Theileria annulata: TA20210
Help
Entry
TA20210 CDS
T00253
Name
(RefSeq) RNA-binding protein, putative
Organism
tan
Theileria annulata
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
CSTF2_hinge
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3864233
NCBI-ProteinID:
XP_954201
UniProt:
Q4UHB5
LinkDB
All DBs
Position
1:1432313..1435691
Genome browser
AA seq
1024 aa
AA seq
DB search
MNVKERNIKLFVGNLPFDAVEDDIRVFLHGCGQIRYLSIRRDPHTNRSRGYAHLEYRTEP
ECIEAFKRLLGKEIRGRPIKIDFCDDVYRKKYPELTSDSIFVKDKPTSVNPDSRKFQGPV
VPPPPPQIPIIPITQPNLGIQITQPIPIPQTIPVPPIIPTPPVPPSLVTLSPLSGLNPLT
GIPNPPPIPNLTGLVNLPVTHSVPIVPELTVEPKRPRSDIELLIDNGKIVNNDLFYIIKN
MSMLDVFKLVKKIDNLMEKSPNTARSILNSNHSMRSALIHAKLLLGYKDLKFSNLTTANH
THIFDYFLTKFRPTTFINTSISEKFPLYCAFRSLTSTQELDLGIEKLHDLVTRDGFVVDD
KVLEWSKNLDFKQEIIDYETLLKSVEIFYKLNEPESISEILNHFSKDIHYIPTEILTQLT
KFCFRKLNNTELTLKLQSELYSRIVDFGLKPDINTVESLLYCTNFIKDYSIVYQTLESVM
ECKNIINYGSLFKVLKLYHFYLSSNNSIEGFMDNIIITLKELNHDSGKNLVNCLRYLLKI
RNYVDFDLDKISSTFVDYEYNLKDLVMILRDIHNSDYLIPESIYSPIITSSFSMLTELPK
DSVVSMLKFLSKHEVKLIEDQKDLLNLNLRIHLNTCNFTTSDVLNALSYYSNPNYTHPHT
VNKLYTYFINKMSKEKDEISDINFEIYVLSKFVLYFNDQNKLNNLTVKRYLRVINWNYLA
LTDRSISYCFYVLYKIDRNPLRLVQKLLPILNSNKDRYKPIDLVQLLLFFTRFRNQHFFP
VLVSRVQQKILDQEFSPKQLVIVCKCLYNYKKIFVSNLFTQVNSKINQMTPSQVCTIFNL
YTKTKLNNKVLINNLNEIISNNLNNLNHKDFVRLLLPIKRGYINDKLVIDEVKRQNLEPW
HYFDVFDEVPELDLDDDQIIKCILSLSQKSRSEEFDKFARFLYEKMFKIVPKLSKSQVSS
ILASIHSYGYTKPKINRLLTSALKKTSVTQESKNIKGEDINSQIFRFFRHISKGPPHLDK
IHSN
NT seq
3075 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgtcaaggaaaggaacattaaattatttgttggaaatttaccctttgatgctgtc
gaagatgatataagagttttccttcatggttgtggacaaattcgatacctatcaataaga
agagaccctcacactaatagaagcagagggtatgcccatcttgaatacagaactgaacca
gagtgtatagaagcctttaaaaggctccttggtaaagaaattcgaggtcgaccgataaag
atagacttttgtgatgatgtttaccgtaaaaaatacccagaactaacatctgattcgata
tttgttaaggataaacctacatcagtcaaccctgatagtaggaaatttcaaggaccagtt
gtaccaccgccaccacctcagatcccaattatacctattacacaaccaaacttaggtata
caaattacacagccaatacctatacctcaaacaataccagttccaccaattataccaact
ccaccagtcccgccttctttggttacactttcacctctatcagggctaaatccactgact
ggtattcctaatccacctcccatacctaatcttactgggttggttaatttgccagtaaca
cactcagtgcctattgttccagaattaactgtcgagcccaaaaggcctcgttcggatatt
gaactgcttatagataacggtaaaatagtgaataatgatttgttctacattattaagaat
atgtcaatgttggacgtgttcaaattagtcaaaaagatagacaacttaatggaaaagtca
ccaaacacagcaagatccattctaaattccaaccactcaatgcgttcagccttaattcat
gcaaaattactcttaggatacaaagacttaaaattttcaaacttgacaacagcaaaccac
acacatattttcgactattttttaactaagtttcggcctactacgtttataaacacttca
atatcggaaaaattcccactctattgtgcttttagaagtctcacaagcacacaggaatta
gatttaggtatagaaaagttacacgatcttgttactagggatgggtttgtggttgatgac
aaggttctcgaatggtcaaagaacttggatttcaaacaggagattattgactatgaaact
ttgctaaagtcggtagagattttttacaaattaaatgaaccagagagtattagtgaaatc
cttaaccacttttcaaaagatatccactacataccaactgaaattctaacccaattaacc
aaattttgcttcaggaaacttaataatactgagttaacactgaaactacagtcagagtta
tactcaagaattgtggatttcggtctaaaacctgacatcaacactgttgaaagtttatta
tactgtacaaattttataaaagattattcaatcgtatatcagacacttgagtccgttatg
gaatgtaagaatataataaattatggttctctgtttaaagtgttaaaactatatcacttt
tatttgtcaagcaataatagtattgaggggtttatggataatattataatcactttaaag
gagttaaatcatgattctgggaagaatttggttaattgtctgagatacttgttaaagatt
agaaattatgttgatttcgacttggataaaatttcaagtacttttgtagactacgagtat
aatttgaaagatttagtaatgattttgagggatattcacaattctgattatttaatcccc
gagtctatttattcaccaataataacgagttcattctctatgttaactgagttacctaaa
gattcagtggtttcaatgctgaagtttctgagtaaacatgaagtgaagttaatcgaggat
cagaaagatcttttaaacttgaatcttagaattcatctaaatacttgtaattttacaacg
tctgatgtcttaaacgcactttcatattattcaaacccgaattacactcatcctcacact
gtaaataaactttatacgtactttataaataaaatgagcaaggagaaggatgagatttca
gatattaatttcgagatatatgtgctgagcaagtttgtgttgtattttaatgatcaaaat
aagctgaataatttgacagtaaaaagatatttaagagtaattaattggaattacttggca
ttaacagacaggagcatctcatactgtttttatgtattgtataaaattgatcgaaatcca
cttaggctggtacaaaaactacttccaatcctaaactccaataaagaccgttacaaacca
atagacttggttcagcttttactatttttcacaaggtttagaaaccagcattttttccca
gtgctagtgagtagagtacagcagaagattttggatcaagaattcagtcccaaacaactt
gtaattgtttgcaagtgtctctacaattataagaaaatctttgtttctaacctttttaca
caagtaaactctaaaattaatcaaatgacgccctctcaagtttgtacaatatttaacctc
tacaccaaaacaaaattaaacaacaaagtcctaatcaataacctaaacgaaatcatatca
aacaatttaaacaatctaaaccacaaagattttgtaagattattattaccaattaaaaga
ggatatataaatgataagttggtgattgatgaagttaagaggcagaatttagaaccctgg
cattattttgatgtttttgacgaggttccagaacttgatttggacgacgaccagattatc
aagtgcattttaagcttgtctcagaagagtagatcagaggaatttgacaaattcgcaagg
tttctatatgaaaaaatgtttaaaatagtcccgaaactgtcgaaatcacaagtgagctca
attttggctagcattcactcgtacgggtacacaaaacctaaaattaaccgtttactaaca
agtgccttgaaaaaaacttcagttacacaagaatcaaaaaatatcaagggagaagatata
aattctcaaattttcaggttctttaggcacatttccaaaggaccgccacacctcgataaa
atacactctaactaa
DBGET
integrated database retrieval system