Tetrahymena thermophila: TTHERM_00317270
Help
Entry
TTHERM_00317270 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF1359
SdrD_B
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7838290
NCBI-ProteinID:
XP_001021408
TGD:
TTHERM_00317270
UniProt:
I7LW87
LinkDB
All DBs
AA seq
2167 aa
AA seq
DB search
MKIQSILSIFAYLICFIQQSYQVGQVTPTREIRVAALDQTSKSLFTIYFSLDTYCPANYY
LRVVFPQYNTVTPISCWIKISTSSTWVSTTCTSSGVASENNVTYLQFPSQVVAGGENIVQ
IQLNESSQLTYASSSFIISTVNSNILTNQFSLDVNNNFGQIPWVSYTPQPLSISVSTVSP
STGFNLPSQFITLQIQISNEQAPVGSALSPAARVKVVLDTPWTFTQTSTVTSVAAMGQTR
PVISSYEMESPNQMSVVFQEYFSGSSRSFSIQISNIQNPYQASINGNVYVYVMDFNSNYV
LQSNSIASLSNTNFPLTVNFQSPGGVPFQQVFYFPSSSGFNGGVFNNVEQHVEFAVSSQT
AIPAGYSLVINFLDPNILIIKGSAFMDKSILPNDPTKPILYSYPQNQILIIQNLGSIPQT
TTFFVTCRIYPTTTNSQIQVQLYIDQNPNITPNQALFQSQTMTQNLLPATPFLELPTDTK
IIPTNSNQLQLQFNGNVPSLSTSNQSQIIISFKNMISKAATGSVTCSNGLTCTFSSISQQ
VNQIIITSPANQNVFPLNALTKFTISGLNIQGTSNAQDQIFQIYACLQATASASSPCMYH
VLSVMITYPIPNTNLIILSIASNSYFSNINYYFPSIISAQFTDPTIFNTITPSQNQVRFA
TVFARLGLKRLTTLQKSQQPCACGANVPVTCIFMEGNTQANAEKFNFQDWDRVIFYLDDS
VVGNTFRLSIPDIYINNIDVYEYVWAIGIYDKGLRTYSYLQASNNNFVRSIPTSSGSTTV
QEYIRTLVTSTSLQPSLQLTLTGSAGQQVSGIPLQLQTSSSFIGQQIANLNGFGGAVVIN
TEWYFWVQFSSQYTSINLWPFGQGSDGPISLNYTDPNNIQHFVTLLPLTNTQTNNLNLVT
QYYLDKVLMPFGYDLPNYTIYVSNSQGVVDGYNTFYNSGSNVFYGTSLTFLNFSCLNLAQ
GVANTYCTITFQPANLIQPFATIFAKFTGLTVATNSCTASQSYGITWIPISNVSCQSSLD
SSQLLFQFLDNQVFSNSLQYQISFYGVSIQTGITQYLNFEIHDSSQKFVIESKTFLITTT
NYNPETIIVSQLQYANLNPYVYTSLLIKFQIPRQLYPNEDVFINLGKDLNDVNIYSNRFH
AILTQLPSNTNIQIATTYVNSRLQLLFINPSQFVAGVYQLNFTSLRSPASNLNDMFQILF
IRRIDQQVVVQNLANQTVPFPVLNINQNSVISLAAANYVLEGGLEQLDFSIKTSTVNLDS
QSVIEFHYPVYYSPGAADFNFNLFCRINQTPVACSRVVGYPYKIRVTNSPINVQAGTPFK
LSVFGLKAPSYTMRYDSRYQDETLFICVDGKGTGNYDEYMVLNAPDIQPINNSGTPQNYI
RIVYVLVDIQFIRSLAYHTVRLITQQAIPLGSIIQVLFPKEYTGVPTISQIYTIFKQVAN
NNLVEIYRGNSPVIGRTIEVSVNQQINALTIIQIEFQNVPTPPQQATVDYNQMQIQVFGV
DRKNLIVRSYYLLNTSLKIAFNIQSNYLQFNNTQQIVVTKGTYSQIIPITTSDGSAFQSN
VYFQCTAVGFGFLPSSIYALLGTTQGTLQVGADKNLFNQAYSFQVQKSEKIYQPLYSSDS
SIVVIVNSNQVQIKVPSTIIVPLGGCSTPQLLTIPNAPFDELTISLDYPYDQYPEEIFKT
DLEITSNILRYSPSITSRYISFCITQNFPSNQSSMQFNFVLGGINAPSYALSQSTVTVNV
IQKQSQLLPTLSISISQVTLNSISINLATNSDGSVYWNLFVSSPYTTNLSLTDIKQNLRQ
QIQNVQQQSDNLSQLYNYMRYMKVGVQQVQTIIKNNQVTVNNLIAGLTYTFCSYFETEFK
INSGKPNCLTFSTPTNGNLIKAQVSLNRVITLAELNNLICFFVQYGSVRLFNLVDQMANS
CSFQTNPQQLYLTYSGQQTYNQQVVNLYVFPTQDSDADAGISGFKKMFSSDSGQITAQVI
TDAQTNYQLNFIQSAQLTTNFSYSDALTPTSNLPIPTLKSMQTTPLIGTDSATLQINQVS
LTSDGMIYFIVESQKLIVQNTDTNVNIQIRESIIPTGQQILNCKNYYGETVQYCGRIIYT
SSSSSLGLSFANARINSIYKVYYVISNDYPITPTINSQVYTQYISTYTYSSIISSLFGLV
ALIILLI
NT seq
6504 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagatttaatcaattcttagtatttttgcatatttaatttgctttattcaatagagc
tattaggtgggataagttactcctactcgtgaaataagagtagctgcattagattaaaca
agtaaatcgcttttcacaatttatttttctcttgatacctattgccctgctaattattac
ttaagagtagtattcccttaatataacacagtaactcctatatcttgttggattaagata
tcaacaagttcaacatgggtaagcactacatgcaccagttcgggtgtagcaagtgaaaat
aatgtaacatatctctaattcccatcacaagttgttgcaggtggagagaatattgtttag
atctagctcaatgagagctcgcaactaacttatgcaagctctagctttatcatatcaaca
gttaattcaaatatacttaccaattagtttagtttagatgttaataataatttcggttag
attccttgggtcagctacacaccttaacctttaagtatttctgtaagcacagtatcaccc
tcaacaggattcaatttaccctcttaatttatcacccttcaaatctaaataagcaacgaa
taagctcctgtaggaagtgcattatctccagctgctagagttaaagtcgttttagataca
ccatggaccttcactcaaacatctactgttacttctgtagcagctatgggataaacaaga
ccagtcatttcttcatatgaaatggaaagtccaaactaaatgagtgttgtgttttaagaa
tattttagtggcagctcaagatcattttcaatccaaatatcaaatattcaaaatccctat
caagcaagcattaatggaaatgtttacgtttatgtaatggactttaactccaattatgta
ctttaaagcaattcaatagcaagtcttagtaatactaatttccctctaactgttaacttt
taatcacctggtggagttccattctaataagtattttactttccatctagttctggattt
aatggaggggtctttaataatgttgaataacatgttgaatttgcagtatcttcttagaca
gctatacctgctggctatagtcttgttataaactttttggatccaaacatactgattatt
aaaggaagtgcttttatggataaaagtatacttccaaatgaccccacaaagcctattttg
tatagttatccctaaaactaaattcttataattcaaaatttaggatcaattcctcaaaca
acaacattctttgtaacatgccgtatttaccctaccactacaaattcttaaatataggtt
tagctctatattgaccaaaaccctaacataactcctaattaagctctcttttaaagctaa
acgatgacttagaatttacttcctgctactccatttttagagttacctactgatacaaaa
attattcctacaaattctaactagctatagctttaatttaatggtaatgttccaagctta
agtactagcaattagtcataaatcattattagtttcaagaacatgatttcaaaggctgca
acaggatcagttacatgctctaatggcttaacttgcactttttccagcataagttagtaa
gttaactagataattattacttctcctgctaattaaaatgttttccctttaaatgctctc
actaaatttacaataagtggcttaaatatttaaggaacctcaaatgcataagattaaata
ttttaaatatatgcttgtttataagcaacagcaagcgcttcatctccatgtatgtatcat
gttctttcagttatgataacttatcctattcctaacactaatttaatcatattatctatt
gctagcaattcttatttctcaaatataaattattatttcccttcaataatatctgcctaa
ttcactgatcctaccatttttaacactataactccaagctaaaattaggtaagatttgcc
accgtttttgcaagactaggattaaagagattgactactttacagaaatcttaatagcct
tgtgcgtgtggtgcaaatgtaccagttacctgtatattcatggaaggtaatacctaagct
aatgctgaaaaattcaatttctaagactgggatagagttattttttacttggatgactct
gttgttggaaatacattcagattatccatacctgatatatatatcaataatattgatgtg
tatgaatatgtatgggctataggaatttatgataaagggttgagaacttattcttattta
taagcctctaacaataattttgtgagatctattccaacttcttcaggttccactacagtt
caagaatatattagaactcttgtaacaagtactagtctataaccttctctctagttaact
ttaacaggtagtgcaggttaacaagtatcaggaatacctctttaacttcaaacatcttca
agcttcataggtcaacaaatagctaatttaaatggatttggtggagcagttgtaatcaat
acagaatggtatttttgggtttaattctcttcgtagtacacttcaataaatttatggcct
tttggttaaggatctgatggtccaatttctttaaattatacagacccaaacaatatatag
cactttgttactcttctacctctgacaaatactcaaacaaataatttgaacctggtcact
cagtattatttagataaagtactaatgccttttgggtatgatttaccaaattacacaatt
tatgtatctaacagctaaggtgtagttgatggttataatactttttacaactctgggtca
aatgtgttttatggaacatcactaacttttttgaatttctcatgtcttaatttagcataa
ggtgtagctaatacttactgcactatcacgtttcagcctgctaatttgattcaacctttt
gctactatttttgctaaatttacaggcttaacagtagctacaaattcatgcactgcatct
taatcctatggaatcacttggattccaatttcaaatgtttcatgctaaagtagtttggat
tcttcataattacttttctagttcctagataattaagtgttttcaaattccctctaatat
taaatttctttctatggtgtttcaatttagacaggaattactcaatacttaaattttgaa
atacatgattcatcacagaaatttgttattgaaagcaaaactttcttaataacaactaca
aattataatccagaaacaataattgtttcctaattgcaatatgctaatttaaatccttat
gtttacacaagtcttcttatcaaattctagatacccagacaattataccctaacgaagat
gtcttcattaaccttggaaaagatttaaatgatgtcaatatttactctaatagatttcat
gctatcctgacccagcttccaagcaatactaatatttaaattgcaactacttatgttaac
tcaagactgcagttactttttatcaatccttcgcaatttgtagcaggagtttactagctt
aattttactagcttaagatctccagcatctaacttaaatgacatgttttaaattcttttt
ataagaagaatcgattagcaagtcgtagttcaaaacctagcaaactaaacagtacctttc
cctgtccttaatattaattaaaattctgttatcagcttggcagcagctaattatgtttta
gagggtggtttagaataacttgacttttcgattaaaaccagcactgtaaacttagactct
taatcagttattgaattccactatcctgtctattattctcctggagctgcagattttaac
tttaatcttttctgcaggatcaattaaactccagttgcttgcagcagagttgttggttat
ccatataaaataagagtaacaaattcacctattaatgtttaagcaggaaccccttttaaa
ttatcagtttttggattgaaagctcctagctatactatgagatacgattcaagatactaa
gatgaaacactatttatatgtgtggatggaaaaggaacaggaaactatgatgaatatatg
gtattaaatgctcctgatattcaaccaatcaacaacagtggcactccataaaattacatc
agaattgtatacgtgttagttgatatacaatttatcagatctttagcctaccatacagtg
aggttaatcacccaacaagctattcctttgggatcaattattcaagtcttattccctaaa
gagtatactggagtacccactatttcatagatatacactatcttcaagcaagtagctaat
aacaatcttgttgaaatctacagaggaaactcacctgttataggaagaacaattgaagta
tctgttaattaacaaattaatgctctaactattatctaaatagaattttaaaatgtacca
actcccccataacaagcaacagtagattataattaaatgtaaatttaagtttttggtgta
gatagaaagaacttgatcgtaagaagctactatcttttaaatactagcttgaaaatagct
tttaatattcaatctaactacctttaattcaataacacctagcagattgtggtcacaaaa
ggtacatattcttaaattattcccataacaacttcagatggatctgccttccaatcaaat
gtatacttctaatgcacagctgtaggatttggattcttacctagcagtatttatgctctt
ttgggaacaacataaggcactcttcaagtaggggcagataaaaatctttttaattaagct
tactccttttaggtgcaaaaatctgaaaagatttatcaaccattatacagttcagattct
agtatagtagtgattgtgaattcaaattaagttcaaattaaagttccttccacaataatt
gttcctttaggaggatgcagcactccttaattgctaacaataccaaatgctccttttgat
gaattgactatatctcttgattatccatatgattaatatcctgaagaaatattcaaaacc
gatcttgaaataacttcaaatatactaagatacagtccaagtatcacaagcagatacatt
agtttctgcataacataaaactttccttcaaattaatcatctatgtaatttaattttgtt
cttggaggaatcaacgcaccatcctatgctttatcttaaagtactgtcactgtaaatgta
atttaaaagcaatcttaactgttaccaactctctcgataagcatctcataagtaactctc
aactctatttcaattaatttagcaactaatagtgatggttctgtgtattggaatctgttt
gtttcatctccctatacaacaaatttatccttaacagatattaaataaaatttgaggtag
taaatctaaaatgttcaacagtaaagtgataatttatctcaactatataattacatgagg
tatatgaaggtaggtgtttaataggttcaaactataataaaaaataattaagttacagtg
aataatttaatagctggtctcacttatactttttgttcttattttgagacagaatttaaa
ataaacagtggaaagcctaattgtttaacattcagcacacctaccaatggaaatttaatt
aaagctcaggtttctctaaatagagttattactttggcagaacttaataatttgatatgc
ttttttgtttaatatggttctgttagattgtttaacttagtagattagatggctaattcg
tgttctttccaaacaaatccctaatagctctacttaacttactcaggataataaacatat
aattagtaagtagtaaacttgtatgttttccctactcaagactcggatgcagatgcagga
atatcaggcttcaaaaaaatgttctcatcagatagtggtcaaattacagcttaagttata
actgatgcatagacaaattattagcttaattttatataatcagcttagcttacaactaat
tttagctatagtgatgctttaactcccacatcgaatttgccaataccaacactaaaatca
atgcaaacaacacctttaattggtactgattcagctaccctttaaataaattaagtttct
ttgacatctgatggtatgatctatttcatagtagaatcataaaagcttattgtgtagaat
acagacactaatgtaaacatttaaattcgtgaatccataatacctactggatagcaaata
ctaaattgtaagaactactacggcgagaccgtttaatattgtggaagaattatctacact
tcttcttcatctagtttaggtttatcattcgcaaatgcaagaattaactcaatatacaaa
gtatattatgtcatttcaaatgactatcctataacacctacgataaattcataagtttac
actcaatatattagtacctacacttatagctcaataatatcttctctatttggtttagta
gctttaattattcttttgatttga
DBGET
integrated database retrieval system