Yersinia pestis Harbin35: CH55_1820
Help
Entry
CH55_1820 CDS
T03717
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
ypj
Yersinia pestis Harbin35
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
ESPR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJK09309
LinkDB
All DBs
Position
complement(1946013..1951748)
Genome browser
AA seq
1911 aa
AA seq
DB search
MNSKLYKLIFCRRLGCLIAVGEFTRSYGRAFSSKGGQAGNNQRRAVGILSRLAMMTGLAL
GIFPLLVLAHPVLPVNGHVVIGQGMLDQQSSTLTVTQQTDKLAINWDSFDIAHGHSVIYA
QPGSQSIALNQVQGQSASQIYGRLQANGQVFLLNPRGILFGKEAQVNVGGLVASTKYMSN
PEFLSGDYRLIGGESEGNIINQANLRSAPGGYIALVGNRIDNQRSGSITTPQGNTVLAVG
HSVTLNLDHGNLLGVQIQGETVAALIQNGGLIQADGGVIQLTAKGKDMLMDTVIDNTGIL
QAKGLSAKNGAIYLDGGGEGVVSQMGTIDVNNQQGRGGRAVVEGKRIYLNKNSNIKAKGT
AGGGTVLVGGGGWQGKDNQIRNATAVVMDKGSDIDVSASRNGPGGSAVLWSEDYTGFHGN
IRARGGPQSGDGGQVETSSQRNLQAFGQVDASAVRGSAGYWLLDPAEVTIVSSGAESGVM
TKVGNIPAEFFSSAHIFIPTANITQILNSSINTQLNSGTNVTITTSNSSLTGCQWCNITV
QADITKTAGADATLTLQADGNIVVNNNITADAGKLNLNLLAGNTTADSAITLNNSKVLLN
GGDFLAKHANDNNTARIGLLGGRYDVGNFTLDGNTALASQVGVNISNAANISVAGETVIS
GVSSNSRGQGWRGIDISNNSILTGVGNMTFSIGSNSNVSWMGAFTNATITSDKNIIFQGT
GSSSGGVDFVNSRILSKSGRVLFDINGNIVVKNVYGLRVNNSQLSAKDVKFAVNVTGVDG
FLLRDSHVTATSGDINANANTINKGIWISGKTNLNASGNVNLHGVTTNSAYAGADAIKIS
GNSSSNNVNITAGGHISLIAVNGGKEIGSTVSVDYANIIAKNGDFNLNITGMKGSPFNNA
TITANNISMNGNITANDAVLMTNTFLTAKGDIKTDLTSPTKGLWFRGNGGMTAANNILLV
ANSTSSGETVKINASSSNKMNITAGKDISIIAGNSKTATGPNINIENVNIETNNGNFTTN
GITSTWLSGVNVSANGVDITSNSTGTGGIVLDNTNILTTVGDINTIVTNSSGKGIWIKSN
STLNSNKDITLVGVSAGQNEGVIIQGSSDASRNNISAQGNITLIGKMGNGSGQHSLINLG
NVSLTSSGRNIDINGSSAGTGDVYFTNVELNATAGNVSIYAETKTALSTSLNAVLSLGGN
NSIKAQNGWLIGKAFNTTQGAGIGFRANSSLSVDGNIILKGETEGVGATRKGIDFYGANT
LNIIKGSQLSLLGENKGAQDTAGGNGISYTSPAKLTVNNNGSLKMEGRSTSGTGINFPSS
NNTLVFNGDGDTLIKGSSVAGTGAAISGVVNNSTGPMTIEGISTDGAGVHLFSAEHRIDR
INVTGSSTHAEGLRISGNAAIVDTTLTGKSINGSGVKIDSLPGSSVVTRSVLDNATLNGS
SSSGKGVEITSDINGIHHSSINGTTTGTGYGIDIGENSNVTGTSEADLLILQGVATTGTG
TGIKLNGNNDLSNTSLNSSAVDGIALDITGPLANQGNVILNGTASGSGIGAQVNGSLSDS
VVNGTSTNGIGVQINGSLKNSRINGISANGSGVKIDGESTLDNATLNGNSTEGKGVDLAA
NLSGNHGSVVHGDTVHGTGIDVGKDVTLSGGGTDEPLTVSGNASGEKGTGVQLGGNNTLD
NTTLSGNATDGHGVEINSRLINNGNTTINGKTSDDGHGVHINGAISGGEINGHSDNSHGV
FLDESALLNDIVIGGGTGSYKLPVFIALPETIGERVTLNGKPIDKTQPEGSKAREGDNLT
RGKYTPLPPATDPELPPASTDEEKNTKQTSTLTPSQKREDPDMLIMARNHILSTLEGRDL
SSSVVTESEQSAAGVTGIMVCLPLSETSEHEPCDTYILDKGQPHLPMMVKK
NT seq
5736 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacagtaaattgtacaaacttattttttgtcgtcggctgggctgcttaattgccgtg
ggagaatttacccgatcatatggccgagccttttcgtcgaaaggcggtcaagccggcaat
aatcagcgccgggccgttggtatcttaagccgtctggcgatgatgacgggcttggcgctt
gggatattccccttgctggttctggcccatccggtgttaccggttaatggccatgttgtc
atcgggcaagggatgttggatcagcaaagcagtacgcttaccgtgacacagcaaacggat
aagttagcgattaattgggacagttttgatattgcgcacggacacagtgtcatttatgcc
cagccgggtagccagagcattgcattgaatcaggtgcaggggcagagcgcatcgcaaatt
tatggccgcttacaggcaaatggtcaggtcttcttgcttaacccgcgcgggatactgttt
ggtaaagaggcgcaggttaatgtcggtgggttggtggcgagcacgaaatatatgtcaaat
ccagagtttctgtctggtgactaccgcctgatcgggggggagagtgaaggcaatattatt
aatcaggcgaatttacgctcggccccagggggatatatcgcactggtgggtaaccggatt
gataaccagcgttcagggtctatcaccaccccacaagggaacactgtgctggcagtcggt
cacagcgtgaccttgaatctggaccatgggaatttattaggggtacaaattcagggggaa
accgttgctgcactgattcaaaatggtgggttaatccaggctgatggcggagtgattcaa
ctgacggctaagggtaaagatatgctgatggatacggtgattgataataccggtatcctg
caagctaaagggttgtcagcgaaaaatggtgctatttatcttgatggcggtggtgagggg
gttgtcagccagatggggaccatcgatgttaacaatcagcaggggcgtggaggacgtgcg
gttgttgaagggaaacgtatttatctgaataagaacagtaatattaaagcgaagggcact
gcaggcggtggcactgttttagtggggggggggggctggcaaggcaaagataatcagatc
agaaatgccacggctgtggtgatggataaaggcagtgatattgatgtttcggcatctcgc
aacgggccgggaggaagtgcggttttatggtctgaggattacaccggttttcacggtaat
atccgagccagaggcgggcctcaatcaggcgatggcggtcaggttgaaacatccagccaa
cgcaatttacaagcttttgggcaagtggatgccagtgccgttcgtggatccgcaggctat
tggttattggaccctgcggaggtaacaattgttagcagtggtgctgagagtggtgtaatg
actaaagtgggtaatatacccgcagagtttttttctagcgcccatatttttattccaacg
gccaatattactcagatcctcaatagtagtattaatacccagcttaatagtggcactaat
gttacgataaccaccagcaacagtagtttaacggggtgccaatggtgcaatataactgta
caagccgatatcactaaaacggcgggagccgatgcgacgctgacattacaggctgacggt
aatattgtagttaataataatattaccgctgatgctggaaaattaaatttaaatttatta
gcaggaaataccactgcggattctgccatcacgctgaataatagcaaggttttattaaat
ggcggtgattttttagctaaacatgccaatgataataatacggcacgtattggcttactg
ggcgggcgatatgatgttggcaatttcaccttggatgggaataccgcattagcctcacaa
gttggggtgaatatcagtaatgcggctaatattagcgtcgcgggcgaaaccgttatctcc
ggtgtgagcagtaacagccgtgggcaagggtggcgtggtattgatatatcaaataattcg
atcttaacgggcgtggggaatatgactttctcgataggctctaactccaatgtttcatgg
atgggggcattcactaatgcaacaattaccagtgataagaatataatattccaagggacg
gggagttcgtcaggtggagtggactttgttaatagccgtattttgtcaaaatctggccgt
gttttatttgatataaatggcaatattgttgttaagaatgtttatgggcttcgggtcaat
aattcacagctcagtgctaaggatgttaaatttgcagtcaatgtcactggagttgatggt
tttttactaagagatagtcatgttaccgcaacttccggtgatattaatgccaatgctaat
accatcaataaaggtatttggatctcaggtaaaaccaatttaaacgccagtggtaatgtt
aatctgcatggtgtgacgactaattcggcctatgcgggtgctgatgcaataaagatcagc
ggtaattccagtagtaacaatgtcaatattaccgctggtggtcatatctctctgatcgcg
gttaatggagggaaagagattggaagcactgtttctgtagattacgccaatataatagct
aagaatggagactttaatttaaatattactgggatgaaagggagtccttttaataacgct
acgataactgccaacaatatttcaatgaatggcaatattaccgctaatgatgcggtgttg
atgactaatacattcctcacggctaaaggcgatatcaaaactgatttaacctctcctact
aaaggtttatggtttaggggaaatggtgggatgaccgcggctaataatatactcttggtt
gctaacagcacatcgagtggagaaacagtgaaaatcaatgcgtcttcctcgaacaaaatg
aatatcactgcaggaaaagatatatctataatagccggtaatagtaaaacagctacggga
cctaacattaatattgaaaatgtcaatatagaaaccaataatggaaactttacgactaac
ggcataacaagtacatggctgtcgggagtgaatgttagcgcgaatggtgttgatataacc
tctaattctactggcaccggtggcatagtattggataatactaatatcctgacaacagta
ggtgatattaatacaatagtaaccaattcttccggcaaaggcatttggattaaatctaac
tcaacattgaattctaataaagatatcaccttggttggagtatccgccggacagaatgaa
ggggtcattattcaaggttcttcagatgcttcacgtaacaatatctctgctcaagggaat
atcaccttaataggtaaaatgggcaatggctctggtcagcattcattaatcaatttgggt
aatgttagtctaacatcaagcggaagaaatattgatattaatggttcgtcagccggtacc
ggggatgtttattttaccaatgtagagcttaatgctaccgcaggtaatgtttctatttat
gctgaaacgaaaaccgctttatcgacatcattaaatgccgtattaagcttggggggtaat
aacagtatcaaagctcaaaatggatggcttattggtaaagcatttaatacgacacaaggg
gcgggtattggttttagagccaatagtagcttatctgttgacggcaatatcattttgaaa
ggcgagaccgaaggggttggggccacacgcaaagggattgatttctatggcgcgaataca
ctgaatattattaaaggtagccaattatctctcctcggtgaaaataaaggggctcaagat
accgcaggtggtaatggcataagctataccagcccagctaaattaacggttaataataat
ggttctttaaaaatggaggggcgttcaaccagcggtacgggaattaacttcccaagcagc
aataatacgctggtattcaatggtgatggtgacacgctgattaaaggcagcagtgtcgcg
ggtacgggggccgctatttccggtgttgttaataatagtaccggccccatgacgattgaa
ggaatcagtaccgatggtgccggtgttcaccttttcagtgcagaacatcgtattgatcgc
attaatgtcacagggagttcaactcacgccgaaggtttgcggatcagtggtaatgcagcg
attgtcgataccacattgaccggaaagtcgatcaatggcagtggtgtgaagattgattca
ttgccgggctccagtgttgttacccgttccgtcttggataatgccacgctcaatggcagc
agtagcagtgggaaaggggtggaaattaccagtgatatcaatggtattcatcacagttcg
attaacggaacgactactggcacgggctacggtattgatattggcgaaaattcaaacgtt
accgggaccagtgaagctgacttgttgattctacaaggtgtggcgacaacaggcactggc
accggaataaaactcaatggtaataatgatttaagtaataccagtttaaatagctctgcg
gttgatggtatcgctttggatatcacgggcccgctagctaaccaagggaatgtgatccta
aacggcacggcttctggttcggggattggtgcgcaggtcaatggttcgctaagtgatagt
gtggttaacggtacgtcgacgaatggtattggtgtgcaaatcaatggatcgcttaaaaac
agccgcatcaacggcatttcggccaatggcagcggggttaaaatcgatggcgagagcacg
ctggataacgctacgctcaatggcaacagtaccgagggcaagggcgtggatctggcggcc
aatctgtccggtaaccatggcagcgtggtgcatggcgacacggtccatggcaccggcatc
gacgtgggtaaagacgtcaccctgagtggcggtggtacggatgaaccgttaacggtcagc
ggtaatgccagcggtgagaaaggcaccggcgtgcaactgggcggcaataataccctcgat
aacaccacgctgagcggcaacgccaccgatggccatggggtagagattaacagccgatta
atcaataacggcaatactacgattaatggcaaaacgtctgatgatggtcacggcgtacat
attaatggggccatcagtggcggagaaatcaatggtcattcagacaatagccacggtgtt
ttcctcgatgaaagtgcgttacttaatgacatcgttatcggaggagggaccggctcatat
aaactgccggtgtttatagcattacctgaaaccatcggtgagcgcgtgactcttaatggt
aaaccgattgataaaacccagccagaaggcagtaaggcacgtgaaggtgataacctgaca
aggggtaaatatacacctttgccaccggctactgaccctgaattgcccccagcatcaacc
gatgaggagaaaaatacaaaacagacctcgacgctaaccccatctcagaaaagagaggat
ccagacatgttgataatggcgcgaaaccatatcttgagtacccttgaagggcgtgattta
tcttcatctgttgtcactgaatcggagcaaagtgcggcgggcgttaccggaattatggtt
tgtctccctctgagtgagacctctgaacatgaaccttgcgatacgtatattttagacaag
ggacaaccccatctccccatgatggtcaagaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system