Ureaplasma urealyticum: UUR10_0591
Help
Entry
UUR10_0591 CDS
T00781
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein
KO
K12574
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
uue
Ureaplasma urealyticum
Pathway
uue03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
uue00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
UUR10_0591
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
uue03019
]
UUR10_0591
Messenger RNA biogenesis [BR:
uue03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
UUR10_0591
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_J_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACI59877
UniProt:
B5ZC16
LinkDB
All DBs
Position
complement(709641..711323)
Genome browser
AA seq
560 aa
AA seq
DB search
MAKINFLSLGGQDERGKSCFVLEVNDDIFIFNAGAKIPTSDVFGVNMIVCDYSYLEKNAK
RVKGIFIGTPTFNNVMGIKLLLAQVGYKIPIYTSPIGAIVVKKIFEQKVNNKKIEPNIIE
LDPISDKKIGSIYVTAFKVSNSMPHSYGFVLKTSDGAIVYIDEFIISNDKNKTFDSQINA
LNNITKNNTLALIVGMGQAGNPCFTAPNHKNKGFYESILQNTKNRLIVGCYSNDAYSIFT
LATIAKQQNRPFIVYSNNFINTFVGVLKLKLFNSKNLISLPVSEINNSKNAIIVVIENQD
TLFPRLNKILHNEDKHITLTSEDQLVLGVVITPGFEMLAAQLSDEVGRLDIPYKALPKTV
LPMTQSDEDLKHLINFLQPKYLIPINGLYKTEVKFTSTVTTSWIKSDQIISISNGELFSI
EDKVLNPKPQVIELEDKYISSFDALDVGANILFERAQMGENGVINLIVIFDKQFQKLFNY
VEFDYCGVVNDDPQVRAQVKEIEETFKKRMGECLVYDDRKRLVLKDTKASLKRLLTKLFE
KKFNKRPLVLPTVVDCYKTK
NT seq
1683 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctaaaattaattttttatcgttaggaggacaagatgaaagaggtaaatcttgcttt
gttcttgaagttaacgatgatatttttatctttaatgctggtgcaaaaattccaacaagc
gatgtttttggcgtaaacatgattgtttgtgattattcatatttagaaaaaaatgccaaa
cgtgttaaaggaatttttattggaacaccaacatttaataatgttatgggaattaaatta
ctactagcacaagttggttataaaattccaatttatacaagcccaataggagcaattgtt
gttaagaagatttttgaacaaaaagttaacaataaaaaaattgaaccaaatattattgaa
ttagatccaatttcagataaaaaaattggatcaatttatgtaacagcatttaaggtttca
aactcaatgcctcattcatatggttttgtactaaaaacaagcgatggtgcgattgtttat
attgatgaatttattatttcaaatgataaaaacaaaacttttgattcacaaattaatgct
ttaaacaatattactaaaaacaatactttagcattaattgttggaatgggtcaggcaggc
aatccttgttttactgcaccaaatcataaaaataaaggtttttatgaatcaattttacaa
aatacaaaaaaccgtttaattgttggatgttatagtaatgatgcttatagtatttttaca
ttagcaactattgctaaacaacaaaatcgtccattcatagtttatagtaataatttcatt
aacacttttgtaggtgtactaaaattaaaactatttaatagtaaaaatttaatttcatta
ccagtttctgaaattaataattcaaaaaacgcaattattgtggttattgaaaaccaagac
actctttttccaagattaaataaaattttacataatgaagataaacatattactttaacc
tctgaagatcaattagtactaggtgttgttataacaccaggatttgaaatgttagcagct
caattaagtgacgaagttggacgtttagatattccttataaagccttaccaaaaacggtt
ttaccaatgactcaatcagatgaagatttaaaacacttaattaatttcttacaaccaaaa
tatttaatacctattaatggattatataaaacagaagttaaatttacatctactgttaca
acttcatgaattaaaagtgatcaaattattagtatttcaaatggcgaattatttagtata
gaagataaagttttaaaccctaaaccacaagttattgaattagaagataaatacatttct
tcatttgatgctttagatgttggtgctaatattttatttgaaagagcacaaatgggtgaa
aatggagtaattaatttaattgttatttttgataaacaatttcaaaaattatttaattat
gttgaatttgattattgtggtgttgttaatgatgatccacaagtacgtgctcaagttaaa
gaaattgaagaaacatttaaaaaacgtatgggcgaatgtttagtttatgatgatcgtaaa
cgtttagttttaaaagatacaaaagcaagtttaaaacgtttattaactaaattgtttgaa
aagaaatttaacaaacgacctttagttttaccaactgtagttgattgctataaaacaaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
