Ziziphus jujuba (Chinese jujube): 107415894
Help
Entry
107415894 CDS
T04794
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At5g15340, mitochondrial
Organism
zju
Ziziphus jujuba (Chinese jujube)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR
PPR_2
DYW_deaminase
PPR_1
PPR_3
E_motif
Eplus_motif
PPR_long
Pput2613-deam
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107415894
NCBI-ProteinID:
XP_015879791
UniProt:
A0A6P3ZW56
LinkDB
All DBs
Position
4:29671697..29673598
Genome browser
AA seq
633 aa
AA seq
DB search
MRWPSHTVIASLSCHQLRSFLRACARRSSLDVGKKFHAVLITSGLAASRDTFLCNALLHF
YALCGSPPCAYKVFDEIPNSHKDTVDWTTLMSCCARHRMPANGLHLFIEMRREGVIVDDV
ALICVFNSCARLSNVDVGLQGHGISKKMGCGSNIKVCNAVMDMYVKCGLLGEAKRVFEEM
EERSIVSWTVILDGTVNLESIGSGRVLFDSMPERNEVAWTIMVVGYIGNGFTHEGFSLLR
EMVFGCGFMLNYVTLCSLLSACARSGDVMMGRWVHAYALKTMGKEMDIMVDTALVDMYAK
CGRMNTAFKVFEHMPLRNVVAWNALVSGLAVHGMGKLILDIFPQMVKEAEPDDLTFTSLL
SACSHSGLVEEGFHYFHNLELLYGITPKIEHYACMVDLLGRAGRLEEAWVLIKKMPMPPN
EVVLGSLLGSCCVHGKLDLGEYVLHELLRLDPYSTECHVLLSNMYALEGKKEKARSLRHA
LKKRGIRKVPGMSSIYVDGQVYQFSAGDKSHPETTKIYMMLGEMIQRLRLAGYVPKTDSQ
VFSGCDSRENNADDFEEIEQALFTHSEKLAVCFGLIRTRAGSPLYIFKNLRICLDCHSAM
KIVSRIYNREIVIRDRNRFHCFKQGSCSCSDYW
NT seq
1902 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagatggccatcccacactgtcatagcttcactctcttgccatcaactccgctcattt
cttcgagcatgtgctcggcgatcctctctcgacgtcggcaagaagttccatgccgtccta
atcacctccggtctcgccgcttcacgggatactttcctctgcaatgccctcctacatttt
tacgcgctatgtggcagccctccgtgtgcatacaaagtgttcgatgaaattcccaactcg
cacaaagatactgtggattggaccaccctcatgagctgctgtgctcgacatcgtatgcca
gcaaatgggctccatttatttattgaaatgagaagagaaggtgtgattgtcgacgatgtg
gccttgatttgcgtgttcaattcgtgtgctcggttgagcaatgttgatgtgggtctgcaa
gggcatggaatttcgaagaaaatgggttgcggttctaatattaaggtctgcaatgctgtt
atggatatgtatgtgaaatgtgggctattgggtgaggcgaaacgggtgttcgaagagatg
gaggaacgaagtattgtgtcttggactgtaattttggatggtacggttaatttggaaagt
attggaagtgggagagtgttgtttgatagtatgcctgagagaaatgaggttgcttggact
attatggttgttggatatatagggaatgggtttacacacgaaggtttttcacttcttcgt
gaaatggtttttggctgtggttttatgctaaactatgtgacactttgttcactgttgtca
gcatgtgcacggtccggggatgttatgatgggcagatgggttcatgcttatgctcttaag
acaatggggaaggagatggatatcatggtggacacagctttggttgacatgtatgccaaa
tgtgggaggatgaacactgcatttaaagtttttgaacatatgccgctgaggaatgtggtg
gcatggaacgctttggttagtggccttgccgttcacggaatgggaaaacttatattagat
atatttcctcagatggtgaaagaagctgagccagatgatctgacctttacttctttgttg
agtgcttgcagccactccggacttgttgaagagggtttccattacttccataatcttgaa
ttattgtatggcataacgcctaaaatagaacattatgcttgcatggtggatctcttgggt
agggctggccgtttagaagaagcttgggttctaataaagaaaatgccaatgcctcctaat
gaggttgttctaggatcccttttgggttcctgctgtgttcatggaaagctagatctgggt
gaatatgtactgcatgagctactacggctggatccttacagtactgaatgtcatgtcttg
ctttctaacatgtatgcattggagggaaagaaggagaaagctagatcccttcggcatgct
cttaagaaaagaggtatcagaaaggttcctggaatgagttcaatttatgttgatggccaa
gtttatcaattcagtgcaggagataaatcacacccggagaccacaaagatttacatgatg
ctgggtgagatgatccagagattgagattagctggttatgttccaaaaaccgattctcaa
gttttctctggctgtgatagtagggagaataatgcagatgactttgaggagatagagcag
gcattattcacccacagtgagaagttggcagtctgttttggacttattagaacaagagct
ggttcacctctatatatttttaagaatttacgcatatgtctggattgtcattctgctatg
aagatagtttctaggatatataatcgagaaattgttatcagagatcgaaatcgcttccat
tgtttcaagcaaggttcttgttcttgttcagattattggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
