Shewanella vesiculosa: KDH10_000894
Help
Entry
KDH10_000894 CDS
T08322
Name
(GenBank) GGDEF domain-containing protein
KO
K13590
diguanylate cyclase [EC:
2.7.7.65
]
Organism
svm
Shewanella vesiculosa
Brite
Enzymes [BR:
svm01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.65 diguanylate cyclase
KDH10_000894
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GGDEF
DUF1843
GGDEF_2
VPS53_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UJL43576
LinkDB
All DBs
Position
1047609..1048631
Genome browser
AA seq
340 aa
AA seq
DB search
MHNTQNLEQTAHILNLALPKMASLAIPVTPENYAIWFEYFAETNLNLKRSIDGLIANGVK
FTPEVNLGLYNRFIEERSPEIIENVQIETHILINSLLSKIEQLNEGTEKFSSNLNQYGEK
LQTNPNVDDLNLIVMSIAAEVEQVIAKNRQMSASLETLSTEILHLKDEMDNLSKVAMMDE
LTSLKNRRSYELFAAEQVTKFVDTQTVCSLLMIDIDDFKQFNDTFGHLIGDKVLAYVALA
MKNTVKGDDLVARYGGEEFVVMLPNAKLNDAVKVAEKIRERISLKQLSIGKEKKQNLGHI
TVSIGVATINTGDDVDTLLSRADEQLYKAKAAGKNCVKFG
NT seq
1023 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcataatacccaaaatcttgagcaaactgcgcatattctgaatttagcgttacctaaa
atggcgtctttagctattcctgtaacgccagaaaattatgctatttggtttgaatatttt
gctgagacgaaccttaatttaaagcgctctattgatggcttaattgctaatggtgttaaa
ttcacacccgaagttaatttaggattatataatcgctttatcgaagagcgttctccagaa
attattgaaaatgtgcaaattgaaacgcatattttgatcaatagtttgctgagtaagata
gagcagcttaatgaaggtacagaaaaattctcaagtaatctcaatcagtacggtgaaaaa
ctgcaaaccaaccctaatgtcgatgatcttaatcttattgtgatgagtatagcggctgaa
gttgaacaagtcattgccaaaaaccggcaaatgtcggcgagtctagagacgttgtcgaca
gagatccttcatcttaaagatgaaatggacaacttaagtaaagtcgccatgatggatgaa
ctcacctctttaaaaaatcgccgttcatatgaactgtttgccgcagagcaggtgactaag
tttgttgatactcaaaccgtatgcagtctgttaatgattgatatcgatgattttaagcaa
tttaatgacacctttggtcatttaattggcgataaagtgttggcctatgtcgccttagcg
atgaagaatacggttaaaggtgatgatttagtcgctcggtatggcggtgaagagtttgtc
gtgatgttacctaatgccaaacttaatgatgctgtgaaagtcgccgaaaaaatccgcgag
cgaatttcattaaagcagctttctatcggtaaagagaaaaaacaaaatctgggccatatt
accgtttctattggtgtggcaaccattaacactggcgatgatgttgatactttattatcg
cgagcagatgaacaactttacaaggctaaagcagcaggcaaaaattgcgttaagttcggt
taa
DBGET
integrated database retrieval system