Trichodesmium erythraeum: Tery_0018
Help
Entry
Tery_0018 CDS
T00387
Name
(GenBank) Rho termination factor-like
KO
K09942
uncharacterized protein
Organism
ter
Trichodesmium erythraeum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ter00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99997 Function unknown
Tery_0018
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4912
Rho_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABG49542
CyanoBase:
Tery_0018
UniProt:
Q11AD2
LinkDB
All DBs
Position
complement(25441..27636)
Genome browser
AA seq
731 aa
AA seq
DB search
MVQERPPLEEMTLRQLRKVASELGISRYSRMRKAQLLAAVIEAQGMNNLSSAPLSKLEVQ
ERAEAKKFESGEENNIDDFFSSVDEGLTDLPNGYAKSKIVLMPRDPEWAYAYWDISNELK
EELRSQGGQQLALRTYDVTDINLDSQSPHSIQEYPCDELAREWYIPIPVSDRNYTVEIGY
RCADGRWLVLSRSEEVNIPPVYPSDWIDEQFITVSWDEDLRGKTFMELFPASRQITFHDN
HDDIYQGMFGIAEAEDKRVSGSMFGSVQMVPGSGQMIEETLSSYAMVSGLGMWASGSNVS
CGNQMMSGVGQTMSGVGLNASGVGLTASGVGLTASGVGLTASGVGLNASGVGLTASGVGL
NASGVGLTASGVGLNASGVGLTASGVGLNASGVGLTASGVGLNASGVGLTASGVGLNASG
VGLTASGVGLNASGVGLTASGMGMNMSGVGLTASGMGMNMSGVGLTASGVGMNMSGVGLT
ASGMGMNMSGVGLTASGMGMNMSGVGLTASGMGMNMSGVGLTASGMGMNMSGVGLTASGM
GMNMSGVGLTASGMGMNMSGVGLTASGMGMNMSGVGLTASGMGMNMSGVGLTASGMGMNM
SGVGLTASGMGMNMSGVGLTASGMGMNMSGIAGSIPPIRPRKFWLVADAELIIHGATEPD
ATVTIGGRPIKLNPDGTFRFQMAFPDGLIDYPIMAVAVDGEQNRSIHMQFTRETPERHTN
KKEEAILEWMS
NT seq
2196 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttcaagaacgtccacccttagaagagatgactttaaggcaactacgcaaagttgct
agtgagctaggtatctctcgttacagcagaatgcgtaaagcacaacttttggcagcagtt
atagaggctcaaggtatgaataatctttcatccgctccactttcaaaattagaagtacaa
gaaagagcggaagcaaaaaagtttgaatcaggcgaagaaaataatattgatgattttttt
tcatcagttgatgaaggtttaactgacttgcctaacgggtatgctaaaagtaaaatagta
ctaatgccaagggacccagagtgggcatacgcttactgggatatttcgaatgaacttaaa
gaagagctacgtagtcaaggagggcaacagttagctctccgtacatatgatgtcacggat
attaacttagactctcaaagtcctcatagcattcaggaatatccttgtgatgaattagct
cgtgaatggtacatacctattccggtaagcgatcgcaactatactgtggaaataggttat
cggtgtgctgatggtcgttggttagttttgtctcgttctgaggaagtaaatattccccca
gtttatccttcagattggattgacgagcaattcatcacagttagttgggatgaagatttg
cgtggaaaaacctttatggaactttttcctgctagtcgtcaaattacttttcatgataat
catgatgatatttatcaaggaatgtttggcatagctgaggctgaggataaacgggtttct
ggttctatgtttggttctgttcaaatggttccaggttcaggccagatgattgaagaaaca
ctaagctcttatgctatggtatcaggtctagggatgtgggcatctggtagcaatgtttct
tgtggcaatcaaatgatgtcaggggttggtcaaactatgtcaggagtaggcttaaatgct
tcaggagtaggtttaactgcttcaggagtaggtttaactgcttcgggtgtaggtttaact
gcttcgggtgtaggcttaaatgcttcaggagtaggtttaactgcttcgggtgtaggctta
aatgcttcaggagtaggtttaactgcttcgggtgtaggcttaaatgcttcaggagtaggt
ttaactgcttcgggtgtaggcttaaatgcttcaggagtaggtttaactgcttcgggtgta
ggcttaaatgcttcaggagtaggtttaactgcttcgggtgtaggcttaaatgcttcagga
gtaggtttaactgcttcgggtgtaggcttaaatgcttcaggagtaggtttaactgcttcg
ggtatgggtatgaatatgtcaggagtaggtttaactgcttcgggtatgggtatgaatatg
tcaggagtaggtttaactgcttcgggtgtaggtatgaatatgtcaggagtaggtttaact
gcttcgggtatgggtatgaatatgtcaggagtaggtttaactgcttcgggtatgggtatg
aatatgtcaggagtaggtttaactgcttcgggtatgggtatgaatatgtcaggagtaggt
ttaactgcttcgggtatgggtatgaatatgtcaggagtaggtttaactgcttcgggtatg
ggtatgaatatgtcaggagtaggtttaactgcttcgggtatgggtatgaatatgtcagga
gtaggtttaactgcttcgggtatgggtatgaatatgtcaggagtaggtttaactgcttcg
ggtatgggtatgaatatgtcaggagtaggtttaactgcttcgggtatgggtatgaatatg
tcaggagtaggtttaactgcttcgggtatgggtatgaatatgtcaggagtaggtttaact
gcttcgggtatgggtatgaatatgtcaggtattgctggctccatcccaccaattcgcccc
cgcaagttctggttagttgctgatgctgaacttattatccacggtgcaactgaacctgat
gctactgttaccatcggtggacgacccattaaactgaaccctgatggtacattccgcttc
cagatggctttccctgatggtttgattgattacccaattatggcagtagcagttgatggt
gaacaaaaccgctctattcatatgcagttcactcgtgaaactccagagcgtcataccaat
aaaaaagaagaagctattctggaatggatgagctaa
DBGET
integrated database retrieval system
