KEGG   ENZYME: 1.14.99.60
Entry
EC 1.14.99.60               Enzyme                                 
Name
3-demethoxyubiquinol 3-hydroxylase;
6-methoxy-3-methyl-2-(all-trans-polyprenyl)-1,4-benzoquinol 5-hydroxylase;
ubiF (gene name);
6-methoxy-3-methyl-2-(all-trans-polyprenyl)-1,4-benzoquinol,acceptor:oxygen oxidoreductase (5-hydroxylating)
Class
Oxidoreductases;
Acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen;
Miscellaneous
Sysname
5-methoxy-2-methyl-3-(all-trans-polyprenyl)benzene-1,4-diol,acceptor:oxygen oxidoreductase (5-hydroxylating)
Reaction(IUBMB)
5-methoxy-2-methyl-3-(all-trans-polyprenyl)benzene-1,4-diol + a reduced acceptor + O2 = 3-demethylubiquinol + acceptor + H2O [RN:R12067]
Reaction(KEGG)
R12067
Substrate
5-methoxy-2-methyl-3-(all-trans-polyprenyl)benzene-1,4-diol [CPD:C19859];
reduced acceptor [CPD:C00030];
O2 [CPD:C00007]
Product
3-demethylubiquinol [CPD:C21860];
acceptor [CPD:C00028];
H2O [CPD:C00001]
Comment
This prokaryotic enzyme catalyses the last hydroxylation reaction during the biosynthesis of ubiquinone. The eukaryotic enzyme is classified under EC 1.14.13.253, 3-demethoxyubiquinone 3-hydroxylase (NADH).
History
EC 1.14.99.60 created 2018, modified 2024
Pathway
ec00130  Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis
ec01100  Metabolic pathways
ec01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Orthology
K03184  3-demethoxyubiquinol 3-hydroxylase
K06134  3-demethoxyubiquinol 3-hydroxylase
Genes
ECO: b0662(ubiF)
ECJ: JW0659(ubiF)
ECD: ECDH10B_0731(ubiF)
EBW: BWG_0533(ubiF)
ECOK: ECMDS42_0522(ubiF)
ECOC: C3026_03310(ubiF)
ECE: Z0811(yleB)
ECS: ECs_0700(ubiF)
ECF: ECH74115_0756(ubiF)
ETW: ECSP_0713(ubiF)
ELX: CDCO157_0685(ubiF)
EOI: ECO111_0692(ubiF)
EOJ: ECO26_0737(ubiF)
EOH: ECO103_0669(ubiF)
ECOO: ECRM13514_0687(ubiF)
ECOH: ECRM13516_0633(ubiF)
ESL: O3K_18275(ubiF)
ESO: O3O_07020(ubiF)
ESM: O3M_18255(ubiF)
ECK: EC55989_0657(ubiF)
ECG: E2348C_0555(ubiF)
EOK: G2583_0825(ubiF)
ELR: ECO55CA74_04050(ubiF)
ELH: ETEC_0690
ECW: EcE24377A_0692(ubiF)
EUN: UMNK88_700(ubiF)
ECP: ECP_0685
ENA: ECNA114_0601(ubiF)
ECOS: EC958_0780(yleB)
ECV: APECO1_1401(ubiF)
ECOA: APECO78_06900
ECX: EcHS_A0709(ubiF)
ECM: EcSMS35_0685(ubiF)
ECY: ECSE_0733
ECR: ECIAI1_0646(ubiF)
ECQ: ECED1_0653(ubiF)
EUM: ECUMN_0755(ubiF)
ECT: ECIAI39_0629(ubiF)
EOC: CE10_0652(ubiF)
EBR: ECB_00630(ubiF)
ECOB: C3029_06935(ubiF)
EBL: ECD_00630(ubiF)
EBE: B21_00621(ubiF)
EBD: ECBD_2989
ECI: UTI89_C0660(yleB)
EIH: ECOK1_0666(ubiF)
ECZ: ECS88_0697(ubiF)
ECC: c0748(yleB)
ELO: EC042_0697(ubiF)
ELN: NRG857_02990(ubiF)
ESE: ECSF_0600
ECL: EcolC_2983
EKF: KO11_20355(ubiF)
EAB: ECABU_c07110(ubiF)
EDH: EcDH1_2964
EDJ: ECDH1ME8569_0631(ubiF)
ELU: UM146_14240(ubiF)
ELW: ECW_m0717(ubiF)
ELL: WFL_03565(ubiF)
ELC: i14_0717(ubiF)
ELD: i02_0717(ubiF)
ELP: P12B_c0644(ubiF)
ELF: LF82_2351(ubiF)
ECOL: LY180_03565(ubiF)
ECOI: ECOPMV1_00672(ubiF_1)
ECOJ: P423_03240(ubiF)
EFE: EFER_2440(ubiF)
EAL: EAKF1_ch0790c(ubiF)
EMA: C1192_09400(ubiF)
ESZ: FEM44_17725(ubiF)
ERUY: OSH18_06345(ubiF)
STY: STY0717(yleB)
STT: t2202(yleB)
SEX: STBHUCCB_23260
SENT: TY21A_11165(ubiF)
STM: STM0671(ubiF)
SEO: STM14_0782(ubiF)
SEV: STMMW_07361
SEY: SL1344_0660(ubiF)
SEM: STMDT12_C07340(ubiF)
SEJ: STMUK_0676(yleB)
SEB: STM474_0692(ubiF)
SEF: UMN798_0725(yleB)
SETU: STU288_11015(ubiF)
SETC: CFSAN001921_13675(ubiF)
SENR: STMDT2_06621(yleB)
SEND: DT104_07011(yleB)
SENI: CY43_03645(ubiF)
SEEN: SE451236_09380(ubiF)
SPT: SPA2069(yleB)
SEK: SSPA1922
SPQ: SPAB_02875
SEI: SPC_0688(yleB)
SEC: SCH_0699(ubiF)
SEH: SeHA_C0789
SHB: SU5_01362
SENH: CFSAN002069_05485(ubiF)
SEEH: SEEH1578_12790(ubiF)
SEE: SNSL254_A0730
SENN: SN31241_16770
SEW: SeSA_A0825
SEA: SeAg_B0716
SENS: Q786_03290(ubiF)
SED: SeD_A0777
SEG: SG0675(ubiF)
SEL: SPUL_2287(ubiF)
SEGA: SPUCDC_2273(ubiF)
SET: SEN0640(ubiF)
SENA: AU38_03275(ubiF)
SENO: AU37_03270(ubiF)
SENV: AU39_03275(ubiF)
SENQ: AU40_03610(ubiF)
SENL: IY59_03325(ubiF)
SENJ: CFSAN001992_08000(ubiF)
SEEC: CFSAN002050_09970(ubiF)
SEEB: SEEB0189_015925(ubiF)
SENB: BN855_6640
SENE: IA1_03510(ubiF)
SENC: SEET0819_10325(ubiF)
SES: SARI_02271
SBG: SBG_0569(yleB)
SBZ: A464_637
SBV: N643_02830(ubiF)
SALZ: EOS98_15765
SFL: SF0620(ubiF)
SFX: S0642(yleB)
SFV: SFV_0665(yleB)
SFE: SFxv_0686(ubiF)
SFN: SFy_0845
SFS: SFyv_0882
SFT: NCTC1_00668(ubiF)
SSN: SSON_0616(yleB)
SBO: SBO_0526(yleB)
SBC: SbBS512_E0585(ubiF)
SDY: SDY_0598(yleB)
SDZ: Asd1617_00763
SHQ: A0259_07000(ubiF)
SHIG: LXH19_15580(ubiF)
ENC: ECL_03042
ENL: A3UG_06330(ubiF)
ECLG: EC036_12200
ECLE: ECNIH2_07080(ubiF)
ECLN: ECNIH4_16280(ubiF)
ECLI: ECNIH5_06165(ubiF)
ECLX: LI66_06040(ubiF)
ECLY: LI62_06940(ubiF)
ECLZ: LI64_06525(ubiF)
ECLO: ENC_20540
EHM: AB284_18825(ubiF)
EXF: BFV63_06185(ubiF)
ECLA: ECNIH3_06180(ubiF)
ECLC: ECR091_06160(ubiF)
EAU: DI57_12535(ubiF)
EKB: BFV64_06060(ubiF)
ENO: ECENHK_06425(ubiF)
EEC: EcWSU1_01236(ubiF)
ELG: BH714_02275(ubiF)
ECAN: CWI88_16075(ubiF)
ERN: BFV67_05825(ubiF)
ECLS: LI67_007085(ubiF)
ECHG: FY206_07460(ubiF)
ESH: C1N69_06180
EPT: HWQ17_06465(ubiF)
ECHU: RQP59_06475(ubiF)
ENT: Ent638_1188
EAS: Entas_1168
ENR: H650_22110(ubiF)
ENX: NI40_005835(ubiF)
ENF: AKI40_2140(ubiF)
LNI: CWR52_06080
EBG: FAI37_00385(ubiF)
END: A4308_10140(ubiF)
ENZ: G0034_06175(ubiF)
ENS: HWQ15_14645(ubiF)
ENK: LOC22_16915(ubiF)
EHU: D5067_0016515(ubiF)
EMOR: L6Y89_06025(ubiF)
ENB: ELK40_06720
EQU: OM418_05940(ubiF)
EPU: QVH39_06130(ubiF)
EDY: F0320_05680(ubiF)
EAX: AAHF05_05935(ubiF)
ENTE: GXP72_06210(ubiF)
ENTY: H2Z33_01460(ubiF)
ESA: ESA_02674
CSK: ES15_2747(ubiF)
CSZ: CSSP291_12610(ubiF)
CSJ: CSK29544_03962
CCON: AFK62_05895(ubiF)
CDM: AFK67_06090(ubiF)
CSI: P262_04007
CMJ: AFK66_013815(ubiF)
CUI: AFK65_05870(ubiF)
CMW: AFK63_12785(ubiF)
CTU: CTU_12870(ubiF)
KPN: KPN_00687(ubiF)
KPU: KP1_1644(ubiF)
KPM: KPHS_15270
KPP: A79E_3551
KPH: KPNIH24_21180(ubiF)
KPZ: KPNIH27_07095(ubiF)
KPV: KPNIH29_07795(ubiF)
KPW: KPNIH30_07825(ubiF)
KPY: KPNIH31_07700(ubiF)
KPG: KPNIH32_07930(ubiF)
KPC: KPNIH10_07610(ubiF)
KPQ: KPR0928_07520(ubiF)
KPT: VK055_1844
KPO: KPN2242_06310(ubiF)
KPR: KPR_3886(ubiF)
KPJ: N559_3634
KPI: D364_03600(ubiF)
KPA: KPNJ1_03890
KPS: KPNJ2_03876
KPX: PMK1_03021(ubiF_2)
KPB: FH42_24480(ubiF)
KPNE: KU54_018830(ubiF)
KPNU: LI86_18655(ubiF)
KPNK: BN49_1747(ubiF)
KVA: Kvar_3679
KPK: A593_17910(ubiF)
KVD: KR75_15375(ubiF)
KVQ: SP68_21990(ubiF)
KQU: AVR78_12115(ubiF)
KQV: B8P98_20240(ubiF)
KOX: KOX_14330(ubiF)
KOE: A225_1685
KOY: J415_23205(ubiF)
KOM: HR38_13070(ubiF)
KMI: VW41_05790(ubiF)
KOK: KONIH1_08275(ubiF)
KOC: AB185_27850(ubiF)
EAE: EAE_13960(ubiF)
EAR: CCG31177
KLL: BJF97_08650(ubiF)
KLW: DA718_19995
KAR: LGL98_17860(ubiF)
KGR: JJJ10_19900(ubiF)
KPAS: LUW96_15030(ubiF)
KLC: K7H21_19925(ubiF)
KLM: BWI76_08140(ubiF)
REE: electrica_03644(ubiF_2)
KLP: GUC22_19155(ubiF)
KLX: GQR96_07100(ubiF)
ROR: RORB6_11640(ubiF)
RON: TE10_09240(ubiF)
RPLN: B1209_19335(ubiF)
RAO: DSD31_18160
RTG: NCTC13098_05341(ubiF_2)
CRO: ROD_06751(ubiF)
CKO: CKO_02501
CFD: CFNIH1_13435(ubiF)
CBRA: A6J81_09790
CWE: CO701_15495(ubiF)
CYO: CD187_16950(ubiF)
CPOT: FOB25_04425(ubiF)
CFQ: C2U38_07275(ubiF)
CSED: JY391_15080(ubiF)
CAMA: F384_02920(ubiF)
CAF: AL524_19365
CIF: AL515_07925
CFAR: CI104_07630(ubiF)
CIR: C2U53_16840(ubiF)
CIE: AN232_23050
CPAR: CUC49_03065(ubiF)
CTEL: GBC03_22650(ubiF)
CITZ: E4Z61_10305(ubiF)
CARS: E1B03_08440(ubiF)
CIX: M4I31_16300(ubiF)
CIB: HF677_016585(ubiF)
CENS: P2W74_16225(ubiF)
CITR: GUC46_16595(ubiF)
CIQ: FD428_15080(ubiF)
CIY: HAP28_07870(ubiF)
BFL: Bfl318(ubiF)
BPN: BPEN_326(ubiF)
BVA: BVAF_321(ubiF)
BCHR: BCHRO640_336(ubiF)
BHB: M9394_03215
BVX: M9408_03205
BEN: BOBLI757_322(ubiF)
BED: BTURN675_309(ubiF)
BEC: GN160_00640
BEM: M9396_00825
BOCR: M9405_01490
HDE: HDEF_0071(ubiF)
SECT: A359_06310
RIP: RIEPE_0077
RPED: AOQ87_02290
EBT: EBL_c27110(ubiF)
CNT: JT31_06440(ubiF)
CEM: LH23_11480(ubiF)
CEN: LH86_10915(ubiF)
CLAP: NCTC11466_03290(ubiF_2)
PGE: LG71_21660(ubiF)
ESC: Entcl_3143
KLE: AO703_06555(ubiF)
KSA: C813_08355(ubiF)
KOR: AWR26_17795(ubiF)
KRD: A3780_06460(ubiF)
KCO: BWI95_12175(ubiF)
KOT: EH164_15905
KPSE: IP581_06500(ubiF)
KOB: HF650_07110(ubiF)
KOO: O9K67_17420(ubiF)
KOU: C0557_06895(ubiF)
KCA: AAEY27_15485(ubiF)
KIE: NCTC12125_02319(ubiF_1)
KAS: KATP_32160(ubiF)
KLU: K7B04_12200(ubiF)
KCY: RIN60_16580(ubiF)
LAX: APT61_16325(ubiF)
LEI: C2U54_11150(ubiF)
LEH: C3F35_05335(ubiF)
LEE: DVA44_17440
LER: GNG29_06355(ubiF)
LEA: GNG26_06035(ubiF)
LPNU: KQ929_14840(ubiF)
LEY: DVA43_11540
LAZ: A8A57_06270(ubiF)
LEF: LJPFL01_1242
LEW: DAI21_20505
BUF: D8682_09090
BAGE: BADSM9389_29480(ubiF)
BFT: MNO13_17810(ubiF)
BSEL: RHD99_17655(ubiF)
SYM: K6K13_06230(ubiF)
AHN: NCTC12129_03538(ubiF)
ASUB: NLZ15_06955(ubiF)
YRE: HEC60_00520(ubiF)
SGOE: A8O29_016260(ubiF)
KIN: AB182_17820(ubiF)
PDZ: HHA33_20360(ubiF)
METY: MRY16398_40710
IZH: FEM41_13200(ubiF)
PTF: PROFFT_A_02930(ubiF)
PLAR: GII40_00284(ubiF)
PSHI: SAMEA2665130_2230(ubiF_1)
PSGC: G163CM_21790(ubiF)
SCOL: KFZ77_05480(ubiF)
PVJ: LMA04_06325(ubiF)
SUPE: P0H77_07420(ubiF)
TOE: QMG90_15020(ubiF)
AAPT: QNH14_12000(ubiF)
MPHG: MPHASIOC01_003924(ubiF)
FPUL: ACBV55_06095(ubiF)
EBF: D782_3185
EBC: C2U52_28865(ubiF)
EBU: CUC76_07950(ubiF)
EBB: F652_344
PSTS: E05_07790
YPE: YPO2621(ubiF)
YPK: y1196
YPH: YPC_3252(ubiF)
YPA: YPA_2476
YPN: YPN_1107
YPM: YP_1092(ubiF)
YPP: YPDSF_2631
YPG: YpAngola_A1828(ubiF)
YPZ: YPZ3_2315(ubiF)
YPT: A1122_12995(ubiF)
YPD: YPD4_2399(ubiF)
YPX: YPD8_2293(ubiF)
YPW: CH59_3494
YPJ: CH55_1554
YPV: BZ15_916
YPL: CH46_2494
YPS: YPTB1114(ubiF)
YPO: BZ17_1429
YPI: YpsIP31758_2914(ubiF)
YPY: YPK_3004
YPB: YPTS_1171
YPQ: DJ40_1159(ubiF)
YPU: BZ21_364
YPR: BZ20_913
YPC: BZ23_642
YPF: BZ19_497
YEN: YE2984(ubiF)
YEP: YE105_C1253
YEY: Y11_19051
YEW: CH47_2352(ubiF)
YET: CH48_2830
YEF: FORC2_2968
YEE: YE5303_34211(ubiF)
YSI: BF17_14120(ubiF)
YAL: AT01_3755
YFR: AW19_468(ubiF)
YIN: CH53_3083
YKR: CH54_1195
YRO: CH64_3735(ubiF)
YRU: BD65_2984
YRB: UGYR_15250(ubiF)
YAK: ACZ76_14990(ubiF)
YMA: DA391_15835
YHI: D5F51_12935
YEL: LC20_01629(ubiF)
YCA: F0T03_15585(ubiF)
YMO: HRD69_11355(ubiF)
YAS: N0H69_18520(ubiF)
YKI: HRD70_19940(ubiF)
YEG: PL78_01215(ubiF)
SMAR: SM39_0639(ubiF)
SMAC: SMDB11_0465(ubiF)
SMW: SMWW4_v1c11890(ubiF)
SPE: Spro_1221
SRR: SerAS9_1193
SRL: SOD_c10870(ubiF)
SRY: M621_06115(ubiF)
SPLY: Q5A_006095(ubiF_1)
SRS: SerAS12_1193
SRA: SerAS13_1193
SMAF: D781_1140
SLQ: M495_05460(ubiF)
SERF: L085_22500(ubiF)
SERS: SERRSCBI_05610(ubiF)
SFW: WN53_15480(ubiF)
SFG: AV650_10940(ubiF)
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STES: MG068_03390 MG068_19210
SINC: DAIF1_07360(ubiF) DAIF1_38390(coq7)
SPAQ: STNY_R07410 STNY_R39000(coq7)
STEQ: ICJ04_15255 ICJ04_16520(coq7)
SGEN: RKE57_03270 RKE57_19260(coq7)
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STEO: PEM_01940 PEM_16675
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SLAB: AB9L18_01720(coq7) AB9L18_16820
PSU: Psesu_0330 Psesu_0601
PSUW: WQ53_06095 WQ53_11870
PSD: DSC_02355 DSC_05475
PMEX: H4W19_07445 H4W19_16365(coq7) H4W19_17510
PJP: LAG73_13065 LAG73_14265(coq7)
PDD: MNQ95_04750(coq7) MNQ95_10385
PWI: MWN52_02745(coq7) MWN52_07050
PSSE: OY559_03410(coq7) OY559_13380 OY559_15220
PKQ: ACEJ41_00810(coq7) ACEJ41_10125
LAB: LA76x_1053 LA76x_4030
LAQ: GLA29479_2099(coq7) GLA29479_3621
LCP: LC55x_4085 LC55x_4401
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LEZ: GLE_1919 GLE_3903(ubiF) GLE_4263
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LCAS: LYSCAS_05720(visC) LYSCAS_08980(coq7)
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LLZ: LYB30171_02129(ubiI) LYB30171_02329(coq7)
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Reference
1  [PMID:10802164]
  Authors
Kwon O, Kotsakis A, Meganathan R
  Title
Ubiquinone (coenzyme Q) biosynthesis in Escherichia coli: identification of the ubiF gene.
  Journal
FEMS Microbiol Lett 186:157-61 (2000)
DOI:10.1111/j.1574-6968.2000.tb09097.x
  Sequence
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