Shewanella japonica: SJ2017_2008
Help
Entry
SJ2017_2008 CDS
T04959
Name
(GenBank) Acriflavin resistance protein
Organism
sja
Shewanella japonica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARD22307
LinkDB
All DBs
Position
complement(2399138..2402341)
Genome browser
AA seq
1067 aa
AA seq
DB search
MEDTNKGLIAWFARNSVAANLLMIIILLGGLLTANTIRKQFFPAVEINWIEFSAVYPGAA
PQEVEEGITVKIEQALETVQGLQRVITYSNRNQANGYFRIEDSYDPQIVLDEVKSEIGSV
STFPAGMEFPKVDRIKIRQEVMYLSLYGDLSQRQLKDLGEKIHKEIMQLPNVNISEFYGG
LNYEISVEVSKDRLREFGLNFNDVAEAVRGYSRNMSAGQIKAENGYINLRVENQAYVGYE
FEDLPLLTLDDGTNLLLGDVATVNDGFEEGIQYSKFNGQNAVTFFVGAAKNQSITDVADT
MKEYIAKKQALLPEGVTLEPWVDMTYYLDGRLDLMLDSMKTGAVLVFFMLALFLRVRLAF
WVMMGLPVCFLGTLLFMPMGFIDVTINVISLFAFILVLGIVVDDAIVMGESAHTECEENG
QNIDSVIRGVKRVAMPATFGVLTTIAAFLPITLDDGPSSAFGQAIGYVVILCLLFSLVES
KLILPSHLAHMNKPKVVQPGSKNPLDWLRNGVNFIQKKIETNLTWFIKNVYKPSLTVAVK
YRYAVIATFVMLIVICASLYISGLVRFIGQPKIPHDFPRISLEMNVDAAETATLDAAHSI
EKALRTVEKQLEDQYGQGMIAELQVELQGRTRAEVRTKLVDPSLRPINTFEVAEMWRQAM
PKIPGVKSFTVQDSLFGGGRDDGDISFRLEGNDEQQLLAASQALKDKLNTLKGVSDVNDS
RQSSAKEVQFDLKPLAHSLGLTLANIASQVGNSFYGLEAQRIIRNGEEIKVMLRYPEEQR
NSIALVQDVLIKTPQGAELPLSEVANITVVQGVSSIRRENGNRTINVWASVDAEQAEPFK
LAKDIRDNFMPELLAKYPRVKSEVSGSIQEQLDSADTQMRDFIISMLVIYSLLAIPLKSY
VQPFMIMSVIPFGVIGSMLGHIILGIDLSALSVFGIIAAAGVVVNDSLVMVDYVNNSRKQ
GIKLNEAVINAGCRRFRAIMLTSLTTFIGLVPIMTETSMQAQMVIPMAVSLAFGVLFATV
VTLCLIPCLYIAIEDMRRIARKIYHLYVPQTKEQALAELNSLTNSSS
NT seq
3204 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagatacaaataaaggcttaattgcttggtttgctcgtaacagtgttgctgcaaac
ttactgatgatcattattttacttggtggtttactgactgctaatacgattcgtaagcag
ttcttccctgccgttgaaattaactggattgaatttagtgcagtttaccctggcgcagca
ccgcaagaagttgaagaaggtataacagtaaaaattgaacaagcacttgaaacagttcaa
ggtttacaacgtgtcatcacctactctaaccgcaaccaagcaaacggctacttcaggatt
gaagactcttatgacccacagattgttttagatgaagtaaaatctgaaattggttctgta
tcaacctttcctgcggggatggaatttccaaaagttgatcgaattaaaattcgtcaagaa
gtcatgtatttaagtttgtatggcgatctatctcagcgacaactaaaagatttaggcgaa
aaaatccataaagagatcatgcaattaccgaatgtgaatatttcggagttttatggtggc
ttaaattacgaaatcagtgtcgaggtaagtaaagaccgtttgcgtgaatttggtcttaac
tttaatgatgttgcagaagctgtgcgtggctactcacgtaatatgtctgctggacaaatc
aaagctgaaaacggctatataaacttacgtgttgaaaaccaagcttatgttggttatgaa
tttgaagatttgccactgttaaccttagatgatggtactaaccttttattaggcgatgtt
gccacggttaatgatggatttgaagaaggtattcaatactcaaaatttaatggacaaaat
gccgtcactttttttgtcggagcagcaaaaaatcaaagtatcaccgatgttgctgacaca
atgaaggaatacattgctaagaaacaagcgctgttaccagaaggtgtaacattagagccc
tgggtagatatgacctattacctagatggtcggttagatttgatgctagatagtatgaaa
acaggtgctgttcttgtgtttttcatgttagcgctatttttacgtgtcaggctcgctttt
tgggtaatgatgggattacctgtttgtttccttggtacccttttatttatgccaatgggt
tttattgacgtgacaatcaacgtcattagtttattcgcatttattctcgtcctcggtatc
gtggtagatgatgccatcgtcatgggcgaaagtgctcacacagaatgtgaagaaaatggc
caaaacatagatagtgttattagaggggtaaaacgagttgctatgcctgcgacattcggc
gtactgaccaccattgccgcgtttttacctattactttagatgacggaccttcatccgcc
tttggccaagcaatcggctatgtcgtcatattgtgtctattattttctttagttgagtca
aagctgattttaccttctcacttagcccatatgaacaaacccaaagttgttcaaccaggt
tcaaagaatccgttggattggctgagaaatggggtcaatttcattcagaagaaaatcgaa
actaatctgacttggttcataaaaaacgtttataaaccaagccttactgttgcggttaaa
taccgttatgcggttattgcaacctttgtgatgttaattgttatatgcgcatcattatat
atcagtggattagttagatttattggccaacctaagatcccacatgatttccctcgcatc
agcttggaaatgaatgtcgatgctgcggaaacagcaacattagatgcagctcactcaatc
gaaaaagccctacgtaccgttgaaaagcagctagaggatcaatatggtcaaggcatgatt
gcagagctacaagttgaattacaaggtcgtactcgtgcggaagtaagaactaagcttgtt
gatccatctttacgtcctatcaatacatttgaagtcgcagagatgtggcgccaagcaatg
cctaaaatcccaggagtcaaatcgtttactgttcaagatagtttatttggcggtggacgt
gatgacggtgatattagctttaggttggaaggaaatgatgaacaacaactgttagctgct
tctcaagcattaaaagacaaacttaacaccttaaaaggtgtcagtgacgtcaatgacagc
cgccaatcttcagccaaagaagttcaatttgatttaaagccgttagcccatagcttaggt
cttaccttagccaatattgcatcgcaagtaggtaacagtttttatggtcttgaggcgcaa
cgtattattcgcaacggtgaagaaattaaagtgatgcttcgttatcctgaggaacaacgt
aattctatcgccttggttcaagatgtattaatcaaaaccccacaaggcgcagaactgcct
ttatctgaagtggctaacattactgtagtacaaggtgtgagtagtattcgtcgtgaaaat
ggtaatcgcaccatcaatgtatgggcttcagttgatgcagagcaagcagagcctttcaaa
ctggctaaagatatccgcgataactttatgccagagttgttggccaaatatcctcgtgta
aaaagtgaagtctcaggcagtattcaagagcagcttgatagtgcagacactcaaatgcgt
gattttattatttcaatgctagtgatatatagtttgttagcgattccgcttaaatcctat
gtgcaaccttttatgatcatgtcagtgatcccgtttggtgtgattggctctatgttagga
catatcatattaggcattgatttaagtgccctatcggtattcgggatcatcgccgctgca
ggtgttgtagtcaatgactccctcgttatggtcgattatgtcaataattcccgtaaacaa
ggcattaaactgaatgaagctgttattaatgcaggttgtcgccgctttagagcgataatg
ttaacgtcattaaccacatttatagggcttgtacctattatgacggaaacaagcatgcaa
gctcagatggttattcccatggctgtctcattagcatttggcgtgttgtttgcgactgtg
gttaccttatgtttaatcccgtgtttgtatattgcgatagaagatatgcgacgtattgca
cgtaagatttatcatctttatgtaccacaaacaaaggaacaagcattagcagagcttaat
tcgttaacgaatagttcaagctag
DBGET
integrated database retrieval system