSGTGRGTGVGAVDDLGFAYNGSGGYNFTHNLDYANPDVIKLG
DPLGWGSPLGASTQDGFINKPEIEDELTSFRLSAEYIFDEGAVRSVEFGVNRTNRDKSKL
DKGYYLTLAGYDGSDNYLETVPDQYLLSPTSLDFFGMGDVLSYDSLAFYNDGGYIETDVA
DVDLSRATNSWDISEEVSTFFVKGNLESELFGFPLTGNVGLQAVHTDQSSDGTVATVEDG
NVVVTPRTAGDSYVEWLPSVNLGFEVADGQMVRLAAARTLTRARMDKMNANVNFSYNENP
TDGVNWSGGAGNPELRPWLARQYDISYENYFSDQGYFALAVFYKDLENYVYDQQTAFDFS
TILPQGADDNPIGLVTQPQNGDGGYIQGIEASFSLDFGMFADQLEGFGTILSGSYNDSEV
KETPDSDPTTLPGLSEKTFNATVYYENAGFEARISSRYRSDFLGEVTAISLTRVNVNVKA
ETVVDAQIGYDFTESGIDALYGLSVQFQVNNLTNEPFTSYTGEDARHVRDYQNYGRNFML
GANYKF
NT seq
2721 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgctatttaaaccgagcttactcacgctagcattagccgccgcaggtgcaagcatt
agtgcttacgctgcagatgatgtaaacacaacagaaactgcagaagaaaatattgaagtg
atccaagtgacgggtatccgtcgcagtttacaagagtcacaatctttaaaaatgtcttct
tcatcaatcgttgaagccatttctgctgaagatattggtaagttacccgacgtcagtatc
gctgaatcacttgcgcgtttaccaggtgtatcagcgcagcgccttgatggacgcgcaaac
gttatttctattcgtggcttaggcccagacttcactactgcgaccttaaatggccgcgaa
caagcctcagtcaacgacaaccgtggtgttgagtttgaccaatacccatcagaattactt
aaccgcgtggttgtttacaaaacgccagatgcttctgttatggcacaatctattggtggc
accgtagacatgcaaaccattagtccactgactcatggtgagcaaactattgctgtggca
cttcgtggcgaaatgaacgatttaggttcgttaaacagtggatcaagcgacactggatac
cgtagtagtatttcatacatcgaccagtttgccgacgacaccattggtattgcactaggt
tatgcccgcatgatgtcgccaaaccaagaagaacgctggcaggcttggggttacccaaca
aatgatgctggcgatagtgttttgggcggagcaaagccgtttgttcgctcaagcgaatta
gagcgcgatggcgtgttagccgtatttgaatacgcaccaaacgagcaatttacctcagta
gttgacgtgtactacacaaagtttaccgacgaccaacgcttacgcggtattgagatacca
gcagcttggggtgctaacggtggtgtaacagcactaacaaccgaagatggactggttacc
caaggtaccattaatggtgcagaagtcgttgttcgtaacgacgttaacaaacgtgatgct
gactcattatcgattggctggaacaacaaatacactattaacgataactggcttgttgaa
gcagacctcgccatatcaaaagttgaacgtaccgacattggtatggaaagctacagtggc
acaggccgtggtacaggtgttggtgcagttgatgatttgggctttgcatacaatggtagt
ggtggctacaacttcactcataatttagattatgccaatccagatgttattaaactaggc
gacccattaggctggggtagtccactgggtgcaagcacacaagatggttttattaacaaa
ccagaaattgaagatgagctaacatctttccgcttaagtgcagagtatatctttgacgaa
ggcgcagtgcgtagcgtcgagtttggcgtaaaccgcaccaatcgcgataaaagtaagtta
gataaaggttattatttaacacttgcaggatacgacggttctgataattacttagaaaca
gtgcctgatcaatatctattgtcaccaacgtcactcgacttcttcggtatgggcgatgtg
ctcagttatgattcgttagcattttataatgacggcggatatatcgaaactgacgtagcc
gatgtggatttatcacgagccactaactcgtgggatatttcagaagaagtatcaacgttt
ttcgtaaaaggtaacctagaatctgagttatttggttttccattaacgggtaacgttgga
ttacaggcagtgcacactgaccaaagttcagacggtactgttgcaacggtagaagatggt
aacgttgttgttacgcctcgcaccgctggtgactcttacgttgaatggctaccaagcgta
aacttaggttttgaagttgctgacggccaaatggttcgtttagcggctgctcgtacccta
acccgtgcgcgtatggacaaaatgaatgctaacgttaattttagctataacgaaaaccca
actgacggagttaactggtcaggtggtgcgggtaatccagagctacgcccttggctagcg
cgtcaatacgacattagctacgaaaactactttagcgatcaaggttattttgctttagct
gtgttctataaagatcttgaaaactacgtttatgatcaacaaacagcgtttgatttcagt
actattttaccgcaaggcgcagatgacaacccaataggtcttgtgacccaaccacaaaat
ggtgatggtggttacatacaaggtattgaagcgtctttctcacttgactttggcatgttt
gctgaccaacttgaaggttttggtaccatattaagtggctcatacaacgacagtgaagtg
aaagaaacgccagacagtgatccaacaaccttacctggtctttcagaaaaaacatttaac
gctactgtttattatgaaaatgcaggctttgaagcacgcataagctcacgttatcgcagt
gacttcttaggtgaagtgaccgcaatcagcttaactcgtgtcaacgttaacgtaaaagca
gaaaccgttgttgatgcacaaattggttatgactttactgaaagcggtatcgatgcccta
tacggtttatcggttcagttccaagtgaacaacttaaccaacgagccatttacctcatac
acaggtgaagatgcacgccacgttcgtgattatcaaaactatggccgtaactttatgtta
ggtgccaactacaagttctaa
DBGET
integrated database retrieval system