Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 700970: UU087
Help
Entry
UU087 CDS
T00040
Symbol
dnaX
Name
(GenBank) DNA polymerase III gamma-tau subunit
KO
K02343
DNA polymerase III subunit gamma/tau [EC:
2.7.7.7
]
Organism
uur
Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 700970
Pathway
uur03030
DNA replication
uur03430
Mismatch repair
uur03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
uur00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
UU087 (dnaX)
03430 Mismatch repair
UU087 (dnaX)
03440 Homologous recombination
UU087 (dnaX)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
uur03032
]
UU087 (dnaX)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
uur03400
]
UU087 (dnaX)
Enzymes [BR:
uur01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
UU087 (dnaX)
DNA replication proteins [BR:
uur03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
UU087 (dnaX)
DNA repair and recombination proteins [BR:
uur03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
UU087 (dnaX)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_delta2
AAA
RuvB_N
DNA_pol3_gamma3
AAA_22
AAA_30
AAA_assoc_2
AAA_14
AAA_19
AAA_16
Mg_chelatase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAF30492
UniProt:
Q9PR58
LinkDB
All DBs
Position
105760..107553
Genome browser
AA seq
597 aa
AA seq
DB search
MSESTLYRKYRPHKFKNVIGQDLIKQALMNACLNNKITHAYIFSGPRGIGKTSIARIFAS
SINCLNPNKGDCCGKCSVCESILKEQSVDLIELDAASNNGVDQIRIITDNINYLPTFFKY
KVYIIDEAHMLSTSAWNALLKTVEEPPQHVIFIFATTEYQKIPLTIISRCQRYDFKRLNN
SELQELIDSILTKEDIKIDNNAIDKLIQLADGSGRDCLSILDQLTTVKKNIDLDLINKTF
GLVDNFKVISLIELIQKNDILLLREFIYELYNQGVNLEAFCVQIINVLIDYLIYLKTNDI
NNLKKVSVDELKKMLLINFNGNYLLNNFISLFNNLKKSLNQVFEFEIYLYKIINANNDKL
ENKKIELSINPEENKINNSQIITTKKIDCFEEINKNTVDFDKLYKTKIFYHKKINNQNDK
ESGINQKEELSTELVNDNKLICNSNDILDNYELAKQAFFNKDIKLSKEMSQKFKDFKNEE
TIENSYIDIIKQADLVLWCSPNALVLGVEFLGLINRINKVTHSFEFIKEFVKKFDSIKLV
IAISKKQALNIINIKKQGLKTNIINDVLIDDIKMLLKQEEQRKQEQTALLNEIEDEE
NT seq
1794 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcgaatcaacattgtaccgtaaatatcggccacataaatttaaaaatgtaataggt
caagatttaattaaacaagcattaatgaatgcttgtttaaacaacaaaattacacatgct
tatatttttagtggaccacgaggaattggaaaaacatcaatagctagaatttttgcgtct
agtattaattgtttaaatcctaataaaggtgattgttgcggcaaatgtagtgtttgtgaa
agtattctcaaagaacaaagtgttgatttgattgaattagatgctgctagtaataatggt
gttgatcaaatacgtattattactgataatataaattatttaccaacattttttaagtat
aaagtctatattattgatgaagcacatatgctatctacatcagcatgaaatgctttatta
aaaacagttgaagaaccaccacaacacgttatttttatttttgcaacaacagagtaccaa
aaaattcccttaacaattattagtcgttgccaacgttatgattttaagcgtttaaataac
agtgaattacaagaattaatagactctatccttacaaaagaagatatcaaaattgataat
aatgcaattgataaattaattcaattagctgatggatctgggcgtgattgtttaagcatt
ttagatcaattaacaacggttaaaaaaaatatagatcttgatttaataaataaaactttt
ggtttagttgacaactttaaagtaatttctttaatcgaattaattcaaaaaaacgacatt
ttattattgcgtgaatttatttatgaattatacaatcaaggtgttaatttagaagctttt
tgtgtgcaaataataaatgttttaattgattatttaatttatttaaaaacaaacgatata
aataatcttaaaaaagtatcagttgatgaattaaaaaaaatgttattaattaattttaat
ggtaattatttgttaaataattttatttctttatttaataatttaaaaaaatcattaaat
caagtttttgaatttgaaatttatttatataaaataatcaatgctaataatgataaatta
gaaaataaaaaaatagaattgtcaattaaccctgaagaaaataaaattaataattcccaa
ataataacgacaaaaaaaatcgattgttttgaagaaataaataaaaatactgttgatttt
gataagttatacaaaacaaaaattttttatcacaaaaaaattaacaaccagaatgataaa
gaatcaggtattaatcaaaaagaagaattaagtacagaattagttaatgataataaattg
atttgcaattctaatgatatattagataattatgaactagccaaacaagctttttttaat
aaagacattaaactttcaaaagaaatgagtcaaaaatttaaagattttaaaaatgaagaa
accattgaaaatagttatattgatattattaaacaagctgatttagtactttggtgctca
cctaatgcactagttttaggagtagagtttttaggattaattaatcgtatcaataaagtt
acgcattcatttgaatttattaaagaatttgttaagaaatttgattctatcaagttagtt
attgctattagcaaaaaacaagcattaaatattattaatattaaaaaacaaggtttaaaa
actaatataattaatgatgttttaattgatgatattaaaatgttattaaaacaagaagaa
caacgaaaacaagaacaaacagcgttattaaatgaaattgaagatgaggagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
