Spathaspora passalidarum: SPAPADRAFT_150269
Help
Entry
SPAPADRAFT_150269 CDS
T03101
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K10858
DNA mismatch repair protein PMS2
Organism
spaa
Spathaspora passalidarum
Pathway
spaa03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spaa00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
SPAPADRAFT_150269
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
spaa03400
]
SPAPADRAFT_150269
DNA repair and recombination proteins [BR:
spaa03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
MutL homologs
SPAPADRAFT_150269
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_mis_repair
MutL_C
HATPase_c_3
HATPase_c
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
18870862
NCBI-ProteinID:
XP_007374418
JGI:
150269
UniProt:
G3AKE6
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
836 aa
AA seq
DB search
MSIRSLPSNDILKITSSQVIIDLKSIIKELVENSIDAKSSKIEITFVNYGIDSISIQDNG
VGIQQQDFPTLCLRNSTSKLVNFDDLNSLSTLGFRGEALNSICSLCKQLTIVTSTEADYP
KNFSLKYNEAGELRDNKSKIGGISNKSGTLVTIEQLFSNLPVRLKNFIKNSKREFHKAIN
FLINYLLIYTGIKFSVYHINNSKKQLILSSRGGEKTTIIDNLISMFGNNNNKNLLEINLP
INEYLKLSGHISSYSFGLGRSTQDRQFLYINRRPIIMKNLSKLINEVYKSFNNVQYPIFV
INLEIQSDKFDINLTPDKSMILLHKESEILQLIREKLIEFYNTQDKVIIPRSNNDSFIEQ
STFEVNTDEQKSPDEFTLINKVNTKQKEMQEDYRSETHHQENKSETEIEVKHQRAELANE
NEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEENQREDCEEEINLTNVSQEDKDNSELQDT
LFDKVHHKVDHIVSEDFKTVSKSKNENLFLSSDPDSLFSLADSFPKSSDPQSVLLQEPQE
ISPNQDLHGKNFFPIDENSNDLLEIKIGDKKFEERASKRSRNSSSHLHKLKSYYSSQEFL
ANLKIKRFQSNTNLKYDQNIKFNNLDDKEKLFHIKKSDFSEMSLIGQFNLGFILVNHQDS
NIFIIDQHASDEKYNFEKLVREFQIKTQPLIVPQQLELNIVDEMLIIEHESIFINNGFRL
KINHDSLPGTRISMLSLPTYKGTIFSLDDFYELINLINEQPGNTAVKCSKIRKLLAMKAC
RTSIMIGSSLTSKKMTEIVENLSTLDKPWNCPHGRPTMRHLIELSEWQNNYHDYEL
NT seq
2511 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccattagatcactaccatcaaatgatatattaaaaatcacttcaagtcaagttata
attgatttaaagtcgattataaaagaattagttgagaattccattgatgctaaaagttca
aaaattgaaataacatttgttaattatggtattgattccatatcaattcaagataatggt
gttggtatacaacaacaagatttcccaaccctttgtctaagaaatagtacttctaaatta
gtaaattttgatgatttaaattcattaagtacccttggattccgtggtgaagctttaaat
tcaatttgttcactatgtaaacaattaacaattgttacctccactgaagccgattatccc
aaaaatttcagtttgaaatacaatgaagctggggagctaagagataataagagcaagatc
ggtggaataagcaataagtctggaactttagtaacaattgaacaattgttttccaactta
ccagttagattgaagaattttatcaagaattccaaaagagaatttcataaggctatcaat
tttttaataaattacctacttatttacactggaattaaattttcagtttaccatattaat
aattctaaaaagcaattaattttatcttcgagaggtggtgaaaaaactacaataattgat
aatttgatttcaatgtttggaaataataataataagaatttactcgaaattaatttacct
ataaatgaatatttaaaattaagtggacatatttcatcttattcatttgggttaggcaga
tcaacacaagatcgacaattcttgtacataaatagacgaccaattattatgaagaattta
tcaaaattaattaatgaagtttataaatcatttaacaatgttcaatatccaatttttgtt
attaatttggaaatccaactggacaaatttgatattaatttgactcctgataagtcaatg
attttattacataaagaatcggaaattttacaactaattcgggaaaaattgatcgagttt
tataatactcaggataaggtaataattccaaggagtaataatgacagtttcatagaacaa
tcaacatttgaagttaatactgacgaacaaaagagcccagatgaattcaccttaataaat
aaggtgaataccaaacaaaaagaaatgcaagaggattatagaagcgaaacccatcatcaa
gaaaataaaagtgaaaccgaaatagaagtaaaacatcaaagagctgaactcgcaaatgag
aacgaagaagaggaggaagaggaagaggaagaggaagaggaggaggaagaagaagaggag
gaggaggaggaggaggaggaggaagaagaagaagagaaccaacgggaggattgtgaagaa
gaaataaatttaacaaatgtatcccaggaggataaagataatctggaattacaagacact
cttttcgataaagttcatcataaggtcgatcatatagtatccgaagatttcaaaacagtt
tcaaaatcgaaaaatgagaatttatttcttagcctggatccagactcgttgtttagctta
gcagattcatttcctaaaagttccgatccccaactggttctcttacaagaaccgcaagaa
atctcaccaaatcaagatcttcatgggaagaactttttcccaatcgatgaaaattccaac
gatttattagaaattaagataggagataagaaattcgaggaaagagcctctaaaagatcg
agaaacagctcatctcatctccataaattaaagtcatattattcttctcaagaattcttg
gcaaatttaaagattaaaagatttcaaagtaatacgaatttgaaatatgaccaaaatatc
aaatttaataatctagatgataaagaaaaattatttcatattaaaaaatctgatttttct
gaaatgagtttaataggacaattcaatcttggatttattttagttaatcatcaagattca
aatattttcatcattgaccaacatgcttccgatgaaaaatataattttgaaaaactagta
cgagaatttcagattaaaactcaaccattgatagtccctcaacaattagaattgaatata
gtcgacgaaatgttgataattgaacatgaatcgatatttattaataatgggttcagattg
aaaattaatcacgattctctcccaggaacaaggatttcaatgttatcattaccgacctat
aaaggaacaatattttcacttgacgacttttatgaattaattaatttgataaatgagcaa
cctggaaatactgcagttaaatgcagtaaaattagaaaattattagcaatgaaagcttgc
aggacaagtataatgattggctcatctttaacatctaaaaaaatgacagaaattgttgaa
aacttaagcactttagataaaccgtggaattgtcctcatggtagacctacaatgagacat
ttaattgaattgtcagaatggcaaaataattatcatgactatgagttgtag
DBGET
integrated database retrieval system