Yersinia pestis El Dorado: CH46_1073
Help
Entry
CH46_1073 CDS
T03719
Name
(GenBank) outer membrane autotransporter barrel domain protein
Organism
ypl
Yersinia pestis El Dorado
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
AC_1
Pertactin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJJ16586
UniProt:
A0A380PG17
LinkDB
All DBs
Position
1173697..1176909
Genome browser
AA seq
1070 aa
AA seq
DB search
MKTNRSTLSPCFRKTMIASLLVPLCSPLYSWAVQTASITDGSTMVISGGYDTEANNHSAV
FVQGSGSTINGGSDVVIETTGVGAIGAYASEGGSLGLTGSTINTENGVAFGVLNDKGTVN
LQGGTITTKGQTAYGVYSSGLGSNTDIHSSAITTSYSLTHAIYGAGGTGLTLNNTTLNTS
GSGSYGIYLDGSGGSLTGANNTINSTHATKGAGIYISAGGSNATLDNTTLNITKGAVGVN
VGEGSSITMDGLIATGNITNLFKVNGNASVSNANIELAAGGVLMAQGSSASNQAVIILNN
VNVISNSGSTTLVDVNKDADVTINGGAYHSKGNNAKGIWVRDNNSSLNVDNAVIITEGVN
ATAIENRGTAIVKNTTVITKGNNSHGLYSEQSLDATNMAISTAGIGSIGVAAAKGGNLNL
NDAFIETTGNSGMVLGTFADSSISAKNITGISTGAGAYALWVDDGSSILLEESQITTQGQ
GAGGIYASNTGTGSHTAYTQVTLNNSQIHSEQGPGIWANGADINVDVKNGSQLTGGNGLL
VYASSNAGAASNVNVNGDNHAVLLGDIHAAENSNINLALNNNSVWTGAATNAKQVDIDSS
SIWNLTGDADVESMHVLGQMNFISNSSDTNSRAPYDNFSTLTINSNVTGSGSFTFNVQLG
DNDSPVDRLYVIGNASGDHGVQVINQGGLGALTTGDGINLITVDGETHSGSFTMSNSVSA
GAYEYFLYKIDDYRWNLQSNLINPGPGPEPEIEPEEIAYRPEVPGYIAAPWLNAFYGFTT
LGSLHERRGSAEGAAEGFNQDSWGRIRGQHNNFDAGRFSYDSNIWFMQLGHDVYQAKNAA
GTQVTGGMMITLGKQNSDTRDRARAINPDLSIDTGKIKTEAYGFGGYYTLMTEEGGYLDI
VSQATLYRNNYESQHNTKHNGYGVVMSAEVGQPYPLAAGWVVEPQGQLKYQYLHLSPKNF
NDSISEIGGTDYSVGQVRGGLRLFSDASEKRDIKPYLTTDVLHQLGRNPQVTVATVDIRP
DFTKTFWQGGAGVTAKVNSQVDLYADAKYQKSFDGKLDGYLGNLGVKVSF
NT seq
3213 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacaaaccgctctacgctttccccgtgctttcgtaaaacaatgatagccagtttg
ttggtgcctctttgcagccccctgtatagctgggcggtacaaacggccagcataacagat
ggcagcacgatggttatctctgggggttatgacactgaggctaataaccactcggcggta
tttgtgcaaggttccggtagcaccattaatggtggctccgatgtcgttattgaaaccacg
ggggttggtgcaattggtgcctatgcctctgaaggtgggtcgttggggctgacgggttcg
actatcaataccgagaatggtgtggcttttggtgtcttaaatgacaaaggtacggtgaat
ttacaaggtggtacgattaccacgaaaggtcagacggcatatggcgtgtattcctctggt
ttgggcagtaataccgatattcacagttcggcgatcacgaccagctactcgttaacccac
gctatttatggtgccggagggacgggattgacattgaacaataccaccctcaataccagt
ggcagtggtagctatggcatttatctggatggttccggagggagcttaacgggcgcgaat
aacaccattaatagtactcatgcgaccaagggtgcgggtatctatatttcagcgggtggc
tcaaatgcgactttagataacaccacactgaatatcactaaaggtgctgttggtgtgaat
gtgggggagggttcatctattacgatggatggccttattgccaccggtaatatcaccaac
ctatttaaagtgaatgggaatgcctcggtcagtaatgccaatatcgaattagccgcgggt
ggcgtattaatggcacagggcagcagtgcgtccaatcaagcggtcatcatattaaataat
gtcaatgttatttctaacagcggcagcacgacactggttgatgttaataaggacgctgac
gtcaccattaatgggggggcttaccactcaaaaggtaacaatgcgaagggaatctgggtt
cgagataataactcatcgctgaatgtcgataacgccgtgattatcaccgagggcgtgaat
gcaacggcgattgaaaatcgtggcaccgctatcgtaaaaaataccacggtgataactaaa
gggaataactctcacggcctctactctgagcaaagccttgatgccaccaatatggcaatt
tccactgcggggattggcagtattggggtggcggcagctaaaggcggtaacctaaatctg
aatgatgcattcatcgagacgacgggtaattcaggtatggtgctgggtacttttgccgac
tcatccatcagcgctaaaaatattacagggatctcgaccggcgctggtgcttatgccttg
tgggtagatgatggtagctcaattctgctggaagagagccaaattaccactcaaggccag
ggcgcgggagggatttatgcctcaaataccgggaccggctctcacaccgcttacactcag
gttacgctgaacaactcacagattcatagtgagcaggggccgggtatctgggctaatggt
gctgacattaatgttgatgtgaagaatggttcgcagttaacgggaggcaatgggttattg
gtctatgcctcaagtaatgcaggggccgccagcaatgtcaatgtgaatggcgataaccac
gccgttctgttgggtgatattcacgccgcagaaaacagcaatattaacctggcactgaat
aataattccgtttggacgggggcggcgactaacgccaaacaggttgatatcgacagcagc
agtatctggaatttaacgggtgatgcagatgttgagtcaatgcatgtattgggccagatg
aactttatctcaaatagcagtgacactaattcacgggctccctacgataatttcagcacc
ttaacgatcaacagtaatgtcaccgggagtggcagttttacctttaatgtgcaattgggt
gataacgactcaccagtggatagactctatgtgattggtaatgcttctggtgaccatggg
gttcaggttattaaccaaggcggtttgggggcattgaccacgggcgacgggattaacctg
attaccgttgatggggagacccattccggctcatttactatgagtaactcggtgagcgca
ggggcctatgaatatttcttgtataagatagatgactaccgttggaacctgcaatctaat
ctcatcaatcccggtcctggtcctgaaccagaaattgaaccagaagagatagcttaccgc
cctgaagttcctggctatattgccgcaccttggttaaatgcattttatggttttactact
ttgggtagcttgcacgaacgccgtggctcggccgagggagcagccgaagggtttaatcaa
gactcatggggccggatccgtgggcagcataataattttgacgcgggccgttttagctac
gattcaaatatctggtttatgcaattgggtcatgatgtctatcaggccaaaaatgccgca
ggcactcaagtgactggcggtatgatgatcaccctaggtaagcagaatagcgatacacgg
gatcgggcgcgggcgataaatccggatttgtcgatcgataccggcaagatcaaaaccgag
gcttatgggtttgggggctattacaccctgatgaccgaggaaggcggttaccttgatatc
gttagccaggcgacgctataccgcaacaactatgagagccaacataataccaagcataat
ggctacggtgttgtgatgtctgccgaagtgggtcagccgtatccactggctgctggctgg
gtagtggagcctcaggggcagctaaaatatcaatacctgcacctgagtccgaagaatttc
aacgatagcatttcagagatcggggggacggattactctgttggtcaggtacgtggcggg
ctgcgtctgttcagtgacgcgagtgagaagcgggacattaagccttatttgaccaccgat
gtgcttcaccagttaggccgaaacccacaggtgacggtagcgacggtggatatccgtcct
gacttcacaaaaaccttctggcaggggggcgcaggggtgaccgccaaagtgaatagtcag
gttgatctctatgctgatgcgaaataccaaaaatcctttgatggcaaattagatggctac
ttaggtaatttgggcgtgaaagtcagtttctga
DBGET
integrated database retrieval system
