KEGG   Yersinia similis: BF17_06970
Entry
BF17_06970        CDS       T03057                                 
Name
(GenBank) autotransporter
Organism
ysi  Yersinia similis
SSDB
Motif
Pfam: Autotransporter AC_1 Pertactin Beta_helix DeoRC
Other DBs
NCBI-ProteinID: AHK19087
LinkDB
Position
complement(1435471..1438698)
AA seq 1075 aa
MKTNRSTLSPCFSKTVIASLLVPLCSPLYSWAVQTASITDGSTMVISGGYDTEANNHSAV
FVQGSGSTINGGSDVVIETTGFGAIGAYSSEGGTLGLTGSTIKTESGTAFGVLNDKGTVN
LQGGTITTKGQTAYGVYSSGLGSNTDIHSSVITTSYSLTHAIYGAGGTGLTLNNTTVNTS
GSGSYGIYLNGPGGSLTGADNTINSTHATNGAGIYISSGGSDATLDNTTLNITKGSVGVN
VGEGSSITMDGLLATGNITNLFKVNGNASVSNANIELAAGGVLMAQGSSASNQAVIILNN
VDAISNSGSTILLDVNKDADVTINGGSYHSKGNYAKGIWVRDNSSSLNVDNAVIITEGVN
ATAIENRGTAIVKNTTVITKGNNSHGLYSEQSLDATNMAISTAGTGSIGVAAAKGGNLNL
NDALIETTGNSGMVLGTFADSSISAKNITGLSTGAGAYALWVDDGSSILLEESQITTQGQ
GAGGIYASNTGTGSHTAYTQVTLNNSQIHSEQGPGIWANGADINVDVKNGSQLTGGNGLL
IYASSNAGATSNVNVNGDNHAVLLGDIQAAENSNISLALNNNSVWTGAATNAKQVDIDSS
SIWNLTGDADVESMHVLGQMNFIPNSSNTNSRAPYDNFSTLTINSNVTGSGSFTFNVQLG
DNDSPVDRLYVIGNASGDHGVQVINQGGLGALTTGDGINLITVDGETHSGSFTMSNSVSA
GAYEYFLYQIDGNRWNLQSNLINPDPGVDPGVDPEVDPGGETAYRPEVPGYIAAPWLNAF
YGFTTLGSLHERRGSAEGAAEGFNQDSWGRIRGQHNNFDAGRFSYDSNIWFMQLGHDVYQ
AKNAAGTQVTGGMMITLGKQNSDTRDRARAINPDLSIDTGKIKTEAYGFGGYYTLMTEEG
GYLDIVSQATLYRNNYESQHNTKHNGYGVVMSAEVGQPYPLAAGWVVEPQGQLKYQYLHL
SPKNFNDAISEIGGTDYSVGQVRAGLRLFSDASEKRDIKPYLTTDVLHQLGRNPQVTVAT
VDIRPDFTKTFWQGGAGVTAKVNSQVDLYADAKYQKSFDGKLDGYLGNLGVKVSF
NT seq 3228 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaacaaaccgctctacgctttccccgtgctttagtaaaacagtgatagccagtttg
ctggtgcctctttgcagtcccctgtatagctgggcggtacaaactgccagcataacggat
ggcagcactatggttatctctgggggttatgacactgaggctaataaccactcggcggta
tttgtgcaaggctccggtagcaccattaatggtggctccgatgtcgttattgaaaccacg
ggctttggtgcaattggtgcctattcttctgaaggtgggacgttgggtttgacgggttcg
actatcaagaccgagagtggtacggcttttggtgtcttaaatgataaaggtacggtgaat
ttacaaggtggtacgattaccacgaaaggtcagacggcatatggcgtgtattcctctggt
ttgggcagtaataccgatattcacagttcggtgatcacgaccagctactcgttaacccac
gctatttatggtgcgggagggacgggattgacattgaacaataccaccgtcaataccagt
ggcagtggtagctatggcatttatctgaatggtcccggtggtagcctaacgggtgcggat
aacaccattaatagtactcatgcgaccaatggtgcgggtatctatatttcatcgggtggc
tcagatgcgactttagataacaccacactgaatataaccaaaggttctgtgggtgtgaat
gtgggggagggatcatctattacgatggatggtcttcttgccaccggtaatatcaccaac
ctatttaaagtgaatgggaatgcctcggtcagtaatgccaatatcgaattagccgcgggt
ggcgtattaatggcacagggcagcagtgcgtccaatcaagcggtcatcatattaaataat
gtcgatgctatttctaacagtggcagcacgatactgttagatgttaataaggacgctgac
gtcaccattaatggggggtcttaccactcaaaaggtaactatgcgaaggggatctgggtt
cgggataatagctcatcgctgaatgtcgataacgccgtgattattaccgagggcgtgaat
gcaacggcgattgaaaatcgtggaacagctattgtaaaaaatactacggtgataaccaaa
gggaataactctcacggcctctactctgagcagagccttgatgccaccaatatggcaatt
tcaacggcggggactggcagtattggggtggcggcagctaaaggcggtaacctaaatcta
aatgatgccctcatcgagacgacgggtaactcaggtatggtgctgggtacttttgccgac
tcatccatcagcgctaaaaatattacaggtctatcgaccggcgctggtgcttatgccttg
tgggtagatgatggtagctcaattctgctggaagagagccaaattaccactcaaggccag
ggcgcgggagggatttatgcctcaaataccgggacggggtctcacaccgcttacactcag
gttacgctgaacaactcgcagattcatagtgagcaggggccgggcatttgggctaatggt
gctgacattaatgttgatgtgaagaatggttcgcagttaacgggagggaatgggttattg
atctacgcctcgagtaatgcgggagccaccagtaatgtcaatgtgaatggcgataatcac
gccgttctgttgggtgatattcaggccgcagaaaacagcaatattagcctggcactgaat
aacaattccgtttggacgggggcggcgactaacgccaaacaggttgatatcgacagtagc
agtatctggaatttaacgggtgatgcagatgttgagtcaatgcatgtattgggccagatg
aactttatcccaaatagcagtaacaccaattcacgagccccttacgataatttcagtacc
ttaacgatcaacagtaatgtcaccgggagtggcagttttacctttaatgtgcaattgggt
gataacgactcaccagtggatagactctatgtaataggtaatgcctctggtgaccatggg
gttcaggttattaaccaaggcggtttgggtgcgttgaccacgggtgatgggattaacctg
attactgttgatggggagacccattctggctcatttactatgagcaactcagtgagcgca
ggagcctatgaatatttcttgtatcagatagatggcaaccgttggaacctgcaatctaat
ctcatcaatcctgatccaggagttgatccaggagttgatccagaagttgatccaggagga
gagacggcttaccgccctgaagttcctggctatattgccgcaccttggttaaatgcattt
tatggttttaccaccttggggagtttgcacgaacgccgtggctcggccgagggggcagct
gaagggtttaatcaagactcatggggccggatccgtgggcagcataataattttgatgcg
ggccgttttagctacgattcaaatatctggtttatgcaattgggtcatgatgtctatcag
gccaaaaatgccgcaggcactcaagtgactggcggtatgatgatcaccctaggtaagcag
aatagcgatacacgggatcgggcgcgggcgataaatccggatttgtcgatcgacaccggc
aagattaaaaccgaggcttatgggtttgggggttattacaccctgatgaccgaggaaggc
ggttaccttgatatcgttagccaggcaacgctataccgcaacaactatgagagccaacat
aataccaagcataatggctacggtgttgtgatgtctgccgaagtgggtcagccgtatcca
ctggctgctggctgggtagtggagcctcaggggcagctaaaatatcaatacctgcacctg
agtccgaagaatttcaacgatgccatttcagagatcggggggacggattactctgttggt
caggtacgtgccgggctgcgtctgttcagtgacgcgagtgagaagcgagatattaagcct
tatctgaccaccgatgtgcttcaccagttgggccgaaacccacaggtgacggtagcgacg
gtggatatccgtcctgacttcacaaaaaccttctggcaggggggcgcaggggtgaccgct
aaagtgaatagtcaggttgatctctatgctgatgcgaaataccaaaaatcttttgatggc
aaattagatggctacttaggtaatttgggcgtgaaagtcagtttctga

DBGET integrated database retrieval system