Thermosipho sp. 1070: Y592_05305
Help
Entry
Y592_05305 CDS
T04909
Name
(GenBank) alpha integrin
Organism
ther
Thermosipho sp. 1070
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FG-GAP_3
FG-GAP
Itfg2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ANQ53829
LinkDB
All DBs
Position
1054387..1056093
Genome browser
AA seq
568 aa
AA seq
DB search
MKKFVLIMLLISFFSFAETYTATFPISNWSQQYPEKAWGAIYVKNISTRVVEDKIVAVNV
YKINDISAVPGYGPFTQVSQTFSVDFNNDGYADIISLTYDGWVVIKKNKMKETGELSFED
ERYFRLLVKNGDGTMIVDDFDNDGKLDLFSFNSWQYAQYVDDVLNKNESTYKKISKDKNF
VTEWTVSAMASYDYNGDGYKDIFYVDYKGRFWVWINDNSKGRERFFNKNNIIKLFRDKDL
SSNGGGAVLDIGDLNNDGIIDLIAGHTDKKDIYVYFGKIVNNQLEFDVENKFVITRDGKL
GEHVKVDPRYSNSKSPEDLPSFGPTIIKITDVDRDGYKDIFVGTDAWRQNKDFGGSVYLF
KGFNITSDNKPEFVSLELVHGSYSWEDNPPYDFDAGTVADLDNDGVPDFVAADGNHSGNF
YKIITQTQKEYETDEAGYIISDYLPNLVGILPKDLPNNFVKRIKVTIKFDLSLGDGTFEI
RYVKSGIKDPQLIDPESYPLMPGASGKIVGSFTTEIEFDKPVPDPQIIIITRPAGPFSAP
HITYLEYEIETQPSQVIIKGFNWIKGDK
NT seq
1707 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagtttgttttaattatgttattaatatcatttttttcttttgcagaaacatat
acagcaacttttcctatttctaattggagtcagcaatatcctgaaaaagcttggggtgca
atttatgtaaaaaatatatctacaagggttgttgaagataaaatagtggcagtaaatgtc
tacaagataaatgatatttctgctgtgcctggatatggtccatttactcaagtttcacaa
acattttccgttgattttaataacgacggatatgcggatataatttcattaacgtatgat
ggatgggtagttattaagaaaaataagatgaaggagactggtgaattaagttttgaagat
gaaagatattttagacttttggtaaaaaatggtgatggaacgatgattgtagatgatttt
gataatgatggaaagttagatttattttccttcaacagttggcaatatgcacaatatgtg
gatgatgttttaaataaaaatgaatctacttacaagaaaatttcaaaagataagaatttt
gtaacagagtggacggtttctgctatggcgagttatgattacaacggagatgggtacaag
gacatattttacgtggattataagggaagattttgggtatggataaatgataattctaaa
ggtagagagaggttttttaacaaaaataatattattaaactttttcgtgataaggatttg
tcttcaaatggtggtggtgccgttttggatataggagatttgaacaacgatggaataata
gatttaatagcgggacataccgataaaaaagatatatacgtgtattttggaaaaattgtg
aataatcaattagagtttgatgtggaaaataagtttgtgataacaagagatggaaaattg
ggagaacacgtaaaagttgatccaaggtattcaaattcaaaatcaccggaagatttaccg
agttttgggcctacaataattaagataactgatgtggatagagatggatacaaagatatc
tttgtgggaacagatgcgtggaggcaaaataaagattttgggggaagtgtgtacttgttt
aaagggtttaacattacttcagataataaaccggaatttgtgagtttggaattggtacac
ggtagttatagttgggaggataatccaccgtatgattttgatgcgggtacagttgcagat
ttggataatgatggtgtaccagattttgtggcggcagatggtaatcattccggtaatttt
tacaagataatcacacagacgcaaaaagagtatgaaacagatgaagctggttatataata
agtgattatctaccaaatcttgttggaattttaccaaaagatttaccaaataactttgta
aagaggataaaagtaactattaagttcgatttgtcacttggagatggtacatttgaaatt
agatatgtaaaaagtggaataaaagacccacagcttatcgatccagagagttatccttta
atgccaggggcaagcggtaaaatagttggaagttttacaacagagatagaatttgacaaa
cctgtacctgatccacagataataataatcacaagacctgctggaccattttccgcacct
catattacttatttggaatacgaaattgaaacgcaaccatcacaggttataattaaggga
tttaattggataaaaggggataaatag
DBGET
integrated database retrieval system
